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Bioaérosols et aérobiologie > Module 10 > Flashcards

Module 10 Flashcards

1
Q

Vrai ou faux.

Le comportement et le devenir des virus dans l’air sont très bien compris et documentés.

A

Faux.

Les évidences permettant d’affirmer que des virus sont transmis par l’air sont souvent indirectes et les données décrivant le comportement des virus dans l’air sont fragmentaires.

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2
Q

Les virus ne sont pas des être vivants parce qu’ils sont incapables de “A” autonome et qu’ils ne possèdent pas de “B”

A. A= reproduction B = gènes de métabolisme et de production d’énergie
B. A= infection B = gènes de virulence
C. A= réplication B = facteurs de croissance
D. A= signalisation B = gènes de résistance aux antibiotiques

A

A. A= reproduction B = gènes de métabolisme et de production d’énergie

Les virus ne sont pas considérés comme des organismes vivants, car ils ne peuvent se reproduire que dans un hôte. De plus, ils ne possèdent pas de gènes de métabolisme et de production d’énergie.

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3
Q

Quel facteur est le plus important dans la détermination de l’endroit où se retrouvera un virus suite à sa libération par la cellule hôte ?

A. Le système immunitaire de l’hôte infecté
B. La localisation de la cellule infectée
C. La température de l’air environnant
D. Le mouvement de l’air autour de la cellule infectée

A

B. La localisation de la cellule infectée

Selon la localisation de la cellule infectée (ex. poumon, intestin, cerveau), le virus se retrouvera dans une solution liquide, sur une surface ou dans l’air.

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4
Q

Vrai ou faux.

Les aérosols viraux sont habituellement des particules de la taille des virus (10 à 400 nm).

A

Faux.

Les virus sont présents sur des particules de tailles pouvant aller de la taille du virus lui-même à des particules de plusieurs microns. On croit que la particule virale a très peu d’influence sur la taille de l’aérosol mais que ce sont les autres composantes formant l’aérosol (ex. protéines, sels) qui ont un impact plus important sur la taille de l’aérosol.

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5
Q

Sachant la composition structurelle du virus (ex. virus enveloppé ou non), il est possible de prédire l’impact de(s) … sur le potentiel infectieux du dit virus.

A. Humidité relative
B. Température
C. Radiations
D. Aucune de ces réponses

A

D. Aucune de ces réponses

L’impact de facteurs environnementaux sur le potentiel infectieux des virus varie selon les virus (ex. espèces, souches).

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6
Q

Parmi les échantillonneurs suivants, lequel a permis de détecter des virus du SRAS dans l’air des hôpitaux de Toronto?

A. Impacteur Andersen à six étages
B. Barboteur AGI-30
C. Impacteur à fente
D. Aucune de ces réponses

A

C. Impacteur à fente

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7
Q

Associer les différents énoncés avec les types de filtres.

  1. Pores de dimension connue
  2. Capture de particules de dimensions plus petites que la dimension des pores
  3. Plus efficaces pour préserver l’intégrité des virus
A
  1. Filtres en polycarbonate (poreux)
  2. Filtres en téflon (fibreux)
  3. Filtres de gélatine
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8
Q

Quelle méthode n’est pas utilisée pour évaluer l’efficacité d’un échantillonneur de particules ?

A. Calcul par modélisation de la concentration de virus qui doit se retrouver dans l’échantillonneur puis comparaison avec la donnée obtenue
B. Utilisation d’un compteur de particules en amont et en aval de l’échantillonneur
C. Aérosolisation de traceurs de diamètres connus puis calcul de l’efficacité de capture

A

A. Calcul par modélisation de la concentration de virus qui doit se retrouver dans l’échantillonneur puis comparaison avec la donnée obtenue

La réponse est a). Il est très difficile de modéliser et de prédire précisément l’efficacité de capture d’un appareil d’échantillonnage pour les aérosols peu volumineux. L’emploi de compteurs de particules en amont et en aval de l’échantillonneur ou de traceurs est une façon simple d’évaluer les « fuites » et d’estimer la capture des particules.

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9
Q

Quelle est la principale différence entre la culture virale et la culture bactérienne?

