Microbiologie - Examen 1 Flashcards
Antonie Van Leewenhoek
Échantillon de la plaque dentaire
premier microscope
Origine de la microbiologie
Louis Pasteur
Procédé de fermentation
Théorie de la biogenèse (Un organisme vivant ne peut venir que d’un organisme vivant
Découverte des principes d’asepsie
Procédé de pasteurisation
Vaccination contre la rage
Edward Jenner
Vaccination contre la variole (conservé ajd dans 2 labo)
Joseph Lister
Mise en place des principes d’asepsie en laboratoire
Robert Koch
Postulats de Koch (pour prouver que les maladies sont d’origine bactériennes
Causes de l’anthrax, tuberculose, cholera
Vaccin contre la tuberculose
Alexander Fleming
Pénicelline
Pourquoi certains microorganismes sont nos ennemis
Détérioration de nos aliments
Détérioration d’équipements
Pourquoi certains microorganismes sont nos amis
Industrie alimentaire
Industrie pharmaceutique
Agents probiotiques
Environnement (insecticides)
Quelle est la bactérie la plus connue
Escherichia coli (Eucolie)
Microbiome buccal:
Combien d’espèces bactériennes différentes?
Combien de bactéries par gramme de plaque dentaire?
Combien d’espèces bactériennes différentes / personne?
Combien de bactérie par cellule épithéliale?
- 700-800
- 10^11
- 200-300
- 100
Nomenclature: échelle hierarchique du plus large au plus précis
Monde vivant - Domaine - Règne - Embranchement - Classe - Ordre - Famille - Genre - Espèce
Différence entre les être Eucaryotes et procaryotes
Identifie les composantes de la cellule
Fonctions membrane cytoplasmique
Transport trans-membranaire
Transport des électrons
Sécrétion d’enzymes / toxines
Fonctions paroi bactérie
Donne la forme
Protection contre la lyse
Protection contre le stress environnemental
Procure une perméabilité sélective
Comparaison des enveloppes cellulaires des bactéries: Gram + vs Gram -
Étapes de la coloration de Gram
Fonction capsule bactérie
Adhérence à des surfaces
Protection bactérie contre dessiccation, variation pH, phagocytose par les cellules de l’hôte
Fonctions glycocalyx
polysaccharides sécrétés par la cellule
attachement aux cellules et aux structures abiotiques
protège l’enveloppe cellulaire
Structure/fonction flagelle bactérie
Structure: protéine
Fonction: motilité
Structure/fonction Fimbriae
Structure: Protéine
Fonction: adhérence des bactéries aux surfaces
Fonction/structure pili bactérie
Structure: épais et court, protéine
Fonction: Échange de matériel génétique entre 2 bactéries
Fonction spores bactériens
Résistance aux stress environnementaux: se forme seulement quand les conditions deviennent défavorables pour la bactérie (Résiste bcp à la chaleur)
Forme et fonction du chromosome bactérien et du plasmide bactérien
Chromosome: ADN, sucre-nucléotide-base azoté (1 nucléotide) / Double hélice et circulaire
Plasmide: ADN extra-embryonnaire, petit et circulaire, apporte une fonction supplémentaire à la bactérie (Résistance antibiotiques, expression d’une toxine)
Quel est le mode de division des bactéries
Division binaire (formation d’un septum)
Quelles sont les 2 raisons pour lesquelles un chromosome bactérien varierait?
Mutation (spontané et rare)
Recombinaison génétique (fréquent)
Recombinaison génétique: Transformation (explication du processus)
Introduction d’ADN bactérien dans une bactérie réceptrice
Recombinaison génétique: Transduction (explication processus)
Introduction d’ADN bactérien dans une bactérie réceptrice par l’introduction d’un bactériophage
Recombinaison génétique: conjugaison (explication du processus)
Introduction d’ADN bactérien suite à un contact entre une bactérie donatrice et une bactérie réceptrice (via pili)
Quelles sont les caractéristiques dont on tien en compte lors de la classificaiton et de l’identification des bactéries?
