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Microbiologie (MCB-1908) COPY:) > Nutrition et culture bactérienne > Flashcards

Nutrition et culture bactérienne Flashcards

1
Q

Selon quels critères peut-on classer les bactéries?

A
  • Type trophique
  • Croissance en présence d’O2
  • Température de croissance
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Q

Quels sont les 12 éléments majeurs essentiels à la croissance des bactéries?

A
  • C (carbone)
  • Ca (calcium)
  • Cl (chlore)
  • Fe (fer)
  • H (hydrogène)
  • K (potassium)
  • Mg (magnésium)
  • N (azote)
  • Na (sodium)
  • O (oxygène)
  • P (phosphate)
  • S (souffre)
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Q

Quels sont les 6 éléments les plus fréquents qui représentent 95% de la matière organique?

A
  • Carbone
  • Oxygène
  • Hydrogène
  • Azote
  • Souffre
  • Phosphate
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4
Q

Quel autre nom donne-t-on aux éléments mineurs?

A

Oligoéléments

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5
Q

Pourquoi appelle-t-on les éléments mineurs ainsi?

A

En raison de leur concentration, mais pas de leur importance

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6
Q

Quels sont les 8 éléments mineurs?

A
  • Co (cobalt)
  • Cu (cuivre)
  • Mn (manganèse)
  • Mo (molybdène)
  • Ni (nickel)
  • Se (sélénium)
  • Zn (zinc)
  • W (tungstène)
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7
Q

En général, sous quelle forme sont assimilés les éléments?

A

Sous forme de sels inorganiques

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8
Q

Quels éléments sont des exceptions et ne sont pas assimilés sous forme de sels inorganiques?

A
  • Souffre
  • Azote
  • Carbone
  • Hydrogène
  • Oxygène
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9
Q

Sous quelles formes est assimilé le souffre?

A

SO4 ou S2O3

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10
Q

Quel type de bactérie forme une exception et assimile le souffre sous forme de H2S pour former du CH4?

A

Archaebactéries méthanogènes

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11
Q

Sous quelle forme est assimilé l’azote?

A

NH3

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12
Q

Quel type de bactérie forme une exception et assimile l’azote d’une autre manière?

A

Les bactéries fixatrices d’azote (azobacter, rhizobium) qui utilisent le N2 pour le transformer en NH3

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13
Q

Sous quelles formes sont assimilés le carbone, l’hydrogène et l’oxygène?

A

Matière organique (source de carbone) et H2O

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14
Q

Quel type de bactérie forme une exception et assimile le carbone d’une autre manière?

A

Les autotrophes utilisent le CO2 pour produire de la matière organique

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15
Q

Entre le catabolisme et l’anabolisme, lequel produit de l’énergie?

A

Le catabolisme

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16
Q

Quel est le but principal de l’anabolisme?

A

Transformation du glucose afin de produire des structures cellulaires qui vont permettre à la cellule de se diviser

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17
Q

Quelles sont les 4 utilisations de l’énergie dans la cellule autre que la production du matériel cellulaire?

A
  • Biosynthèse et polymérisation
  • Transport actif
  • Motilité
  • Maintien de la balance osmotique
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18
Q

Quelles doivent être les concentrations de H+ et K+ dans la cellule?

A
  • K+ plus grande à l’intérieur

- H+ plus grande à l’extérieur

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19
Q

Comment peut-on classer les bactéries selon leur source d’énergie?

A
  • Chimiotrophes (source de l’oxydation de composés organiques ou inorganiques)
  • Phototrophes (source lumineuse)
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20
Q

Comment peut-on classer les bactéries selon leur source de carbone?

A
  • Autotrophe (utilisent CO2 atmosphérique)

- Hétérotrophe (utilisent matière organique)

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21
Q

Quelle est la forme de carbone la plus oxydée?

A

CO2

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22
Q

Pourquoi même en présence de CO2, les autotrophes doivent trouver leur énergie ailleurs?

A

Car même si le CO2 est source de carbone, il n’est pas une source d’électrons, d’hydrogène ou d’énergie

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23
Q

Comment peut-on classer les bactéries selon leur source d’électrons?

