MICROORG DU SOL Flashcards

1
Q

Le CO2 en gaz dans l’atmosphère provient de ? (2)

A

respiration hétérotrophe des animaux et respiration autotrophes des plantes (la nuit)

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2
Q

durant le jour le CO2 est fixé par les plantes par

A

photosynthèse

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3
Q

une fois fixé apr les plantes, le carbone est libéré par __

A

par les racines des plantes

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4
Q

le carbone est stocké sous forme de ____ qui pourra être utilisé par les microorg et macroorg ___

A

carbone organique

telluriques

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5
Q

Dans le sol, des microorg ___ convertissent le carbone en méthane CH4+

A

métanogènes

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6
Q

le méthane peut ¸être soit relargué dans l’atmosphère par évaporation ou être utilisé par des microorg___ qui vont l’oxyder en CO2

A

méthanotrophes

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7
Q

Le N2 atmosphérique est fixé par quoi? et quelles sont leur 2 manières?

A

bct fixatrices d’azote du sol.

  1. par des bct fixatrices d’azote libres dans le sol
  2. bct fixatrices d’azote associés aux racines de plante dans un nodule symbiotique; l,azote fixé est transmis directement à la plante
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8
Q

Une fois l’azote libre fixé, il y a une ___ pour être transformer en NH4+.

A

ammonification

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9
Q

Une fois en NH4+, des __ __ convertissent en NO2- (nitrite) puis en NO3-

A

bct nitrificatrices

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10
Q

Une fois en nitrate (NO3-), quelles sont les 2 possibilités après?

A
  1. NO3- assimilés par les plantes, puis animaux, puis décomposition par bct et champi pour produire a nouveau du NH4+.
  2. bct dénitrificatrices convertissent NO3- en N2 atmosphérique.
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11
Q

les ions ferreux (Fe2+) sont oxydés de 2 manières:

A
  1. oxydation spontanée en Fe3+

2. respiration: bct utilisent le fer comme accepteur final d’é donc fait Fe3+

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12
Q

le Fe3+ (ion ferrique) est oxydé en quoi

A

hydroxyde de fer Fe(OH)3

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13
Q

une fois en Fe(OH)3, il se passe quoi pour aller en conditions anaérobie?

A

précipitation

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14
Q

Une fois le Fe(OH)3 précipité, en anaérobie, il se passe quelle rx?

A

réduction dissimilatoire par des bct pour etre transformée en Fe2+.

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15
Q

Une fois la réduction dissimilatoire en Fe2+, 2 possibilités:

A
  1. oxydation par bct ferro-oxydantes pour etre retransformer en Fe(OH)3
  2. Fe2+ se solubilise et remonte en surface.
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16
Q

le soufre retrouvé au sol provient de? (2) et sous quelle forme?

A
  1. environnement
  2. rejets industriels (homme)
    en sulfate (S04 -2)
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17
Q

quelles sont les bct qui réduisent le sulfate en sulfite? (S2-)

A

bct sulfato-réducteurs

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18
Q

quelles sont les 2 possibiltés pour le sulfite (S2-)

A
  1. oxydation spontannée

2. bct sulfureuse transforment S2- en S. Puis bct autotrophes qui transformentS en sulfate SO4-2

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19
Q

quel est l’effet des changements climatiques a court terme?

A

Plus ya de CO2 atmosphérique, plus ya de biomasse des plantes et de fixation du carbone dans le sol. À court terme, cela fait que ya plus de biomasse de microorg donc plus de CO2 séquestrée dans le sol.

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20
Q

quel est l’effet des changements climatiques a long terme?

A

le sol s’appauvrit en éléments nutritifs donc la communauté microbienne sera affectée. Dominance par les bct oligotrophes ce qui conduit a une reduction de CO2 atmosphérique. (ca a l’air bénéfique mais difficile de prédire a long terme)

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21
Q

quelles sont les 4 zones macroscopiques du sol

A
  1. terre de surface (rhizosphère)
  2. zone vadose
  3. zone capillaire
  4. zone saturée
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22
Q

combien de % de matière organique dans la terre de surface?

A

0.1 a 5%

23
Q

combien de % de matière organique dans la zone vadose?

A

moins de 0.1%

24
Q

la zone saturée est saturée en quoi et contient-elle bco de matière organique?

A

saturée en eau et non 0.1%

25
Q

quelles sont les zones microscopiques d’une particule de terre?

