Mutaties Flashcards
Welke mutatie is bij patiënten met AML een voorspeller voor een slechtere prognose?
FLT3-receptor
Welke soorten puntmutaties kunnen we krijgen?
Transities: purine –> purine of pyrimidine –> pyrimidine
Transversies: purine <–> pyrimidine
Kleine inserties/deleties
Welke chromosomale afwijkingen kunnen we krijgen?
Translocaties
Amplificaties (dicentrische chromosomen, breuken, etc.)
Deleties
Numerieke afwijkingen
Welke vormen van chemische instabiliteit kennen we die kunnen zorgen voor DNA schade?
Spontane hydrolyse leidend tot depurinatie
Deaminatie van basen leidend tot omzetting van cytosine in uracil
Welke biologische stoffen kennen we die leiden tot DNA schade?
Oxidatieve DNA schade waardoor de complementariteit verandert
Benzoapyreen wat zorgt voor een dubbelhelix storing
Welke fysische agens kennen we die DNA schade veroorzaakt?
UV straling wat zorgt voor intrastrengse DNA beschadigingen
Wat voor DNA schade repareer je met BER?
Oxidatieve DNA schade, deaminatie van basen, ssDNA breuken
Wat voor DNA schade wordt gerepareerd met NER?
Grotere adducten
Wat doet het CSB1-eiwit?
Wanneer de DNA-polymerase geblokkeerd raakt, wordt deze door CSB1 achteruit geduwd, om te zorgen dat het beschadigde DNA vrijkomt en gerepareerd kan worden.
Welke 2 herstelmechanismen hebben we voor het herstel van dubbelstrengse breuken?
Niet-homologe DNA eindverbinding
Homologe recombinatie
Wat is een voordeel van de mutaties die ontstaan door NHEJ?
Ze vergroten de diversiteit van antilichamen
Wat is de functie van het RAD51-eiwit?
Het zorgt ervoor dat het homologe DNA gevonden kan worden
Wat is het risico van homologe recombinatie met het homologe chromosoom?
Verlies van heterozygositeit
Wat is het gevaar van LOH?
Er is een groter risico op het kopiëren van de breuk, waardoor een homozygote mutatie kan ontstaat
Wat is het risico van NHEJ?
Genomische instabiliteit
Waarmee paart een imino C?
A
Waarmee paart een enol T?
G
Welk eiwit is nodig voor de reparatie van enkelstrengse breuken?
PARP1
Welke mutatie blijkt bij elke patiënt met CML aanwezig?
t(9;22)
Welk fusiegen ontstaat ten gevolge van de t(9;22)?
BCR-ABL
Welke mutaties bij AML geven de meest gunstige prognose?
inv(16)
t(15;17)
t(8;21)
Welke mutatie geeft bij AML de meest slechte prognose?
monosomie 7
Welke mutaties zie je bij de standaardgroep van AML?
Geen cytogenetische afwijkingen
Welke technieken kunnen gebruikt worden om chromosomen in kaart te brengen?
Aankleuring van chromosomen
FISH in situ hybridisatie
FISH chromosoomspecifiek
Spectrale karyotypering
Wat is chromothripsis?
Het uit elkaar vallen en weer in elkaar zetten van een chromosoom
Wat is het resultaat voor het chromosoom van chromothripsis?
Collectie van translocaties en deleties
Waarom wil je cytogenetische afwijkingen bekijken?
Relevant voor diagnose
Belangrijk voor voorspellen prognose
Respons op chemotherapie
Identificatie van betrokken genen
Welke numerieke chromosomale afwijkingen kennen we?
Winst van een compleet chromosoom
Verlies van een compleet chromosoom
Welke gebalanceerde structurele chromosomale afwijkingen kennen we?
Translocaties
Inversies binnen een chromosoom (paracentrisch en pericentrisch)
Insertie
Welke niet-gebalanceerde structurele chromosomale afwijkingen kennen we?
Deleties
Amplicaties
Niet-gebalanceerde translocaties
Genmutaties (op niveau van baseparen)
Welke type deleties komt veel voor bij AML?
Terminale deletie chromosoom 7
Interstitiële deletie chromosoom 5q-
Welke cytogenetische afwijkingen geven de slechtste prognose bij AML?
Complex karyotype
Monosomaal karyotype
Wat zijn voordelen van FISH?
Aantonen microdeleties
Detectie breekpunt
Aantonen cryptische translocaties
Aantonen complexe genoomveranderingen
Snel stellen diagnose
Demonstratie kleine hoeveelheden aberante cellen
Wat zijn nadelen van FISH?
Gelimiteerde sensitiviteit
Alleen antwoord op onderzochte vragen
Niet veel targets tegelijkertijd bekijken
Op welke cellen verricht je metafase FISH?
Lymfocyten
Leukocyten
Solide tumoren
Op welke cellen verricht je interfase FISH?
Kernen van niet/slecht delende cellen voor snelle analyse
Wanneer gebruik je een fusieprobe set voor FISH?
Translocaties
Wanneer gebruik je break-apart probes?
Ongebalanceerde translocaties
Welke mutatie zie je bij chronische neutrofiele leukemie (CNL) en wat is hiervan het directe gevolg?
T618I-mutatie, waardoor de GSF3R-receptor spontaan kan dimeriseren
Wat is het effect van een JAK2-mutatie?
Een mutatie in het JH2-domein, waardoor het JH1-domein niet wordt geremd bij PV of ET.
Wat is het gevolg van een MPL-mutatie?
De TPO-receptor (MPL) kan spontaan dimeriseren en daarmee activeren.
Wat is de meest relevante mutatie voor PV?
JAK2
Welke mutatie veroorzaakt Familiaire Adenomateuze Polyposis (FAP)?
Een kiembaanmutatie in het APC-gen
In welke genen kunnen mutaties zijn optreden in het geval van het Lynch syndroom?
MMR-genen MLH1, MSH2, MSH6 of PMS2
Welke mutatie is opgetreden bij een plaveiselcelcarcinoom van de long?
Inactiverende mutatie van p16INK4
En vaak p53
Welke mutatie zie je bij rokers met een adenocarcinoom van de long?
K-RAS
Welke mutatie zie je bij niet-rokers met een adenocarcinoom van de long?
EGFR
Welke mutaties zie je bij neuroendocriene tumoren van de long?
Rb
p16-overexpressie
p53
Welke mutatie is het belangrijkst voor het ontwikkelen van coloncarcinoom en kan zowel sporadisch als in kiembaan vorm voorkomen?
APC-mutatie
