Metabolisme Flashcards
Hvad er koncentrationen over hvis det er et makro næringsstof?
over 0.1 mM
Hvad er koncentrationen under hvis det er et mikro næringsstof?
under 0.1 mM
Hvad er heterotrophe mikroorganismer
mikro organismer der bruger organisk stof som carbon kilde.
Hvad er Autotrophe mikroorganismer
mikro organismer der burge CO2 som deres caron kilde.
I hvilke former kan nitrogen indtages af mikro organismer
Ammonika (NH3)
Nitrat (NO3-)
Dinitrogen (N2)
Aminosyre (Der er en amin i N-terminal)
Hvilke måder kan nærings stoffer komme ind i cellen?
De kan komme ind via diffusion eller aktiv transport mekanisme.
Hvilke næringsstoffer kan diffusere gennem membranen?
Små og neutrale næringsstoffer kan diffusere gennem membranen
meget langsomt
Hvad heder de 3 vigtige hoved grupper af aktiv transport mekanismer?
Simple transport
Group transport
ABC transport
Hvordan fungere simple transport
Simple transport er drevet af en proton gradient, hvor man bruger proton motiv force som energi til at transportere næringsstoffet.
Her kan næringsstoffet både komme ind eller ud, men protonen kommer altid ind i cellen da det er den vej der frigives energi.
Hvordan fungere Group transport
§ Stoffet kommer ind i cellen og der bliver det fosforleret, som så trækker stoffet
Videre ind i cellen.
Hvordan fungere ABC transport
A: bindings proteiner binder stoffet, og føre det hen til pumpen, hvor ATP
pumper stoffet ind i cellen.
Hvad er vigtigt når man dyrker mikroorganismer i forhold til deres metabolisme?
At man ved hvilke næringsstoffer mikroorganismen lever af optimalt. Da det er stor variation af metabolisme på tværs af mikroorganismer.
Hvilke klasser inddeles mikroorganismer i iforhold til deres energi kilde?
Chemotropy
Chemoorganotrophe
chemolithotrophe
Phototrophy
Hvad betyder Chemotropy?
De lever af kemiske stoffer
Hvad betyder Chemoorganotrophe
De lever af organiske stoffer
hvad betyder chemolithotrophe
De lever af uorganiske stoffer
hvad betyder Phototrophy
De lever af lys
Hvad er en exergonisk proces?
en proces hvor der fri gives energi; DeltaG < 0
Hvad er en endergonisk proces?
en proces der kræver energi; Delta G > 0
Hvad gør en katalysator?
Den sænker aktiveringsenergien så processen forløber mere spontant.
Det gøres ofte ved at danne et intermediet der har laver energi niveau end oprindelige intermediet
hvad er et enzym?
I mikrobiologi kaldes katalysatore for enzymer, enzymer er aktive proteiner der bruges til forskellige reaktioner.
De er meget specifikke, da de har et binding site hvor reaktanterne binder sig til, og dermed er det kun de stoffer der kan reagere
Hvis der normalt er forskellige isomerer former, danner enzymer kun den ene isomer form.
Hvad er aktiv center i enzymer
Det sted hvor reaktanten sætter sig
Hvad er en cofaktor for et enzym
Det er den der aktivere nogle enzymer
Hvor mange klasser af enzymer er der ?
Og hvad heder de?
- Oxidoreductases
- transferases
- Hydrolases
- Lyases
- Isomerases
- ligases
Hvad bruges Oxidoreductases til?
Redox reaktioner, hvor der sker elektron overførsel
Hvad bruges transferases til?
Groupe reaktioner
Hvad bruges Hydrolases til?
Hydrolysis reaktioner (omdanner funktionel gruppe til vand)
Hvad bruges lyases til?
Addition på dobbelt binding, eller elimination og danner dobbelt binding
Hvad bruges isomerases til?
ændre grupper i molekyler for at danne isomere former
ligases
Danner C-C, C-S, C-O og C-N, ved kondenserings reaktioner (ATP kløvning)
Hvor mange struktur har enzymer.
Og hvad kende tegner dem?
- Primære struktur: er den struktur hvor man ser i hvilken række følge aminosyrene er orienteret i
- Sekundær struktur: er den struktur hvor man kan se om kæden danner alfa-helix eller beta-sheet.
- Tertiærstruktur: er der hvorman kan se hvordan den folder sammen i 3D-struktur
- Kvarternærstruktur: er den struktur hvor man kan kan se hvordan flere protein kæder sidder sammen for at danne et bestemt enzym
- Dette sker dog ikke altid.
Hvordan fungere et enzym?
enzym virker virker ved at reaktanten passer lige ned i aktiv center, og coenzymet kan sættes på
Så reaktionen kan forløbe
Hvad fortæller reaktions kinetik om?
Hvor hurtig en reaktion forløber, men ikke hvor langt
Hvordan analyseres reaktion kinetik?
med Michaelis menten ligningerne
hvad er redox, og hvilke del reaktioner kan de deles ind i
Redox reaktioner består af to del reaktioner:
- Oxiderende del, den der donere elektroner i reaktionen
- Reducerende del, den der accepter elektroner i reaktionen
Hvad forklare Nernst ligningen?
Om deltaG og om reaktionen vil lave en redox reaktion.
Den tager udgangspunkt i molekylernes reduktions potentiale (E0)
Hvad heder det stof mikroorganismer bruger mest til redox reaktioner?
Og hvad gøre de?
NADH (oxiderende: donere elektroner)
NAD+ (reduceres: acceptere elektroner)
Der kan også bruges NADPH og FADH2
Hvilke energirige stoffer er der i mikroorganismer
ATP (Adenosine TriPhosphate), men der er også Acetyl-CoA og Acetyl phosphate osv
Hvad bruges de energirige stoffer til?
Til endergoniske reaktioner hvor der skal bruges energi
Hvilke langtids energi opbevaring bruger prokaryote?
- Glykogen (polyglukose)
- Poly-beta-hydroxybutyrate og andre polyhydroxyalkanoates
- Elemental sulfur
Hvilke langtids energi opbevaring bruger euaryote?
- Stivelse
- Lipider (Simpel fedt)
- Glykogen
Hvad er glykolysen?
Det er den proces hvor 1 glykose (6 C-atom) omdannes til 2 pyrovat (3 C-atom)
Hvad bruges / dannes i glykolysen
1 glukose (6 C-atomer) + 2 ATP + 2 NAD+
bliver til
2 pyrovat (3 C-atom) + 4 ATP + 2 NADH
Hvad er fermentering?
Fermentering er ATP-dannelse på substrat niveau, hvor ATP dannes direkte fra reaktanterne.
Hvad er de kendte produkter fra fermentering?
Ethanol mælkesyre Propionic acid mixed acids smørsyre butanol CO2
men der er mange flere
