Mécanisme de la transcription Flashcards
Est-ce que la transcription ressemble à la réplication de l’ADN ?
Très semblable car dans les deux cas ça nécessitent des enzymes qui synthétisent des nouveau brin d’acides nucléiques complémentaires au brin “matrice”.
Mais possède plusieurs différence :
- Dans la transcription : le brin est constitué de ribonucléotides.
- ARN polymérase : ne requiert pas d’amorce
- L’ARN ne reste pas apparié au brin matrice de l’ADN : l’enzyme déplace la chaîne naissante
- La transcription est moins fidèle que la réplication : 1/10 000 nucléotides vs 1/10 000 000 nucléotides
- Réplication doit assurer la transmission fidèle du matériel génétique aux cellules filles et toute erreur devient permanente dans le génome et peut avoir des conséquences désastreuse.
Quelles sont les différentes ARN polymérase?
ARN pol réalisent les mêmes réaction dans toutes les cellules.
Bactéries : une seule ARN polymérase
Eucaryotes : 3 ARN polymérases :
-pol I : Transcrit précurseur d’ARNr
-pol II : Plupart des gènes
-pol III : ARNt et ARNr 5S
Quels sont les homologues chez les eucaryotes et chez les procaryotes?
procaryote (B,B’,a’,a’’, w)
eucaryote (RPB1, RPB2, RPB3, RPB11, RPB6)
B-RPB2
B’-RPB1
a’-RPB11
a’‘-RPB3
w-RPB6
Comment se déroule l’initiation de la transcription?
Il faut définir le promoteur : c’est la séquence d’ADN qui fixe l’ARN polymérase et les facteurs d’initiation requis.
- formation du complexe fermé (ADN double-brin)
- formation du complexe ouvert (ADN-simple-brin)
- la polymérase démarre la transcription et se détache du promoteur
La synthèse initiale de l’ARN est inefficace (courts transcript de -10 nucléotides) : synthèse abordive
- Ça permet la libération de l’ARN polymérase.
Qu’est-ce que la phase d’élongation ?
- 52 nucléotides / sec (polymérase bactérienne)
-elle déroule l’ADN devant elle
-Réassocie le brins derrière le complexe
-dissocie la chaine ARN de la matrice durant la progression
-Corrige les erreurs potentielles (elle-même)
Est-ce que l’ARN polymérase minimale chez les bactérie peut initier la transcription n’importe où sur l’ADN?
C’est vrai in vitro mais pas in vivo:
- In vitro L’ARN polymérase a besoin d’un facteur additionnel σ qui convertit l’enzyme minimale (a2BB’wσ )
-Ça devient l’holoenzyme de l’ARN polymérase et permet d’initier la transcription uniquement au promoteur.
Quelles sont les caractéristiques des promoteurs bactériens?
-Chez E.coli le facteur σ prédominant: σ70
-Les promoteurs reconnus par σ70 se retrouvent entre les élements -10 et -35 mais c’est pas identiques chez tous les gènes.
-Certains promoteurs σ70 n’ont pas d’élément -35 mais vont posséder un région allongée à -10 (gènes gal)
Qu’est-ce que la séquence concensus d’un promoteur?
- Elle obtenue par l’Alignement de 300 séquences du promoteur σ70
-Les promoteurs fort c’est-à-dire où l’initiation de la transcription est élevé : c’est les séquences les plus près du concensus.
-Les promoteurs plus puissants possèdent aussi un élément additionnel : élément UP
-Ça permet d’augmenter les liaisons avec la polymérase grâce à des intéraction spécifique supplémentaire enzyme/ADN (gène ARNr) : c’est l’élément descriminateur situé en aval de -10.
Quelles sont les régions du facteur σ70?
-C’est divisé en 4 régions (1 à 4)
-Région 2 + 4 : reconnaissent les éléments -10 et -35
-Région 4 : porte 2 hélices formant le motif hélice-coude-hélice
1ère hélice : reconnaît le grand sillon ADN de l’élément -35
2ième hélice : est situé en travers au dessus du sillon est établit des contacts avec le squelette ADN
-Élément -10 : est aussi reconnu par l’hélice a (région 2) mais les interactions sont moins caractérisée et plus complexe
-Élément -10 allongé : est reconnu par l’hélice a (région 3)
Élément discriminateur : est reconnu par la région 1.2
Par quoi est reconnu l’élément UP?
Pas par l’hélice σ mais par le domaine C-terminal de la sous-unité a de la polymérase : aCTD.
