MICROORG DU SOL Flashcards
Le CO2 en gaz dans l’atmosphère provient de ? (2)
respiration hétérotrophe des animaux et respiration autotrophes des plantes (la nuit)
durant le jour le CO2 est fixé par les plantes par
photosynthèse
une fois fixé apr les plantes, le carbone est libéré par __
par les racines des plantes
le carbone est stocké sous forme de ____ qui pourra être utilisé par les microorg et macroorg ___
carbone organique
telluriques
Dans le sol, des microorg ___ convertissent le carbone en méthane CH4+
métanogènes
le méthane peut ¸être soit relargué dans l’atmosphère par évaporation ou être utilisé par des microorg___ qui vont l’oxyder en CO2
méthanotrophes
Le N2 atmosphérique est fixé par quoi? et quelles sont leur 2 manières?
bct fixatrices d’azote du sol.
- par des bct fixatrices d’azote libres dans le sol
- bct fixatrices d’azote associés aux racines de plante dans un nodule symbiotique; l,azote fixé est transmis directement à la plante
Une fois l’azote libre fixé, il y a une ___ pour être transformer en NH4+.
ammonification
Une fois en NH4+, des __ __ convertissent en NO2- (nitrite) puis en NO3-
bct nitrificatrices
Une fois en nitrate (NO3-), quelles sont les 2 possibilités après?
- NO3- assimilés par les plantes, puis animaux, puis décomposition par bct et champi pour produire a nouveau du NH4+.
- bct dénitrificatrices convertissent NO3- en N2 atmosphérique.
les ions ferreux (Fe2+) sont oxydés de 2 manières:
- oxydation spontanée en Fe3+
2. respiration: bct utilisent le fer comme accepteur final d’é donc fait Fe3+
le Fe3+ (ion ferrique) est oxydé en quoi
hydroxyde de fer Fe(OH)3
une fois en Fe(OH)3, il se passe quoi pour aller en conditions anaérobie?
précipitation
Une fois le Fe(OH)3 précipité, en anaérobie, il se passe quelle rx?
réduction dissimilatoire par des bct pour etre transformée en Fe2+.
Une fois la réduction dissimilatoire en Fe2+, 2 possibilités:
- oxydation par bct ferro-oxydantes pour etre retransformer en Fe(OH)3
- Fe2+ se solubilise et remonte en surface.
le soufre retrouvé au sol provient de? (2) et sous quelle forme?
- environnement
- rejets industriels (homme)
en sulfate (S04 -2)
quelles sont les bct qui réduisent le sulfate en sulfite? (S2-)
bct sulfato-réducteurs
quelles sont les 2 possibiltés pour le sulfite (S2-)
- oxydation spontannée
2. bct sulfureuse transforment S2- en S. Puis bct autotrophes qui transformentS en sulfate SO4-2
quel est l’effet des changements climatiques a court terme?
Plus ya de CO2 atmosphérique, plus ya de biomasse des plantes et de fixation du carbone dans le sol. À court terme, cela fait que ya plus de biomasse de microorg donc plus de CO2 séquestrée dans le sol.
quel est l’effet des changements climatiques a long terme?
le sol s’appauvrit en éléments nutritifs donc la communauté microbienne sera affectée. Dominance par les bct oligotrophes ce qui conduit a une reduction de CO2 atmosphérique. (ca a l’air bénéfique mais difficile de prédire a long terme)
quelles sont les 4 zones macroscopiques du sol
- terre de surface (rhizosphère)
- zone vadose
- zone capillaire
- zone saturée
combien de % de matière organique dans la terre de surface?
0.1 a 5%
combien de % de matière organique dans la zone vadose?
moins de 0.1%
la zone saturée est saturée en quoi et contient-elle bco de matière organique?
saturée en eau et non 0.1%
quelles sont les zones microscopiques d’une particule de terre?
