Proteinas Flashcards

1
Q

¿Qué es la proteómica?

A

Expresión, función y regulación del conjunto de prot cod por un organismo

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2
Q

Técnicas de la proteómica para estudiar a las prot

A

Electroforesis mono y bidimensional
Espectometría de masas
Técnicas in silico (análisis de bases de datos)

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3
Q

¿Qué requiere la proteómica pasa el análisis?

A

Fraccionar mezclas de prot o péptidos

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4
Q

¿Qué busca la separación en la proteómica?

A

Reducir complejidad y tiempo de análisis

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5
Q

Interacciones prot-prot

A

Purificacion por afinidad-MS
Prot en estudio se aisla por afinidad que tiene con a.c. y las prot que estan pegadas a ellas

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6
Q

MS

A

Espectometría de masas

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7
Q

Pasos para analizar prot

A

1 Homogenización / extracción
2 Desalinización / diálisis y concentrac
3 Intercambio iónico y cromatograf de filtración en gel
4 SDS-PAGE
5 Degradación proteolítica
6 Purificación y secuenciación de a.a.

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8
Q

¿Como extraigo prot?

A

Con a.c. específicos

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9
Q

Electroforesis bidimensional ¿Cuando?

A

1995 O’Farrel et al.

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10
Q

¿Que es la electroforesis bidimensional?

A

Utiliza geles de poliacrilamida dos dimensiones:
- Carga: Isoelectroenfoque (IEE)→punto isoeléctrico(PI)
- Masa mol

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11
Q

En electroforesis bidimensional el gel se tiñe normalmente con…

A

Plata

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12
Q

Identificación de prot

A

Manchas individuales se identifican mediante tinción, despues se dirigen con proteasas

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13
Q

¿Después de la identificación de prot como se secuencian?

A

Mediante espectrometría de masas → se identifica prot

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14
Q

¿Cuando se hace la identificación de proteinas en espectometria bidim

A

Se hace una vez corrido el gel bidim

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15
Q

Espectrometria de masas

A

Corta y muestra cada aminoácido de la prot

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16
Q

¿Qué enzima se utiliza comúnmente para digerir muestras proteicas antes del análisis por espectrometría de masas?

A

Tripsina

17
Q

¿Qué significa “huella dactilar” en el contexto de la espectrometría de masas?

A

Combinación única de a.a. en un péptido que permite identificar prot específicas a través de sus masas características

18
Q

SDS-PAGE

A

Gel bidimensional

19
Q

Huella peptídica

A

Capacidad que se tiene de identificar una prot

20
Q

¿Cómo se determina la masa de un péptido en espectrometría de masas?

A

Mediante relación masa/carga de los iones generados durante la ionización

21
Q

¿Cuál es el primer paso en el proceso de espectrometría de masas?

A

Ionización
Moléculas→iones

22
Q

¿Que se obtiene a partir del análisis por espectrometría de masas?

A

Características de las prot, sus mod quimicas y estructura

23
Q

¿Con que se comparan los fragmentos de prot analisados en espectrometría de masas?

A

Con bases de datos

24
Q

Pasos de la espectometría de masas

A

1 Extracción de muestra
2 Agregamos tripsina
3 Espectometría
4 Análisis in silico
5 Id de proteina

25
Q

¿Para que es la espectometría de masas?

A

Id de proteina