A. La culture virale se fait toujours à 37°C
B. La culture virale se fait toujours en liquide
C. La culture virale nécessite l’utilisation d’une cellule hôte
D. La culture virale prend toujours plusieurs semaines

A

C. La culture virale nécessite l’utilisation d’une cellule hôte

Les virus ont comme caractéristique principale qu’ils sont incapables de croissance autonome. Ils se développent nécessairement au profit d’une cellule hôte. Celle-ci doit donc être utilisée afin de mettre les virus en culture. La culture virale peut se faire à diverses températures, tout comme la cellule bactérienne. De plus, elle peut se faire sur une boîte de milieu de culture gélosé et être rapide ou prendre plus de temps selon le type de virus.

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10
Q

Vrai ou faux.

Des approches moléculaires “universelles” permettent de quantifier les virus en très peu de temps, sans savoir quels virus sont présents.

A

Faux.

Malheureusement, il n’existe pas de séquence dite “universelle” pouvant permettre une approche non dirigée pour la détection ou la quantification des virus. Contrairement aux virus, les bactéries ont un gène possédant des séquences universelles pouvant être mises à profit pour les analyses moléculaires.

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11
Q

Les virus sont-ils des être vivants? Argumenter.

A

À la limite du vivant et du non vivant.

NON vivant pcq :

  • association de molécules bio
  • fruit de l’auto-organisation de molécules organiques
  • ne comprend pas d’enzyme pour la production d’énergie
  • ne se multiplie pas seul
  • inertes qd ils sont dans cellules hôtes

VIVANT :
- Qd ils se X ds cellule hôte

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12
Q

Vrai ou faux.

L’aérovirologie est une science en développement.

A

Vrai.

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13
Q

Que faut-il connaitre pour afin de pouvoir mieux contrôler la présence des virus et développer des méthodes efficaces d’échantillonnage et d’analyse? (3)

A
  • nature
  • concentrstion
  • pouvoir pathogène
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14
Q

Quel est le premier virus pathogène humain à être identifié?

A

fièvre jaune

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15
Q

Nommez 2 maladies virales ayant été responsable de grandes épidémies historiquement.

A

Variole et poliomyélite

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16
Q

Quel virus est responsable du phénomène de “lyse bactérienne”?

A

Virus de bactéries = bactériophage

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17
Q

Quelle bactérie possède un mode de vie se rapprochant énormément de celui de virus?

A

Rickettsia :

  • ne peuvent vivre qu’à l’int d’une cellule hôte
  • perde matériel génétique et fonction et utilise ceux des hôte
  • fait des ravages
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18
Q

Le virus est un parasite ________ ________.

A

intracellulaire obligatoire

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19
Q

Vrai ou faux.

Les virus sont des entités bio nécessitant l’équipement enzymatique de cellules vivantes hôtes pour se X.

A

Vrai.

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20
Q

Qui peut être les cellules vivantes hôtes? (6)

A
  • bactéries
  • archaebactéries
  • fungi
  • protistes
  • plantes
  • animaux
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21
Q

Comment s’appelle le virus extra cellulaire libre?

A

Virion

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22
Q

Vrai ou faux.

Le virus est l’entité bio le moins abondant de la planète.

A

Faux.

Le plus abondant

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23
Q

Quel est la grosseur moyenne d’un virus?

A

10 à 400 nm

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24
Q

Vrai ou faux.

Chez les mammifères, 11% du génome est composé de séquences d’origine virale, appelé retrotransposon.

A

Vrai.

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25
Q

L’ADN du virus peut s’incorpore dans l’ADN de l’hôte. Chez les bactéries, comment s’appelle le virus intégré?

A

prophage

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26
Q

Quelles sont les 3 composantes d’un virus?

A
  • Capside protéique
  • Acide nucléique (ADN ou ARN)
  • Enveloppe lipidique (parfois)
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27
Q

Qui stabilise les acides nucléiques?

A

nucléoprotéines basiques

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28
Q

Vrai ou faux.

Les différentes composantes structurelles du virus ont aucun impact sur la sensibilité du virus à l’enviro ext.?

A

Faux

Elles ont un impact.

