Microbiologie Flashcards
Chapitre1à6
Expérience de Francesco Redi
-réfute la notion de la génération spontanée
-génération spontanée: la nature peut spontanément s’organiser pour donner l’existence à une forme de vie
-“La vie est nécessaire pour faire la vie”
Création de Antonie van Leeuwenhoek
-observe pour la première fois des micro-organismes à travers le premier microscope
Expérience de Needham
-veut prouver Redi tort
-ne réussit pas, puisqu’il n’a pas bouché le contenant avant de le bouillir
Expérience de Spallanzani
-prouve que les microbes viennent de l’air
-personne n’est convaincu
Expérience de Pasteur (1857-1895)
-chauffe boullion dans contenant couvert de coton (évite contamination)
-met coton dans bouliion et observe contamination
-montre que les microorganismes sont présents dans l’air
-découvre que les levures font fermenter le sucre pour donner alcool
Louis Pasteur en 1861
-démontre l’absurdité de l’idée de la génération spontanée
-méthode de stérélisation (destruction des microorganismes par la chaleur)
Rôle de Robert Koch
-médecin allemand et le premier à avoir confirmé l’implication des bactéries dans les maladies
-microbiologie médicale
-1873-1882: met en évidence le bacille responsable de la tuberculose
Pasteur en 1879
-effectu le premier vaccin vivant atténué sur des poules contre le choléra
-enlève le pouvoir pathogène du virus et l’injecte pour former une immunité
-évite de retomber malade
Découverte de Alexander Flemming
-découvre le premier antibiotique (péniciline)
-boîte contaminée de pénicillium (moisissure) qui inhibe l’activité du Staphylococcus
Domaines du vivant
-Eucaryotes (domaine le plus important)
-Bactéries (procaryotes)
-Archéobactéries (procaryotes)
-les virus ne sont pas des organismes vivants (ne peuvent pas produire leur propre énergie)
-Acaryotes (pas de noyau ni d’organisation cellulaire)
Organisations des cellules eucaryotes et procaryotes
Écriture des espèces bactériennes (binome)
-Genre espèce en italique
Formes et arrangement (coque)
-cocci
-diplocoque
-streptocoque
-staphylocoque
-tétrades
-sarcines
Formes et arrangement (bâtonnets)
-bacille
-diplobacille
-streptobacille
-coccobacille
Formes et arrangement (spirallés)
-vibrion
-spirille (forme héliocïdale et corps rigide)
-spirochète (forme héliocïdale et corps fléxible)
Méthodes de classifications
-coloration Gram
-mobilité (cils, flagelles, etc.)
-capacité à sporuler et photosynthèse
-température de croissance
-besions nutritionnels
-mode respiratoire
Rôle dans le maintien de l’équilibre écologique
-vivent dans le corps humain et animal (santé)
-servent dans applications commerciales
-causent des maladies (propriétés pathogènes vs résistance de l’hôte)
Relation avec les animaux et les végétaux
-les pathogènes (+/-)
-le microbiote commensal (+/0)
-le mutualiste (+/+)
Écologie microbienne
-eau: présence indique une forte concentration d’éléments nutritifs
-sol: décomposition des déchets et revitalisation des sols par la réintégration de minéraux
-atmosphère: en suspension, attachés aux particules de poussière
Acaryotes
-pathogènes intracellulaires obligatoires
-virus: simple ou double brin d’ADN ou d’ARN entouré de couche protéinée
-viroïdes: ARN seulement, infectueux (seulement chez végétaux)
-prions: protéine avec forme 3D infectueuse qui déforme les autres protéines
Pathogènes oportunistes
-mutualiste ou commensaliste qui devient parasitaire pour se reproduire en masse
-potentiel infectueux
Infection nosocomicale
-pathogène acquis à l’hôpital
-entraîne infections parfois graves
Structures obligatoires
-chromosome (Info génétique et synthèse protéines)
-plasmide (ADN hors du chromosome, pili sexuel)
