Nutrition et culture Flashcards
(158 cards)
1
Q
Selon quels critères peut-on classer les bactéries?
A
- exigences alimentaires
- croissance en présence d’O2
- température de croissance
2
Q
Quels sont les deux classes de nutriments nécessaires à la croissance des bactéries?
A
- macronutriments (éléments majeurs)
- oligonutriments (éléments mineurs)
3
Q
Combien y a-t-il de bioéléments majeurs pour la croissance bactérienne?
A
12
4
Q
Quels sont les constituants majeurs (qu’one retrouve le plus) dans les macronutriments?
A
C, O, H, N, S, P
5
Q
Vrai ou faux, les macronutriments majeurs qui constituent la matière organique représentent 95% de la masse sèche de la cellule?
A
Vrai
6
Q
Quels sont les autres macronutriments à part le C, O, H, N, S, P?
A
K, Mg, Ca, Fe, Na, Cl
7
Q
À quoi sert le potassium (K) lors de la croissance bactérienne?
A
principale cation inorganiques servant de cofacteurs d’enzyme et nécessaire dans la synthèse protéique
8
Q
À quoi sert le magnésium (Mg) lors de la croissance bactérienne?
A
Sert de cofacteur d’enzyme et dans l’intégrité membranaire, présent dans la chlorophylle ainsi que dans la bactériochlorophylle
9
Q
À quoi sert le calcium (Ca) lors de la croissance bactérienne?
A
sert de cofacteur d’enzyme (protéases, amylases) utilise pour la synthèse du dipicolinate de calcium présent chez les endospores
10
Q
À quoi sert le fer (Fe) lors de la croissance bactérienne?
A
présent dans les cytochromes et autres protéines impliquées dans la bioénergétique
11
Q
À quoi sert le sodium (Na) lors de la croissance bactérienne?
A
sert pour le transport membranaire, il est aussi important pour les bactéries marines
12
Q
À quoi sert le chlore (Cl) lors de la croissance bactérienne?
A
principal anion inorganiques servant dans l’intégrité électrostatique
13
Q
De combien est la demande d’une bactérie en macronutriments?
A
de 10^-4 M ou 0,0001 mM
14
Q
Qu’arrive-t-il lorsqu’il y a absence de macronutriments?
A
il n’y a pas de croissance
15
Q
Combien y a-t-il d’oligonutriments nécessaires à la croissance bactérienne?
A
8
16
Q
Quels sont les oligonutriments?
A
Zn, Mn, Mo, Se, Co, Cu, Ni, W
17
Q
À quoi sert le Zinc (Zn) lors de la croissance bactérienne?
A
Sert à la polymérases utiles pour l’ADN et l’ARN
18
Q
Qu’arrive-t-il lorsqu’il n’y a pas de Zinc dans le milieu de croissance?
A
Il n’y a pas de croissance de la population bactérienne puisque le Zinc est nécessaire à la division cellulaire
19
Q
À quoi sert le manganese (Mn) lors de la croissance bactérienne?
A
présente dans la SuperOxyde Dismutase (SOD) qui transforme l’O2 en H2O2 (peroxyde) en présence de H+. Utile dans le photosystème II des cyanobactéries
20
Q
À quoi sert le molybdène (Mo) lors de la croissance bactérienne?
A
sert à la fixation du N2 et présent dans la nitrogénase
21
Q
À quoi sert le sélénium (Se) lors de la croissance bactérienne?
A
sert à la biosynthèse des acides aminés comme la sélénocystéine (Se-Cys)
22
Q
À quoi sert le cobalt (Co) lors de la croissance bactérienne?
A
sert à la biosynthèse des acides aminés comme l’acide glutamique (glu) et la vitamine B12
23
Q
À quoi sert le cuivre lors de la croissance bactérienne?
A
sert de cofacteur pour la syperoxyde dismutase (OD) et dans la bioénergétique de la cellule
24
Q
À quoi sert le nickel (Ni) lors de la croissance bactérienne?