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29
Q

Quels sont les rôles de l’enveloppe lipidique des virus? (5)

A
  • Maintien du potentiel patho
  • Protection supp contre action enzymes et composés chimiques
  • Facilite vision virus-membrane cellulaire hôte
  • Interaction virus et enviro ext
  • Reconnaissance des cellules hôtes par virus
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30
Q

Quels sont les 3 formes de capsides possibles des virus eucaryotes? Donnez un ex pour ch.

A
  • Cubique (apparence sphérique) = poliomyélite
  • Hélicoïdale (apparence long cylindre creux) = mosaïque du tabac
  • Bacille = rage
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31
Q

Quelle la morphologie des virus procaryotes?

A

Tête icosaédrique (capside) + queue hélicoïdale (cylindre creux) (facultatif)

32
Q

Vrai ou faux.

Le potentiel infectieux d’un phage dépend de l’intégrité de la queue du phage.

A

Vrai.

33
Q

Vrai ou faux.

La présence d’une queue est observée chez 96% des phages et aussi chez certains eucaryotes.

A

FAUX.

JAMAIS chez les eucaryotes

34
Q

Vrai ou faux.

Les phages possédant une queue ont tous un génome d’ADN double brin.

A

Vrai.

35
Q

À la différence des cellules vivantes, les virus ne contiennent qu’un seul type acide nucléique (ARN OU ADN) sauf _____ et ______ qui contiennent à la fois ADN et ARN.

A

Mimivirus et Cytomégalovirus

36
Q
  • Qui est le plus petit virus connu?
  • À quelle maladie est-il associé?
  • Combien de gènes possède-t-il?
  • Quel est sa caractéristique?
A
  • virus delta
  • hépatite D
  • 1 seul gène
  • incapable de se X si le virus de l’hépatite B n’est pas présent en même temps dans la cellule parasitée
37
Q
  • Qui est le plus gros virus connu?
  • Combien de gènes possède-t-il?
  • Quel est sa grosseur?
A
  • Mimivirus
  • 1200 gènes
  • 400 nm
38
Q

Quel est le nom du virus découvert dans le permafrost Sibérien, mesurant 1 um et possédant 500 gènes?

A

Pithovirus sibericum

39
Q

Les virus sont classés selon quoi? (6)

A
  • Nature de l’acide nucléique du génome (ADN ou ARN)
  • Structure acide nucléique (simple ou double brin)
  • Forme acide nucléique (linéaire, circulaire, segmenté ou non?)
  • Présence/absence enveloppe
  • Symétrie capside
  • Sérogroupage
40
Q

Décrivez les 2 méthodes de classification des virus.

A
  1. Baltimore = basée sur
    - type acide nucléique (ADN ou ARN)
    - mode d’expression
  2. ICTV (International Committee on Taxonomy of Viruses) = selon
    - ordre
    - famille
    - sous-famille
    - genre
    - espèce
41
Q

Pk la classification des virus n’est pas phylogénétique?

A

Les virus ne partagent pas d’origine commune et ainsi ne possède pas de gène universel.

42
Q

Les gènes les plus conservés dans les virus codent pour quoi?

A

Prot structurales (ex : prot de capside)

43
Q

Voici une liste de virus transmissibles par l’air. Décrivez les maladies infectieuses qu’ils provoquent.

  1. Adénovirus
  2. Virus de la varicelle
  3. Rhinovirus
  4. Virus Influenza
  5. Morbilivirus
  6. Filovirus (certains)
  7. Virus du SRAS
  8. Poliovirus
  9. Virus FMDV
A
  1. Pharyngite, pneumonie
  2. Zona
  3. Rhume
  4. Grippe
  5. Rougeole
  6. fièvre Ebola (chez singe seulement par air) ou hémorragique
  7. fièvre, frissons, myalgies, malaise, céphalée
  8. poliomyélite
  9. fièvre aphteuse (rare chez humains) : fièvre élevée, ulcères buccaux, cloques sur pieds, pertes poids (adultes), diminution prod lait (vaches)
44
Q

Comment les virus se retrouve dans les enviro ext?

A

À partir d’une cellule infectée, ils sont expulsés directement ds air ou se répandent dans des piques ou des surfaces.

45
Q

Qui est la source la plus importante d’aérosols chargés en virus patho pour les humains?

A

humains

46
Q

Vrai ou faux.

La nature de la source a un impact sur le da et par le fait même le comportement des particules aérosolisées. L’humidité relative a aussi un impact.

