Phylogénie Flashcards
Qu’est ce que la biodiversité?
Diversité des être vivants qui varie spacialement et temporellement
Qu’est ce que la systématique?
Discipline une science qui se charge de classer les etre vivants en se basant sur leurs nomenclature et leur taxonomie
Nomenclature?
La nomenclature a été mise en place par le savant Carl Van Limmé au 18ème sciecle.
Nommer les escpèces
nomenclature binomiale
Taxonomie?
Classification au sens stricte à pour objetif de regrouper les êtres vivants au sein de taxon et ordonner ses taxons les un par rapport au autre
Taxon?
Ensemble des organismes reconnu et défini dans chacune des catégories de la classification biologique hiérarchisé
Espèce ?
Ensemble des organisme intérfecond. Capble de se reproduire entre eux et donner une descendance fértile.
Classification ?
objt definition de taxons et fait partie d’un processur systématoque ca veut dire que l’on va regrouper les taxon par ressemblance ou parenté.
un trie?
C’est quand on regroupe les organisme selon différents critéres , afin d’aboutir à leur détermination
quelle sont les classifications les plus anciennes ?
utilitaires et alphabétique
Quel est le problème avec la classification de Linné?
-critére choisit arbitrairement
-ordre de l’utilisation des critéres si on change l’ordre on change la classification
C’est quoi la classification utilitaire ?
si la plante est veineneuse ou pas ?
par rapport à son utilité
C’est quoi la classification fonctionelle?
Classification par caractére physiologieque ( lié au fonctionnement de l’organisme ou écologique, sa place dans l’écosystème)
C’est quoi la classification philogénique ?
Classification en lien avec la théorie de l’évolution (qui est + proche parents de qui ?
Quel caractére ont utilise pour la classification ?
fonctionnel, morphologieque, anatomique, embryologique , biochimique, moléculaire.
C’est quoi une analogie ?
C’est quand deux caractéres ont le même état dans différents taxon
HOMOLOGIE?
état de caractére qui a été hérité d’un ancêtre commun
HOMOLOGIE 2 état
Etat ancéstrale ou plésiomorphe
Etat dérivé ou apomorphe - état différent de l’ancêtre commun innovation évolutive
C’est quoi une synapomorphie ?
etat de caractére derivéé et partagée par plusieurs taxons et hérité du même ancêtre commun.
C’est quoi une symplésiomorphie?
Etat ancéstral de caractére partagée par plusieurs taxon
Que doit maximiser une vraie classification évolutive :
maximiser les synapomorphies
HOMOPLASIE
C’est lorsque 2 état de cractère qui se ressemble ne sont pas hérité d’un ancêtre commun.
Les deux types d’homoplasie
Convergence évolutive
lien avec la séléction naturelle pour survivre
Révertion retour de l’état dérivée à l’état ancestrale
C’est quoi le parallélisme?
état de caractére pas hérité d’un ancêtre commun mais relativement proche ( rongeur se ressemble mais on pas d’ancêtre commun)
Classification phénétique
calcule d’un indice de similitude globale entre taxon (distance entre taxons)
construction d’une matrice de distance
pour produire un arbre phénétique
longueur des traits proportionnelle ànla distance génétique calculée
(intéressant pour les caractére moléculaire)
méthode probabiliste ?
évolation des états de cractére exprimé en probabilité
c’est celui avec le plus de vraisemblance qui être choisie
difficile à appliqué pour les carctére morphologie aucune idée des probabilité de transfo d’un etat à un autre .
Quelle est le problème de la classification évolutionniste
regroupement espèce qui partagent les mêmes caractéres homologue
accepeteraient un regoupement de syplésiomorphie = groupe paraphylétiques ( ne contient pas tout les ancêtres commun exclusif au groupe)
Calssification phylogénique
=clasidiques
les taxons sont des clades
on regroupe sur la base de synapomorphie les caractére sont homologue et d’état dérivée.
monophylétique
construit en utilisants des synapomorphie
paraphylétique
en utilisant une symplésio morphie (ancêtre du groupe et une partie seulement des descendants. )
polyphylétique
aucun ancêtre commun à tout les membres du groupe
ca sert quoi la phylogénie?
chercher la parenté donc le groupe frére et non l’ancêtre.
Il sagit de chercher pour un groupe donné le groupe avec lequel il partage un ancêtre exclusif parmi l’échantillon
Comment trouve t’on les états plésiomorphe et amorphe?
1- Grace à l’extragroupe
extérieur au groupe d’étude il posséde l’état asêstrale de tout les carctére étudié
C’est quoi le critère ontogénique ?
lors d’un developpement embryonnaire les caractéres généraux avant les caractéres plus particulier.
Pour polariser un caractére il suffit de déterminer lequel va pparaitre en premier.
Comment les fossils aident à identifié les caractéres plésiomorphe et apomorphes ?
hypothèse sur les caractères ancéstraux , en mettant en évidence l’apparition de forme derivée abscente chez les fossils
c’edt quoi al détermination a posteriori?
extragroupe est pas utilisé car pas deffinisable ou trop loin des espèces etudié , on fait un arbre sur la base de la probabilité en partant d’un modèle évolutif (par exemple à l’aide de fossil. C’est à partir de l’arbre qu’on va polariser des caractére.
c’est quoi le principe de parcimonie?
l’arbre considérer le plus vraisemblable est celui avec la moins de pas évolutif .