Brainscape's Knowledge GenomeTM

Browse over 1 million classes created by top students, professors, publishers, and experts.


See full index

Molekularna biologija > mb > Flashcards

mb Flashcards

1
Q

proteini sekretnog puta

A

sintetiziraju se na ribosomima koji su vezani na membranu endoplazmatskog retikuluma
lokalizirani su u endoplazmatskom retikulumu, golgijevom aparatu, vakuoli ili izbačeni iz stanice

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
2
Q

proteini sintetizirani na slobodnim ribosomima

A

proteini jezgre, mitohondrija i peroksisoma

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
3
Q

uzvodna sekvenca

A

ispred početka transkripcije
označava se -
promotorsko mjesto

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
4
Q

nizvodna sekvenca

A

iza početka transkripcije
označava se +
kodirajuća sekvenca

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
5
Q

tri faze trasnkripcije

A

inicijacija
elongacija
terminacija

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
6
Q

idealna sekvenca za vezanje RNA polimeraze

A

konsenzus sekvenca

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
7
Q

mjesta koje prepoznake sigma podjedinica RNA polimeraze kod prokariota

A

TATA box
7 nukleotida na -10

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
8
Q

RNA polimeraza footprint

A

od -10 do -50

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
9
Q

jaki promotori

A

oni koji su sličniji konsenzus sekvenci pa imaju veću učestalost započinjanja transkripcije

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
10
Q

slabi promotori

A

imaju manju sličnost konsenzus sekvenci i imaju manju učestalost inicijacije transkripcije

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
11
Q

trp operon

A

sadrži pet gena koji kodiraju za proteine koji sudjeluju u metabolizmu triptofana
svi geni su pod regulacijom jednog promotora

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
12
Q

šta se dobije traskripcijom gena u trp operonu (i za prokariote i za eukariote)

A

policistronska mRNA koja ima 5 različitih mjesta za početak translacije i dobije se 5 različitih proteina
kod eukariota se ovi geni nalaze na 4 različita kromosomima, svaki ima svoj primarni traskrip

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
13
Q

regulacija trp operona

A

na razini pre-inicijacije, tj. pre-inicijacijskog kompleksa jer vezani represor onemogućuje vezanje polimeraze te samim time nastajanje pre-incijacijskog kompleksa

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
14
Q

lac operon

A

tri gena pod regulacijom jednog operona
produkti tih gena sudjeluju u metabolizmu laktoze

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
15
Q

o koliko parametra ovisi regulacija ekspresije lac operona

A

o dva parametra, tj. dva proteina
1. represor- ako je na njega vezana alolaktoza on se ne može vezati na operator
2.CAP-protein- ovisi o razini glukoze (niska razina glukoze-nastaje cAMP)

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
16
Q

šta se veže na operator kod lac operona?

A

samo represor, nikako CAP-protein

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
17
Q

operator kod lac operona

A

ima tri operatorske regije O1, O2, O3
represor je dimerni protein koji stupa u interakciju sa dvije regije (ili O1 i O2 ili O1 i O3)
mutacija u O2 i O3 smanjuje represiju za 70%

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
18
Q

gen glnA

A

kodira za glutaminsintetazu

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
19
Q

RNA polimeraza kod gena glnA

A

cijelo vrijeme je vezana na promotor jer nema represora

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
20
Q

enhenceri

A

mjesta vezanja aktivatora, tipični za eukariote, nalaze se udaljeniji od mjesta početka transkripcije uzvodno ili nizmodno
mogu biti unutar strukturnih gena

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
21
Q

ntrB domene

A

senzor domena i transmiter domena

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
22
Q

ntrC domene

A

regulatorna i DNA binding domena

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
23
Q

geni za transport/metabolizam fosfata-proteini koji sudjeluju u regulaciji i domene

A

PhoR- transmiter
PhoB- reciever i DNA binding domena

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
24
Q

leader sekvenca

A

nalazi se prije strukturnih gena, poslije operatora i početka mjesta transkripcije promotora

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
25
Q

što se nalazi u regiji 1 leader sekvence kod trp opeona

A

2 kodona za triptofan
to je puno za tako malu regiju od oko 15ak nukleotida
to stanica koristi da zna ima li triptofana u stanici

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
26
Q

mehanizam regulacije na razini elongacije kod trp operona
šta se događa kad ima i kad nema triptofana?