Morphologie: Forme, taille, cils, flagelle, inclusions cellulaires
Physiologie: source d’énergie, constituants paroie cellulaire, Relation avec l’oxygène, métabolites secondaires
Métabolisme bactérien (Transformations chimiques): différence entre l’anabolisme et le catabolisme
Catabolisme: dégradation moléculaire
Anabolisme: Réactions de synthèse
Quels sont les besoins énergétiques des bactérie?
Énergie: Lumineuse (phototrope la transforme en ATP grâce à des pigments: chlorophylles,…) / chimique (oxydation des molécules minérales (chimio-lithotrophes) ou organique (chimio-organotrophes))
Carbone
Quelles sont les 2 catégories de microorganismes en fonction de leurs exigences nutritionnelles en carbone?
Autotrophes: se développent en milieu minéral (inorganique ou en utilisant le CO2 ou le HCO3- comme source de carbone
Hétérotrophes: exigent des molécules organiques pour leur croissance
Comment se nomment les bactéries qui vivent à des températures de:
0-20˚C
20-45˚C
+ que 45˚C
- Psychrophile
- Mésophile
- Thermophile
Comment se nomment les bactéries qui vivent à des pH de:
6.5-7.5
1-5
8-12
- Neutrophile
- Acidophile
- Alcalophile
Relation entre les bactéries et l’oxygène 4 types
- Aérobie stricte
- Microaérophile
- Anaérobie facultative
4é Anaérobie stricte
Quelles sont les caractéristiques d’une culture pure de bactéries
Culture originaire d’une seule cellule provenant d’une seule espèce
Quels sont les différents types de composition chimiques des milieux de cultures de bactérie? Quelles sont leurs caractéristiques?
Défini: composantes connues
Complexe: riche en nutriments divers (viande, protéines)
Sélectif: composantes établies et spécifiques dans le but d’isoler une espèce. Il peut y avoir l’ajout d’inhibiteurs
Différentiel: Permet de différencier 2 espèces et d’en mettre une en évidence. (Bactéries coliformes = lactose + indicateur de pH)
Quelles sont les différents états physiques dans lesquels il y a des milieux de cultures de bactéries? Quelles sont leurs caractéristiques?
Liquide: bactéries se divisent toutes les 20-30 mins, croissance homogène, permet de mesurer la croissance de ces bactéries
Solide (gel): 3 types: Lisse, muqueux ou rugueux. Permet l’énumération, la différenciation et l’isolement de bactéries.
Quel est l’instrument de mesure qui permet de déterminer une courbe de croissance bactérienne?
Turbidimètre
Quelles sont les 4 phases d’une courbe de croissance bactérienne?
- Phase de latence: attente/préparation
- Phase exponentielle
- Phase stationnaire: espace limité, accumulation de déchets, limite nutriments
- Phase de déclin: trop de déchets accumulés
Quelles sont les étapes de l’analyse de la microflore buccale? Quelles sont leurs caractéristiques?
Échantillonnage: possibilité de contamination avec d’autres bactéries
Transport au laboratoire: Adapté, plus court possible
Observation microscopique: coloration de Gram, permet de déterminer les proportions des différents morphotypes
Dispersion de l’échantillon: permet de séparer les agrégats en cellules individuelles, vortex/ultrason
Culture: Étalement sur milieux de culture
Identification
Comment peut-on identifier le phénotype d’une bactérie?
morphologie cellulaire
Coloration de gram
réponse à l’oxygène
Tests biochimiques
Quelles sont les 2 méthodes d’identification génétique d’une bactérie?
- Le test PCR (Polymerase en chaîne)
- Le séquençage de l’ADN
Qu’est-ce que le test PCR? (polymerase en chaîne)
Méthode d’amplification génique in vitro
duplication d’une séquence d’ADN/ARN connue à partir d’acide nucéique et d’amorces spécifiques
On doit connaître d’avance ce qu’on cherche
Quelles sont les étapes du séquençage du gène ARN 16S? À quoi cela sert-il?
