PROTEİN 3D YAPI Flashcards

1
Q

Protein yapısında bulunan atomların uzaysal düzenlenmesi

A

konformasyon

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
2
Q

Doğal konformasyonu kararlı hale getiren bağlar

A

disülfit (kovalent)
bağları ve kovalent olmayan zayıf etkileşimlerdir (hidrojen
bağları, hidrofobik ve iyonik etkileşimler)

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
3
Q

protein kararlılığında en
baskın zayıf etkileşimdir

A

hidrofobik etkileşimler

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
4
Q

Peptit bağındaki C-N bağı kısmi

A

çift bağ niteliğinde . serbest dönmez

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
5
Q

Dönüş Ca-C ve N-Ca bağları etrafındadır

A
How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
6
Q

a sarmalın dönüşü

A

sağ el

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
7
Q

Sarmalın bir dönüşü

A

3.6 aa

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
8
Q

Amino asitlerin hangi
grupları sarmalın dışına
uzanır.

A

R

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
9
Q

Aynı protein ailesinde yer alan poteinlerin globin ailesi

A

Birincil ve üçüncül yapıları önemli oranda benzer, işlev benzer

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
10
Q

Protein ailesindeki proteinler

A

evrimsel olarak ilişkilidir

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
11
Q

Amino asit dizisinde küçük benzerlik olan iki ya da
daha fazla aile aynı temel örgüyü kullanıyor ve
işlevsel benzerlik söz konusu ise bu aileler

A

üst aile / üst protein ailesi

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
12
Q

multimer

A

Çoklu alt birimlere sahip proteinler

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
13
Q

protomer

A

multimer ama hep aynı birim tekrarlanıyor

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
14
Q

oligomer

A

sadece birkaç altbirimli protein

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
15
Q

Üç-boyutlu yapısı belirlenmiş ille oligomerik protein, dört polipeptit
zinciri ve dört hem prostetik grubu içeren, demir atomlarının ferröz
(F e+2) durumda bulunduğu

A

Hemoglobin

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
16
Q

dönüşlü simetri ya da sarmal
simetri ye sahiptir

A

oligomerler

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
17
Q

Virüs kılıfı ve kapsitlerde
yaygın olarak bulunan
yapıdır.

A

İkozahedral simetri

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
18
Q

2130 özdeş alt birimden oluşan sağ el dönüşlü
sarmal bir iplikçiktir

A

TMV

19
Q

sarmal simetri nerede yer alabilir

A

oligomerlerden bazıları sarmal simetrili
viral kapsitler sarmal simetri
TMV

20
Q

denatürasyon

A

protein üç boyutlu yapısının kaybı ile proteinin aktivitesini yitirmesi

21
Q

denatürasyonda birincil yapı nasıl etkilenir

A

birincil yapı hiçbir kovalent bağ denatürasyon sırasında yıkılmadığından bozulmaz aynı kalır

22
Q
A

sıcaklık
ph
organik çözücüler:aseton
deterjanlar
üre veya guanidin hidroklorür

23
Q

sıcaklık proteinlerin bozulmasında hangi bağları yıkarak etki eder

A

hidrojen

24
Q

Ökaryotik Hsp70 ve Hsp40
proteinlerinin benzeri E. coli’de

A

Dna J ve Dna K proteinleridir

25
Q

şaperoninler

A

kendilğiğnde katlanmayan bazı hücresel proteinlerin katlanması için gerekli olan karmaşık protein komplexleri

26
Q

GroEl ve GroEs

A

ŞAPERONİN ÖRN
E.COLİ DE BULUNUR

27
Q

Bazı proteinlerin katlanma yolakları izomerleşme tepkimelerini katalizleyen 2 enzime ihtiyaç duyar.Bu enzimler

A

1.Protein Dİsülfid İzomeraz PDİ
2.Peptid prolil cis trans izomeraz PPİ

28
Q

Bu hastalıklara amiloidozlar adı verilir

A

Tip 2 diyabet
* Alzheimer
* Hungtington
* Parkinson

29
Q

Protein katlanması sonucu oluşan amiloidoz hastalıklar nasıl oluşur?

A

1.Çözünür yapıdaki bir protein yanlış katlanma sonucu çözünmeyen bir proteine dönüşür.
2.Hücre dışında amiloid lifleri birikir
3.Lifler 7-10 nm çapta ve yüksek oranda b tabaka yapısı

30
Q

Proteinin ligandına tersinir olarak bağlanmas

A

oksijen bağlayan proteinler

31
Q

Protein tarafından tersinir olarak bağlanan moleküle

A

LİGAND denir

32
Q

ligandın bağlandığı bölge

A

bağlanma bölgesi

33
Q

Enzimler diğer molekülleri bağlar ve kimyasal olarak değiştirir. Enzimlerin
etkilediği moleküller ligand değil substrat olarak adlandırılır. Ligand bağlayan
bölgesi de katalitik bölge veya aktif bölge olarak adlandırılır

A
34
Q

Hem =

A

protoporfirin + ferröz demir

35
Q

protoporfirin

A

Protoforfirin dediğimiz yapı ferröz durumda (Fe+2) tek bir demir atomunun
bağlandığı durumdur

36
Q

Miyoglobinin oksijene afinitesi hemoglobinden daha

A

yüksektir

37
Q

CO serbest hem molekülüne O2 den 20.000 kat daha
fazla bağlanır.

A
38
Q

yüzde 78 alfa sarmal yaoısında bir hem bir polipeptid zinciri içeren kas proteini

A

miyoglobin

39
Q

miyoglobinin hem grubuna bağlı olan aa

A

HİSTİDİN

40
Q

hemositoblast

A

İnsanda bulunan eritrositlerin kök hücreleri

41
Q

Allosterik protein

A

bir bölgeye bir ligand bağlandığında farklı bir bölgenin bağlanma özelliklerinin etkilendiği
proteinlere denir

42
Q

c=o grup ismi

A

karbonil

43
Q

n-c

A

karboksil amin

44
Q
A