Méthodes d'analyses Flashcards
Pourquoi certains gènes peuvent être utilisés comme chronomètre moléculaire de l’évolution?
- la fréquence des mutations moléculaires est relativement constante avec le temps
- séquences génétiques spécifiques conservées entre les espèces apparentées
calibré à l’aide d’un point de référence
distribution universelle - fonction homologue (SSU ARNr, prot choc thermique,ARNt synthetase, etc)
Quelles sont les caractéristiques phénotypiques permettant l’identification des procaryotes?
morphologie,motilité,métabolisme,physiologie,autres traits(pigments,serotype,etc)
Quelles sont les méthodes d’analyses génotypique?
hybridation ADN-ADN
pourcentage C+ G
utile lorsque l’on connait pas la séquence en ADN génomique
séquençage ARN ribosomal (SSU rRNA)
séquençage multilocus (housekeeping genes)
ribotypage
séquençage génomique
Dans quel contexte les méthodes d’analyses génomiques sont utilisées?
comparative
différences et similitudes
déduire la fonction des gènes
Shotgun sequencing
clonage de fragments du génome
séquençage Sanger des clones
Qu’est-ce qu’un gène homologue?
même gène ancestral
Qu’est-ce qu’un gène orthologue?
homologues qui ont divergés suite à la spéciation
Qu’est-ce qu’un gène paralogue?
homologues qui sont issus d’un événement de duplication