Programme Jaune Flashcards
Def cellule 1838
C’est l’unité structurale et fonctionnelle des organisme vivants
Système optique
Pouvoir de resolution, observation coloré c’est comme une source lumineuse condensé avec une lentille (min 10microm)
Type particulier epifluorescence et contraste de phase
Fluorochrome
Est une molecule flluorescente qui après avoir été excité réemet de la lumière à une longueur d’onde spécifique
Ex DAPI-bleu, FITC-vert, Rhodonamine-rouge
L’epifluorescence
Permet d’observer des elements fluorescent dans une cellule grace a un fluorochrome,
Ex le DAPI qui peut colorer le noyau
L’immunofluorescence
Anticorps couplé avec un fluorochrome pour se fixer a des anntigenes spécifique et donc le relever
MET
E- transmit, ceux qui sont passé au travers de l’objet qui vont aller jusqu’a un ecran phosphorescent, l’image mettra en evidence les structure plusou moins opaque aux electron en fonction de leur densité
Resolution : 0,08-nm0,04nm
MEB
E- secondaire, reflechit et detecter par le microscope
L’image mettra en evidence l’inclinaison des surfaces de balayage de l’echantillon, son relief
Les trauvaux de Griffith
1928 : sur bactérie, avec 2 forme R et S, quand Smorte melanger avec R vivantes - S revit : transformation
Travauxx Avery
1944 : meme que griffith mais avec DNases et proteases, impact sur ADN impact la bacterie donc l’ADN joue un role sur la transformation
Information genetique
Info codée dans l’ADN permettent le dvlpmt et le f°mt d’un organisme et transmise aux descendants. Il a un pouvoir pathogène, un pv sur les caractéristiques, sur la capacité/ efficacité a métabolisé de l’alcool, il contient un risque/ probabilité de dvlpé une maladie
Gene
Sequence de nucleotide qui sert à programmer la sunthèse d’un ARN et necessaire a au moins une fonction, certaine sequence d’un gene ne code pas forcement une prot, certaine partie vont coder la programmation d’utilisation du gene(=regulation ) En fonction des types cellulaires et du moment
L’ADN
Est un porteur de l’info génétique qui determine lles caractèristiques phénotypiques. Pour perdurer elle est transmise donc maintient et transmission de l’info génétique
L’ADN mais compo
C’est un polymère composé de 4 monomères differents relierr par des liaisons phosphodiester. Le brin d’ADN est orienté 5’P et 3’OH, la molécule d’ADN est constituer de 2 brins d’ADN complementaire et antiparallèles
Decouverte Watson et Crick
A l’aide de Rosalind Franklin : decouverte de la structure de l’ADN en double hélice, hélicoidale
Travaux de A.Kornberg
Travaux sur la synthèse d’ADN avec ADN polymerase bactérienne. donc pour repliquer l’ADN on a besoin de matrice ADN simple brin, amorce double brin, dNTP libre et ADN polymerase
Lecture 3’-5’, et synthèse 5’-3’, avec polymération d’un brin complémentaire
Meselson et Stalh
Replication semi-conservative en 1958, Analyse d’ADN après centrifugation sur gradient de chlorure de cesium, sunthèse d’ADN puis azote leger et lourd
Les molécules d’ADN se concentrent a l’endroit ou la densité est égale a leur propre densité
On a donc 3 pick L-lourd, l-leger, H-hybrid
Suite a la division cellulaire, dans la molecule d’ADN des cellules filles, ont trouve un brin d’ADN d’origine maternelle et un brin néo-synthètiser
La replication bidirectionnele
Au niveau des fragment d’Okasaki
Avec l’ADN polymerase avec une activité RNase va enlever l’ARN et le remplacer par l’ADN, puis l’ADN ligase va reformer les liaison Pdiester
Le chromosome bactérien
A un ADN double brin circulaire en un seul exemplaire, c’est un organisme haploide avec parfois des plasmide
Les plasmides
Sont des genomes surnumeraire porteur d’une info facultative, avec ADN double brin, circulaire, autoreplicatif, multicopies qui permettent de conferer un avantage selectif
Le genome
Le genome eukaryote est fragmenté. Il est composé de plusieurs chromosomes linéaires
Un chromosome
C’est unfragment d’ADN associé a des proteine constituant ainsi la chromatine, chaque chromo est present en 2 exemplaires ont a des chromosmes homologues diploides
Un gene
Un gene donner est present a un endroit precis, un locus sur les 2 chromosomes homologues, dans toutes les cellules des individu d’une espece donnée
Le locus d’un meme genes est different entre 2 especes
L’ADN informatif
Séquences transcrite et fonctionnelle du genome dont les genes codant (1-2%) qui vont codé des proteines et des genes non codant qui permettent la synthèse d’ARN mais non traduit
ADN non informatif
C’est le reste de l’ADN, ce sont des séquences régulatrices et introns, un ADN repetitif (≈60% du genome humain) et encore plein de chose qu’on ne sait pas a quoi sa sert
ADN repetitif
C’est un ensemble de regions constituer de séquences repetés soit en tandem (≈10%) qui ont un role structural (ex centromère) soit en repétition dispersé (≈45%)
Le noyau
C’est un organite intracellulaire délimité par une enveloppe (double mb) qui contient des chromosomes decomdenser
Souvent on a 1 noyau par cellule sauf exception (c muscu), il est au centre de la cellule et sa forme et taille varie en fonction des types cellulaires et de l’etat de la cellule
L’enveloppe nucleaire
Sert de frontière entre le nucleoplasme et le cytoplasme.