A
  • Litotrophes (molécules inorganiques réduites)

- Organotrophes (molécules organiques)

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24
Q

Nommer un exemple d’organisme photoautotrophe.

A

Cyanobactérie

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25
Q

Nommer un exemple d’organisme chimioautotrophe.

A

Thiobacillus

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26
Q

Nommer un exemple d’organisme photohétérotrophe.

A

Bactéries vertes photosynthétiques

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27
Q

Quel est l’accepteur final d’électron chez les organismes aérobies stricts?

A

O2

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28
Q

Quels sont les 5 types de bactéries selon leur rapport à l’oxygène?

A
  • Aérobie strict
  • Anaérobie facultative
  • Aérotolérant
  • Anaérobie strict
  • Microaérophile
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29
Q

Quel type d’organisme est représenté sur l’image?

A

Aérobie strict

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30
Q

Quel type d’organisme est représenté sur l’image?

A

Anaérobie facultatif

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31
Q

Quel type d’organisme est représenté sur l’image?

A

Aérotolérant

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32
Q

Quel type d’organisme est représenté sur l’image?

A

Anaérobie strict

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33
Q

Quel type d’organisme est représenté sur l’image?

A

Microaérophile

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34
Q

Quel est l’accepteur final d’électrons chez les anaérobies stricts?

A

Produit final de la fermentation

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35
Q

Quelle est la forme toxique de l’O2?

A

O2- (ions du peroxyde)

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36
Q

Quelles sont les 3 enzymes qui éliminent les formes toxiques de l’O2?

A
  • Superoxydase dismutase (SOD)
  • Catalase
  • Peroxidase
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37
Q

Quelle réaction catalyse le SOD?

A

Transforme le O2 - en peroxyde et oxygène

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38
Q

Quelle réaction catalyse la catalase?

A

Transforme le peroxyde en H2O et oxygène

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39
Q

Quelle réaction catalyse la peroxidase?

A

Transforme le peroxyde en eau à l’aide du NADH

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40
Q

Pourquoi les anaérobies stricts ne possèdent pas d’enzymes comme la SOD?

A

Car ces enzymes favorisent la transformation en oxygène et ces organismes ne tolèrent pas l’oxygène

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41
Q

Vrai ou faux. Autant chez les aérobies que anaérobies, la croissance diminue si la concentration en O2 devient plus grande que 20%.

A

Vrai

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42
Q

Quel processus a lieu chez les aérobies stricts?

A

Respiration aérobie

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43
Q

Quel processus a lieu chez les anaérobies stricts?

A

Fermentation

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44
Q

Quels sont les organismes les plus polyvalents en fonction de la concentration d’O2?

A

Les anaérobies facultatifs

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45
Q

Quel processus a lieu chez les anaérobies facultatifs?

A

Respiration ou fermentation (utilise le métabolisme le plus rentable selon les conditions)

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46
Q

Nommer un exemple bien connu d’anaérobie facultatif.

A

E. Coli

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47
Q

Retrouve-t-on les enzymes SOD, catalase et peroxydase chez les anaérobies facultatifs?

A

Oui

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48
Q

Y a-t-il plus de fermentation ou de respiration chez les anaérobies facultatifs?

A

Plus de respiration

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49
Q

Y a-t-il plus de fermentation ou de respiration chez les aérotolérants?

A

Fermentation exclusivement

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50
Q

Retrouve-t-on les enzymes SOD, catalase et peroxydase chez les aérotolérants?

A

Oui

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51
Q

Quelle est la relation des aérotolérants face à l’O2?

A

Ils tolèrent la présence d’O2 sans l’utiliser

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52
Q

Sous quelles conditions les microaérophiles peuvent-ils croitre?

A

Exclusivement en présence de faible concentration de O2 (entre 2 et 10%)

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53
Q

Quel processus retrouve-t-on chez les microaérophiles?

A

Respiration aérobie

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54
Q

Quels sont les 5 types de bactéries selon leur température optimale de croissance?