-aCTD est relié à aNTD par un pont flexible
-les éléments σ qui se lient à l’ADN (σ2–10) et (σ4- -35) sont exposé à la surface de l’enzyme et sont non enchâssés.
Quelles sont les modifications structurales dans l’ARN polymérase et le promoteur lorsqu’il y a une transition en complexe ouvert?
-La transition complexe fermé est réversible mais pas celle en complexe ouvert
- La transition en complexe ouvert nécessite la modification structurale de l’enzyme et la séparation de brins d’ADN (expose brin matrice et brin sens) au niveau de la positions -11 à +3
-Dans la polymérase σ70 il y a une transition sous forme d’isomération qui ne requiert pas d’énergie de l’hydrolyse de l’ATP.
Quels sont les canaux d’entrée et de sortie du complexe ouvert?
La polymérase comporte 5 canaux:
-Canal d’entrée des NTPs au centre actif (pas visible)
-Canal de sortie de l’ARN
-3 canaux qui permettent l’entrée et la sortie de l’ADN
Comment fonctionnent les brins d’ADN dans le complexe ouvert et quels sont les deux changements structuraux observés?
-Les brins d’ADN se séparent à partir de 3+ dans le centre catalytique
-Le brin sens quitte le centre actif par le canal NT
-Le brin matrice suit le parcours passant par le centre catalytique puis dans le canal brin matrice (T)
-La double hélice se reforme en -11
CHANGEMENT
-Fermeture des machoires
-Déplacement région N-terminale σ1.1
complexe fermé: σ1.1 dans le foyer catalytique
complexe ouvert: σ1.1 est déplacé
Comment fonctionne le mécanisme d’initiation de la transcription?
1) ARN polymérase initie la synthèse d’ARN sur ADN matrice sans amorce
2)1er ribonucléotide amené au site actif est maintenu stable dans la matrice
3) le 2ième NTP présenté pour permettre à la polymérasation de se dérouler
-ARN polymérase débute la plupart de ses transcription par un A qui se lie au nucléotide matrice T par seulement 2 liens H+
- Il est important que l’enzyme établis des intéractions spécifiques avec le 1er et/ou le 2ième pour permettre les attaques chimiques du NTP entrant ce qui implique différentes parties de l’holoenxyme (linker3/4 de σ)
Quel est le mode de déplacement du site actif de l’ARN pol sur la matrice ADN
une égnime
Quelles sont les trois types de modèle d’initiation de la transcription?
-Modèle d’excursion transitoire :
Cycle translocation ARN polymérase avant/arrière
-Modèle inchworming (chenille arpenteuse) : Élément flexible de la polymérase qui permettrait au module (site actif) de se déplacer vers l’aval en synthétisant de court transcrit (-9nucléotides) avant de se retracter dans le corps de l’enzyme
-Modèle de compression (scrunching) :
ADN en aval tiré et replié à l’intérieur de l’enzyme ce qui permet à l’ADN de s’y accumuler sous forme de boucles simples (+probable)
Que se passe-t-il avec l’ARN naissant?
Elle ne peut pas rester contenu dans les région où il s’hybride à l’ADN donc commence à s’insérer dans le canal de sortie de l’ARN
Quel est le rôle de la région du linker 3/4 qui imite l’ARN?
Il joue le rôle de mime moléculaire
À l’élongation il va avoir éjection de la région 3/4 qui est probablement responsable de la diminution des forces de liaison de σ à l’enzyme
Conséquence :σ se décroche du complexe d’élongation (après la synthèse ARN d’environ 80 nucléotide)
Que se passe-t-il lors de la libération du promoteur dans le modèle scrunching?
L’empilement de l’ADN dans l’enzyme est inversé ce qui fait en sorte que l’ADN est ré-enroulé et qu’il y a une réduction des bulles de transcription de 22-24 nucléotides à 12-14 nucléotides.
Ce processus permet de fournit de l’énergie à l’ARN polymérase pour :
-rompre les intéractions polymérase-promoteur
-libérer le noyau de l’enzyme du facteur σ
Quelles sont les corrections effectuées par la ARN polymérase dans la phase d’élongation? et quelques caractéristiques de la phase d’élongation?
*À tout moment : il y a seulement 8 ou 9 nucléotides dans la chaine ARN naissante qui sont apparié à l’ADN matrice
*la taille des bulle reste constantes
1ère : correction pyrophosphotylique qui catalyse l’enlèvement de 1 ribonucléotide incorrect par incorporation de PPi (P2O74-)
2ième : correction hydrolytique : l’enzyme recule d’un ou de plusieurs nucléotides et clive l’ARN (d)
Que se passe-t-il lorsque l’ARN polymérase est bloquée et doit être enlevée de la matrice?
