Mycologie Flashcards
Saprophytes
Décomposeurs de: bois, carcasses
Ds environnement et sont source de contamination pour humain
Saprophyde dimorphes
Champignons qui ont dév. capacité infecter tissus humain en adoptant forme diff.
ex: Blastomyces dermatitidis, Coccidioides immitis, Histoplasma capsulatum
Saprophytes opportunistes
Champ. et levures qui peut causer infections superficielles ou profondes chez Pt affaiblis
ex:
Candida albicans: tout le monde petite quantité sur peau
Cryptococcus neoformans: excrements de pigeons, méningites chez immunocompromis
Aspergillus fumigatus: presque impossible enlever sur poumons
Mucorales
Parasites
Vivent au dépend de l’hôte vivant comme agents d’une mycose humaine ou animale
Champignons suivants:
- Ceux ds FN qui peuvent devenir pathogènes opportunistes, infection endogène (mess avec pH vaginal peut faire infection de C. albicans
- Parasites obligatoires ex: dermatophytes
Symbiose
Association bénéfique réciproque avec autre être vivant (ex: lichens = champ + algue)
Morpho de champignons
Partie du régne mycètes
Pluricel ou unicel
Pas de chlorophylle donc incapable photosynthèse
Hétérothrophes: dégrade composés org. pour énergie
Produisent spores diff. formes qui permettent ID
3 groupes:
1. Champignons macroscopiques
- Levures: unicell., reproduisent par bourgeonnement (blastoconidies), colonies crémeuses comme bactéries sur géloses
- Moisissures: pluricell., reproduisent par allongement des hyphes qui spécialisent et forment des organes de fructification qui émettent spores, colonies filamenteuses sur gélose
Hyphes
Hyphes dans thalles nommés selon fonction dans milieu
Hyphes végétatifs: couvrent surface nutritive en quête de nourriture
Rhizoides: sousterrains qui enfoncent dans milieu et forment pseudoracines
Hyphes aériens: portent organes de fructification qui produisent et libèrent spores
Thalles filamenteux sur gélose
Forment colonies:
diamètre variable
plus ou moins colorés
aspect: ouaté (bcp de hyphes aériens), plâtreux/granuleux/poudreux (grains de sucre en poudre, produit bcp de conidies), glabre (très peu hyphes aériens et conidies, surface lisse), excentrique et centrifuge (centre vers périphérie et explique lésions arrondies sur peau de Pt infectés par dermatophytes)
Provenance d’un thalle
De la germination d’une spore produite par thalle adulte de même espèce
Spore sur milieu nutritif –> spore produit tube ou se trouve cytoplasme et noyaux –> noyaux divisent –> parois cellulaires élaborent pour former filaments qui forment le thalle
Thalle mature produira spores qui seront propagées dans environnement pour trouver nouveau habitats
Reproduction
Production de spores qui sont issues de reproduction sexuée ou asexuée
sexuée: fécondation entre 2 gamètes, ces spores pas souvent obs. sur milieux de culture (rarement utilisé pour ID)
asexuée: tous champ. en croissance sur gélose et forme utilse pour ID.. ces spores sont nommés conidies
Différentes sortes de conidies
Aleurioconidies (AKA aleurispores) Arthroconidies (AKA arthrospores) Blastoconidies (AKA blastospores) Chlamydoconidies (AKA chlamydospores) Phialoconidies Sporangiospores
Aleurioconidies
Spore terminale
- paroi, couleur, forme et dimension les rapprochent des conidies
Microaleuries et macroaleuries
Aleuries seulement dans cultures de dermatophytes
ex: Trichophyton, Microsporum, Epidermophyton
Arthroconidies
Spores fréquentes formées par fragmentation de hyphe segmenté
Paroi de chaque segment de hyphe épaissit légèrement et angles arrondissent
2 types:
1. simples: chaque cloisson forme arthroconidie ex: Geotrichum, Trichosporon
2. alternée: entre chaque arthroconidies il y a une cellule disjoctive ex: Coccidiodes immitis (très dangereux)
Blastoconidies
Structure produite par bourgeonnement
Cellules levuriformes donnent naissance à cellule fille (blastoconidie) par division cellulaire nommée bourgeonnement
Peuvent rester attacher les unes aux autres pour former filament appelé pseudohyphe (clamp)
Peuvent aussi former une hyphe (pas de clamp) ex: Candida
Chlamydoconidies
Élément de filament rond avec paroi épaisse et un cytoplasme dense chargé de matière de réserve (lipides)
Spores résiste conditions difficiles
Spores répandues chez plusieurs champ. microscopique
Retrouvé sur pseudomycélium de C. albicans ainsi que sur les hyphes des dermatophytes
Phialoconidies
Conidies organisées en chaîne et produites des phialides (structures spécialisée placée sur vésicule sur extrémité de hyphe)
Spores externes qui détachent facilement des hyphes qui les ont formés ex: Penicillium (sur pain), Aspergillus
Sporangiospores
Spores emprisonnées dans vésicule nommée sporange
Sporange situé à l’extrémité d’un hyphe specialisé nommé sporangiophore
Quand mature: sporange dilate et éclate sous effet de pression interne et libère sporangiospores ex: Rhizopus, Mucor, Zygomycota
Pathogénicité
300 espèces pathogènes
infection par champ. = mycose
3 niveaux:
1. Superficielles: cutanée (peau, poil, cheveux, ongle), muqueuse
2. Sous-cutanée ou sous muqueuse
3. Profonde: sang, urine, LCR, autres liquides bio
Mycoses cutanées
Pied athlète (T. rubrum)
Teigne (T. tonsurans, Candida)
Tous les sites: C. albicans
FN = Staph. coag neg, Strep viridans, levures, etc.
