Molbi termit Flashcards
proto-onkogeeni
- normaali geeni, usein mukana solun jakaantumisen säätelyssä, joka voidaan muuttaa syöpää edistäväksi onkogeeniksi mutaation avulla
RAS -> onkogeeni
Ras super-perhe
- laaja superperhe, joka sisältää monomeerisiä GTPaaseja
- voidaan myös kutsua GTP:tä sitoviksi proteiineiksi, joista Ras on prototyyppinen jäsen
- Ras auttaa viemään signaaleja solukalvon RTK-reseptoreilta (tyrosiini-kinaasi-reseptori) tumaan usein vasteena signaaleille, jotka stimuloivat solun jakaantumista
GTPaasit
- entsyymi, joka muuttaa GTP:tä GDP:ksi
- kuuluvat kahteen isoon proteeiniperheeseen: isot trimeeriset G-proteiinit ja pienet monomeeriset GTP:tä sitovat proteiinit
Isot trimeeriset G-proteiinit
- koostuvat 3 alayksiköstä (alfa, beeta ja gamma-osat)
- G-proteiinikytkentäiset reseptorit aktivoivat G-proteiineja
- kytkevät G-proteiinikytkentäisiä reseptoreja entsyymeihin tai ionikanaviin
Pienet monomeeriset GTP:tä sitovat proteiinit
- yksi alayksikkö, joka auttaa välittämään signaaleja monenlaisista solun pinnan reseptoreista
- lisäksi tärkeä rooli solun sisäisissä signalointireiteissä
- säätelee vesikkelien kuljetusta ja vesikkelien välitystä solun tukirangalle
G-proteeinikytkentäiset reseptorit
- seitsemän-silmukkainen solun pinnan reseptori
- kun sen solunulkoinen ligandi aktivoi sen, se aktivoi vuorostaan G-proteiinin, joka puolestaan aktivoi joko entsyymin tai ionikanavan solukalvossa
ongelmana syövän heterogeenisuus -> infratumor heterogeneity
- kasvainten heterogeenisen rakenteen vuoksi syöpädiagnostiikka vaatii kehittyäkseen vielä paljon lisätutkimusta nimenomaan kasvainsolujen perimän sekä geenien säätelyn muutoksista
- syövän hoitoa vaikeuttaa se, että jokainen kasvain on erilainen ja kaikkiin sopivaa yleistä hoitokeinoa ei ole olemassa
gain-of-function
- esisyöpägeeni -> mutaatio (usein gain-of-function) -> aktiivinen syöpägeeni
- gain-of-function-mutaatio lisää geenin toimintaa tai tekee sen aktiiviseksi vääränlaisissa tilanteissa
- usein dominantti
onkogeenit
- Myc, Ras, K-Ras, MLL, Blc2
- gain-of-function eli aktivoiva mutaatio mahdollistaa onkogeenin promotoimaan solun muutosta
- onkogeeni = muuntunut geeni, jonka tuote voi toimia dominanttina auttaen solun muuntumista syöpäsoluksi
- usein onkogeeni on tavallisen geenin mutanttimuoto ja se on mukana solun kasvun/ jakaantumisen kontrollissa
MLL2 ja 3 -> onkogeenejä
- MLL-geeni on osallisena monissa kromosomaalisissa translokaatioissa
- tärkeä leukemiassa
Myc -> onkogeeni
- geenejä säätelevä proteiini, joka aktivoidaan, kun solun ulkoiset signaalit stimuloivat solua kasvamaan ja jakaantumaan
- aktivoi monien geenien transkription sisältäen ne geenit, jotka stimuloivat solun kasvua
K-Ras -> onkogeeni (mutatoituneella onkogeenillä potentiaali muuttaa normaaleja soluja syöpäsoluiksi)
- K-ras-geeni luo ohjeet K-Ras-proteiinin valmistamiseksi, joka on pääasiallisesti käytössä solusyklin säätelyssä
- osana RAS/MAPK-viestiketjua se välittää signaaleja solun ulkopuolelta tumaan
- signaalit solun ulkopuolelta ohjeistavat solua kasvamaan ja jakaantumaan tai erilaistumaan
- K-Ras-proteiini on GTPaasi eli se muuttaa GTP -> GDP:ksi
- välittääkseen signaaleja K-Ras laitetaan päälle sitomalla se GTP-molekyyliin