A

leader sekvenca
4 regije
nema triptofana komplementarno se sparuju 2 i 3 regija- nastavak transkripcije
ima triptofana komplementarno sparivanje 3 i 4 regije - prekid transkripcije

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
27
Q

kontrola terminacije transkripcije kod B. subtilis
šta kada ima purina i kada nema?

A

-na 5’ kraju prije mjesta početka transkripcije dolazi do formiranja strukture koja se naziva aptamerska struktura
-ta regija se može nalaziti i na 3’ kraju i ona se ne transkribira
-kada ima purina on se veže na tu strukturu i to je signal za terminaciju transkripcije
-kada nema purina formira se druga struktura koja ne označava terminaciju

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
28
Q

TATA box

A

regija koja je bitna za prepoznavanje mjesta gdje će se vezat RNA polimeraza. Na TATA box se veže TATA-binding protein
nalazi se uzvodno od mjesta početka transkripcije
na +1 ima A, a na -1 T ili C

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
29
Q

promotor proksimalni elementi

A

kod eukariota
važni za vezanje transkripcijskih faktora, regulatora itd.
nalaze se još uzvodnije od promotora

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
30
Q

UAS kod kvasaca

A

upstream activating sequence
promotor proksimalni elementi

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
31
Q

CpG otoci

A

C i G povezani fosfatom
mjesta na kojima može doći do inicijacije transkripcije

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
32
Q

RNA polimeraza kod eukariota

A

tri različite RNA pol (I, II, III)
I- sinteza rRNA
II- sinteza mRNA
III- sinteza tRNA

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
33
Q

kako se označavaju opći transkripcijski faktori?

A

TF pa broj (II za RNA pol II) i slovo

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
34
Q

formiranje pre-inicijacijskog kompleksa

A

-TATA binding proteon (TBP) je dio TFIID kompleksa i on se veže na promotorsku regiju
-nakon vezanja TFIID vežu se i TFIIA i TFIIB i to na neki način omogućuje vezanje RNA pol
-nakon vezanja RNA pol veže se i TFIIF i dobijemo srž pre-inicijacijskog kompleksa
-dokazano uvođenjem mutacija i sve su bile letalne

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
35
Q

kako se dobije zatvoreni pre-inicijacijski kompleks?

A

-dolazi do povezivanja faktora TFIIE i TFIIH (on je bitan jer ima kinaznu i helikaznu aktivnost pa pomaže RNA poli u formiranju transkripcijskog mjehurića, razdvajanje lanaca i pronalaska mjesta početka transkripcije)
-kada se ta dva faktora povežu dolazi do formiranja zatvorenog pre-inicijacijskog kompleksa

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
36
Q

otvoreni pre-inicijacijski kompleks

A

TFIIH helikaznom aktivnošću razdvaja lance DNA i formira se transkripcijski mjehurić i onda govorimo o otvorenom pre-inicijacijskom kompleksu

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
37
Q

uloga karboksilne terminalne domene RNA polimeraze kod formiranja elongacijskog kompleksa

A

TFIIH svojom kinaznom aktivnošću fosforilira serinske ostatke u karboksi terminalnoj domeni RNA pol i to omogućuje otpuštanje inicijacijskih faktora i vezanje leongacijskih faktora
-prelazak iz inicijacijskog kompleksa u elongacijski

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
38
Q

looping DNA

A

vezanjem aktivatora na promotor proksimalne elemente i/ili enhancere omogućuje looping DNA
-aktivatori dolaze u kontakt sa RNA pol ili sa nekim od općih transkripcijskih faktora, dolazi do promjene konformacije i čvršćeg vezanja RNA pol i započinjanja transkripcije

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
39
Q

Clamp domena

A

nalazi se na RNA pol koja je otvorena kada se veže na DNA i tu dolazi do izlaska RNA molekule

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
40
Q

aktivatori kod eukariota-domene i navesti koliko ima kojih domena u kvascu i viših eukariota

A

-aktivacijska i DNA binding domena
ima i fleksibilno proteinska domena koja
-nije baš prava domena
-kod kvasca jedna aktivacijska (C terminalni kraj) jedna binding (na N terminalnom kraju)
-kod višik eukariota uvijek jedna binding domena, a može biti više aktivacijskih domena