-paroi cellulaire (gram + ou -)
Structures facultatives
-fimbrea et pili
-flagelle
-capsule, couche mucoïde et biofilm
-inclusions cytoplasmique
-endospore
Paroi gram +
-peptidoglycane: par dessus membrane et inclu TA et LTA
-acides: téchoïques (TA) et lipotéchoïques (LTA)
-protéines membranaires: membrane
Paroi gram -
-membrane externe
-périplasme (milieu liquide entre 2 membranes)
-peptidoglycane: dans périplasme (résistance chimique et physique)
-lipopolysaccharide: dans membrane externe (inclu Lipide A)
-lipide A: cause symptomes et libéré durant lyse
Capsule et couche mucoïde
-capsule: empêche la phagocytose
-couche mucoïde: mène au biofilm, adhérence entre bactéries et surfaces, résistance +,
-biofilm: bactéries synchronisent expression des gènes (communication), plus de résistance, potentiel infectueux élevé
Flagelles
-moteur protéique complexe qui permet tactisme (chimiotactisme et phototactisme) par récepteurs membranaires
-monotriche, lophotriche, amphitriche, péritriche
Inclusions cytoplasmiques
-stockage de molécules
-dépots cytoplasmiques entourés de protéines
Endospore
-protection contre conditions extrêmes en s’auto-tuant pour expulser son code génétique entouré d’une membrane de protéines
-lorsque l’environnement n’est plus favorable
-inerte et déshydratée
Fimbrea et pili
-appendices filamenteux différenciés par nombre et longueurs
-pili: long et peu nombreux, transfert de matériel génétique et mobilité
-fimbrea: court et nombreux, utilisé dans l’adhésion et invasion cellulaire, essentiel pour biofilms
Principe de la respiration cellulaire
-aérobie: fort potentiel redox
-anaérobie: faible potentiel redox
-aérobie plus rapide qu’anaérobie
Respiration aérobie
-glycolyse produit pyruvate qui est utilisé pour cycle de Krebs
-chaine de transport d’électrons à l’accepteur final d’électrons (O2)
Fermentation
-accepteur final d’é: molécule organique
-O2 pas nécessaire
-pas de chaine de transport d’é (potentiel redox faible)
-homo/hétérofermentation: carbone fermenté en une ou plusieurs molécules
Fermentation alcoolique
-produits: 2 ATP, CO2 et éthanol
Fermentation lactique
-produits: 2 ATP et acide lactique
Respiration anaérobie
-dégradation complète de source de carbone
-accepteur d’é: molécule inorganique autre qu’O2
-desulfovibrio: SO4 en H2S
-méthanogènes: CO3 en CH4
-bactéries dénitrifiantes: NO3 en N2
Hétérotrophe chimiooranotrophes
-source de carbone: molécules organiques (hétéro)
-donneur d’é: molécule organiques (organo)
-source d’énergie: molécules organique (chimio)
Autotrophe chimiolithotrophe
-source de carbone: CO2 (auto)
-donneur d’é inorganique: fer, H2, Arsenic (litho)
-métabolisme énergétique: fermentation et respiration
Autotrophe photolithotrophe
-source de carbone: CO2
-donneur d’é: molécule inorganique
-énergie lumineuse produit ATP (photo)
Hétérotrophe photoorganotrophe
-source de carbone: molécule organique
-donneur d’é: molécules organiques
-énergie lumineuse produit ATP
Métabolismes énergétiques des procaryotes
Besoins pour la croissance de bactéries
-besoins nutritifs uniques
-facteurs environnementaux spécifiques
Conditions de croissance
-température
-pH
-pression osmotique
-oxygène
Condition de croissance: température
-elle influence les réactions enzymatiques (métabolismes, reproduction)
-fenêtre optimale: croissance maximale
-fenêtre min/maximale: croissance minimale
Bactéries psychrophiles
-fenêtre optimale: 15 degrés
Bactéries psychrotrophes
-autour de nous
-fenêtre optimale: 25 degrés
Bactéries mésophiles
-dans notre corps
-fenêtre optimale: 37 degrés
Bactéries thermophiles
-extrêmophiles
-fenêtre optimale: 61 degrés
Bactéries hyperthermophiles
-extrêmophiles, habituellement des archées