Il est composé de 2 mb, une interne et une externe, la mb externe et en continuité avec le REG, de plus elle est percé de pores nucléaires
Elle permet de reguler les echanges nucléo-cytoplasmique en laissant passé selectivement des molécules
Le nucleoplasme
Il contient la matrice nucleaire et la chromatine
Les pores nucléaires
Ce sont des interruptions de l’enveloppe nucléaire dans lequel se structurent des complexes proteiques
Le complexe pore nucléaire (CPB)
Ils sont constituer d’une 5ène de protéines( nucleoproteine). Il est former de 8 complexes identiques agencé pour formé une corbeille dont le diamètre peut croitre de 9-26nm
La chromatine
Elle est repartie dans l’espace nucléaire avec des zones dense (heterochromatine) et des moins dense (euchromatine)
Heterochromatine
Forme compacté de la chromatine correspond au region du genome inactif sur le plan transcriptionnel c’est en tassant des fibres
Euchromatine
Forme decondensé qui correspond au region active du genome, si on l’isole du noyau on obtient une forme en collier de perles
Les principales protéines associer au noyaux
On a les histones -H2A,H2B,H3,H4- ils vont constituer la basse du collier de perle, ce sont des protéine basique avec des AA basiques, il permettent la structure du nucléosomes
Le nucleosome
Est l’unité de base qui compose la chromatine, il est composé d’histone autour duquel est entouré de l’ADN, c’est l’association de 8 histones avec 2XH2A, 2XH2B, 2XH3, 2XH4, cela va constituer le coeur de l’histone, autour va s’enrouler 140-146 paire de base de l’ADN et entre ces structures ont a un ADN linkeur de 60pb
La fibre nucléosomique
Composé d’une succession de nucléosomes, de plus l’histone H1 qui va ssocier les nucléosomes voisins pour les compacté en structure solénoide (fibre : 30nm)
Un genome humain
Correspond a 3,2 Gpb, donc a chaque division la cellule a besoin de 6,4 milliard de dNTP et plus de 60 million de chaque histone
Territoire chromosomique
Ce sont des chromosomes localisés de façon précise dans le nucléoplasme
Le nucléole
C’est un élement très dense, unique, il refletent l’activité métabolique de la cellules, il a un role dans la biogénèse des ribosomes avec les synthèse des ARNr et la formation des sous-unités ribosomiques
Il va s’organiser autour des 10 regions chromosomiques contenant le gene ARNr-45s, il est donc une region nucléaire, qui contient aussi des ARNr car c’est le lieux de production
Les protéines ribosomiques
Ils vont dans le noyau/nucléole pour associer au ARNr qui forme les 2 sous unités qui sont s’assemblé autour de l’ARNm dans le cytoplasme
Organique
Compartiment cellulaire delimiter par 1 ou 2 mb
La membrane plasmique
C’est une frontière perméable entre exterieur et interieur de la cellule, va controler les échange cellulaire
Modèle d’étude de la membrane plasmique
Avec hématie des mammifères car pas dde noyau ou organite. On va séparé/ vidé la cellule de sont contenue interne avec un milieu hypotonique avec de l’eau pour faire un choc hupotonique ce qui va provoquer une lyse cellulaire
Ensuite centrifugation, la mb va faire le culot et le reste c’est le surnageant
Et durant l’étude du culot on va trouver les fantome d’hématie qui font nous permettre d’étudier la composition de la mb : lipides, protéines et glucides
Les lipides membranaires
Insoluble dans l’eau, groupe hétérogènes, soit amphiphile ou hydrophobe
Dans la membrane on a les Plipides, glycolipides et cholesterol
Les protéines
Polymères constituer d’une succesion d’AA, associer par des liaisons peptidique