- Isolement ADN de la bactérie à identifier
- Utilisation d’amorces universelles, amplification (PCR) du gène codant pour le gène de l’ARNr 16S
- Comparaison de la séquence avec des banques de données
- Identification avec % de certitude
Permet d’identifier une bactérie jusqu’au genre
Qu’elles sont les caractéristiques du séquençage de type Shotgun? À quoi cela sert-il?
Séquençage du génôme entier
Tous types d’ADN sont détectés
Permet de déterminer l’abondance relative de l’espèce
Permet de déterminer les voies métaboliques des communautés microbiennes
Permet l’identification jusqu’à l’espèce de la bactérie.
Quelles sont les 2 techniques de conservation des bactéries?
Congélation: -80˚C = congélateur / -180˚C = azote liquide
Lyophilisation: déshydratation sous vide (congélation à long terme)
Taille des virus?
20-300 nm : plus petit agent infectueux
Qu’est-ce qu’un bactériophages? Quelles sont ses caractéristiques/sa structure?
Définition: Virus infectant spécifiquement les bactéries
Structure: Tête = glycoprotéine (matériel génétique) / Queue = protéine (fixation à la bactérie)
Quel est le mécanisme d’infection du bactériophage?
Injecte son matériel génétique à travers la membrane de la bactérie
- Arrivée (reconnaissance spécifique)
- Fixation
- Contraction de la queue
- Pénétration du matériel génétique
- Injection de l’ADN
Quelles sont les 2 types de mycètes? Leurs caractéristiques? (taille/forme/O2)
Levures: ovale / 5-10 µm / anaérobie facultative
Moisissures: forme complexe / 5µm - …mm / aérobie stricte
Quelles sont les modes de reproduction des mycètes?
Asexué: fission binaire
Sexuée: fusion de 2 spores
Nommer des (2) mycètes pathogènes
Mycose superficielle (Candida albicans): stomatite chez les porteurs de protèses, vaginite
Mycose en profondeur (Aspergillus fumigatus): Aspergillose (poumons)
Quelle est la différence entre un antibiotique bactéricide et bactériostatique?
Bactéricide: mort bactérie
Bactériostatique: empêche la croissance de la bactérie
Mécanisme d’action des antibiotiques (Effet bactéricide ou bactériostatique / noms d’antibiotiques / caractéristiques) : Inhibition de la formation de la paroi
Bactéricide
Pénicilline et vancomycine
Bactéries gram + sensibles
inhibition de la transpeptidase (enzyme qui lie les molécules des peptidoglycans)
Mécanisme d’action des antibiotiques (Effet bactéricide ou bactériostatique / noms d’antibiotiques / caractéristiques) : Modification de la perméabilité de la membrane
Bactéricide
Polymyxine
Fuite des composantes intracellulaires
Mécanisme d’action des antibiotiques (Effet bactéricide ou bactériostatique / noms d’antibiotiques / caractéristiques) :Inhibition de la synthèse des protéines
Bactéricide ou bactériostatique
Fixation sur les ribosomes
Tétracycline / érythromycine
Mécanisme d’action des antibiotiques (Effet bactéricide ou bactériostatique / noms d’antibiotiques / caractéristiques) : Inhibition de la fonction des acides nucléiques
Bactéricide ou bactériostatique
Réplication ADN : métronidazole
Transcription ADN et ARNm ; rifampicine
Mécanisme d’action des antibiotiques (Effet bactéricide ou bactériostatique / noms d’antibiotiques / caractéristiques) : inhibition compétitive
Bactériostatique
Sulfamides ou analogues de vitamines
empêche la synthèse d’acide tétrahydrofoliquee nécessaire à la croissance de certaines bactéries
Quels antibiotiques ont un spectre d’activité étroit?
Métronidazole et pénicilline
Quels antibiotiques ont un spectre d’activité large?