A
sert de cofacteur pour la déshydrogénase utile dans les réactions d’oxydoréduction
25
À quoi sert le tungstène (W) lors de la croissance bactérienne?
sert de cofacteur pour la déshydrogénase utile dans les réactions d'oxydoréduction
26
Vrai ou faux: les bactéries ont besoin de grandes quantités d'oligonutriments dans leur environnement pour croître?
Faux, les bactéries ont besoin d'oligonutriments ayant des concentration très faible
27
Vrai ou faux: l'eau contient les concentrations d'oligonutriments nécessaires à la croissance bactérienne?
Vrai
28
Sous quelle forme chimique sont assimilés les bioéléments?
La majorité sont absorbés sous forme de sels inorganiques
29
Quels bioéléments ne sont pas absorbés sous forme de sels inorganiques?
C, O, H, S, N (grande partie des macronutriments)
30
Comment est assimilé le soufre?
Sous forme de SO4^-2 (sulfate) ou S2O3^-2 (thiosulfate)
31
Quels sont les bactéries qui assimilent le soufre de manière différente que sous forme de sulfate ou de thiosulfate et comment?
1. Archébactéries méthanogènes: utilisent le H2S et libèrent du CH4 (méthane)
2. autres bactéries: utilise les acides aminés contenant du soufre comme la cystéine et la méthionine
32
Comment est assimilé l'azote?
sous forme de NH3
33
Quels sont les bactéries qui assimilent l'azote de manière différente que sous forme de NH3 et comment?
1. bactéries fixatrices d'azote (Azobacters et les Rhizobium: utilisent le N2 et libèrent du NH3
2. autres bactéries: utilisent les acides aminés
34
Comment sont assimilés le carbone, l'oxygène et l'hydrogène?
sous forme de matière organique et d'eau
35
Vrai ou faux: tous composés organiques naturels sont dégradés par des microorganismes pour fournir leur bioéléments?
Vrai
36
Comment appelle-t-on les bactéries qui fournissement leur propre nutriments et comment?
les bactéries autotrophes: utilisent le CO2 dans le cycle de Clavin pour former leur matière organique
37
En quoi sont transformés les éléments nutritifs?
1. énergie
2. matériel cellulaire
38
Vrai ou faux: les macromolécules composent 96% du poids sec de la cellule bactérienne?
Vrai
39
Quelles sont les macromolécules qui composent 96% du poids sec de la cellule?
1. protéines (60%)
2. polysaccharides (5%)
3. lipides (9%)
4. ADN, ARN (22%)
40
De quoi est composé le 4% du poids sec de la cellules bactérienne?
de sels inorganiques, d'intermédiaires métaboliques et de précurseurs (ils sont rapidement changés en macromolécules)
41
Qu'est-ce que le métabolisme?
Ensemble des réactions biochimiques cellulaires: Métabolisme = catabolisme + anabolisme
42
Qu'est-ce que le catabolisme?
transformation des nutriments en métabolites
43
Vrai ou faux: les intermédiaires (précurseurs) sont en nombre restreints et commun à tous les organismes?
Vrai
44
Qu'est-ce que l'unité de la biochimie?
Que tous les intermédiaires métabolique sont les mêmes chez tous les organismes vivants
45
Que donne la transformation des nutriments en métabolites?
leur transformation produit de l'énergie sous forme d'ATP, de NADH et de NADPH
46
Qu'est-ce que l'anabolisme?
utilisation des intermédiaires et de l'énergie créés par le catabolisme pour la biosynthèse de macromolécules nécessaires au matériel cellulaire
47
Pour quels processus est utilisé l'énergie chez la bactérie?
1. biosynthèse et polymérisation
2. transport actif
3. motilité
4. maintien de la balance osmotique
48
À quoi sert le transport actif?