Cause courante du blocage : un brin d’ADN endommagé
Conséquense des arrêts peuvent être catastrophique car il y obstruction des autres polymérases essayant de transcrire ce gène
-machinerie (TRCF) qui enlève la polymérase bloquée et récrute des enzymes de réparation (endonucléase Uvr(A)BC)
-réparation couplée à la transcription nécessite l’enzyme TRCF
Comment fonctionne TRCF?
Elle permet la réparation des dommages et de recruter l’enzyme de réparation
- lie l’ADN double brin en amont (derrière) polymérase
- Utilise un moteur ATPase pour se déplacer sur ADN pour rencontrer l’ARN polymérase bloquée
- Collision pousse la polymérase vers l’avant
- Reprend l’élongation ou se dissocie du complexe ternaire
Qu’est-ce que les terminateurs?
Séquences qui conduisent la polymérase en élongation à se dissocier de l’ADN et à libérer l’ARN
Chez les bactéries il y a deux sortes de terminateurs
- 1er : Rho-dépendant : nécessite protéine Rho pour provoquer la terminaison
-2ième : Rho-indépendant : provoque la terminaison sans autres facteurs
Quelles sont les caractéristiques de rho?
- Possède 6 sous-unités identiques
-Se fixe à l’ARN simple-brin dès qu’il sort de ARNpol (aux sites rut)
Site rut : possède environ 70 nucléotides sans la structure secondaire riches en C et est situé près de la fin du gène
-rho possède aussi un activité ATPase qui permet d’hydrolyser l’ATP requise pour la terminaison
-rho est incapable de lier ARN en traduction
-Rho induit la terminaison uniquement des transcrits en cours de transcription au-delà de la fin d’en gène
-ARNpol fait une pause à un site située 100nt en aval du sit rut (RSPS) pour permettre à Rho de rattraper l’ARNpol car l’ARNpol est plus rapide que RHO de 40nt/sec
Quels sont les trois possibilités du modèle d’action de Rho ?
-Rho pousserait la polymérase en avant
-Rho arracherait l’ARN de la polymérase et attendrait le duplex ARN-ADN pour les séparer
-Rho induirait un changement de conformation de la polymérase
Qu’est-ce que la séquence d’un terminateur Rho-indépendant ?
Aussi appelés terminateurs intrinsèques
Absolument besoin de courtes séquences répétées et inversées et des paires de bases A-T de 8 nt
Fonctionne sur l’ARN mais pas sur l’ADN
- ARN en formation
- Forme de structure tige-boucle
- Désorganisation du complexe d’élongation
- terminaison
Comment l’Épingle à cheveux induit la terminaison?
- Provoquant le déplacement vers l’avant de la polymérase
-Extirpant le transcrit de la polymérase
-induisant un changement de conformation de la polymérase
*possible que les trois hypothèse fonctionne en même temps
*Fonctionne efficacement uniquement si elle est suivie par une série de bases T ou U dans l’ARN
Quelles sont les caractéristiques de pol I et pol III ?
-Ils reconnaissent des promoteurs distincts mais nécessitant TBG
-Ils ressemblent à Pol II (partagent plusieurs sous-unités)
-Ils initient la transcription sur des promoteurs distincts de Pol II et transcrivent des gènes disctincts de Pol II
-Ils codent des ARN spécialisés et non des protéines
-TBP est universelle : impliquée dans l’initiation de transcription par pol I, pol II et pol III
-Pol I est nécessaire pour l’expression d’un seul gène qui est précurseur des ARNr
Quelle sont les caractéristiques du promoteur Pol I?
Le promoteur ARNr est composé de 2 partie :
- Promoteur central
-Élément de contrôle amont (UCE)
Deux autres facteurs sont requis pour l’initiation :
-SL1 : comprend TBP + 3 TAFs spécifiques qui son fixe au promoteur central et requiert UBF pour la liaison
-UBF : lie UCE en recrutant SL1 ce qui stimule la transcription en recrutant Pol I
Quelles sont les caractéristiques du promoteur Pol III?
- Il existe sous plusieurs formes
-Certain contiennent la boîte A et la boîte B séparés par un court élément (gène ARNt)
-Certain contiennent la boîte A et la boîte C
-Certain contiennent la boîte TATA
-La transcription par Pol III nécessitent des FTGs en plus de la Pol III
-Pol III utilise TBP compris TFIIB
Comment fonctionne la transcription chez les bactéries ?