Tétracycline et Érythromycine
Classe d’antibiotique (Action à quel niveau / Bactéricide ou bactériostatique / caractéristiques) : Pénicilline
Action au niveau de la synthèse de la paroi
Bactéricide
Présence de groupement B-lactame qui entraîne une résistance aux antibios
naturelle/modifiée
possibilité d’hypersensibilité
Classe d’antibiotique (Action à quel niveau / Bactéricide ou bactériostatique / caractéristiques) : Céphalosporines
Action au niveau de la synthèse de la paroi
Bactéricide
Structure chimique similiaire à la pénicilline mais spectre d’activité plus large
Classe d’antibiotique (Action à quel niveau / Bactéricide ou bactériostatique / caractéristiques) : Aminoglycosides
Action au niveau de la synthèse des protéines
Bactéricide
Efficace contre les bactéries aérobies à Gram -
Non-absorbée par l’intestin
Classe d’antibiotique (Action à quel niveau / Bactéricide ou bactériostatique / caractéristiques) : Tétracycline
Action au nivau de la synthèse des protéines
Bactériostatique
spectre tres large
Classe d’antibiotique (Action à quel niveau / Bactéricide ou bactériostatique / caractéristiques) : Érythromycine
Action au niveau de la synthèse des protéines
Bactériostatique
Spectre très large
Bon choix pour personnes allergiques à la pénicilline
Classe d’antibiotique (Action à quel niveau / Bactéricide ou bactériostatique / caractéristiques) : Métronidazole
Action au niveay de la réplication de l’ADN
Bactéricide
Spectre d’activité restrein aux bactéries anaérobies
À quoi sert un antibiogramme?
Déterminer vis-à-vis de quel antibiotique une bactérie est sensible
Qu’est-ce que le CMI
Concentration minimale inhibitrice: Concentration d’antibiotique la plus faible pour empêcher l’apparition d’une croissance bactérienne visible
Qu’est-ce que le CMB
Concentration minimale bactéricide: La plus petite concentration en antibiotiques capable de tuer 99,99% d’une population bactérienne en 18-24h.
Quels sont les 2 types de méthodes de diffusion utilisées par les antibiogrammes et que permettent-elles de mesurer?
Gélose: sensibilité et CMI antibiotiqe
Liquide
Pourquoi développe t’on une résistance aux antibiotiques?
Prescription abusive
Utilisation massive dans les élevages et dans le milieu hospitalier
apparition de bactéries multi-résistantes
Quels sont les principaux mécanismes de résistance aux antibiotiques?
Décomposition des antibiotiques par des enzymes
Modification de la perméabilité membranaire (réduction du nombre de porines dans la bactérie)
Expulsion des antibiotiques hors de la cellule
bactérienne grâce à des pompes d’efflux
Modification ou remplacement de la cible thérapeutique
Comment peut-on contrôler l’apparition de résistance aux antibiotiques?
Éviter l’usage abusif
Respecter la posologie (temps/dose)
Combiner des antibiotiques
Changer d’antibiotique quand apparition d’un oganisme résistant
Quelles sont les propriétés idéales d’un antibiotique?
Activité sélective
Affecte pas la flore normale de l’hôte
Bactéricide
N’induit pas de résistance
Ne crée pas d’allergie
Conserve son activité au contact de n’importe quel tissus ou fluide du corps
stable et soluble dans l’eau
Atteind rapidement un taux sanguin bactéricide et pour le temps que doit durer le traitement
administration par voie orale et voie générale possible
Élimination facile par le corps (À un taux qui maintien son action dans le sang)
Facilement disponible et à prix abordable
Agents anti-mycètes: nommer 3
Fluconazol, flucytosine, griseofluvine
Agents anti-viraux: disponibilité? Mode d’action?
Peu nombreux
agit en perturbant chimiquement un moment précis du cycle de réplication d’un virus
Action directe sur un virus
Amplifie la réponse de l’hôte face à un virus
Quelles sont les caractéristiques qui permettent l’identification et la classification des bactéries
Morphologie: forme, taille, cils, flagelles. inclusions cellulaires
Physiologiques et métaboliques: source d’énergie, constituants de la paroi cellulaire, relations avec l’oxygène et métabolites secondaires
Quelles sont les sources d’énergie des bactéries
-Lumineuse
-Chimique
comment l’énergie lumineuse est transformée en ATP dans les bactéries
grâce à des pigments: chlorophylle, bactriochlorophylles, carotènes
D’où provient l’énergie chimique des bactéries
oxydation des molécules minérales ou organiques