Replicación del DNA Flashcards

1
Q

Modelos de replicación

A

Conservativa, semiconservativa y dispersiva

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2
Q

Replicación conservativa

A

1 cadena original, 1 cadena hija: 1 cadena original 3 cadenas hijas

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3
Q

Replicación semiconservativa

A

2 cadenas mezcladas: 2 cadenas mezcladas, 2 cadenas hijas

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4
Q

Replicación dispersiva

A

2 cadenas mezcladas: 4 cadenas mezcladas

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5
Q

¿Qué modelo de replicación es el correcto?

A

Semiconservativo

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6
Q

¿Cuándo se duplica el DNA?

A

Antes de cada división celular

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7
Q

¿Cuál es la velocidad de replicación promedio?

A

1,000 nucleótidos por segundo

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8
Q

¿Cuál es el papel de la doble hélice durante la replicación?

A

La doble hélice actúa como plantilla para su propia duplicación

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9
Q

A=T y G=…

A

C

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10
Q

¿Quién dirige la copia de nucleótidos?

A

DNA Polimerasa

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11
Q

¿Quienes requieren un molde de DNA monocatenario?

A

Nucleótidos libres ( desoxirribonucleósidos trifosfato)

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12
Q

¿Qué es la horquilla de replicación?

A

Es una estructura de DNA en forma de Y

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13
Q

¿La horquilla de replicación es simétrica?

A

No, es asimétrica

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14
Q

¿En qué dirección se polimeriza el DNA?

A

5’ a 3’

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15
Q

Moléculas cortas de DNA

A

Fragmentos de Okazaki

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16
Q

¿Qué hace DNA Primasa?

A

Sintetiza primers de RNA, puede iniciar una nueva cadena y abre disponibilidad para el DNA polimerasa

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17
Q

¿Cuánto mide un cebador?

A

10 nucleótidos de longitud

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18
Q

De cuánto son los intervalos en la cadena rezagada?

A

200 nucleótidos

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19
Q

¿Quién borra a los cebadores?

A

ARNasa H

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20
Q

¿Qué hace DNA ligasa?

A

Sella un enlace fosfodiéster roto

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21
Q

¿Qué se utiliza para activar 5’?

A

ATP

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22
Q

Culaquier cebador que entre en la síntesis de fragmentos de Okazaki será…

A

Inexacto

1 error en 10’5

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23
Q

Proteínas que abren la doble hélice

A

Helicasas y single strand basing protein (SSBP)

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24
Q

Helicasas

A

Proteínas que hidrolizaban ATP. Se impulsan rápidamente a lo largo de la cadena a través de hidrolisis.