A

Vrai.

47
Q

Vrai ou faux.

Les dimensions du virus influencent beaucoup sur le da et le poids des particules aérosolisées.

A

Faux.

Peu d’influence

48
Q

Quel est le da proposé des particules portant les virus?

A

Max : 100 à 200 um

Min : 20 à 30 nm

49
Q
  • Suite à l’aérosolisation, da serait potentiellement _____ par agrégation des particules générées.
  • Que peut-on conclure de cette affirmation?
  • De quoi dépend la vitesse d’agrégation? (3)
A
  • augmenté
  • plusieurs virus serait présents sur la même particules aérosols
    1. grosseur de particules aérosolisées
      1. [aérosols]
      2. conditions thermodynamiques
50
Q

Vrai ou faux.

À ce jour, il n’y a pas d’association claire entre le potentiel infectieux des virus patho aérosolisés et la grosseur des particules les contenant.

A

Vrai.

51
Q

Quels facteurs permettent la protection des virus? (2)

A
  • Présence de matière org/inorg

- Grosseur des particules

52
Q
  • Quels sont les facteurs pouvant influencer le maintien du potentiel infectieux des virus? Expliquez ch. (7)
  • VRAI OU FAUX :
    L’impact d’un facteur varie en fonction du virus et ne peut être prédit.
A
    1. Humidité relative :
  • Augmentation = favorise virus nues
  • Diminution = favorise virus enveloppés
  1. T° : diminution = augmentation infectiosité
  2. Radiations (UV) = diminution infectiosité
  3. Nature source = certains protègent contre dessication/stress enviro
  4. Temps d’expo
  5. Compo chimique de l’air
    - +/- [O2]
    - ozone = virucide
  6. Méthodes d’échantillonnage
    - VRAI
53
Q

Quel fut le premier modèle de transmission de maladies respiratoire autrement que par grosses gouttelettes?

A

SRAS

54
Q

Nommez un excellent modèle de transport de longue distance de virus par l’air.

A

fièvre aphteuse

55
Q

Le comportement des bioaérosols nanométriques (comme les virus) est davantage régit par ____.

A

les collisions des particules avec les molécules de gaz (mouvement brownien ou diffusion)

56
Q

Résumé les principales méthodes d’échantillonnage des virus dans l’air :

  1. Impacteurs (impaction inertielle)
  2. 1 Impacteur à fente
  3. 2 Cyclones
  4. 3 Barboteurs all-glass impingers (AGI-4, AGI-30)
  5. 4 Cyclones sec à 2 ou 3 étages
  6. Filtration
  7. Précipitateurs électrostatiques (LVS)
  8. Impacteur électrique à basse pression (ELPI)
  9. Autres méthodes (3)
A

1.1. - SRAS

  1. 2 - Virus aéroportés (fièvre aphteuse)
    - Avantage : permettre concentration d’un volume important d’air sur une surface sèche ou ds un petit volume de collection
    - Limite = - efficaces pour faible []
    - De Wells = influenza
  2. 3 - Biosamplers = grippe porcine et SRRP
  3. 4 Pour détection et quantifier spores de moisissures et de virus
    • part de 0,3 um pas efficacement échantillonés
      - Échantillonnage efficace < 300 nm
      - Limite : endommage virus -> donc analyse pas PCR (pas besoin d’infectiosité)
      - Filtre poreux (en polycarbonate) = bioaérosols plus gros que pores recueillis
      - Filtre fibreux (de téflon) = bioaérosols plus petits que pores recueillis
      - Filtre gélatine = conserve potentiel infectieux
    • peu utilisé pr virus
      - ds humidité = prod ozone
    • permet compte part 6 nm à 10 um
      - virus collectés = PAS infectieux -> PCR après
      - prometteur pour futur aérovirologie
      - comprend : source ions + impacteur multi-étages
      - substrat Al
      - pression de - de 40 mb requise
    • écouvillonnage des surfaces
      - prétris ouverts
      - animaux sentinelles
57
Q

Résumé les principales méthodes d’échantillonnage des virus dans l’air :

  1. Culture
  2. Bio moléculaire
A
    • Nécessite présence virus infectieux vivant intacte
      - technique de plaque pour bactériophage
      - échantillon étalé sur tapis de cellule
      - peut être compté par microscopie électronique
    • détection matériel génétique virus morts ou vivants
      - extraction de ADN ou ARN par PCR point final ou temps réel
      - trousses d’extraction dispo sur marché pr lyse des cellules virales, élimination pro et concentration et purification du matériel génétique
      - Limite : savoir quel virus est recherché et la méthode de détection à utilisé
58
Q

Que permet l’utilisation des virus modèles?

