Replicação; PCR Flashcards

1
Q

Quais são os tipos de replicação?

A

Modelo theta (procariontes)
Circulo-rolante (plasmideos e virus)
Linear (eucariotos)

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Q

Como é a replicação do modelo theta?

A

Se inicia em uma origem de replicação, com abertura da dupla fita formando uma bolha de replicação e formando duas forquilhas de replicação (uma para cada lado da bolha), elas vão replicando as duas fitas nos dois sentidos até formar duas duplas fitas

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3
Q

O que fazem as proteinas iniciadoras e um exemplo delas

A

DNA A: reconhecem a origem e abrem a dupla fita em sítios específicos

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4
Q

O que faz o DNA B?

A

É uma helicase que abre a hélice na forquilha de replicação

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5
Q

O que faz o DNA G?

A

É uma primase. Adicionam os primers, que são os primeiros nucleotideos de rna da replicação e a partir do primer a DNA polimerase vai polimerizando a fita, adicionando nucleotídeos na fita complementar

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6
Q

O que faz a DNA girase?

A

Gira o dna diminuindo a tensão da dupla fita gerada pela dna helicase

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7
Q

O que são as SSDs?

A

Proteínas ligadora de fita simples. Evita que bases complementares se liguem antes que ocorra a replicação da fita que está aberta

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8
Q

O que é a fita líder?

A

É a fita que esta sendo formada no sentido da abertura da forquilha

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9
Q

O que é a fita tardia?

A

Fita sendo formada no sentido contrário da forquilha. Ocorre em fragmentos: fragmentos de okazaki (esse fragmentos são ligados pela ligase)

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10
Q

Quais enzimas tem atividade revisora?

A

Dna polimerase 1 e 3

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11
Q

Qual dna polimerase é responsavel pelo alongamento do dna e qual e responsável por colocar ou tirar primers?

A

Alongamento: 3
Colocar ou tirar primers: 1

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12
Q

O que o Ciprofloxacino faz no organismo?

A

Ciprofloxacino atua impedindo a ação da girase, bactérias não conseguem replicar o dna e consequentemente não conseguem se proliferar

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13
Q

O que fazem as DNA polimerases?

A

Catalisam as reações de alongamento de cadeia. Primer é colocado, após isso a dna polimerase polimeriza até o próximo fragmento (nas fitas tardias). Nas fitas contínuas há apenas a polimerização

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14
Q

Quais são as dna polimerases de eucariontes?

A

Alfa: inicio da síntese de DNA nuclear, tem atividade de primase
Delta: síntese de filamentos lagging dna nuclear
Epsilon: síntese de filamento leading

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15
Q

Os telomeros são responsáveis pelo que?

A

Dão estabilidade aos cromossomos e impedem a degradação do dna

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16
Q

Porque a cada ciclo de replicação o dna diminuiria de tamanho?

A

Porque a fita tardia não tem espaço para colocar um primer de polimerização no sentido contrário à abertura da forquilha

17
Q

O que faz a dna telomerase?

A

Ela possui um molde em rna da sequência complementar à sequência consenso (cada espécie tem a seu tipo de sequência repetitiva). Elas reconhecem as sequências consenso livres dos telomeros e ela se liga e completa e alonga a fita molde da fita tardia, abrindo espaço para a primase adicionar um primer e a partir dele ocorrer a polimerização do trecho final que não foi replicado

18
Q

O que acontece quando o telômero é replicado?

A

Eles formam uma alça: há a abertura de um trecho do telômero e ocorre a invasão de uma extremidade 3’ em uma região telomerica de dupla fita. Essa abertura é feita por uma helicase TRF1 e depois proteínas se ligam ao TRF1 para revestir os telômeros

19
Q

Quais são os requisitos do processo de replicação do dna?

A
  1. Um molde de DNA unifilamentar
  2. Matéria prima para a síntese do novo filamento de DNA (nucleotideos)
  3. Enzimas e outras proteínas que leem o molde e sintetizam a nova fita a partir da informação contida no molde
20
Q

O que é o PCR?

A

Reação em cadeia da polimerase (PCR). É uma replicação in vitro

21
Q

Quais são os componentes do PCR?

A

Dna, primers, nucleotideos, taq polimerases (de termobacterias), termociclador (modifica a temperatura interna por tempos pré estabelecidos)

22
Q

Quais são os processos do PCR?

A
  1. Desnaturação para a dupla fita do dna se separar
  2. Anelamento. Para que os primers reconheçam a sequência complementar no molde e ocorra o pareamento dos primers
  3. Atuação das taq polimerases para reconhecem os primers e alongar as fitas novas
  4. Repete o ciclo
23
Q

Qual é a diferença do PCR para o qPCR (PCR e tempo real)

A

Os primers que serão utilizados ou alguns nucleotideos podem ser marcados com fluorescência, dessa maneira, a medida for ocorrendo os ciclos de replicação, é possivel avaliar a fluorescência e avaliar e quantificar a fluorescência ao longo dos ciclos