A
  • Psychrophiles
  • Psychrotrophes
  • Mésophiles
  • Thermophiles
  • Thermophiles extrêmes
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55
Q

Quelle est la température optimale des psychrophiles?

A

Entre 10 et 15 C

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56
Q

Les psychrophiles peuvent exister jusqu’à quelle température?

A

-20 C

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57
Q

Dans quel type d’environnement retrouve-t-on les psychrophiles?

A

Les océans, glace, neige

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58
Q

Dans quel éventail de température retrouve-t-on les psychrotrophes?

A

Entre 20 et 30 C

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59
Q

Quels autres noms peut-on donner aux psychrotrophes?

A

Psychrotolérants, psychrophiles facultatifs

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60
Q

Dans quel éventail de température retrouve-t-on les mésophiles?

A

Entre 20 et 45 C

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61
Q

Quelle est la température optimale de la plupart des pathogènes humains?

A

37 C

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62
Q

Quelle est la température optimale de la plupart des pathogènes aviaires?

A

42 C

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63
Q

Dans quel éventail de température retrouve-t-on les thermophiles?

A

Entre 45 et 85 C

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64
Q

Quelle est la température optimale des thermophiles?

A

50-60 C

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65
Q

À quelle température retrouve-t-on les thermophiles extrêmes?

A

Plus élevé que 85 C

66
Q

À quel endroit particulier retrouve-t-on beaucoup de thermophiles extrêmes?

A

Dans les cheminées hydrothermales

67
Q

Quel est le pré-requis important d’un milieu de culture?

A

La stérilité du milieu (absence de microorganismes)

68
Q

Quels sont les 2 types de culture?

A
  • Pure

- Mixte

69
Q

Est-ce qu’une culture mixte constitue un type de contamination et pourquoi?

A

Non, parce qu’on choisit nos microorganismes et on connait les composantes de départ

70
Q

Qu’est-ce qu’un facteur de croissance?

A

Précurseur essentiel qui ne peut être synthétisé par la bactérie d’intérêt (doit être ajouté au milieu de culture)

71
Q

Nommer quelques exemples de facteurs de croissance.

A
  • Vitamines
  • Acides aminés
  • Purines et pyrimidine
72
Q

Comment fait-on pour mesurer la quantité de microorganismes dans une culture en milieu liquide?

A

En mesurant le trouble dans la bouteille/tube

73
Q

Quel agent gélifiant est souvent utiliser dans les géloses?

A

Agar (0,5-1,5%)

74
Q

Quelles sont les températures de solubilisation et de gélification de l’agar?

A
  • Solubilisation 100 C

- Gélification 45 C

75
Q

Comment peut-on cultiver en gélose les bactéries dégradant l’agar?

A

Utilisation d’un autre agent gélifiant comme le gel de silice

76
Q

Quelle est la définition de la stérilisation?

A

Élimination de toutes formes vivantes incluant les endospores

77
Q

Par quoi est influencée l’efficacité de la stérilisation par la chaleur?

A
  • Température
  • Durée
  • Humidité
  • Nombre et état des microorganismes
78
Q

Vrai ou faux. Une flamme peut atteindre 1275 C.

A

Vrai

79
Q

Quel nom peut être donné au four à air chaud (chaleur sèche)?

A

Four Pasteur

80
Q

Quelles températures sont utilisées dans le four Pasteur?

A

160-170 C

81
Q

Entre la chaleur sèche et la chaleur humide, quelle est la plus efficace?

A

Chaleur humide car elle est plus pénétrante

82
Q

Quel appareil utilise la chaleur humide pour stériliser?

A

Autoclave

83
Q

Vrai ou faux. Dans l’autoclave, il y a perte des endospores.

A

Vrai

84
Q

Pourquoi ne peut-on pas stériliser au micro-ondes?

A

Car il n’y a pas de chaleur uniforme

85
Q

Quel est l’effet de l’utilisation de radiations ionisantes?

A

Induit des dommages à l’ADN

86
Q

Quel est l’effet des rayons y sur l’ADN?