Muqueuses
Nez, bouche (C. albicans = muguet), vagin (C. albicans = monoliase), gorge
Plus fréquent = C. albicans (levure)
Doit distinguer de levures FN
2 indices pour faire différence:
1. # (agent pathogène en plus grand #)
2. GB (qui indique rnx inflam. –> hôte se défend)
Prélèvement avec écouvillon ou spatule abaisse-langue et faire état frais
ID avec symptômes et observation au microscope du spécimen (rare de faire culture)
Sous-cutanées
Entrée: blessures au niveau de la peau, spore ou fragment de hyphe pénètre
ex: Sporothrix schenckii associé au jardinage
Profondes
Entrée: inhalation de spore (conidie) qui envahit voies resp. inf. et déclenche infection pulmonaire
Most du temps pas de symptômes ou symptômes non spécifiques (toux)
Symptômes dans cas suivants:
1. immunocompromis (schroom dans tous organisme par sang)
2. immunocompétent suite a inhalation massive de spores (ex: démolitions)
ex: Blastomyces dermatidis, Candida, Aspergillus
Examen microscopique direct
Utilité:
- Donne rapport préliminaire rapide au médecin
- Detecte rapidement structures fongiques (hyphes, pseudohyphes, levures)
- Facilite interprétation de culture en comparant résultats avec culture
Colo: calcofluor
Méthode la plus utilisée
Fluorochrome non-spécifique avec affinité pour chitine dans paroi cellulaire de schrooms (fluo vert pomme)
Besoin microscope à fluorescence
Fibre coton captent colo et peuvent être confondues avec hyphes
Colo: bleu de coton, lactophénol
Pour cheveux et leurs bulbes Colore hyphes (seront plus facilement observables)
Colo: fungifluor
Mise en évidence levures et mycoses dans spécimens respiratoires
Fluorochrome non-spécifique affinité pour chitine dans paroi cellulaire de schrooms
Fluo vert pomme aussi
Besoin microscope fluo
Colo: PAS
Ac. périodique de Schiff
Colore certains polysaccharides dans paroi cellulaire des schrooms
Rose
Méthode plus longue, mais permet colo permanente qui peut être conservée
Colo avec traitement au KOH
Pour ongles et squames cutanées
KOH 10% pour squames cutanées
KOH 30% (plus DMSO) pour ongles
KOH dégrade débris de PR- et dissout ciment qui retient les cellules kératinisées ensembles
Permet alors de repérer plus facilement hyphes et arthrospores (pas bcp alors bon de pouvoir les spotter)
Milieux de culture: Sabouraud glucosé ou Sabouraud dextrose
Routine
Milieu de base pour ID schrooms
Si dans bouche ajoute chloramphénicol pour inhiber FN
Peut ajouter extrait de levures 0.5% pour stimuler croissance des dermatophytes
pH 5.5 qui inhibe croissance quelques bactéries de FN
Milieux de culture: Sabouraud modifié
Plus utilisée que l’original
Diminue glucose à 1% ce qui augmente pH à 7 (favorise croissance et sporulation des dermatophytes)
Peut aussi éliminer glucose pour conserver les dermatophytes
Milieux de culture: Mycosel (BBL) ou Mycobiotic (Difco)
Même géloses, différentes compagnies
Milieux sélectif
Additionné de:
RT **Cyclohexamide: antifongique pour inhiber certains schrooms de l’air et levures comme Cryptococcus neoformans
Chloramphénicol: antiB qui inhibe croissance de bactéries
Milieux de culture: PCB
Patate carotte bile
Milieu pauvre sans sucre
Pour sporulation (chlamydospores) et mise en évidence de pseudohyphes par C. albicans
Colonies développent meilleure colo (critère imp. pour ID moisissures)
ou PDA (patate dextrose agar): qui permet d’observer morpho typique de schrooms
Milieux de culture: corn meal ou farine de maïs
Ou Oxgall qui a la même fonction
Pour sporulation (production de chlamydospores)
Peut être additionné de Tween 20
Durée d’incubation
1-4 jours pour levures
1-2 semaines pour moisissures à croissance rapide
jusqu’a 6 semaines pour moisissures à croissance lente
ToC d’incubation
25-30 oC pour moisissure d’infections superficielles
35 oC pour schrooms d’infections profondes
Atmosphère d’incubation
Aérobiose pour moisissures et certaines levures
Ana facultative: levures
Colonies levuriformes
Consistance crémeuse et croissance rapide (1-4 jours) comme colonies bactériennes
Composées de levures de forme ovale et bourgeonnante qui ne produisent pas de vrai filament
Colonies filamenteuses ou thalliques
Texture laineuse à sèche
Composées de cellules filamenteuses appelées hyphes
Certaines hyphes recouvrent surfaces, d’autres sont aériens
hyphes + organes de fructification = thalle
Schrooms dimorphes
Capacité de former colonies de type levuriforme à 35 oC et filamenteuse à 22 oC
ID
Souvent limitée au genre ID espèce pour: C. albicans Cryptococcus neoformans Levures des sites normalement stériles Dermatophytes Saprophytes dimorphes (facile puisque usually seulement une espèce dans le genre) Saprophytes opportunistes: quelques espèces d'Aspergillus (A. fumigatus, A. niger, A. terreus)