-fenêtre optimale: 92 degrés
Condition de croissance: pH
-métabolisme énergétique est adapté à l’environnement
-acidophiles à neutrophiles à alcalophiles
Condition de croissance: pression osmotique
-milieu isotonique: aucun changement
-milieu hypertonique: perte d’eau (plasmolyse)
-milieu hypotonique: lyse de la paroi (trop d’eau rentre)
Condition de croissance: oxygène
-aérobie strict: resp. aérobie
-anaérobie strict: resp. anaérobie
-anaérobie aérotolérant: resp. anaérobie
-anaérobie facultatif: resp. aérobie, anaérobie et fermentation
-microaérobie (O2 obligé, mais pas trop): resp. aérobie
Courbe de croissance
- Phase de latence
- Phase exponentielle/ de croissance
- Phase stationnaire
- Phase de déclin
Phase de latence
-adaptation de la bactérie aux conditions
-population augmente peu
-activité métabolique élevée
-bactérie augmente de volume
-temps de génération très long
Phase exponentielle
-taux de croissance le plus élevé
-peu de mortalité
-temps de génération très court
-métabolisme bactérien le plus élevé
Phase stationnaire
-accumulation de déchets, pas assez de nutriments
-peu de croissance, plus de mortalité
-métabolisme diminue
-mutations adaptives pour mieux survivre
-sécrétion d’exotoxines, antibiotiques et bactériocines
Phase de déclin
-mortalité plus élevé, pas de croissance
-déclin de population
Organisation d’un opéron
-précédé d’un gène régulateur (produit répresseurs)
-structure: promoteur, opérateur, gènes de structure
-promoteur et opérateur déterminent si transcription et cmb de fois
Types de régulation
-répression: corépresseur se lie au répresseur pour bloquer transcription (sinon trasncription pas bloquée par répresseur)
-induction: coinducteur se lie au répresseur pour permettre transcription (sinon trascription bloquée par répresseur)
-catabolique: activateur se lie à ARN polymérase pour renforcer liaison au promoteur (molécule de signalisation de stress se lie à l’activateur pour l’activer)
Déf: colonie et biofilm
-colonie: regroupement de bactéries génétiquement identiques provenant d’une seule bactérie
-biofilm: tas structuré de cellules bactériennes enrobés d’une matrice polymérique et attachés à une surface
Types de milieux de culture
-enrichi: plusieurs molécules complexes présentes pour qu’une grande variété de bactéries puisse grandir
-sélectif: contient un agent inhibiteur qui empêche la croissance d’un groupe de bactéries
-différenciel: permet d’observer un changement visuel qui indique la présence/absence d’une molécule précise en lien ave le métabolisme de la bactérie
Différentes géloses
-TSA: (enrichi)
-sang: (enrichi et différentiel) met en évidence hémolyse des globules rouges (hémolyse complète beta = gélose transparente; partielle alpha = gélose verdâtre)
-mannitol-sel: (sélectif et différentiel) uniquement staphylococcus peut grandir et gélose devient jaune si fermentation du mannitol
-MacConkey: (sélectif et différentiel) uniquement entérobactérie peut grandir et gélose rose si fermentation du lactose
Test biochimique de la catalase
-catalase: enzyme qui dégrade peroxyde en eau + CO2
-présence de catalase forme des bulles à cause du peroxyde ajouté
Test biochimique de l’oxydase
-détecte la présence du cytochrome C oxydase
-couleur bleu si cytochrome présent
Test biochimique du rouge de méthyle
-détecte production d’acides à partir du glucose
-couleur rouge si fermentation du glucose (après 24h)
Test biochimique de Voges-Proskauer
-détecte la production d’acétoïne à partir du glucose
-couleur rouge si production d’acétoïne
Test avec gélose de citrate
-détecte l’utilisation du citrate comme source de carbone
-gélose couleur bleue si citrate utilisé