A

Bris des 2 brins d’ADN

87
Q

Vrai ou faux. Les rayons UV sont pénétrants.

A

Faux

88
Q

Vrai ou faux. Les rayons y sont pénétrants.

A

Vrai

89
Q

Quel type d’installation doit être utilisé pour utiliser des rayons y?

A

Des parois couvertes de plomb pour empêcher les rayons gamma de se propager

90
Q

Quelles utilisations sont faites à l’aide des rayons gamma (y)?

A

Conserves et épices

Objets à usage unique: pipettes, pétris
(plastiques thermosensibles)

91
Q

Quel est l’effet des rayons UV sur l’ADN?

A

Dimérisation thymine-thymine (bloque la réplication et la transcription)

92
Q

Quelles installations doivent être utilisées pour travailler avec des rayons UV?

A

Enceintes de biosécurité

93
Q

Quel application peut être faite avec les rayons UV?

A

Usine de traitement d’eau (exposition de l’eau à une source d’UV diminue le nombre de bactéries)

94
Q

Quel type de filtre peut être utilisé pour stériliser?

A

Filtre de nitrocellulose

95
Q

Quelle est la porosité du filtre de nitrocellulose?

A

0,22-0,45 u

96
Q

Vrai ou faux. Les virus passent au travers du filtre de nitrocellulose.

A

Vrai (ils sont trop petits)

97
Q

Quels types de gaz stérilisant peuvent être utilisés?

A

Oxyde d’éthylène et ozone

98
Q

De quoi doit ternir compte la méthode d’enrichissement choisie?

A
  • Proportions de l’espèce d’intérêt
  • Vitesse de croissance
  • Caractéristiques spécifiques/discriminante
99
Q

Quelles sont les 3 méthodes permettant d’enrichir/sélectionner un microorganisme d’intérêt?

A
  • Chimiques
  • Physiques
  • Biologiques
100
Q

Nommer une méthode chimique de sélection.

A

Inhiber une source de carbone ou d’azote selon le type trophique de l’organisme

101
Q

Quelles substances inhibitrices peuvent être utilisées pour sélectionner chimiquement un m.o. d’intérêt?

A
  • Violet de cristal
  • Alcool phényléthylique
  • Sels biliaires
102
Q

Qu’inhibent le violet de cristal et le vert brillant?

A

Les bactéries à Gram +

103
Q

Qu’inhibe l’alcool phényléthylique?

A

Les bactéries à Gram -

104
Q

Qu’inhibent les sels biliaires?

A

Les organismes non intestinaux

105
Q

Comment pourrait-on mettre en évidence caulobacter?

A

En utilisant un milieu oligotrophes (pauvre en nutriments)

106
Q

Dans quel type de milieu retrouve-t-on caulobacter?

A

Dans un milieu dilué (eau douce)

107
Q

Nommer un exemple de sélection par méthode physique.

A

Traitement à la chaleur à 80 C pendant 10 min, élimine les cellules qui n’ont pas d’endospores

108
Q

Pourquoi doit-on parfois avoir recours à des méthodes biologiques comme méthode de sélection?

A

Car souvent c’est la seule façon de cultiver ces m.o.

109
Q

Nommer un exemple de symbiose.

A

Plante et rhizobium, infection avantageuse

110
Q

Vrai ou faux. Une colonie est toujours une culture pure.

A

Faux, ça dépend de plusieurs choses dont la complexité de notre échantillon

111
Q

Quelles sont les 3 types de techniques pour l’obtention d’une culture pure?

A
  • Striation sur milieu solide
  • Dilution et étalement en surface
  • Dilution et étalement en profondeur
112
Q

En quoi consiste la striation sur milieu solide?

A

Une série de strie successives sur une gélose, il y a épuisement quantitatif de la population

113
Q

Quelle est la principale limite de la striation sur milieu solide?

A

Proportion faible de l’espèce d’intérêt (s’il n’y a pas beaucoup de notre organisme, on peut le perdre à force de faire l’épuisement)

114
Q

En quoi consiste l’étalement en surface?