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25
SSBP's
Estabilizan el desenrollado y previenen que se formen horquillas cortas
26
Las DNA pol tienden a...
Disociarse del DNA
27
Para poder sintetizar cadenas de DNa largas se necesitan...
Una proteína accesoria que es como una abrazadera
28
Máquina de coser pequeña
Gran complejo multienzimático que se mueve a lo largo del DNA
29
¿Qué es un primosoma?
Unidad de primasa vinculada con una helicasa de DNA, visto solo en procariotas.
30
E.Coli se desarrolla en
30 minutos
31
Sistema de corrección de errores producido por mutante
Exonucleasa de 3' a 5'
32
SI las bases no son complementarias entonces...
Entra en acción el sistema de reparación dirigida de cambio de bases
33
el tercer sistema de correción de errores en procariontes es...
Metilación de residuos de A
34
Sistema de muesca
Las hebras de DNA presentan una muesca y estas proporcionan la señal que mana al sistema de corrección.
35
Proteína que detecta las muescas
MutL
36
Proteína que se une a bases coincidentes
MutS
37
¿Qué hacen las topoisomerasas de DNA?
Previenen la tensión del DNA
38
¿Qué hace la topoisomerasa I?
Produce una ruptura de una sola cadena, lo cual cuasa que las dos secciones de hélice giren una respecto a la otra
39
¿Qué hace la topoisomerasa II?
Separa eficientemente dos hélices entrelazadas de DNA.
40
¿En qué especie se han hecho experimentos de duplicación?
Sacharomyces Cerevisiae
41
¿Quién tiene más componentes proteícos?
Eucariotas
42
¿Cuantas subunidades tiene SSB en eucariotas? ¿Cuantas en bacterias?
3 subunidades para eucariotas mientras que bacterianas tiene 1 subunidad
43
Diferencias de la horquilla de mamífero
Utiliza dos DNA polimerasas y su primasa es subunidad de una de las polimerasas de la cadena rezagada
44
Fases de la replicación
Iniciacion: Saber donde empezará la replicación Alargamiento: Lo que pasa en la horquilla donde se copian los polinucleótidos del molde Terminación: Final
45
¿Qué pasaría si no hubiera limite en la replicación?
Las dobles cadenas lineales se acortarían en cada ciclo
46
¿Cómo inicia la replicación?
Tanto en procariotas como eucariotas empieza con una secuencia unica llamada origen de replicación
47
Origen de replicación de E. Coli
Son 245 bp y se llama OriC
48
¿Que forma tiene el genoma bacteriano?
Es un genoma circular por lo tanto solo tiene un origen de replicación
49
Origen de replicación del humano
Tenemos 20,000 sitios de origen
50
DNA Polimerasa I en E. Coli
Rellena huecos durante reparaciones
51
DNA Polimerasa II en E. Coli
Responde al SOS y facilita la sintesis de DNA dañado
52
DNA Polimerasa III en E. Coli
Cataliza el alargamiento
53
¿Cuanto mide una molécula de DNA lineal?
150 millones de pares de nucleótidos
54
Con una sola horquilla, ¿cuanto se tardaría en replicar una molécula de DNa?
Aproximadamente 800 h
55
¿Cómo se activan los orígenes de replicación?
Se activan en unidades de replicación o grupos, aprox. 20-80 orígenes
56
¿Cuánto espacio hay entre unidades de replicación?
Aprox. 30,000 - 300,000 pares
57
¿Cómo se inicia la replicación?
Se requiere de un complejo llamado ORC como en lavaduras pero menos específico
58
¿Cuantas secuencias de terminación hay en E. Coli?
6 y son las proteínas Tus que dejan que pare
59
¿De qué se componen los cromosomas?
Mezcla de DNA y cromatina
60
¿Donde se sintetizan las histonas?
Fase S
61
¿Qué problema hay con los cromosomas lineales?
No se puede producir el cebador de RNA para iniciar el último fragmento de Okazaki
62
¿Cómo se soluciona el problema de cromosomas lineales en bacterias?
No tienen tal problema pues tiene moléculas de DNA circular como cromosomas
63
¿Cómo se soluciona el problema de cromosomas lineales en eucariotas?
Hay secuencias especiales que se incorporan en los telómeros y llaman a la enzima Telomerasa
64
¿Cómo son las secuencias de DNA de los telómeros?
Son muchas repeticiones en tándem de una secuencia corta con un bloque de G's
65
¿Qué es la telomerasa?
Es una transcriptasa inversa que sintetiza DNA
66
¿Cómo es cada telomero?
Su extremo 3' es más largo que el 5'
67
Células somáticas
Estas nacen con una dotación complta de repeticiones telómericas, que sirven para prevenir la proliferación ilimitada de células en tejidos
68
Telómeros como control de división celular
Después de muchas generaciones, los cromosomas serán defectuosos y las células dejarán de dividirse
69
Reparación del DNA
Errores ocasionados por accidentes metábolicos, radiación, etc. deben ser corregidos.
70
Errores comunes
Base faltante, base altewrada, base incorrecta, etc.
71
Posibles mutaciones como consecuencias de errores
Varios tipos de cáncer, sensibilidad a UV, envejecimiento temprano, anormalidades congenitas, etc.
72
Probables alteraciones espontáneas que requieren reparación
Daño oxidativo Ataque hidrolitico Metiliación no controlada
73
Son muy frecuentes y pueden causar graves dañaos al DNA
Despurinación y desaminación
74
¿Qué es el dímero de timina?
Es un daño en el DNA causado por exposición UV, se puede formar entre dos bases pirimidina vecinas
75
Desaminación
Se traduce en la sustitución de una base por otra
76
Despurinación
Puede conducir a la sustitución o pérdida de un par de nucleótidos
77
Mecanismos de reparacion (3)
Reparación por apareamiento incorrecto Reparación por escisión: Eliminación de una región dañada y luego sintesis de DNA para llenar el vacío Reparación por roturas de doble hebra
78
Tipos de unión de extremos para reparación por roturas de doble hebra
Reparación de DNA no homólogo, esta altera la secuencia original Reparación de DNA homólogo, muy precisa
79
Respuesta al daño de DNA
Un cambio extremo en el entorno de una célula activa ciertos mecanismos
80
Respuesta de choque térmico
Estabilizan proteínas celulares desnaturalizadas
81
Respuesta SOS en E. Coli
Aumento en la transcripcion de 15 genes, primero activacion de RecA
82
¿Cuantas polimerasas menores hay en humanos?
Más de 10, muchas son un ultimo recurso
83
¿Qué causa el daño del DNA en el ciclo celular?
Se retrasa la progresión del ciclo celular hasta que se haya reparado el DNA