Une seule polymérase et un seul facteur d’initiation additionnel σ
Comment fonctionne la transcription chez les eucaryotes ?
- Possède 3 polymérases différentes : Pol I, Pol II, Pol III
-Requiert plusieurs facteurs généreux de transcription (FGT) :
*accomplissent les fonctions de σ dans la transcription bactérienne
*aident Pol II à se fixer au promoteur et à séparer les brins d’ADN
*aident Pol II à détâcher les promoteur et à engager l’élongation
-Requiert des facteurs supplémentaires:
*protéine régulatrice liant ADN
*complexe médiateur
*Enzymes de modification de la chromatine
Qu’est-ce que le promoteur minimal de Pol II?
C’est le plus petit ensemble d’éléments de séquence nécessaire pour assurer l’initiation de la transcription par la machinerie de Pol II in vitro
Situé à 40-60 nucléotides en amont ou en aval du site d’initiation de la transcription
-Élément reconnu par TFIIB (BRE)
-Élément (boîte) TATA
-Élément initiateur (inr)
-Éléments d’aval du promoteur (DPE, DCE et MTE)
Que retrouve-t-on en amont du promoteur minimal ?
Des séquences régulatrices importantes pour la transcription efficace in vivo
Il y a différentes catégories selon la localisation, l’organisme concerné et la fonction
- Élément proximaux du promoteur
- Les séquences activatrice (UAS)
- Les “enhancers” ou amplificateur
- D’autres éléments (“silencers”, éléments de frontière et isolateur)
Comment fonctionne l’initiation de la transcription par l’ARN polymérase II?
- Requiert la formation du complexe de préinitiation (PIC) : Ensembles des FGTs et de la Pol II liés au promoteur
- La boîte TATA (-30) est reconnue par TFIID ce qui est critique pour l’initiation
TFIID qui comprend un complexe de sous-unités comprenant TBP et TAFs
- Le complexe TBP-TATA fournit la plateforme pour attirer sur le promoteur d’autres FGTs et pol II
-TFIIA
-TFIIB
-TFIIF + pol
-TFIIE
-TFIIH
- Fusion de l’ADN du promoteur ce qui requiert l’hydrolyse de l’ATP avec l’aide de TFIIH (TFIIH participe aussi l’activité hélicase qui stimule le déroulement de l’ADN)
- Phosphorylation des Sous-unités de la Pol II (le domaine C-terminal (CDT) : queu) composé d’une série de répétition de heptapeptide (52 chez l’homme : TYR-SER-PRO-THR-SER-PRO-SER ce qui aide la Pol II à se défaire de la plupart des FGTs
Quelles sont les étapes dans la libération du promoteurs chez les eucaryotes qui sont absentes chez les bactéries?
- Hydrolyse de l’ATP
(en + de hydrolyse de l’ATP pour fusion ADN par TFIIH) - Phosphorylation de la Pol II
Quelles sont les caractéristiques du complexe TBP-ADN?
- TBP : utilise une large région constituée d’un feuillet B pour reconnaître le petit sillon au niveau de la boîte TATA (inhabituel car les protéines lient l’ADN par l’hélice a dans le grand sillon)
-Pour sélectionner TATA : TBP se fie à la capacité de cette séquence à subir des déformation structurale pour ce faire :
- TBP intéragit avec le phosphate (-) de l’armature de l’ADN avec des résidus Lys et Arg (+)
- Provocation l’élargissement du petit sillon jusqu’à ce que la configuration devienne presque plane
- Provoque aussi un repliement de l’ADN d’un angle de 80 degré
La spécifité dépend des chaines latérales de 2 résidus de phénylalanine qui s’intercalent entre les pb aux extrémités TATA
Quelles sont les caractéristiques des FGTs TAF?
-TBP s’associe à environ 10 TAF et ensemble ils forment le FGT TFIID
-Deux TAFs se lient à des éléments du promoteurs (inr ou des éléments en amont ou en aval)
-TAF42 ET TAF62 possèdent des similitudes structurales avec les histones
*Ils se lient de manière semblable à l’ADN et forment des structures qui ressemblent à des tétramères H3/H4
*Ils sont présent dans TFIID mais aussi en association avec des enzymes modificateurs d’histone
LES AUTRES FGTs ne sont pas connues en détail : certains sont constitués de 2 sous-unités ou +
Quelles sont les caractéristiques des FGTs TFIIA?