A

On prend chaque tube de dilution et on étale directement sur le milieu

115
Q

En quoi consiste l’étalement en profondeur?

A

On prend chaque échantillon de dilution et on les met dans une 2e gélose liquide qu’on coule sur un milieu gélosé

116
Q

Pour quel type de colonies l’étalement en profondeur peut être avantageux?

A

Des colonies envahissantes (car maintenant elles sont emprisonnées dans l’agar)

117
Q

Quelles sont les limites des dilutions séquentielles et étalement en profondeur/surface?

A
  • Proportion faible de l’espèce d’intérêt

- Bactéries thermosensibles (2e gélose de surface à 45 C)

118
Q

Quel est l’avantage de la technique de dilutions séquentielles suivi d’étalement?

A

La quantification (estimer proportion dans un échantillon environnemental)

119
Q

Si l’on observe des différences avec le microorganisme de départ/désiré, quelles sont les 2 explications possibles?

A
  • Contamination

- Mutation

120
Q

Selon quels critères peut-on classer les cutures en culture solide?

A
  • Taille
  • Marge (bord)
  • Élévation
  • Texture
  • Caractéristiques optiques
  • Pigmentation
  • Hémolyse
  • Fluorescence
121
Q

Selon quels critères peut-on classer les cutures en culture liquide?

A

◦ Quantité de croissance cellulaire
◦ Distribution (en surface, au fond, homogène)
◦ Texture (grumeaux, filaments)

122
Q

Qu’est-ce qu’un biofilm?

A

Forme de croissance ubiquitaire dans les envrionnements aqueux Biofilms :communautés microbiennes organisés, enchâssés dans des substances polymériques extracellulairess associées à des surfaces et possédant souvent des caractéristiques structurelles et fonctionnelles complexes

123
Q

De quoi sont enrobés les populations microbiennes présentes dans les biofilms?

A

D’une matrice de polymères extracellulaires où les cellules adhèrent les unes aux autres ou à une surface

124
Q

Comment appelle-t-on les biofilms avec la présence de plusieurs microorganismes?

A

Biofilms polymicrobiens

125
Q

Dans quelle structure très ancienne retrouvait-on des biofilms?

A

Stromatolite

126
Q

Pourquoi la croissance des biofilms est-elle plus rapide au bord de la colonie?

A

Car les gradients d’oxygènes, de nutriments et de produits sont différents aux bords

127
Q

Sur quels types de surfaces les biofilms peuvent-ils se développer?

A
  • Inorganiques (minérales, béton, etc.)
  • Organiques (cellules vivantes ou mortes)
  • Flocs (agrégats microbiens)
128
Q

Quels sont les avantages pour les bactéries à former un biofilm?

A
  • Accès privilégié aux nutriments
  • Création d’un microenvironnement
  • Favorise la croissance
  • Protection des cellules
129
Q

Entre les cellules planctoniques et sessiles, quelles sont pluricellulaire?

A

Sessiles

130
Q

Entre les cellules planctoniques et sessiles, quelles utilisent le quorum sensing?

A

Sessiles

131
Q

Qu’est-ce que le senseur de masse critique (quorum sensing)?

A

Quand les organismes atteignent une certaine quantité uniforme de la même espèce, il y a sécrétion de molécules qui influencent le comportement des cellules en permettant l’expression de gènes qui normalement ne s’expriment pas.

132
Q

Quelles sont les 5 étapes de formation du biofilm?

A

1) Attachement à une surface
2) Stabilisation de l’attachement
3) Formation de micro-colonies
4) Maturation du biofilm
5) Essaimage

133
Q

Vrai ou faux. L’attachement à une surface d’un biofilm est irréversible.

A

Faux, peut être réversible s’il n’y a pas de compatibilité entre le m.o. et la surface

134
Q

Qu’est-ce qui peut influencer l’attachement à une surface d’un biofilm?

A

◦ Surfaces
–Rugosité, micro-courants, nature de la surface : charges, hydrophobicité
(plastiques)
◦ Cellules
–Glycocalyx, fimbriae, adhésines, flagelles

135
Q

Quelles structures de la cellules sont impliquées dans l’attachement à une surface d’un biofilm?