1. concentration de nutriments dans la cellule
2. élimination des déchets métaboliques
49
À quoi sert la biosynthèse et la polymérisation?
formation de macromolécules et structures cellulaires à partir de précurseurs
50
À quoi sert la motilité des cellules bactériennes?
déplacement vers les nutriments et éloignement des répulsifs
51
Vrai ou faux: le maintien de la balance osmotique permet de garder le K+ plus concentré à l'intérieur de la cellule qu'à l'extérieur et de garder le H+ plus concentré à l'extérieur qu'à l'intérieur?
Vrai
52
Selon quoi peut-on classer les types trophiques (types d'alimentation)?
1. sources d'énergie
2. sources de carbone
53
Quelles sont les sources d'énergie possibles et comment appelle-t-on les bactéries les utilisant?
1. Lumière: phototrophes
2. chimique: chimiotrophes
54
Quelles sont les sources de carbone possibles et comment appelle-t-on les bactéries les utilisant?
1. CO2: autotrophes
2. Matière organiques: hétérotrophes ou organotrophes
55
Comment appelle-t-on les autotrophes qui utilise la lumière comme source d'énergie?
Photoautotrophes
56
Comment appelle-t-on les autotrophes qui utilise l'énergie chimique comme source d'énergie?
Chimioautotrophes ou chimiolithotrophes
57
Les cyanobactéries sont des ___?
photoautotrophes
58
Thiobacillus sont des ___?
chimioautotrophes
59
Comment appelle-t-on les hétérotrophes qui utilise la lumière comme source d'énergie?
photohétérotrophes
60
Comment appelle-t-on les autotrophes qui utilise l'énergie chimique comme source d'énergie?
chimiohétérotrophes ou chimioorganotrophes
61
Les bactéries vertes photosynthétiques sont des ___?
photoautotrophes
62
Vrai ou faux: la majorité des microorganismes cultivés sont des chimiohétérotrophes?
Vrai
63
Vrai ou faux: les chimiohétérotrophes sont au sommet de la pyramide alimentaire?
Vrai
64
La capacité des bactéries à croître en présence d'O2 est dû à quoi?
1. leur métabolisme énergétique
2. la possibilité de neutralisation des formes toxiques de l'O2
65
Que sont les aérobies strictes?
bactéries pouvant croître seulement en présence d'O2. Elles font de la respiration aérobie exclusivement dû à l'accepteur finale des électrons qui est l'O2.
66
Que sont les anaérobies strictes?
Bactéries pouvant croître seulement en absence d'O2. Font de la fermentation et l'accepteur final d'électrons est le produit de la fermentation
67
Il y a accumulation de quelle molécule toxique chez les anaérobies strictes?
l'O2-
68
Pourquoi l'O2- est-il toxique pour les anaérobies strictes?
car c'est un puissant agent réducteur qui est nocif pour les enzymes.
69
Pourquoi les anaérobies strictes ne peuvent croître en présence d'O2?
car la SOD, la catalase ainsi que la peroxydase sont absente ou plus ou moins fonctionnelles, ce qui entraine une accumulation d'O2- ou de peroxyde d'hydrogène qui sont tous deux de puissants réducteurs.
70
Vrai ou faux: la présence d'O2 peut aussi être toxique pour les aérobies strictes?
Vrai, il y a croissance seulement si les concentrations d'O2 sont inférieures à 20%
71
Quelle est la fonction de la SOD?
transformer l'O2- en peroxyde d'hydrogène et en O2 en utilisant les H+:
2O- + 2H+ → H2O2 + O2
72
Quelle est la fonction de la catalase?
transformer le peroxyde d'hydrogène en eau et en O2:
2H2O2 → 2H2O + O2
73
Quelle est la fonction de la peroxidase?
transformer le peroxyde d'hydrogène en eau en utilisant de l'énergie:
H2O2 + NADH + H+ → 2H2O + NAD+
74
Que sont les anaérobies facultatives?
bactéries pouvant croître en présence ou en absence de O2 et pouvant faire de la respiration ou de la fermentation tout dépendant des conditions. Elles adoptent leur métabolisme selon ce qui est le plus rentable
75
Quel est le métabolisme le plus rentable entre la fermentation et la respiration?