- riches en matière organique
- aérobie/anaérobie
- solide/liquide
- zone d’attachement au biofilm
quel est le but du Earth microbiome projet? et quel en a été le résultat?
d’analyser des communautés microbiennes a travers le monde, dans différents types d’habitat.
- génération de fiches de repartition des microorg
quels sont les bct les plus abondantes dans le sol?
proteobacterie et actinobacterie
quel bct dans les protéobacteria sont les plus abondants?
alphaproteobacteria
quels sont les bct majoritaires dans le sol des alphaproteobacteria? Elles sont situées a quel niveau du sol?
Bradyrhizobium
Rhodoplane
Sphingomonas
Devosia
surface de la terre , la rhizosphère
quels sont les bct majoritaire dans le sol des betaproteobacteria?
Methylibium(hydrocarbure comme source de C)
Ramlibacter
quelle sont les caractéristiques typiques de actinobacteries telluriques?
produisent mycélium et certains se reproduisent par sporulation.
3 exemples d’actinobacteries
Streptomyces
Mycobacterium
Salinibacterium
quelle bct produit des geosmins, responsable de l’odeur de la terre?
Streptomyces, une actinobct
exemple d’acidobct. et caractéristique.
Candidatus Solibacter
bcp sont acidophiles
quelle est la bct qui s’est adapté au souterrain?
Candidatus Desulforudis audxviator
quel est le seul facteur qui influence la diversité microbienne du sol?
le pH
quelle famille sont les microorg nodulaire et quel ordre?
alphaproteobct et ordre des Rhizobiales
comment fonctionne la relation symbiotique des microorg nodulaire avec la plante?
la plante fournit le carbone et les bct fournissent azote
qui s’occupe du transport d’oxygene aux bct nodulaires pour leur respiration?
une hemoglobine végétale (leghemoglobine) rose
quels sont les 5 bct phytostimulateurs libres?
Azotobacter, Azospirillum, Pseudomonas, Bacillus et Paenibacillus
un des 5 mécanismes de phytostimulation est la diazotrophie. Explique
production d’une nitrogenase codée par nifH
un des 5 mécanismes de phytostimulation est l’amélioration de nutrition en P. explique
des bct peuvent solubiliser le P minéral en P organique, ainsi disponible pour la plante aussi.
un des 5 mécanismes de phytostimulation l’amélioration de la nutrition en Fe. explique
transformation de Fe3+ (insoluble) en Fe2+ par Pseudomonas souvent
un des 5 mécanismes de phytostimulation sont les effets positifs sur la croissance racinaires. explique
les bct ont 2 mécanismes pour stimuler la croissance des plantes.
- réduire le taux d’éthylene dans les racines ( facteur de stress des plantes)
- produire phytohormones reconnus par la plante pour induire croissance
un des 5 mécanismes de phytostimulation est l’émission de composés organiques volatils(COVs) explique
bct produit COV qui induit croissance (mais pas de toute les plantes, ca depend)
la biodégradation des hydrocarbures par des bct___
hydrocarbonoclastes
les bct hydrocarbonoclastes produisent des ___ qui formera des microgouttelettes qui seront intégrés par ces bct
surfactants
cest quoi la biominéralisation?
précipitation extracellulaire des métaux par bct (réduction des métaux)
quelles sont les 3 aptitudes des plantes dans la phytoremédiation?
- phytodégradation
- phytoextraction
- phytostabilisation
le controle microbien est bénéfique contrairement au fongicides, pesticides, etc car: (2)
- ne pollue pas l’environnement
2. pas toxique
quel est le champignon ubiquitaire du sol qui forment des colonies souvent incolores utilisé dasn le controle microbien?
Trichoderma
quel est le mécanisme de protection de Trichoderma?
c’est un mycoparaiste qui infecte d’autres champignons pathogènes. Il sécrète des enzymes lui permettant de penetrer les hyphes des champi.
quel anitbio produit Trichoderma?
gliotoxine.