A
  • Glycocalyx
  • Fimbriae
  • Adhésine
  • Flagelles
136
Q

Quels types d’interactions ont lieu dans la stabilisation de l’attachement du biofilm?

A
  • Cellules-cellules

- Cellules-surfaces

137
Q

Quel type de couche se forme dans la stabilisation de l’attachement du biofilm?

A

Monocouche

138
Q

Combien de couches de cellules se forment dans l’étape de formation de micro-colonies de biofilm?

A

3 à 5

139
Q

À quelle étape de formation du biofilm la matrice est-elle formée?

A

Étape de formation de micro-colonies

140
Q

Qu’est-ce que l’essaimage?

A

Une portion de la colonie se déplacer pour aller coloniser ailleurs

141
Q

Qu’est-ce qui peut causer l’abrasion du biofilm?

A

Bris mécanique

142
Q

Quelle est la conséquence de la présence de biofilms sur le système immunitaire?

A

Le phagocyte ne peut pas dégrader la matrice du biofilm donc la bactérie reste vivante

143
Q

Nommer des exemples de conséquences sur la santé humaine de la présence de biofilms.

A
  • Fibrose kystique
  • Maladies paradontales
  • Infections d’implants/prothèses/cathéters
  • Infections de lentilles cornéennes
144
Q

Quelles conséquences industrielles sont dûes à la présence de biofilms?

A
  • Diminution du débit des liquides (tuyau, aqueduc)

- Hausse de la corrosion des structures

145
Q

Quelle algue permet d’inhiber la formation de biofilms?

A

Delisea pulchra

146
Q

Comment delisea pulchra inhibe-t-elle la formation de biofilm?

A

En inhibant le quorum sensing

147
Q

Qu’est-ce que le cycle de Calvin-Benson?

A

Transformation de carbone inorganique (CO2) en carbone organique (glucose)

148
Q

Quel cycle utilisent les organismes autotrophes pour produire leur nourriture?

A

Le cycle de Calvin-Benson

149
Q

Quels composants importants retrouve-t-on dans le milieu MacConkey?

A
  • Sels biliaires
  • Cristal violet
  • Lactose
  • Rouge neutre
150
Q

Vrai ou faux. Les oligoéléments doivent être ajoutés au milieu de culture.

A

Faux, ils sont déjà présents à l’état de traces dans l’eau

151
Q

Certaines bactéries forment une exception et assimilent le souffre sous forme de quels acides aminés?

A
  • Cystéine

- Méthionine

152
Q

Vrai ou faux. L’azote peut également être assimilé sous forme d’acides aminés.

A

Vrai

153
Q

En quoi sont transformés les éléments nutritifs?

A
  • Matériel cellulaire

- Énergie

154
Q

Les macromolécules comptent pour combien de % du poids sec de la cellule?

A

96% (autre 4% = sels, intermédiaires métaboliques, précurseurs)

155
Q

Combien de protéines différentes retrouve-t-on dans une cellule?

A

Environ 1100

156
Q

L’eau compte pour combien de % du poids humide de la cellule?

A

70%

157
Q

À quelle température y a-t-il croissance lente des psychotrophes?

A

Entre 0-20 C

158
Q

Vrai ou faux. Les milieux gélosés permettent les échanges gazeux.

A

Vrai

159
Q

L’autoclave est une bonne approche pour … (2)

A
  • Préparation de liquides thermorésistants

- Conserves

160
Q

Quels types de liquides sont thermosensibles et doivent être stérilisés par filtration?

A
  • Sérum
  • Vitamines
  • Antibiotiques
161
Q

À quelle concentration doivent être présents les bioéléments majeurs?

A

10^-4 M

162
Q

Que doit contenir un milieu de culture

A

Tous les éléments nécessaires, en quantités suffisantes, pour permettre la croissance
◦ Sources d’énergie et de carbone
◦ Facteurs de croissance

Microbiologie (MCB-1908) COPY:) (11 decks)

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