-Composée de deux chaines de polypeptidiques qui intéragit avec TBP/TFIID et stabilise le complexe
-Encodé par deux gènes distincts : TFIIAa/b (TOA1) de sous-unité 55 kDa et TFIIAy (TOA2) de sous-unité 12 kDa
-TFIIA intéragit avec TBP et pas avec l’ADN
Ses fonctions :
-Intéraction TFIIA-TBP/TFIID est d’éliminer les intéraction du répresseur avec TBP qui empêchent la formation de complexe d’initiation (PIC)
-Agit comme co-activateur pour certains activateurs
Quelles sont les caractéristiques des FGTs TFIIB?
- Comprend une seule chaine de polypeptide qui rejoint le complexe de préinitiation après TBP/TFIID et TFIIA
-Possède une structure cristalline avec des contacts spécifique TFIIB-TBP et TFIIB-ADN
-Intéraction base-spécifique avec les grands sillons en amont (BRE) et les petits sillon en aval de TATA
-Aussi en contact la Pol II dans le complexe de préinitiation soit insérés dans le canal de sortie de l’ARN ou dans à la gorge des sites actifs de la polymérase
- Ça fait le lien entre TBP lié à la boîte TATA et la Pol II
Quelles sont les caractéristiques des FTGs TFIIF?
- Ils sont recrutés par les promoteurs déjà associé à Pol II
*humain c’est 2 sous-unités essentielle: RAP74 et RAP30
*Levure c’est 3 sous-unités essentielle: Tfgq (RAP74) et Tfg2 (RAP30) et non-essentielle : Tfg3
-La liaison de Pol II-TFIIF permet de stabiliser le complexe ADN-TBP-TFIIB
- Il faut que TFIIF arrive avant TFIIH dans le complexe préinitiation
-il croit où l’ADN s’enroule 1x autour du complexe de préinitiation ce qui contriburait à maintenir l’enroulement serré de l’ADN
Quelles sont les caractéristiques des FGTs TFIIE et TFIIH?
-TFIIE possède 2 sous-unités qui se lie au complexe et recrute et régule TFIIH
-TFIIH permet de contrôler la transition du complexe de préinitiation fermé au complexe ouvert
-TFIIH est l’un des plus gros et des plus complexe des FGTs ( 10 sous-unités)
-2 sous-unités de la TFIIH (XPD et XPB) permet d’activé l’ATPase (hélicase) et l’activité de la protéine kinase ( CTD-kinase)
*c’est deux sous-unités joue un rôle dans la fusion du promoteur et dans le détachement de Pol II du promoteur
*Impliqué dans la réparation de ADN (excision de nucléotide : NER)
Quelle est l’ordre du complexe d’initiation de la transcription ?
TFIID (TBP-TAF) - TFIIA - TFIIB - TFIIF + polymérase - TFIIE - TFIIH
In vivo le niveaux élevés de la transcription et la régulation de la transcription nécessitent quoi ? et pourquoi?
- Protéines régulatrices (facteurs de transcription)
-Complexe médiateur
- Enzyme de modification des nucléosomes
Pourquoi :
- ADN matrice in vivo est empaqueté dans la chromatine
-Complique la liaison au Promoteur de la Pol II et ses facteurs associés
Quelles sont les caractéristiques du médiateur ?
- Il est constitué de beaucoup de sous-unités
-Il facilite l’initiation en régulant l’activité de la CTD kinase de TFIIH
-Il est associé par une face à la queue CTD de Pol II et à d’autres faces qui forment des intéractions avec les activateurs liés à l’ADN
-Il permet la délétion individuelle de certaines sous-unités qui sont souvent la réduction d’un petit groupe de gènes mais c’est différent pour chaque sous-unité affectée
Quelles sont les nouveaux facteurs qui stimule l’élongation par Pol II et la correction de l’ARN?
-Lorsque la Pol II est libérée du promoteur et initie la transcription : c’est le passage à la phase de l’élongation et il se débarasse de la plupart des facteurs d’initiation (FGT et médiateur)
-Nouveaux facteurs vont remplacer les anciens
- certains ( TFIIF et hSPT5) sont des facteurs d’élongation
-D’autres sont nécessaires à la maturation de l’ARN : les enzymes impliquées sont recrutées au CTD Pol II et préfèrent la forme phosphorylée de CTD
Quelles sont les caractéristiques de la CTD pol II ?
