Microbiologie de l'eau Flashcards
Quels paramètres influencent la croissance microbienne dans le milieu aquatique ?
Salinité, température, lumière, pH, [nutriements] (molécules inorganiques et organiques), [O2 dissous et potentiel redox (Eh), pression hydrostatique, turbidité mouvement
Qu’est-ce que la salinité ?
Quantité de sels dissous dans un volume d’eau donné
Provient de l’érosion des roches de la lithosphère produite par les eaux de ruissellement/souterraines
Types d’eau : douces, saumâtres (transition douce et salée) et salée (NaCl = principal)
Comment la salinité influence la croissance microbienne ? (Quels types de bactéries, leurs adaptations, où on les trouve)
Halophiles obligatoires/strictes : se développe slmnt dans milieu hypersalin, dépendance absolue à grande [NaCl]
Contient : halophiles modérés (5-15% [NaCl]) et extrêmes (10-30%, paroi se désintègre si inférieur à 8%) Adaptations : Utilisation canaux Na+/K+ et augmente osmolarité intra¢
Halotolérants/halophiles simples : tolèrents grande [NaCl] mais ø besoin, 2-5%
Se trouvent dans eaux salées (mers/océeans), ø halophiles dans rivières et lacs (eau douce
Comment la température influence la croissance microbienne ?
Influencées par :
-Latitude
-Profondeur :
Surface : 0°C en région polaires = psychrophiles/trophes ET 40°C régions équatoriales = mésophiles
Sous surface : 0-5° = psychrophiles/trophes
Fonds marins : évents thermiques 350°C = thermophiles/hyperthermophiles
-Moment de la journée et de l’année (été vs hiver)
T° de croissance et optimum pour psychrophiles
Croissance : -5 à 20°C
Optimum : 15°C
T° de croissance et optimum pour psychotrophes
Croissance : 0-35
Optimum : 20-30
T° de croissance et optimum pour mésophiles
Croissance : 15-45
Optimum : 37
T° de croissance et optimum pour thermophiles
Croissance : 40-80
Optimum : 50-60
T° de croissance et optimum pour hyperthermophiles
Croissance : 65-110
Optimum : 80-90
Comment la lumière influence-t-elle la croissance microbienne ?
Par la photosynthèse :
-produit molécules organiques à partir du CO2
-Par algues/cyanobactéries
-Dans zone euphotique, phonique et épipélagique : zone où lumière pénètre dans eaux et permet photosynthèse des algues/autres végétaux photosynthétiques
3 informations sur la zone euphotique/photique/Épipélagique ?
-profondeur dépend pénétration lumière solaire donc turbidité des eaux
-Lieu de production primaire, zone océanique riche biologiquement
-En-dessous 1% de lumière incidente, quitte zone photique, devient zone aphasique = ø éclairé avec endolIthes ou uo endolithiques
Nommer des adaptations microbiennes influencent le spectre d’absorption de certains organismes photosynthétiques ?
Algue verte (chlorophycophyta) : contient chlorophylle a = pics d’absorption maximale à 665 (rouge) et 430 nm (bleue)
Cyanobactérie (synechococcus) : idem
Algue rouge (porphyridium) : pics d’absorption maximale à 550 nm à cause d’un pigment accessoire, le phycoérythrine
Types de pigments influence position verticale. Ex Chlorobium, bactéries vertes soufrées, utilisant énergie longueurs d’ondes courtes pénétrant + dans l’eau = plus profondes qui cyanobactéries
Pourquoi le partage du specter lumineux ?
Maximiser capacités photosynthétiques et diminuer compétition entre phototrophes
Qu’est-ce que le pH? comment le calculer &
log - [H+] = log (1/H+]) = pH
Mesure de l’acidité relative d’une solution
Qu’est-ce qu’un acidophile ?
pH : <4
Optimum : 2-3,5
Qu’est-ce qu’un neutrophile ?
pH : 4-8
Opti : 6,5-7,5
Qu’est-ce qu’un alcalophile ?
pH : >8
Opti : 9,5-11,4
Qu’est-ce qu’un alcotolérant ?
supporte milieux au pH >9, optimum = autour < ou = à 7
Quelles bactéries trouve-t-on dans l’eau de mer et pourquoi ?
neutrophiles et alcalophiles car pH 7,5 à 8,5, moyenne de 8,3
Quelles bactéries trouve-t-on dans les lacs et rivières et pourquoi ?
pH + variable, influencé par condition locales
Expliquer le système tampon carbonate et les effets des autotrophes sur celui-ci ?
Plus l’eau est tamponnée, - son pH varie
Quand autotrophes utilisent CO2 dissous (H2CO3) pour photosynthèse, pH augmente (donc +CO2 -> +de H2CO3-> pH diminue, vice versa)
Comment la concentration en nutriments (molécules organiques et inorganiques) influence-t-elle la croissance microbienne ?
-Pour composé org et inor : dépend de types et [ ] respectives
Composés inorganiques : phosphates et nitrates en excès–> explosion croissance algues, plantes aquatiques et cyanobactéries –> O2 dissous diminue = eutrophisation
La charge nutritives ([nutriments] de molécules org et inorganiques) varie selon…?
Courants :
zone pélagique = centre océan = faible charge nutritive stable, effet dilution
près zone côtière = bord océan = + nutriments –> remontée des eaux (upwelling, vents forts poussent eau surface océans = vide où remontent eaux des profondeurs chargées en nutriments)
Déversements :
effet antibactérien des déchets industriels (effet toxique métaux lourds = - uo)
effet nutritif des déchets industriels (composés organiques = alimentation = +uo)
Comment l’eutrophisation des lacs influencent les microorganismes ? (en parlant des 3 tubes d’eutrophisation)
oligotrophes : aérés et peu de mo, peu de végétaux bcp d’sp
mésotrophes : O présent et mo partiellement minéralisée
eutrophes : peu d’O et bcp de mo, bcp végétaux peu d’sp