La respiration est la plus rentable énergétiquement
76
Vrai ou faux: chez les anaérobies facultatives, il y présence de la SOD, de la catalase et de la peroxidase?
Vrai
77
Que sont les aérotolérantes?
bactéries pouvant croître en présence ou en absence de O2. Elles tolèrent l'O2, mais ne l'utilisent pas. Elles font de la fermentation exclusivement
78
Vrai ou faux: les aérotolérantes peuvent faire de la respiration?
faux, elles font exclusivement de la fermentation, même en présence d'O2
79
Que sont les microaérophiles?
bactéries pouvant croître seulement en présence de faible concentration d'O2 (entre 2% et 10%). Elles font de la respiration aérobie, mais leurs activités enzymatiques essentielles sont sensibles au O2
80
Quelles sont les concentrations d'O2 nécessaires pour les microaérobies?
entre 2% et 10% d'O2
81
Pourquoi les microaérobies ne tolèrent pas les concentration trop élevées d'O2?
Car elles ont beaucoup moins de SOD que les aérobies strictes
82
Que sont les psychrophiles?
bactéries pouvant croître à des températures entre 0 et 20 °C avec une température de croissance optimale entre 10 et 15 °C
83
Où retrouve-t-on les psychrophiles?
dans les océans, la neige ou la glace
84
Comment appelle-t-on les biologistes qui étudient les microorganismes qui vivent en dehors de la terre?
les exobiologistes
85
Vrai ou faux: les exobiologistes de la NASA et de l'ASE étudient les psychrophiles de Titan, Encedalus et Europa?
Vrai
86
Que sont les psychrotrophes (psychrotolérants, psychrophiles facultatifs)?
bactéries vivant à des températures entre 20 et 30 °C. Elles sont une croissance lente entre 0 et 20 °C
87
Que sont les mésophiles?
bactéries vivant à des températures entre 20 et 45 °C
88
Les pathogènes humains et les pathogènes aviaires sont des ___?
des bactéries mésophiles
89
Les pathogènes humains ont une température de croissance de combien?
37 °C
90
Les pathogènes aviaires ont une température de croissance de combien?
42 °C
91
Que sont les thermophiles?
bactéries vivant à des températures entre 45 et 85 °C. Elles ont une croissance optimale entre 50 et 60 °C
92
Où retrouve-t-on les thermophiles?
dans des sources d'eau chaudes ou dans le fumier
93
Que sont les thermophiles extrêmes?
bactéries vivant à des températures de plus de 85 °C
94
Les pyrodictyum sont des ___ et ont une température de croissance de ___?
sont des thermophiles extrêmes ayant une température de croissance de 110 °C
95
La souche 121 sont des ___ et ont une température de croissance de ___?
sont des thermophiles extrêmes ayant une température de croissance entre 121 et 130 °C
96
Où retrouve-t-on les bactéries de la souche 121?
dans les cheminées hydrothermales
97
Les bactéries de la souche 121 ne peuvent vivre en bas de quelle température?
mort des souche 121 si la températures est inférieure à 80 °C
98
Quel est le pré-requis pour les milieux de culture?
il doit y avoir stérilité du milieu de culture donc absence de microorganismes
99
Quels sont les deux types de culture possible?
1. culture pure
2. culture mixte
100
Qu'est-ce qu'une culture pure?
culture présentant un seul type de microorganisme: tous les individus ont les mêmes caractéristiques
101
Qu'est-ce qu'une culture mixte?
culture présentant plusieurs microorganismes
102
Que peut permettre une culture mixte?
permet d'étudier les interactions entre différents microorganismes: l'inhibition, la compétition ainsi que la synergie.
103
Vrai ou faux: un milieu de culture où l'on retrouve différentes populations de microorganismes veut dire qu'il y a contamination?
