Nukleové kyseliny, AMK, peptidy, proteiny, enzymy Flashcards
Jaké typy nukleových kyselin rozlišujeme?
DNA a RNA
Jaké podtypy RNA máme?
mRNA, tRNA, rRNA
Co je to mRNA a jakou má funkci?
Je to messenger RNA (informační), nese informaci o pořadí AMK.
Co je to tRNA?
Je to transferová RNA, slouží pro přenos aminokyseliny z cytoplazmy na místo určení (na ribozom).
Co je to rRNA a jakou má funkci?
Je to ribosomální RNA, tvoří jednu ze stavebních složek ribosomů, vzniká primárně v jadérku.
Co je to nukleotid?
Je to organická struktura, která je složena ze sacharidů, heterocyklických dusíkatých bází na bázi purinů a pyrimidinů a zbytku kyseliny fosforečné.
Jak vypadá nukleotid DNA?
1) Cukerná složka (pentóza) - 2-deoxy-D-ribóza
2) Dusíkaté báze DNA - purinové (Adenin, guanin), pyrimidinové (cytosin, thymin)
3) fosfát
Jak vypadá nukleotid RNA?
1) Cukerná složka (pentóza) - D-ribóza
2) Dusíkaté báze DNA - purinové (Adenin, guanin), pyrimidinové (cytosin, uracil)
3) fosfát
Co je to nukleosid?
Nukleosid je pouze cukerná složka a báze bez fosfátu.
Jaký je rozdíl mezi 2-deoxy-D-ribózou a D-ribózou?
U 2-deoxy-D-ribózy není OH skupina, ale pouze vodík, zatímco u D-ribózy je uhlík klasicky substituován OH skupinou.
Co je to primární struktura DNA?
Jeden řetěz nukleotidů vzájemně spojených fosfodiesterickou vazbou přes -OH skupinu na 3´ uhlíku a fosfát na 5´ uhlíku.
V jakém směru roste řetězec DNA?
Pouze ve směru 5´-3´
Jak vypadá napojení nového nukleotidu do DNA?
1) Proces zahájí nukleosid vázaný na trifosfát
2) Difosfát se odštěpí a uvolní se energie
3) nukleotid se váže do řetězce
Co tvoří sekundární strukturu DNA?
Dvoušroubovice
Co je to dvoušroubovice?
Vzájemně dva antiparalelní řetězce.
Podle čeho jsou spojeny řetězce DNA?
Podle komplementarity bazí.
Co říká Chargaffovo pravidlo?
Počet purinových bází je stejný jako počet pyrimidinových.
V jaké fázi buněčného cyklu dochází k replikaci DNA?
V S-fázi
Co znamená, že je replikace DNA semi-konzervativní proces?
Že jeden řetězec nově vzniklé DNA je z původní molekuly DNA a druhý byl nově dotvořen na základě komplementarity bazí.
Co je to replikační vidlice?
Když se od sebe oddělí vlákna DNA.
Jaký je rozdíl mezi vedoucím a váznoucím řetězcem?
U vedoucího řetězce probíhá replikace kontinuálně —-> je rychlejší.
U váznoucího řetězce je nucena se replikovat po Okazakiho fragmentech, protože jinak by jela ve směru 3´- 5´,což nejde.
Co je to primer?
Je to několik nukleotidů RNA, které zahajujínové vlákno, je nutný pro nasednutí DNA polymerázy na původní řetězec DNA.
Jaký enzym spojuje sousední nukleotidy?
Ligáza.
Co dělá helikáza?
Slouží k rozvinutí dvoušroubovice(přerušuje vodíkové vazby mezi bázemi)
Co dělá DNA polymeráza?
Katalyzuje připojení nukleotidů.
Co dělá primáza?
Syntetizuje primery.
Co dělá nukleáza?
Odstraňuje primer a nahrazuje ho DNA.
Co dělá topoizomeráza?
Narovnává vlákno, aby mohla pracovat helikáza.
Co dělají SSB proteiny?
Udržují vlákna DNA před replikací rozdělená, aby nedošlo k jejich spojení.
Co je to proteosyntéza?
Proces tvorby proteinu.
Jaké dva děje můžeme pozorovat při proteosyntéze?
Transkripci z DNA do mRNA a potom translaci z mRNA do proteinu.
Co je to transkripce?
Je to přepis z DNA do mRNA na základě komplementarity bazí.
Co dělá RNA-polymeráza?
Katalyzuje transkripci.
Jak se přepisuje jednotlivé nukletotidy z DNA do RNA?
Adenin –> uracil
Thymin –> adenin
Cytosin –> guanin
Guanin –> cytosin
Jaké fáze má transkripce?
Iniciaci, elongaci, terminaci
Co se děje při iniciaci transkripce?
Otevře se DNA šroubovice.
Co se děje při elongaci u transkripce?
Syntetizuje se řetěz RNA za účasti RNA-polymerázy.
Co se děje při terminaci transkripce?
Ukončí se přepis, vzniklá mRNA se uvolní do cytoplazmy.
Jaká dvě vlákna rozlišujeme u DNA při transkripci?
