Replicación Del DNA Flashcards

1
Q

Como se rompe el dogma central de la biología molecular

A

Por el descubrimiento de la DNA Polimerasa RNA dependiente

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Q

Definición de transcripción inversa

A

Formación de DNA a partir de RNA Cromosómico
Nota -> catalizado por la transcriptasas inversas. Se da en los retrovirus

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Q

Definición de replicación del RNA

A

Síntesis de una molecula de RNA como duplicado de un RNA cromosómico catalizado por RNA transcriptasas
Esto se da en algunos virus como el virus del mosaico del tabaco

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4
Q

Menciona la sentencia correcta respectó a la replicación

A

Los nuevos duplex sintetizados de Novo tienen la misma secuencia que el progenitor

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Q

Que es la replicación conservativa

A

Las cadenas originales se mantienen unidas después de servir como molde al igual que las sintetizadas de Novo

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6
Q

Definición de replicación dispersiva

A

duplex original de DNA se fragmenta y los pequeños pedazos dan las cadenas de Novo

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7
Q

Con base al experimento de Meselson-stahl de 1958, cuál es la función de isotópo N15

A

Es un isotopo pesado en el que se desarrollan las células inicialmente

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8
Q

Con base al experimento de Meselson-stahl de 1958, como refuta la replicación conservativa

A

Si fuesen conservativas, las cadenas pesadas progenitoras deberían permanecer intactas y aparecer las moleculas de DNA ligeras las cuales representarían cada vez un porcentaje mayor del DNA total
No habría cadenas híbridas

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9
Q

Con base al experimento de Meselson-stahl de 1958, menciona la sentencia correcta

A

En el modelo de la replicación dispersiva, las cadenas híbridas N15-N14 solo aparecerían en la primera generación. En seguida comenzaría a ser cada vez más ligeras con cada generación

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10
Q

Que es el replicón

A

Unidad de DNA en el que se produce un acto individual de replicación y sólo se da una vez cada ciclo celular

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11
Q

De qué depende qué el replicón sea unidireccional o bidireccional

A

Dependiendo si se forman una o dos horquillas de replicación

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12
Q

Define Horquilla de replicación

A

Punto en el que se produce la replicacion
Se mueve desde su punto de comienzo en el origen de la replicacion

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13
Q

En célula animales, los orígenes de la replicacion se encuentran

A

Cada 100 kpb

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14
Q

Como se organizan las horquillas de replicación

A

En focos

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15
Q

Numero aproximado de focos que contiene el cromosoma eucariota

A

Entre 100 y 300 focos (podrían representar estructuras fijas a partir de las cuales se mueve el DNA replicante) que contiene > 300 horquillas replicacion cada una

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16
Q

Menciona la tasa de replicación en células procariotas y eucariotas

A

Bacterias -> 50,000 bp por min
Eucariotas -> 2,000 bp por min y tardaría una hora en copiarse todo el genoma

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17
Q

Duración de la fase S en mamíferos

A

6 horas y no más del 15% de replicones están activos en un momento dado

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18
Q

Principal marcador en replicación

A

Bromo de Oxiuridina ( BrDU-FITC)

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19
Q

En la fase de iniciación de la replicación, menciona las enzimas principales

A

Primasa y helicasa

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20
Q

En la fase de enlongacion de la replicacion, cual es el papel del REPLISOMA

A

Solo existe como un complejo asociado a la estructura de la Horquilla de la replicacion, no independiente como el ribosoma
La síntesis de DNA es sólo una de sus funciones

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21
Q

Que son los Loci DNA

A

Componentes de la maquinaria de replicación y se han identificado mediante el estudio de mutantes letales condicionales ( crecen a 37 C pero, el incremento de la Tem inhibe la función proteica X y mueren)

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22
Q

Función de los mutantes de detención rápida

A

Detiene la replicación inmediatamente al subir la temperatura (enlongación)

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23
Q

Función de los mutantes de detención lenta

A

Completan la tanda de replicación en curso pero, no pueden comenzar otra (iniciación)

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24
Q

Función de las polimerasas

A

Síntesis de ácidos nucleicos

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25
Q

Función de las nucleasas

A

Degradación de AN, hidrolizan el enlace Ester de fosfató de nucleotidos contiguos

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26
Q

Función de las exonucleasas

A

Actúan sobre los extremos 5’ 3’ del DNA

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27
Q

Función de las endonucleasas

A

Actúan sobre enlaces internos de la molécula del DNA

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28
Q

Función de las ligasas

A

Unen moléculas del DNA

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29
Q

La DNA Polimerasa es

A

DNA y RNA dependientes

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30
Q

La RNA es polimerasa es

A

DNA y RNA Dependiente

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31
Q

Cuales son las DNA polimerasas que participan en funciones auxiliares como la reparación