A

Mimer le comportement des virus patho pour humain dans l’air sans mettre en danger le personnel de labo.

59
Q
  • À quoi servent les traceurs?
  • Donnez des ex
  • Comment autre façon étudier efficacité de capture d’un échantillonneur?
A
  • Évaluer efficacité d’un échantillon à capturer des particules aérosolisées d’un da précis sans affecter leur intégrité et infectiosité.
  • P-32, uranite, rhodamine B et spores de bacillus
  • En branchant compteurs de particules en amont et en aval de l’appareil testé
60
Q

Quels sont les impacteurs les plus souvent utilisés pour les virus?

A

impacteurs liquides (AGI-30, SKC biosamplers)

61
Q

Vrai ou faux.

Les impacteurs à trous multiples, les impacteurs à fente, les cyclones et les barboteurs sont plus efficaces pour la capture de grosses particules.

A

Vrai.

62
Q

Vrai ou faux.

Les virus aérosolisés de SRRP sont plus efficacement écjantiollonés par le biosampler et l’AGI-30 que l’AGI-4.

A

Vrai.

63
Q

Vrai ou faux.

Les biosampler et les barboteurs ont été conçus pour l’étude des virus aérosolisés et sont efficaces pour l’échantillonnage des particules aérosolisés ultravides ou de - d’un micron soir des particules contenant potentiellement des virus.

A

Faux.

n’ont pas été conçus et ne sont pas efficaces

64
Q

Les filtres de polycarbonate (poreux) sont moins efficaces que les filtres PTFE (fibreux) pour l’échantillonnage des virus. PK?

A

Faible surface de contact des filtre de polycarbonate

65
Q

Si la conservation de l’infectiosité n’est pas importante, quel filtre sont plus efficaces pour l’échantillonnage à long terme de particules virales de 10 à 900 nm?

A

PTFE (téflon) d’une porosité 0,3 um

66
Q

Décrivez le fonctionnement des précipitateur électrostatiques (6 étapes).

A
  1. Air passe entre 2 plaques chargés
  2. Filaments chargés ionisent particules
  3. Particules chargées - sont arrivées sur plaque +
  4. Particules - s’accumulent sur plaque +
  5. Air sort épuré du système
  6. Particules sont récupérés en faisant vibres plaques
67
Q

Mise en situation… Je cherche un virus modèle pour étudier l’Influenza. Je n’ai toutefois accès qu’à un laboratoire ayant un niveau de confinement 1. Que me suggérez-vous?

A

Bactériophages (PhiX174)

68
Q

Quel type de virus est la fièvre aphteuse?

Quel est son sérotypage prédominant?

A

ARN non enveloppé

sérotype O

69
Q

Pk les humains sont rarement sensible au virus de la fièvre aphteuse?

A

neutralisation par le liquide gastrique

70
Q

L’ARN viral extrait est transformé en ADN à l’aide de quelle enzyme?

A

TRansciptase inverse

71
Q

En PCR, les amorces doivent cibler quels gènes de virus?

A

Les plus conservés a.k.a les protéines de la capside

72
Q

Quels bactériophages ont été les premiers modèles utilisés?

A

ordre des caudovirales (phages T-like)

73
Q

Qui est l’hôte des MS2?
Quel genre ADN?
Ressemble à quelle famille?

A

E. coli
ARN simple brin
Famille de poliomyélite, rhume, fièvre aphteuse

74
Q

Qui est l’hôte de phiX174?
Quel genre ADN?
Utiliser pour mimer qui?

A

E. coli
ADN simple brin
poliovirus et parvovirus

75
Q

Qui est l’hôte de phi6?

Utiliser pour mimer qui?

A

Pseudomonas synringae

petit virus enveloppé

Bioaérosols et aérobiologie (13 decks)

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