Pan-genomique Flashcards
EBI
European bioinformatics institute, Cambridge Angleterre
NCBI
National center for biotechnology information,
Bethesda USA
Pubmed
Recherche biblio
Affiche les articles scientifiques dans ordre décroissant
Refseq
Banque de données spécialisé :
Séquences des Genes
Fournit la séquence de référence
Genbank
Banque de données spécialisées :
Séquences des gènes
dbSNP
Variations polymorphes de l’ADN
Uniprot
Séquences et fonctions des protéines
Genatlas
Banque de donnés spécialisée :
France
Structure intron-exon d’un gène
DDBJ
Banque de données primaires au Japon
ENA
Banque de données primaires en Europe
Genbank
Banque de données primaires au USA par le NCBI
Genecards
Photographie d’un gène: toutes les infos connus et catégorisés
UCSC Génome Browser
Outil de cartographie du génome
Université de californien stanford USA
Structure du gène
GÉO
Gêne Expression Omnibus, NCBI
Base de dépôt
Résultat CGH-Array + biopuces expr
Array-Express
Base de dépôt
Résultat de chaque expérience d’hybridation
Primer 3
Trouver des amorces de PCR
Nouvelle amorce in silico
Pour deter la séquence des amorces
Alamut
Trouver des amorces de PCR
Nouvelles amorces in silico
Visualiser la représentation d’un gène
Blast
Vérifie la spécificité des amorces
Comparaison des séquences
COSMIC
Connaître les mutations d’un gène dans les pathologies cancéreuses
OMIM
Connaître les pathologies liées à une gêne
Orphanet
Trouver une prise en charge de pathologie rare ou de diagnostique mutationnel
France
Permet de trouver une consultation en Europe
Pas d’info sur le gêne en 1ere intention