Protein Transport Flashcards
אילו בעיות נהיו עקב המעבר לתא אאקוריוטי?
1) חלוקת האברונים בין תאי הבת
בזמן המיטוזה
(מיטוכונדריה ואי-אר מתחלקים לפני חלוקת התא, ויש איברים שהתא יודע לייצר - אנדוזום, פרוקסיזום)
2) מידור אברונים בתא - לאברונים יש מקום ספציפי בו הם נמצאים. אי-אר צמוד לממברנת הגרעין. חלבוני מיקרוטובולין מכוונים את האורגנלות למקומן
3) מיקום חלבונים במקום ובזמן הנכון - חלבונים עוברים תרגום בציטוזול, ואז עוברים למדורים שונים.
היכן החלבונים עוברים תרגום?
בציטוזול (למעט אלו שמתורגמים במיטוכונדריה)
כיצד החלבונים עוברים לגרעין?
gated transport
חורים בממברנת הגרעין נקראים
nuclear pores
הם מכילים חלבוני פיברילות
מה קורה לחלבונים ללא רצף הכרה?
נשארים בציטוזול
איזה חזרות מכילים חלבוני הפיברילות?
פנילאלנין וגליצין
מה לא נמצא בממברנת הגרעין?
גליקופרוטאינים
מה מגבלת הגודל למעבר חלבונים בדיפוזיה בגרעין?
מתחת ל-5,000 דלתון החלבונים עוברים בקלות.
60,000 דלתון עוברים בקושי
האם החלבונים שעוברים דרך הגרעין מקופלים או לא?
החלבונים יכולים להיות מקופלים, שכן הם עוברים דרך הפורס ולא דרך הממברנה עצמה.
מה חלבון צריך כדי להיכנס לגרעין?
NLS - nuclear localization signal
מורכב מחומצות אמינו חיוביות בעיקר. אם משנים אפילו חומצה
אמינית אחת, הוא לא יכנס לציטוזול
מזוהה ע״י NPC
מה חלבון צריך כדי לצאת מהגרעין?
NES - nuclear export signal
מאופיין בכמה חומצות לאוצין
חלבונים שמוציאים מהגרעין הם אקספורטינים
כיצד מתבצע היבוא של החלבון לתוך הגרעין?
1) זיהוי רצף על גבי החלבון
2) קישור לאימפורטין
3) הקומפלקס מוכר ע״י הפיברילות ומוכנת לתוך הגרעין
4) כעת צריך להתבצע מחזור האימפורטין - חלבון
RAN-GTP
נקשר אל הקופמלקס ומשחרר את החלבון מהאימפורטין. האימפורטין יוצא כי יש לו רצף שמאפשר ייאה. בחוץ הוא פוגש
RAN-GAP
שהופך את החלבון ל
RAN-GDP
ובכך משחרר את האימפורטין מהחלבון וכעת הוא פנוי לסבב נוסף.
בגרעין יש
RAN-GEF
שמחזיר ל
RAN -GTP
מהו אדפטור?
חלבון שנקשר לרצף ה
NES
על גבי החלבון, ועוזר לתווך בקישור לאימפורטין
האם חלבון יכול להכיל גם
NES & NLS?
כן. אי אפשר לדעת במצב זה איפה החלבון יהיה ממוקם, גם אם לצורך העניין יהיו יותר רצפים של כניסה לגרעין מאשר יציאה
what is NF-AT?
פקטור שעתוק מרכזי שגורם לתגובה אימונית. הוא צריך להיכנס לגרעין ולעשות אקטיבציה של ביטוי גנים מסוימים. תאי טי
באופן הוא נמצא בציטופלסמה במצב מזורחן, בהינתן סיגנל חיצוני יש פוספטז שמסיר את קבוצת הפוספט - וזה חושף את רצף הכניסה לגרעין. עם סיום התגובה האימונית, הוא מזורחן מחדש והוא יוצא חזרה לציטוזול.
השליח השניוני שמפעיל את התגובה הוא רמות גבוהות של קלציום
מה מיוצר ב-
sER?
ליפידים
בנוסף שם יש מאגר של סידן תוך תאי
מה מיוצר ב-
rER?
חלבונים טרנס ממברנליים או חלבונים שמיועדים להפרשה מהתא
היכן לרוב ימצא רצף ההכרה של חלבון שמיועד ל
ER?
לרוב בתחילת החלבון. זהו רצף הידרופובי כי החלבון יעבור דרך הממברנה.
יש רצף נוסף, קצר, שדואג שחלבון שנוצר באי-אר ישאר באי-אר.
what is translocator?
חלבון שהוא תעלה על הממברנה של האי-אר, דרכו עוברים החלבונים. ההעברה יכולה להיות בעת התרגום או לאחר התרגום.
כיצד מתבצע המעבר מהציטוזול לתוך האי-אר?
כאשר סיגנל המעבר בולט מתוך הריבוזום, מגיע חלבון שנקרא
SRP
החלבון קושר את הסיגנל מצד אחד ותופס את הריבוזום. מביא את הקומפלקס לטרנסלוקוטר. הסיגנל של החלבון נכנס לטרנסלוקטור (הידרופובי) הריבוזום נקשר לטרנסלוקטור וחלבון ה
SRP
מתנתק , הסינתזה של החלבון ממשיכה והיא דוחפת את החלבון לתוך האי-אר. לאחר מכן יש ביקוע של הסיגנל וכך הוא לא יחזור לציטוזול.
כיצד מתבצעת סינתזת חלבונים טרנס-ממברנליים?
חלבון שחוצה את הממברנה פעם אחת, צריך שני רצפי הכרה:
start transfer sequence
stop transfer sequence
רצף העצירה באזור בו הוא צריך להתחיל להיות מחוץ לאי-אר.
מתחילים מתרגום בציטופלסמה, מובא אל הטרנסלוקטור. עובר באמצעות רצף ההתחלה וממשיך עד רצף הסיום. ואז אנזים פפטידז חותך את הלופ ליד רצף ההתחלה. בנוסף משתחרר הטרסנלוקטור.
רצפי ההתחלה והסוף הם הידרופובים כדי שיוכלו להשתלב בממברנה.
אפשר לעשות כמה רצפים כאלה ואז החלבון יעבור כמה פעמים בממברנה.
מה קורה כאשר יש רצף התחלה באמצע של החלבון (ולא בהתחלה?)
במקרה זה החלבון שמתורגם יגיע אל הטנסלוקטור ויעבור דרך רצף ההכרה, ואחד הקצוות שלו יכנס אל הלומן והשני ישאר בציטוזול. הכיווניות של החלבון נקבעת על פי הרצף מיד אחרי רצף ההתחלה. אף הרצף שסמוך סיגנל הוא חיובי, הוא יעדיף את הסביבה השלילית של הציטוזול - ולכן החלק שיכנס ללומן יהיה החלק האמיני.