Les proteines membranaires en fonction de leur masse on peut les séparer avec l’electrophorèse sur gel de polyacrylamine
Liaison peptidique
Relier la fonction OH avec NH2
Les différentes structures
Structures primaires : enchainement des AA
Structures secondaires : helice alpha, feuillet beta
Structure tertiaire : ensemble de la structure dans l’espacede la protéines
Structure quaternaire : association de plusieurs proteines
Les glucides membraniare
Glycoproteine : polymères de sucre qui s’associe aux proteines
Glycolipides : polymères de sucre qui s’associer aux lipides
On les trouve sur la face extra-cellulaire de la membrane
Organisation moléculaire des lipides
Les lipides font des mono/bi-couche car amphiphile donc hydrophobe a l’interieur.
Il s’organise soit un micelle, en double feuillet ou en liposomes
L’ultrastructure de la mbavec le modèle mosaique
Modèle organisation mosaique fluide donné par Singer et Nicholson en 1972, demontre s’une mb est une structure fluide, composé de 2 feuillet lipidique avec des protéines intrinsèque et extrinsèque qui peuvent etre associer avec des glucide
La cryofracture
Pour mieux observer les proteines mb
On va congeler l’échantillon brusquent dans l’azote ou du propane liquide puis on va le fracturé au hasard a froid et sous vide, a la fin on obtiendra une relique qu’on observera au MET ou on pourra determiner les différentes protéines membranaire
La fluidité de la membrane
Est plus ou moins fluide en fonction de la nature ddes lipides qui la compose, va dependre de la taille des chaine d’AG, de leur saturation (plus saturé - moins fluide) et de la teneur en cholesterol (plus cholesterol - plus rigide), et depend aussi de la Tm des lipides
Flipflop
Passage d’un lipide d’une hémimembrane a une autre
La diffusion des proteines
Experience de 1970 qui utilise des hétérocaryon (fusion cellule humaine et cellule de souris avec anticorps fluorescent)
Le transport passif
Pas d’énergie, sens gradient avec une diffusion simple (lent, pas de saturation, pas d’inhibition, pour petite molécule)
Et une diffusion facilité (avecc prot, selectif, perméase, pore/canaux, aug vitesse passage, saturable, possible inhibition)
Transport actif
Pour grosse mol non-chargé et ions, besoin énergie, et transporteur, contre gradient, E par ATP(primaire) ou passage mol dans le sens du gradient avec cotransport (secondaire)
Endocytose
Pinocytose : pour liquide, et plusieurs
Phaocytose : grosse molécules comme bactéries
Exocytose
Voie constitutive : fusion avec mb, petite molécules, non reguler
Voie controler : cellule spécifique avec exocytose de façon organisé
REL et REG
Role : synthèse protéines secrété et prot mb,
REG : car avec ribosomes, prolongement de l’enveloppe nucléaire
REL : role de nv b avec insertion lipides dans la mb existante et autophagie
On a un mvmt de Plipide (choline/serine) avec scromblase, flipase et flopase qui participe a l’asymétrie de la mb existante
Appareil de golgi
Empilement saccule golgien = dyctiosome
3 region : trans/median/cis- golgi
Role : controle dvlpmt des vesicules dans la cellule, maturation des prot, tri cellulaire et mise en place de l’asymétrie des lipide dans la mb
Lysosome
Polymorphe, contient hydrolase acide (digère tout)
Role hétérophagie et autophagie
Milieu acide - riche en protons
Hétérophagie
Digestion de ce qui vient de l’interieur de la cellule,
Production d’endosome qui vont fusionner avec le lysosome et digérer par endocytose ou phagocytose
Pour la mito elle est entouré par le RE qui fusionne avec lysosome
Vacuole
2 mb comme noyau/ mito, permet le stockage