A

Las DNA dependientes

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32
Q

Función de la DNA Pol l en la E.Coli

A

Reparación del DNA

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33
Q

Función de la DNA Pol ll en la E.Coli

A

Reparación del DNA

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34
Q

Función de la DNA pol lll en la E.Coli

A

Réplicasa con dominios alfa -> DNA Polimerasa (dnaE)
E o Epsilon -> exonucleasa 3’ 5’ (dnaQ)
Es la Replicasa de la E.Coli

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35
Q

En eucariotas cuál es la replicasa nuclear

A

La delta

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36
Q

En eucariotas cuál es la enzima de reparación nuclear

A

La Beta y también la Épsilon

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37
Q

En eucariotas cuál es la enzima de la replicación del DNA mitocondrial

A

La gamma

38
Q

Función del proofreading

A

Actividad correctora 3’ 5’ exonucleasa

39
Q

Que es la procesividad de la enzima

A

Es la tendencia a permanecer en una solo plantilla o molde en vez de disociarse y re asociarse y evitar el deslizamiento de replicación que es insertar u omitir un nucleotido sobre todo en regiones homopolimericas

40
Q

Que es la melladura en la síntesis del DNA

A

La escisión de la cadena para poner un 3’ y así poder iniciar la polimerización

41
Q

Requerimientos para el inicio de la síntesis de DNA

A

Se requiere un extremo 3’ OH cebador o primer

42
Q

La síntesis del DNA es discontinúa debido a:

A

Su estructura antiparalela del duplex
Porqué la cadena conductora o líder se sintetiza de forma continua
Porque la cadena retrasada crece globalmente de 3’ a 5’. Se sintetiza en fragmentos, de Okazaky, de 100 a 2000 bases (procariotas) y 100 a 200 bases en eucariotas

43
Q

Dirección de la cadena conductora

A

Va en 5’

44
Q

Cuál es la cadena que se tiene que sintetizar en fragmentos

A

La cadena retrasada

45
Q

Función de la primasa

A

Síntesis de RNA
Su locus es dnaG
Incorpora un cebador de RNA de unas 11 o 12 bases

46
Q

Cuál es la secuencia con la que comienza la primasa

A

5’-pppAG -3’ puesta al molde 3’-GTC-5’

47
Q

Donde se realiza la actividad primasa

A

En la iniciación en el primosoma al comienzo de la síntesis de la cadena conductora y en la enlongación en el replisoma al comienzo de cada fragmento de Okazaki

48
Q

Cuál es la única polimerasa con actividad 5’-3’ Exonucleasa

A

Pol l
Actúa en la translación de melladuras
La posición de la melladura se mueve a lo largo del duplex

49
Q

Que polimerasa, durante la replicación, remueve los cebadores de RNA

A

Pol l
Nota: en eucariotas no hay Polimerasa con actividad 5’3’

50
Q

Hablando de exonucleasas, cuál es la función de RNAasa H1

A

Endonucleasa-hace ruptura en duplex de RNA o DNA

51
Q

Función de FEN1/MF1 nucleasa

A

Elimina RNA

52
Q

La DNA ligada sella la Melladura de Nick en dos pasós

A

1- AMP del complejo enzima-AMP se une al 5’ fosfató de la melladura
2- se forma el enlace fosfodiester

53
Q

Función y características de la Helicasa

A

Es de tipo dnaB (5’_3’)
Separa las cadenas de DNA empleando la hidrolisis del ATP

54
Q

Menciona otras características de la Helicasa

A

Interacciona con el DNA tanto duplex como de cadena sencilla
Polaridad especifica en cadena sencilla con extremo 3’ (helicasa 3’_5’) o con extremo 5’ (helicasa 5’-3’)

55
Q

Que dirección tiene la cadena retrasada

A

5’-3’ es el molde

56
Q

Función de las proteínas SSBp

A

Proteínas de unión a cadena sencilla
Son monomeros que se van uniendo e impiden que se forma nuevamente el duplex de DNA

57
Q

Qué tipo de mutantes son la proteína SSPb

A

“Mutantes de detención rápida”
Esta es la proteína de unión a cadena sencilla de DNA

Monomeros que se van uniendo e impiden que se vuelva a hacer el duplex de DNA

58
Q

La replicasa es una Holoenzima con diferentes componentes, cuales de estos conforman el núcleo

