PROTEİN 3D YAPI Flashcards
Protein yapısında bulunan atomların uzaysal düzenlenmesi
konformasyon
Doğal konformasyonu kararlı hale getiren bağlar
disülfit (kovalent)
bağları ve kovalent olmayan zayıf etkileşimlerdir (hidrojen
bağları, hidrofobik ve iyonik etkileşimler)
protein kararlılığında en
baskın zayıf etkileşimdir
hidrofobik etkileşimler
Peptit bağındaki C-N bağı kısmi
çift bağ niteliğinde . serbest dönmez
Dönüş Ca-C ve N-Ca bağları etrafındadır
a sarmalın dönüşü
sağ el
Sarmalın bir dönüşü
3.6 aa
Amino asitlerin hangi
grupları sarmalın dışına
uzanır.
R
Aynı protein ailesinde yer alan poteinlerin globin ailesi
Birincil ve üçüncül yapıları önemli oranda benzer, işlev benzer
Protein ailesindeki proteinler
evrimsel olarak ilişkilidir
Amino asit dizisinde küçük benzerlik olan iki ya da
daha fazla aile aynı temel örgüyü kullanıyor ve
işlevsel benzerlik söz konusu ise bu aileler
üst aile / üst protein ailesi
multimer
Çoklu alt birimlere sahip proteinler
protomer
multimer ama hep aynı birim tekrarlanıyor
oligomer
sadece birkaç altbirimli protein
Üç-boyutlu yapısı belirlenmiş ille oligomerik protein, dört polipeptit
zinciri ve dört hem prostetik grubu içeren, demir atomlarının ferröz
(F e+2) durumda bulunduğu
Hemoglobin
dönüşlü simetri ya da sarmal
simetri ye sahiptir
oligomerler
Virüs kılıfı ve kapsitlerde
yaygın olarak bulunan
yapıdır.
İkozahedral simetri