-Est situé à côté du canal de sortie de l’ARN
-Est très long
-Permet au CTD de lier plusieurs composants de la machinerie d’élongation et de maturation et les met en contact avec l’ARN
Quel est le rôle de la kinase P-TEFb?
Elle est adjointes de la Pol II par les activateurs transcriptionnels
C’est important dans la stimulation de l’élongation en phosphorylant le résidu SER r dans la répétition de la CTD et corrèle avec l’élongation
Permet aussi de recruter et phosphoryler et d’activer d’autres protéines comme TAT-SF1 un facteur d’élongation
Qu’est-ce que la famille ELL?
C’est d’autres facteur d’élongation
Ils se lient à la Pol II en phase d’élongation et supprime les arrêts temporaires de l’enzyme en améliorant la processivité de Pol II
Quel est le rôle de TFIIS dans la stimulation de l’élongation?
- Stimule le taux d’élongation en diminuant le temps de pause Pol II sur la séquence qui ralentissent sa progression
-Contribue à vérifier des séquences créer par Pol II
-Stimule l’activité RNase de la Pol II
-Possède des stratégie alternative pour éliminer les bases incorrectes par hydrolyse limitée de l’ARN (comparable à la correction hydrolitique stimulée par Gre)
Comment fonctionne le facteur FACT?
-hétérodimère de 2 protéines très conservées (Spt16 et SSRP1)
-Un modèle d’élongation au travers de nucléosomes possible avec FACT sinon in vivo la chromatine gêne la transcription
- Spt16 se lie à H2A/H2B et SSRP1 se lie au tétramère H3/H4
- Devant Pol II en transcription FACT extrait 1 dimère H2A/H2B ce qui permet à Pol II de passer le nucléosome
-FACT possède aussi des activité chaperon d’histone qui permet de réinsérer H2A/H2B dans les héxamères d’histones derrière la Pol II
Quelles sont les modifications subit par l’ARN eucaryote avant son exportation au noyau et la traduction ?
-Formation de la coiffe à l’extrémité 5’
-Épissage de l’ARN (+complexe)
-Polyadénylation à l’extrémité 3’
Quelle est la structure et la formation de la coiffe 5’?
C’est l’ajout d’une guanine méthylé à l’extrémité 5’ ARN via une liaison 5’-5’ impliquant 3 phosphates
L’addition de la coiffe se fait dès que l’ARN émerge du canal de sortie de la Pol II
3 étapes enzymatiques :
1ère : un groupe phosphate enlevé extrémitté 5’ ARN
2ième : Ajout d’un nucléotide GMP
3ième : Méthylation du GMP
Après l’ajout de la coiffe :
-déphosphorylation Ser5 du CTD : dissociation de la machinerie d’assemblage de la coiffe
-Phosphorylation Ser 2 du CTD : assemblage de machinerie d’épissage
Quels sont les rôles de la coiffe?
-Stabilise ARNm (protège ribonucléase)
-Export ARNm dans cytoplasme
-Recrutement ribosomes
Qu’est-ce que la polyadénylation?
C’est intimement lié à la terminaison
Se passe lorsque la Pol II atteint la fin d’un gène et rencontre la séquence spécifique (AATAAA) qui est transcrit en (AAUAAA) qui stimule le transfert enzymes de la polyadénylation du CTD à l’ARN
Conduit à 4 évènements :
- Clivage de ARNm
- Ajout d’un grand nb de résidus adénine à son extrémité 3’
- Dégradation de l’ARN encore associé à l’ARN Pol II
- Terminaison de la transcription
Quelles sont les deux complexes protéiques transportés par Pol II (CTD) lorsqu’elle s’approche de la fin?
Les signaux Poly-A : stimulent le transfert de CPSF et CstF à l’ARN
CPSF permet de recruter la Poly-A-polymérase ce qui ajoute environ 200 A à l’extrémité 3’ à l’ARN clivé ce qui permet le recrutement des PABP et l’exportation des ARNm mature au cytoplasme
Est-ce que Pol II s’arrête immédiatement après le clivage et la polyadénylation de l’ARN?
Non avant elle se déplace sur la matrice et produit une deuxième 2ième molécule d’ARN composé de plusieurs milliers de nucléotides avant de s’arrêter
Qu’est-ce que le modèle de terminaison torpille ?
Qu’est-ce que le modèle de terminaison allostérique?
-Dépend des modifications structurale de Pol II qui réduit le caractère possessif de Pol II
-Lié à la polyadénylation
-Provoquée par le transfert d’enzyme modifiant l’ARN (CPSF et CstF) de la queue CTD de Pol II à l’ARN