Faux, si c'est un milieu de culture mixte voulu, on ne parle pas de contamination, car il n'y a pas de microorganismes inconnus.
104
Quelle est la composition d'un milieu de culture?
1. source d'énergie et de carbone
2. facteurs de croissance
105
Que sont les facteurs de croissance?
Ce sont des éléments essentiels à la biosynthèse des macromolécules et qui sont impossibles pour le microorganisme de synthétisés dû à une perte des voies métaboliques nécessaires
106
Quels sont les facteurs de croissance nécessaires?
1. vitamines
2. acides aminés
3. purines et pyrimidines
107
Quels sont les deux types de milieux de culture possibles?
1. milieu liquide
2. milieu solide (gel)
108
Dans quoi se font les milieux de culture liquides?
dans des bouteilles, des tubes ou des fermenteurs avec bouchon de ouate.
109
Quel est l'avantage des milieux de culture liquides?
permettent de grandes populations
110
Dans quoi se font les milieux de culture solides?
dans des plats de Petri
111
Quel est l'avantage des milieux de culture solides en pétri?
permettent les échanges gazeux
112
Quels sont les deux milieux solides possibles/les plus utilisés?
1. agar
2. gel de silice
113
Quelles sont les caractéristiques de l'agar?
solubilisation à 100 °C, gélification à 45 °C
114
Quelles sont les avantages de l'agar?
1. non dégradé par la majorité des microorganismes
2. permet la croissance en colonie et donc la séparation physique/isolement
115
Quand utilise-t-on le gel de silice?
lorsqu'on cultive des bactéries qui dégradent l'agar
116
Qu'est-ce que la stérilisation?
élimination des microorganismes viables incluant les endospores
117
Quels sont les moyens de stérilisation?
Stérilisation par la chaleur (sèche ou humide), par rayon ionisant (pénétrants ou non pénétrants), par filtration, par substances chimiques
118
Quels sont les facteurs qui influencent l'efficacité de la stérilisation par la chaleur?
1. température
2. durée
3. humidité
4. nombre et états des m/o (endospores et cellules végétatives)
119
Qu'est-ce qu'un Bec Bunsen?
objet créant une flamme à 1275 °C à l'apex (entre les 2 flammes)
120
Pourquoi la flamme du Bec Bunsen créée-t-elle un champs stérile?
car il y a création de courants d'air ascendant
121
Quel instrument crée une chaleur sèche et combien de temps dure la stérilisation?
four à air chaud (four Pasteur)
stérilisation à 160-170 °C pendant 2-3 hrs
122
Pour quels instruments est utilisée la chaleur sèche?
verreries, pipettes, objets de métal
123
Quel est l'avantage majeur de la stérilisation dans le four à air chaud?
à la sortie, les objets conservent leur stérilité
124
Quel instrument crée une chaleur humide et combien de temps dure la stérilisation?
autoclave (utilise la vapeur d'eau)
stérilisation à 121°C à pression de 1kg/cm2 pendant 15 minutes
125
Vrai ou faux: on augmentation le temps de stérilisation dans l'autoclave en fonction du volume?
Vrai
126
Quel témoin est utilisé pour la stérilisation à chaleur humide?
la perte de viabilité des endospores
127
Pour quel objectif est utilisée la chaleur sèche?
préparation de liquide thermorésistants, préparation de conserves
128
Que font les radiations ionisantes utilisées pour la stérilisation?
causent des dommages à l'ADN
129
Pour quels instruments est utilisée la chaleur sèche?
pour stériliser les objets à usage unique comme les pipettes, les pétris de plastique thermosensibles, pour les conserves et épices
130
Comment doivent être les installations pour la stérilisation par rayons gamma?
en parois couverte de plomb
131
Quand utilise-t-on les rayons U.V (non pénétrants)
pour stériliser des surfaces ou dans les enceintes stériles ou les usines de traitement d'eau
132
Comment est effectuée la stérilisation par filtration?
utilisation des propriétés filtrantes de filtres de nitrocelluloses ayant des pores entre 0,22 et 0,45 µ
133
Vrai ou faux: la stérilisation par filtration permet la rétention des bactéries et des virus?
faux, seulement des bactéries
134
Vrai ou faux: la stérilisation par filtration peut être utilisée pour mettre en évidence les virus présent dans un liquide?
