Protein structure and folding

Question 1

Strukturelle proteiner

Answer 1

Avgjør formen på celler og cellenes ekstra-cellulære miljø (miljøet som er rundt cellen) og som er retningstråder som veileder molekyler og organeller intracellulært (inni cellen)

Question 2

Scaffold proteiner

Answer 2

bringer proteiner sammen for å utføre spesifikke funksjoner som er mer effektive enn funksjonene proteinene ville hatt individuelt

Question 3

Enzymer

Answer 3

proteiner som katalyserer kjemiske reaksjoner

Question 4

Regulatoriske proteiner

Answer 4

fungerer som sensorer, signaler og brytere som kan kontrollere aktiviteten til celler, med å regulere/endre funksjonen til andre proteiner og gener

Question 5

Membran transport proteiner

Answer 5

lar molekyler og ioner transportere inn og ut av cellemembranen

Question 6

Hormoner

Answer 6

type signalprotein som da tilhører den brede funksjonelle klassen Regulatoriske proteiner

Question 7

Motor proteiner

Answer 7

Ansvarlige for å bevege andre proteiner, organeller, celler eller til og med hele organismer.

Question 8

Molekylære maskiner

Answer 8

Begrep som ofte brukes om proteiner som samles til store komplekser og da effektivt kan utføre sine mål

Question 9

Proteom

Answer 9

En celle eller et individ sitt samlede antall uttrykte proteiner

Question 10

Peptidbindinger

Answer 10

Binding mellom aminosyrer i proteiner

Question 11

Polypeptid

Answer 11

Polymer/Peptid av mer enn 30 aminosyrer

Question 12

Oligopeptid

Answer 12

Polymer/Peptid av relativt få aminosyrer

Question 13

Konformasjon

Answer 13

Begrep knyttet til beskrivelsen av den romlige plasseringen av atomene i et molekyl. Brukes spesielt om proteiners fasong (avhenger av proteinets aminosyre sekvens)

Question 14

Aminosyre sekvens

Answer 14

Rekkefølgen av aminosyrer i et peptid

Question 15

Ball-and-stick modell

Answer 15

Viser alle atomene i et protein, veldig detaljert modell

Question 16

Bånddiagram (ribbon diagram)

Answer 16

Viser hvor de sekundære strukturene er plassert, men ikke alle atomene

Question 17

Hybrid modell

Answer 17

Viser sekundære strukturer og overflaten

Question 18

Cα Backbone trace

Answer 18

viser hvordan polypeptidene er tett pakket i et lite volum

Question 19

De 4 hierarkiske nivåene i protein-struktur

Answer 19

Primær
Sekundær
Tertiær
Kvartær

Question 20

Primær strukturen

Answer 20

Aminosyre sekvensen, skrives ofte med 3 første bokstavene i aminosyrene eller bare forbokstaven

Question 21

N-terminus

Answer 21

Den “enden” av proteinet der det er en aminogruppe (N, pga NH3+). Vises først (venstre ende) i protein-modeller.

Question 22

C-terminus

Answer 22

Den enden av proteinet der det er en karboksyl-gruppe (C pga karbon). Bakerst (til høyre) i protein-modeller.

Question 23

Peptid ryggrad (backbone)

Answer 23

α-karbonene, N-terminus, C-terminus, alt som ikke er en sidegruppe på peptidet

Question 24

Dalton

Answer 24

Måleenhet fot proteinmasse

Question 25

113Da

Answer 25

Gjennomsnittlig aminosyre-masse i et protein

Question 26

113Da

Answer 26

Gjennomsnittlig aminosyre-masse i et protein

Question 27

Sekundær strukturen

Answer 27

Korte segmenter med spesifikk romlig form basert på hydrogen-bindinger mellom ryggrad (backbone) amino og karbonyl grupper

Question 28

Hva avgjør om en spesifikk sekundær struktur formes?

Answer 28

Aminosyre sekvensen

Question 29

De viktigste sekundær strukturene

Answer 29

alfa helicer og beta sheets

Question 30

Alfa helicer og beta sheets er ofte koblet via

Answer 30

beta-turns

Question 31

Intrinsically disordered region (egenforstyrret region)

Answer 31

Del av polypeptid som som ikke har stabil form (i det hele tatt)

Question 32

Hva avgjør om en alfa heliks er hydrofil eller hydrofob?

Answer 32

Sidegruppene

Question 33

Beta sheets består av

Answer 33

B strands på lengde 5-8 aminosyrer

Question 34

De to hovedgruppene av proteiner

Answer 34

Globulære eller kuleformede proteiner og fiberproteiner

Question 35

Den største av de 2 hovedgruppene proteiner

Answer 35

Globulære proteiner

Question 36

Fiberproteiner

Answer 36

langstrakte og motstandsdyktige

Question 37

Eksempel fiberproteiner

Answer 37

Kollagen, keratin, elastin

Question 38

Viktige eksempler på globulære/kuleformede proteiner

Answer 38

Enzymer, hormoner, hemoglobin

Question 39

Globulære proteiner

Answer 39

generelt sett vannløselige og kompakte