A

Alfa, Epsilon y Sigma

59
Q

Función del componente alfa de la replicasa

A

Centro catalitico DNA Polimerasa
Tiene actividad Polimerasa

60
Q

Función del componente Épsilon de la replicasa

A

Función Exonucleasa 3’-5’

61
Q

Función del componente Sigma

A

Ensamblaje de Alfa y Épsilon

62
Q

Función del componente Beta (no pertenece al núcleo) de la replicasa

A

Es la Tenaza. Componente de la procesividad que mantiene la polimerasa sobre el DNA

63
Q

Función del componente Tao de la Replicasa

A

Componente de Dimerización

64
Q

Función del componente GAMMA de la Replicasa

A

Cargador que coloca las subunidades Beta sobre el DNA
Es el CARGADOR DE LA ABRAZADERA

65
Q

Por qué los dos núcleos de la Replicasa tiene. Capacidades diferentes de disociarse del DNA

A

Porque cada uno tiene un DIMERO BETA ASOCIADO

66
Q

En él modelos de la Horquilla de Replicación, cuál es la función de la Holoenzima

A

Resuelve el problema de coordinación entre la síntesis de la cadena conductora y retrasada

67
Q

Función de TAO

A

Conecta al primosoma (helicasa-primasa)con la polimerasa. Se incrementa 10x la velocidad de síntesis y la procesividad

68
Q

Como se posiciona la Helicasa en el modelo de la horquilla de replicacion

A

La Helicasa 5’-3’ sobre la cadena molde de la cadena retrasada

69
Q

Abreviación de la Helicasa

A

DnaB

70
Q

Como se libera la primasa en la Replicación

A

Tras la síntesis del CEBADOR

71
Q

En qué organismos se han identificado secuencias que detienen el movimiento de la horquilla de Replicación

A

En E.Coli y Plasmidos

72
Q

Que son los elementos TER

A

Secuencia de 23 pb en el DNA

73
Q

Gen que reconoce los 23 pb en la proteína

A

Gen TUS

74
Q

Función del gen TUS

A

Actividad anti-Helicasa

75
Q

Función de la hélice alfa de TUS

A

Protruye rededor de la doble hélice en el extremo que bloquea la horquilla de Replicación (en una sola dirección)

76
Q

En qué sitios las mutaciones no son letales

A

En TER y TUS

77
Q

En el origen de la replicacion, menciona una característica donde se inicia la cadena conductora

A

Punto de actuación en CIS capaz de afectar solamente aquella molécula de DNA en la que reside

78
Q

En el origen de la Replicación cuantas y cuales son las proteínas que se necesitan

A

Son 6 y son: DnaA,B,C; HU, GIRASA y SSB

79
Q

De las enzimas implicadas en el origen de la replicacion, cuales son las que se consideran el motor de inicio

A

DnaA y DnaC

80
Q

Que proteína del origen de la replicacion, tiene actividad Helicasa y como actúa?

A

DnaB -> Desplaza a DnaA y activa a DnaG Primasa

81
Q

Función de la GIRASA

A

Quita vueltas -> disminuye la tensión
Elimina o rompe una o dos cadenas para liberar la tensión

82
Q

Función de las proteínas SSB

A

Estabiliza la cadena sencilla impidiendo el duplex

83
Q

Como es el origen de la secuencia que es reconocida por las 6 proteínas

A

TTA

84
Q

Función del origen de replicacion OriC

A

Asegura que se utiliza una vez cada ciclo
11 copias de la secuencia GATC en el origen

85
Q

Función de Dam

A

Metilación de la adenina en N6

86
Q

Los orígenes hemi metilados son activos o inactivos

A

No son activos

87
Q

Los orígenes son activos si no están metilados?

A

Si, son activos aún no estando metilados pero, esto no sucede en Dam

88
Q

En el Timing de la replicacion procariota, que es el RETRASO DE LA REMETILACIÓN

A

El DNA hemimetilado, producto del primer ciclo de replicacion, permanece en el origen aprox 13 min antes de la replicacion
Siendo que otro lugares del genoma se remetilan casi inmediatamente < a 1.5 min

89
Q

Menciona lo correcto respecto a la inhibición de la unión de DnaA

A

“SeqA” es otra proteína que retrasa la REMETILACIÓN de OriC y DnaA, es un regulador negativo que interacciona con DnaA.

90
Q

Que es el secuestro físico del origen

A

Cuando el DNA está asociado a la membrana esto porque está HEMIMETILADO y por ende no permite su replicación

91
Q

Función de MCM 1,,2, 3

A

Se une al material cromosómico antes de la replicacion y se liberan posteriormente a la replicacion
Son ubiquitinados y degradados y entran en el núcleo solamente durante la mitosis además de que contiene una Helicasa