Meignin, part I Flashcards
Quel est le lieu de synthèse de protéines dans la cellule ?
Le cytoplasme
Que se passe-t-il lors de la maturation des ARNm ?
Ajout d’une coiffe, d’une queue polyA.
Epissage
Dépot d’EJC
Clivage
A quoi servent les EJC ?
Ils permettent l’export nucléaire des ARNm par les pores.
Qu’est-ce que la technique MS2MCP ? En donner les étapes principales.
Il s’agit d’une technique de mesure de l’apparition d’un ARNm pré-messager.
Le gène d’intérêt est fusionné à des séquenceARNMS2.
Lorsque le transcrit d’intérêt est synthétiser, les boucles MS2 sont reconnues par la MCP-GFP qui se fusionne.
On peut désormais observer une fluorescence.
Quelles trois enzymes permettent l’addition d’une coiffe ?
La RTPase
La GTase
La N7MTase
Par combien d’enzymes est mise en place la queue polyA et quel complexe recrute elle ?
La poly A est mise en place par une seule enzyme (polyA polymérase) et permet le recrutement de la CPSF (complexe de 6 protéines) ainsi que les protéine d’export.
Donner les neuf étapes de l’épissage.
Reconnaissance de SD par U1 Reconnaissance de SA par U2 Recrutement du omplexe U4/U5/U6 Libération de U1 et U4 Clivage SD Clivage SA Jonction d'exons adjacents Excision de l'intron Recyclage des composants du spliceosome
De quoi est composé le spliceosome ?
De 5 snARN et plus de 150 protéines.
Quelles fonction auraient les introns ?
Leur présence pourrait augmenter par 300x l’expression d’un gène.
Rappeler ce qu’est un mRNP et comment sont-ils formés.
Un mRNP est une ribonucléoprotéine obtenues grâce à l’EJCP en liant un ARNm à une RBP.
Certaines protéines peuvent vérifier la distance entre codon initiateur et stop : que se passe-t-il i celle ci est trop courte ?
L’ARN va être dégradé à l’aide de la queue poly A qui peut déstabiliser ces protéines.
Quand et comment est-ce que l’ECJ est recruté ?
Recruté lors de la deuxième étape de l’épissage entre deux exons nouvellement attachés (20-24 nt en amont du site de jonction )
Quelle protéine majeure lie les ARNm au sein de ce complexe EJC, et laquelle stabilise dit complexe ?
L’eIF4AIII lie les ARNm
Magoh-Y14 stabilise le coeur de l’EJC. Ce sont des hétérodimères très stables.
Quelle protéine permet le désassemblage de EJC ?
La protéine PYM.
Une fois que l’ARNm sur lequel il y a l’EJC est traduit, qu’advient-il de l’EJC ?
Il est désassemblé par la PYM, puis Magoh et Y14 s’associent avec une importine Imp13 et retournent dans le noyau
En résumé, donner 4 rôles de l’EJC
NMD : mécanisme eucaryote de dégradation de l’ARNm
Export nucléaire
Localisation cytoplasmique
Efficacité de traduction augmentée
Qu’est-ce que CWC22 ?
C’est un facteur d’épissage qui recrute eIF4AIII dans le spliceosome actif . sa présence est requise pour le dépot de l’EJC sur les ARN épissés.
Comment interagissent CWC22 et eIF4AIII ?
Ils forment un complexe actif et CWC22 inhibe l’activité ATPase d’eFI.
Quelle technique proposer pour étudier le rôle d’eIF in vivo ?
La CLIP-seq