Vlákno pracovní
Vlákno paměťové - to se do transkripce přímo nezapojuje
Co jsou to posttranskripční úpravy?
Primární transkript, tzv. pre-mRNA projde sestřihem (splicingem), kdy jsou odstraněny introny a jsou zachovány pouze exony. Tímto se vytvoří již hotová mRNA.
Co je to translace?
Překlad genetické informace z mRNA do proteinu.
Kde probíhá translace?
V cytoplazmě na ribozomech.
Které typy RNA se účastní translace?
Všechny (mRNA, tRNA, rRNA)
Co je to kodon?
Triplet nukleotidu na mRNA.
Co je to antikodon?
Triplet nukleotidů na tRNA.
Jaké fáze translace máme?
0) navázání mRNA na ribozom a spojení malé a velké podjednotky ribozomu
1) iniciace
2) elongace
3) terminace
Co se děje při iniciaci translace?
Translace je zahájena od start kodonu.
Jaký kodon je start kodon?
AUG
Co se děje při elongaci u translace?
Vytvoří se peptidická vazba mezi jednotlivými AMK, které na ribosom nese tRNA –> roste polypeptidický řetězec.
Co se děje při terminace translace?
Translace se ukončí na základě stop kodonu za uvolnění vzniklého proteinu.
Které kodony jsou stop kodony?
UGA, UAA, UAG
Co platí o AMK a tRNA?
Každá AMK má svou specifickou tRNA.
Co dělá enzym aminoacyl-tRNA syntáza?
Odpovídá za přiřazení AMK ke správné molekule tRNA.
Jaká jsou vazebná místa na ribozomu?
Aminoacylové, peptidylové a exitové
Kam se váže AMK?
Na tzv. aminoacidické místo
Co se děje na P-místě?
tRNA se posune a AMK je zařazena do vznikajícího polypeptidu.
Co je to genetický kód?
Je to soubor pravidel pro překlad informace z mRNA do proteinů.
Jaké vlastnosti má genetický kód?
1) Je univerzální
2) Je nepřekrývaný
3) Je degenerovaný
Co znamená, že je genetický kód nepřekrývaný?
Triplety na mRNA jsou překládány jeden za druhým.
Co znamená, že je genetický kód degenerovaný?
Že jsou některé AMK kódovány více než jedním tripletem.
Co jsou to aminokyseliny?
Substituční deriváty karboxylových kyselin.
Jak dělíme AMK podle polarity postranního řetězce?
Na hydrofobní (nepolární) a hydrofilní (polární)
Jak dále dělíme hydrofilní AMK?
Na neutrální, kyselé a zásadité
Co je typické pro neutrální AMK?
Jejich postranní řetězec je neionizovatelný a mají stejný počet COOh a NH2 skupin.
Co je typické pro zásadité AMK?
Větší počet NH2 skupin.
Co je typické pro kyselé AMK?
Více skupin COOH
Jaké AMK patří mezi nepolární AMK?
Glycin, Alanin, Valin, Leucin, Izoleucin, Fenylalanin, Tryptofan, Prolin, Methionin
Jaké AMK patří mezi neutrální?
Serin, Threonin, Cystein, Tyrosin, Asparagin, Glutamin,
Jaké AMK patří mezi kyselé?
Kyselina asparagová, kyselina glutamová
Jaké kyseliny patří mezi aminokyseliny bazické?
Lysin, Arginin, Histidin
Co jsou to esenciální AMK?
AMK které musíme přijímat v potravě, protože si je naše tělo neumí vyrobit.
Jaké AMK patří mezi esenciální?
Valin, Leucin, Isoleucin, Phe, Tryptophan, Methionin, Histidin, Threonin, Lysin, Arginin
Jak vznikají peptidy?
Kondezací většího počtu alfa-AMK
Jak jsou v peptidech spojeny jednotlivé AMK?
Peptidovou (amidovou) vazbou
Jak dělíme peptidy?
Na oligopeptidy, dipeptidy, tripeptidy, polypeptidy
Kolik AMK mají v sobě dipeptidy?
2
Kolik AMK mají v sobě tripeptidy?
3
Kolik AMK obsahují oligopeptidy?
2-10
Kolik AMK obsahují polypeptidy?
11-100 AMK
K čemu slouží glutathion?
Je to důležitý antioxidant krevní plazmy a červených krvinek.
Od kolika AMK je to protein?
100 a více
Jaké typy sekundární struktury máme?
alfa-helix, beta-skládaný list, neuspořádaná strukture
Co většinou dělají globulární proteiny?
Jsou to většinou transportní nebo jinak funkční proteiny.
Co dělají fibrilární proteiny?
plní většinou strukturní funkci (proteiny kůže, vlasů, svalových vláken…)
Jaké například proteiny zařazujeme mezi globulární?
Globulin a albumin.
Jaké například proteiny zařazujeme mezi fibrilární?
Kolagen a elastin.
Co je to kolagen?
Základní stavební jednotka pojivové tkáně (chrupavka, kost, šlachy)
Co je to denaturace proteinu?
Je to když protein ztratí svou vyšší strukturu spolu se ztrátou funkce proteinu.