A
  1. riches en matière organique
  2. aérobie/anaérobie
  3. solide/liquide
  4. zone d’attachement au biofilm
26
Q

quel est le but du Earth microbiome projet? et quel en a été le résultat?

A

d’analyser des communautés microbiennes a travers le monde, dans différents types d’habitat.
- génération de fiches de repartition des microorg

27
Q

quels sont les bct les plus abondantes dans le sol?

A

proteobacterie et actinobacterie

28
Q

quel bct dans les protéobacteria sont les plus abondants?

A

alphaproteobacteria

29
Q

quels sont les bct majoritaires dans le sol des alphaproteobacteria? Elles sont situées a quel niveau du sol?

A

Bradyrhizobium
Rhodoplane
Sphingomonas
Devosia

surface de la terre , la rhizosphère

30
Q

quels sont les bct majoritaire dans le sol des betaproteobacteria?

A

Methylibium(hydrocarbure comme source de C)

Ramlibacter

31
Q

quelle sont les caractéristiques typiques de actinobacteries telluriques?

A

produisent mycélium et certains se reproduisent par sporulation.

32
Q

3 exemples d’actinobacteries

A

Streptomyces
Mycobacterium
Salinibacterium

33
Q

quelle bct produit des geosmins, responsable de l’odeur de la terre?

A

Streptomyces, une actinobct

34
Q

exemple d’acidobct. et caractéristique.

A

Candidatus Solibacter

bcp sont acidophiles

35
Q

quelle est la bct qui s’est adapté au souterrain?

A

Candidatus Desulforudis audxviator

36
Q

quel est le seul facteur qui influence la diversité microbienne du sol?

A

le pH

37
Q

quelle famille sont les microorg nodulaire et quel ordre?

A

alphaproteobct et ordre des Rhizobiales

38
Q

comment fonctionne la relation symbiotique des microorg nodulaire avec la plante?

A

la plante fournit le carbone et les bct fournissent azote

39
Q

qui s’occupe du transport d’oxygene aux bct nodulaires pour leur respiration?

A

une hemoglobine végétale (leghemoglobine) rose

40
Q

quels sont les 5 bct phytostimulateurs libres?

A

Azotobacter, Azospirillum, Pseudomonas, Bacillus et Paenibacillus

41
Q

un des 5 mécanismes de phytostimulation est la diazotrophie. Explique

A

production d’une nitrogenase codée par nifH

42
Q

un des 5 mécanismes de phytostimulation est l’amélioration de nutrition en P. explique

A

des bct peuvent solubiliser le P minéral en P organique, ainsi disponible pour la plante aussi.

43
Q

un des 5 mécanismes de phytostimulation l’amélioration de la nutrition en Fe. explique

A

transformation de Fe3+ (insoluble) en Fe2+ par Pseudomonas souvent

44
Q

un des 5 mécanismes de phytostimulation sont les effets positifs sur la croissance racinaires. explique

A

les bct ont 2 mécanismes pour stimuler la croissance des plantes.

  1. réduire le taux d’éthylene dans les racines ( facteur de stress des plantes)
  2. produire phytohormones reconnus par la plante pour induire croissance
45
Q

un des 5 mécanismes de phytostimulation est l’émission de composés organiques volatils(COVs) explique

A

bct produit COV qui induit croissance (mais pas de toute les plantes, ca depend)

46
Q

la biodégradation des hydrocarbures par des bct___

A

hydrocarbonoclastes

47
Q

les bct hydrocarbonoclastes produisent des ___ qui formera des microgouttelettes qui seront intégrés par ces bct

A

surfactants

48
Q

cest quoi la biominéralisation?

A

précipitation extracellulaire des métaux par bct (réduction des métaux)

49
Q

quelles sont les 3 aptitudes des plantes dans la phytoremédiation?

A
  1. phytodégradation
  2. phytoextraction
  3. phytostabilisation
50
Q

le controle microbien est bénéfique contrairement au fongicides, pesticides, etc car: (2)

A
  1. ne pollue pas l’environnement

2. pas toxique

51
Q

quel est le champignon ubiquitaire du sol qui forment des colonies souvent incolores utilisé dasn le controle microbien?

A

Trichoderma

52
Q

quel est le mécanisme de protection de Trichoderma?

A

c’est un mycoparaiste qui infecte d’autres champignons pathogènes. Il sécrète des enzymes lui permettant de penetrer les hyphes des champi.

53
Q

quel anitbio produit Trichoderma?

A

gliotoxine.