Meignin, part I Flashcards

1
Q

Quel est le lieu de synthèse de protéines dans la cellule ?

A

Le cytoplasme

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2
Q

Que se passe-t-il lors de la maturation des ARNm ?

A

Ajout d’une coiffe, d’une queue polyA.
Epissage
Dépot d’EJC
Clivage

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3
Q

A quoi servent les EJC ?

A

Ils permettent l’export nucléaire des ARNm par les pores.

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4
Q

Qu’est-ce que la technique MS2MCP ? En donner les étapes principales.

A

Il s’agit d’une technique de mesure de l’apparition d’un ARNm pré-messager.
Le gène d’intérêt est fusionné à des séquenceARNMS2.
Lorsque le transcrit d’intérêt est synthétiser, les boucles MS2 sont reconnues par la MCP-GFP qui se fusionne.
On peut désormais observer une fluorescence.

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5
Q

Quelles trois enzymes permettent l’addition d’une coiffe ?

A

La RTPase
La GTase
La N7MTase

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6
Q

Par combien d’enzymes est mise en place la queue polyA et quel complexe recrute elle ?

A

La poly A est mise en place par une seule enzyme (polyA polymérase) et permet le recrutement de la CPSF (complexe de 6 protéines) ainsi que les protéine d’export.

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7
Q

Donner les neuf étapes de l’épissage.

A
Reconnaissance de SD par U1
Reconnaissance de SA par U2
Recrutement du omplexe U4/U5/U6
Libération de U1 et U4
Clivage SD
Clivage SA
Jonction d'exons adjacents
Excision de l'intron
Recyclage des composants du spliceosome
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8
Q

De quoi est composé le spliceosome ?

A

De 5 snARN et plus de 150 protéines.

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9
Q

Quelles fonction auraient les introns ?

A

Leur présence pourrait augmenter par 300x l’expression d’un gène.

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10
Q

Rappeler ce qu’est un mRNP et comment sont-ils formés.

A

Un mRNP est une ribonucléoprotéine obtenues grâce à l’EJCP en liant un ARNm à une RBP.

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11
Q

Certaines protéines peuvent vérifier la distance entre codon initiateur et stop : que se passe-t-il i celle ci est trop courte ?

A

L’ARN va être dégradé à l’aide de la queue poly A qui peut déstabiliser ces protéines.

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12
Q

Quand et comment est-ce que l’ECJ est recruté ?

A

Recruté lors de la deuxième étape de l’épissage entre deux exons nouvellement attachés (20-24 nt en amont du site de jonction )

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13
Q

Quelle protéine majeure lie les ARNm au sein de ce complexe EJC, et laquelle stabilise dit complexe ?

A

L’eIF4AIII lie les ARNm

Magoh-Y14 stabilise le coeur de l’EJC. Ce sont des hétérodimères très stables.

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14
Q

Quelle protéine permet le désassemblage de EJC ?

A

La protéine PYM.

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15
Q

Une fois que l’ARNm sur lequel il y a l’EJC est traduit, qu’advient-il de l’EJC ?

A

Il est désassemblé par la PYM, puis Magoh et Y14 s’associent avec une importine Imp13 et retournent dans le noyau

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16
Q

En résumé, donner 4 rôles de l’EJC

A

NMD : mécanisme eucaryote de dégradation de l’ARNm
Export nucléaire
Localisation cytoplasmique
Efficacité de traduction augmentée

17
Q

Qu’est-ce que CWC22 ?

A

C’est un facteur d’épissage qui recrute eIF4AIII dans le spliceosome actif . sa présence est requise pour le dépot de l’EJC sur les ARN épissés.

18
Q

Comment interagissent CWC22 et eIF4AIII ?

A

Ils forment un complexe actif et CWC22 inhibe l’activité ATPase d’eFI.

19
Q

Quelle technique proposer pour étudier le rôle d’eIF in vivo ?

A

La CLIP-seq