Régulation des gènes eucaryotes Flashcards
Que font les silencers et les insulateurs
Silencer: inhibe la transcription
Insulateur: restreint l’utilisation des amplificateurs et silencers
Quels sont les éléments de contrôle de la transcription dans l’ADN
-promoteur de base, facteurs de transcription généraux, ARN polymérase II
-éléments de contrôle proximaux dont l’identité varie d’un gène à l’autre
-amplificateurs liant des facteurs de transcription régulateurs dont l’action est indépendante de la position/orientation
Définir un reader
Protéine qui reconnait une ou des modifications d’histones
Définir un eraser
Enzyme qui enlève une modification acétyl, méthyl ou autre aux histones
Définir un writer
Enzyme qui ajoute une modification acétyl, méthyl ou autre aux histones
Quelles sont les enzymes impliquées dans les modifications des histones
Méthylation: histone méthyltransférases/déméthylases
Acétylation: histone acétyltransférases/désacétylases
Phosphorylation: kinases/phosphatases
Nommez les types de modifications des histones
-lysine: acétylation, méthylation, ubiquitination
-arginine: méthylation
-sérine/thréonine: phosphorylation
Définir la modification des histones agissant sur l’empaquetage de la chromatine
-combinaisons différentes de modifications post-traductionnelles des queues N-terminal des histones forment un code génétique
-ces combinaisons entraînent des effets transcriptionnels différents
Décrire la méthylation de l’ADN
-associé à la répression de l’expression des gènes
-c’est un changement épigénétique qui peut être transmise d’une génération à l’autre
-peut être réversible
-peut être modifiée par l’environnement
Par quoi est caractérisé la chromatine déconcensée dans les cellules mammifères
-dégradation accrue de la chromatine transcriptionnellement active par la DNase I
-présence de sites hypersensibles à la DNase I
-absence de l’histone H1
-contenu en protéines HMG augmenté
Quelles sont les méthodes pour altérer les gènes
-amplification: augmentation des copies des gènes encodant les ARNr durant l’ovogénèse
-délétion: élimination du noyau cellulaire des globules rouges
-réarrangement des gènes endodant les anticorps dans les lymphocytes B: déletion de régions d’ADN
Quel est le but des médicaments qui ont comme cible les histones
Empêcher l’expression des gènes, tuer la cellule en empêchant la réplication. Se sont souvent des traitements anti-tumoraux
Qu’est-ce qui fait que lors de la chimiothérapie, se ne sont pas toutes les cellules saines qui meurent?
Les cellules cancéreuses se multiplient/divisent super rapidement ce qui fait qu’elles captent plus de médicament rapidement contrairement aux cellules saines qui se réplique plus lentement et n’absorbe pas autant rapidement le traitement
Quels sont les rôles des facteurs de transcription régulateurs
-augmente ou diminue l’initiation de transcription en recrutant et stabilisant les composants du complexe transcriptionnel
-recrute des coactivateurs
-recrutement d’un complexe appelé « Médiateur »
Comment agissent les coactivateurs
Ils remodèlent la chromatine ou modifient les histones menant à des altérations de la structure de la chromatine
À quoi sert le Médiateur
Sert de pont entre les facteurs de transcription régulateurs liés à des amplifications et le complexe transcriptionnel
Comment sont controlés les niveaux des protéines (facteurs de transcriptions et cyclines)
Sont contrôlés au niveau de leur dégradation par le protéasome
Quels sont les étapes de la régulations des gènes eucaryotes, ubiquitination et stabilité des protéines
-Activation de l’ubiquitine (chaine de76 a.a.) en se liant à une enzyme (E1)
-Transfert de l’ubiquitine activée à l’enzyme conjuguant l’ubiquitine (E2)
-Liaison à un résidus lysine de la protéine à dégrader (E3)
-Addition de d’autres molécules d’ubiquitine
-Reconnaissance des chaines par le protéasome et dégradation
Quels sont les étapes de la régulations des gènes eucaryotes, microARN, stabilité de l’ARNm et traduction
-Transcription du miARN en pri-miARN avec tige-boucle
-Clivage du pri-miARN en pre-miARN par Drosha
-Transport dans le cytoplasme et clivage du pre-miARN en miARN par Dicer
-Liaison au complexe RISC pour former miRISC
-Intéractions entre miRISC et l’ARNm
-Dégradation de l’ARNm ou inhibition de la traduction par un ou plrs miARN
Le modèle combinatoire prévoit que l’expression des gènes dépend de quoi
D’une combinaison de facteurs de transcription régulateurs ubiquitinaires et tissu-spécifiques, liant de multiples éléments de contrôle dans l’ADN et varient d’un gène à l’autre
Décrire le contrôle de l’expression des ARNm par les microARN
-près de la moitié des gènes seraient régulés par des miARN
-habituellement transcrits par ARN polymérase II
Comment l’amplificateur peut-il affecter l’expression d’un gène à distance?
- des FT régulateurs lient la séquence d’ADN de l’amplificateur
-liaison entraine formation d’une boucle qui rapproche l’amplificatuer du promoteur
-Les FT régulateurs intéragissent avec des coactivateurs qui modifient les histones
-les FT régulateurs lient le complexe médiateur qui stabilise le complexe transcriptionnel
Quelles sont les classes de des FT régulateurs selon leurs motifs de liaison
-motif hélice-tour-hélice
-motif doigt de zinc
-motif leucine zipper
-motif hélice-boucle-hélice
Caractériser la régulation post-traductionnelle des FT par phosphorylation
Ajout de charges négatives –> chngt conformation:
-augmente/diminue capacité de lier l’ADN
-augmente/diminue capacité d’activation ou répression
-modifie la localisation
Écrire les étapes de la régulation de la transcription par phosphorylation
CREB lie un élément de réponse à l’AMPc (CRE):
-suite à un signal, production d’AMPc et activation de la PKA
-translocation de la PKA au noyau
-phosphorylation de CREB sur le site CRE
-recrutement du coactivateur CBP, un HAT qui acétyle les histones
Quel est l’objectif des médicaments ciblant la régulation des gènes eucaryotes
Inhiber le cylce cellulaire/tuer la cellule
