Proteinas da Replicação 2.0/2.1/2.2 Flashcards

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1
Q

Defina DNA replicase

A

DNA replicase são DNA-polimerase que realiza a síntese das duas fitas novas de DNA.

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Q

Explique suscintamente como a DNA pol sintetiza de 5`-3´

A

Adicionando nucleotídeos trifosfatados na extremidade 3’-OH livre, sintetizando a fita no sentido 5’→3’

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3
Q

Oque é necessário para que a DNA polimerase faça a incorporação de bases ?

A
  • Síntese prévia de pequenas sequências de ribonucleotídeos, denomina dos iniciadores (primers)
  • Proteína primase / DNA-Pol 𝜶 sintetiza o primer nos eucariotos
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4
Q

Correlacione as DNA polimerases com suas respectivas funções

A

DNA Polimerases I (Familia A) ; DNA Polimerases III (Familia C)

  • Replicação

DNA Polimerases II (Familia X) ; DNA Polimerases IV (Familia Y) e DNA Polimerases V (Familia Y)

  • Reparação de Lesões no DNA
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Q

Cracteristica geral das DNA pol bacterianas

A

Fazem

  • Polimerização - sintese 5´-3
  • Exonuclease - remoção de nucleotídeos
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6
Q

Qual a importância da atividade de exonuclease(3´-5`) ? Qual seria sua principal função ?

A
  • Permite que o processo de replicação feito pelas replicases ocorra livre de erro
  • Sua principal função é reconhecer e clivar um pareamento incorreto na extremidade 3´-OH da fita nova
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7
Q

Como ocorre o processo de “correção de erro” na replicação de E.coli

A
  1. um nucleotídeo é adicionado na cadeia nova crescente pela atividade de polimerização da DNA-polimerase III, formando o pareamento das bases;
  2. a enzima anda uma base à frente para adicionar o próximo nucleotídeo de um novo pareamento;
  3. sendo o pareamento de bases anterior
    1. incorreto, a enzima fica impedida de continuar a polimerização e, movendo um nucleotídeo para trás, coloca-se em con- tato com o nucleotídeo que deve ser removido com a atividade de exonuclease 3’→5’;
  4. o nucleotídeo com pareamento de bases incorreto é removido e um novo nucleotídeo pode ser adicionado na região onde ocorreu a correção de erro
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8
Q

Quais as caracteristicas das exonucleases 5´-3´ presentes em algumas DNA Polimerases ?

A

Removem blocos de nucleotídeos (aproximadamente 10 nucleotídeos) de uma das fitas no sentido oposto ao da exonuclease de correção de erro.

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9
Q

O que pode acontecer se no DNA ocorrer uma quebra de ligação fosfodiéster (nick), ou há falta de alguns nucleotídeos (gap) ?

A

Podem acontecer …

  1. atividade de exonuclease 5’→3’ remove blocos de nucleotídeos no sentido 5’→3’, a partir da região alterada no DNA
  2. a atividade de polimerização sintetiza as regiões que foram removidas, originando uma fita nova de DNA nessa região
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10
Q

Principal diferença entre a replicação de E.coli e eucariotos.

A

Maior número de DNA - Polimerases envolvidas na replicação

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11
Q

Defina DNA-polimerase 𝜶

A
  • Eucarioto
  • Proteina complexa com capacidade de polimerização e primase
  • Indicios q faz a sintese dos iniciadores nas 2 novas fitas de DNA (continua e descontinua)
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12
Q

Função da DNA Polimerase 􏰁􏰁Delta 𝝳 (eucariotos)

A

O prosseguimento da fita continua

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13
Q

Quais são as proteinas, com funções especificas, necessárias para que aconteça o processo de replicação no replissomo ?

A
  • Dna Polimerases
  • Proteinas SSB
  • Primases
  • Ligase
  • Topoisomerase
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14
Q

Função da helicase na replicação

A
  • Quebra as pontes de hidrogênio entre as bases, separando as duas fitas de Dna.
  • Sem a quebra, a forquilha não se movimenta
  • Dna polimerase depende dessa “abertura” inicial para que possa replicar
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15
Q

Helicase DnaB

A
  • Replissomo de E.coli
  • Utiliza ATP p romper as ligações
  • Movimenta-se 5´- 3´
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16
Q

Nome e estrutura da helicase presente em arqueas e eucariotos

A
  • MCM (manutenção de minicromossomo)
  • Estrutura de anel com 6 subunidades
17
Q

Defina SSB

A
  • Bacteria
  • Grupo de proteinas que se ligam à fita simples de DNA
  • SSB (Single Strand Binding)
  • Ligação ocorre sempre de forma cooperativa
18
Q

Qual a principal função das SSB ?

A
  • Estabiliza a fita simples de DNA em Bacteria
    • Evita torção da fita simples; induz conformaçao ideal
  • Protegem as fitas da degradação por nucleases
19
Q

Função das primases

A
  • Sintese dos iniciadores da replicação
  • Pequenas sequencias de RNA
20
Q

Responsável pela atividade de primase em eucariotos

A

DNA-polimerase Alpha