Vrai
135
Quand utilise-t-on la filtration?
pour les liquides thermosensibles (sérum, vitamines, antibiotiques)
136
Comment est effectuée la stérilisation par substances chimiques?
utilisation de gaz stérilisants comme l'oxyde d'éthylène ou l'ozone
137
Quels sont les dangers de l'oxyde d'éthylène et de l'ozone?
- oxyde d'éthylène: explosif lorsque mélangé avec O2
- ozone: neurotoxique
138
Quand utilise-t-on la stérilisation par substances chimiques?
pour les instruments chirurgicaux (cathéters, prothèses, laparoscope)
139
Vrai ou faux: on doit utiliser des enceintes hermétiques lors de la stérilisation par substances chimiques?
Vrai
140
Pourquoi la stérilisation est-elle essentielle?
1. pour une interprétation des résultats non biaisées
2. pour diminuer les risques d'infection après chirurgie
141
Vrai ou faux: dans les populations microbiennes, il y a beaucoup de biodiversité?
Vrai, par exemple sur la peau et les muqueuses
142
Combien y a-t-il d'espèces microbiennes dans la muqueuse buccale?
700
143
Combien y a-t-il d'espèces microbiennes dans la muqueuse intestinales?
10^11 microorganismes/g
144
Combien y a-t-il d'espèces microbiennes dans le microbiote du sol?
10^9 microorganismes/g
145
Vrai ou faux: en nature on retrouve des cultures pures?
faux, des cultures mixtes
146
À quoi sert l'enrichissement des cultures?
permet d'augmenter la proportion du microorganisme d'intérêt
147
De quoi doit-on tenir compte lors de l'enrichissement de culture?
1. proportion de l'espèce d'intérêt
2. sa vitesse de croissance
3. caractéristiques spéciales/déterminantes
148
Les méthodes d'enrichissement peuvent être ___, ___ ou ___
chimiques, physiques ou biologiques
149
Quelles sont les méthodes d'enrichissement chimiques?
1. par nutriments ou sources d'énergie
2. milieu dilué
3. substances inhibitrices (colorants, alcool phényléthylique, sels biliaires et désoxycholate de Na)
150
Quels sont les substances inhibitrices utilisées lors de l'enrichissement de culture et leurs effets?
1. cristal violet, vert brillant: diminution Gr +
2. Alcool phényléthylique: diminution Gr -
3. Sels biliaires, désoxycholate de Na: utilisés pour bactéries entériques
151
Qu'est-ce que le mélange de MacConkey
permet de distinguer les Gr- entériques ainsi que les lactoses +/-
152
Quel est le rôle du lactose dans le mélange de MacConkey?
augmenter la croissance des Lac+
153
Quel est le rôle du rouge neutre dans le mélange de MacConkey?
colorer les Lac+ en rouge
154
Quel est le rôle du cristal violet dans le mélange de MacConkey?
éliminer les Gr+
155
Quel est le rôle des sels biliaires dans le mélange de MacConkey?
éliminer les bactéries non entériques
156
Quelles sont les méthodes physiques possibles?
- traitement à la chaleur
- dessiccation
- incubation
- taille cellulaire
- pathogénécité
- symbiose
157
Que permet le traitement à la chaleur?
Permet la sporulation des cellules, soit la formation d’endospore et l’élimination de cellules végétatives pouvant se diviser
158
Quel filtre utilise-t-on pour la méthode physique basée sur la taille cellulaire?
Filtre de 0,22 microns