loss-of-function (tuumorisuppressori)
- mutaatio, joka vähentää tai poistaa geenin toiminnan
- usein resessiivinen
- suurin osa mutaatiosta tällaisia
- resessiivisyys -> organismi voi useimmiten toimia normaalisti, kunhan se sisältää ainakin yhden normaalin kopion muuntuneesta geenistä
tuumorisuppressorigeeni (loss-of-function)
- geeni, joka näyttää auttavan, että syöpää ei kehittyisi
- jos tällaisissa geeneissä tapahtuu loss-of-function-mutaatio, se auttaa syövän kehittymisessä
- normaali solu -> mutaatio inaktivoi tuumorisuppressorigeenin -> toisessa geenin kopiossa ei vaikutusta -> toinen mutaatio inaktivoi toisen geenin -> tuumorisuppressorigeeni on eliminoitu
Rb = retinoblasmaproteiini -> tuumorisuppressori
- Rb on tuumorisuppressori, joka on osallisena solun jakaantumiseen
- mutatoitunut retinoblasmassa (retinoblastooma) eli silmän verkkokalvon syövässä, mutta myös monissa muissa kasvaimissa
- normaalisti säätelee eukaryoottisolun solusykliä sitoutuen ja siten inhiboiden E2F-proteiineja eli estäen solun siirtymisen DNA-replikaatioon ja solun jakaantumiseen
E2F-proteiini
- geenejä säätelevä proteiini, joka saa monet geenit aktiivisiksi, jotka koodaavat proteiineja, joita tarvitaan solun siirtymiseksi S-faasiin solusyklissä
p53 -> tuumorisuppressori
- tuumorisuppressorigeeni, joka on mutatoitunut lähes puolessa löydetyistä syöpätapauksista
- koodaa geenin säätelyproteiinia, joka aktivoituu DNA:n hajoamisen seurauksena ja osallistuu blokkaamaan solun etenemistä solusyklissä
- NORMAALISTI toimiessaan:
- voi pysäyttää solusyklin hetkeksi
- voi aiheuttaa lopullisen solusyklipysähdyksen
- voi viedä solun apoptoosiin
- ehjissä toimivissa soluissa p53 on hyvin epäpysyvä ja sitä on vain hyvin pieniä määriä soluissa
- vuorovaikuttaa Mdm2-proteiinin kanssa, joka toimii ubikitiiniligaasin tavoin ohjaten p53:n hajotusta proteasomien kautta
- DNA-vaurion jälkeinen p53:n fosforylaatio vähentää sen sitoutumista Mdm2:seen, mikä vähentää p53:n hajotusta, jolloin p53:n konsentraatio kasvaa
- Mdm2:n sitoutumisen väheneminen stimuloi p53:n kykyä geenin transkriptioon
Syövän molekyylibiologia
I) Syövästä yleistä II) Syövän synty - mutaatiot luovat syöpägeenejä - epästabiili genomi lisää mutaatiofrekvenssiä - klonaalinen evoluutio valikoi parhaimman kasvupotentiaalin omaavat solut jatkopeleihin - syövän kantasolut III) Syövän tuntomerkit - kasvusignaalien autonomia - ei vastetta kasvurajoitesignaaleille - solukuoleman estyminen - rajoittamaton kasvupotentiaali - kasvainkylvö - uudisverisuonitus IV) Syöpägeenien nujertaminen
TGF-beeta -> tuumorisuppressori
- laaja perhe, johon kuuluu rakenteellisesti samantyyppisiä eritettyjä proteiineja, jotka toimivat hormoneina tai paikallisina välittäjäaineina kontrolloiden suurta määrää toimintoja
- TGF-beeta inhiboi monien solutyyppien proliferaation joko jättäen solusyklin G1-vaiheeseen / apoptoosi
syöpäreitit
- ominaisuuden menetyksen aiheuttava syöpämutaatio -> Rb-proteiinireitti
- p53-reitti
translokaatio
1) mutaatiotyyppi, jossa osa yhdestä kromosomista irrotetaan ja liitetään toiseen -> vaihdetaan kromosomin osat ristiin -> esim krooninen myelogeeninen leukemia
2) prosessi, jossa proteiini kuljetetaan kalvon yli