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
41
Q

mehanizmi regulacije aktivatora

A
  1. regulacija sinteze proteina- aktivatora
  2. vezanje liganda (primjer kod CAP proteina i cAMP kod lac operona)
  3. fosforilacija (primjer NtrC protein kod glnA gena)
  4. dodatna podjedinica
How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
42
Q

represori kod eukariota
karakteristike i domene

A

-oni se ne vežu na DNA pa ne dolazi do mehaničkog ometanja kod vezanja RNA pol
-imaju dvije domene: DNA vezajuću domenu i represorsku domenu

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
43
Q

represori kod eukariota-mehanizmi

A
  1. situacija kada represor i aktivator imaju iste vezajuće domene tako da se aktivator i represor natječu za vezanje i to ovisi o koncentraciji protein, ali i afinitetu te DNA vezajuće domene
  2. situacija je kad represor i aktivator imaju različite vezajuće domene, ali se nalze u blizini tako da se represorska domena represora veže na aktivacijsku domenu aktivatora i tako onemogućuje vezanje aktivatora na opće transkripcijske faktore ili RNA pol i onemogućuje djelovanje aktivatora
  3. situacija aktivator i represor se vežu na različita mjesta, ali se represor veže na opće transkripcijske faktore i tako onemugućuje vezanje aktivatore na OTF i tako ne dolazi do transkripcije
How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
44
Q

na šta djeluje represor kod eukariota?

A

djeluje na aktivatore, on onemogućuje funkciju aktivatora jer je aktivacija aktivatora glavni mehanizam regulacije transkripcije u eukariota

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
45
Q

enhanceosom

A

više od dva vezna mjesta koja su isprepletena kod enhancera i omogućuje vezanje više aktivatora

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
46
Q

CIS elementi

A

elementi koji se vežu bliže ili dalje od promotora na regije (promotor proksimalne regije ili enhenceri)

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
47
Q

na šta se vežu aktivatori kod eukariota?

A

na promotor proksimalne regije (UAS kod kvasca) i enhancere

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
48
Q

kod eukariota što je važno pored aktivatora za početak transkripcije?

A

vezanje koaktivatora
važan je i medijator

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
49
Q

što koaktivatori rade kod aukariota?

A

oni služe na neki način da povezuju aktivatore, tj. aktivacijsku domenu aktivatora sa općim transkripcijskim faktorima i/ili RNA pol

50
Q

od čega se sastoji medijator kod eukariota?

A

sastoji se od nekoliko povezanih proteina
kompleks se naziva Med

51
Q

primjeri regulacije transkripcije kod eukariota

A
  1. regulacija protein kinaze A
  2. steroidni hormoni
  3. glukokortikoidni hormoni
  4. interferoni
52
Q

steroidni hormoni karakteristike

A

zbog svoje građe mogu proći i kroz plazma membranu i kroz jezgrinu membranu
aktivator se nalazi u jezgri
dteroidni hormon se veže na receptor i dolazi do promjene konformacije aktivatora, njegove dimerizacije, vezanje na cis element i aktivacije transkripcije
na temelju slike receptor je u jezgri

53
Q

domene aktivatora kod glukokortikoidnih hormona

A

DNA binding domena
aktivacijska domena
ligand binding domena

54
Q

šta su receptori kod interferona?navedi domene

A

-transmembranski proteini
-ima dvije domene; jedna je u citosolu, a druga s vanjske strane membrane, tj. u ekstracelularnom prostoru
-interferonski receptori su dimerni receptori, dimerizacija se događa tek kada se na receptor veže interferon

55
Q

koliko vrsta histona postoji?

A

pet
H1 (monomer i nije dio nukleosoma), H2A, H2B, H3 i H4

56
Q

nukleosom

A

DNA omotana oko histona
podjedinica kromatina

57
Q

koliko je nukleotida omotano oko nukleosoma?

A

146 pb (2 namota)

58
Q

koje posttranslacijeske modifikacije su moguće kod histonskih repova?

A

acetilacija
metilacija
fosforilacija
ubikvitinilacija

59
Q

acetilacija histona

A

acetilira se lizinski ostatak pomoću enzima HAT, to dovodi do otpuštanja forme nukleosoma, DNA nije toliko čvrstvo vezana na histone
acetilacijom se uvodi negativan naboj i dolazi do odbijanja DNA

60
Q

metilacija histona

A

dolazi do čvršćeg vezanja DNA jer metilacija uvodi pozitivan naboj

61
Q

ubiktitinilacija

A

stanični signal za razgradnju proteina

62
Q

fosforilacija histona

A

fosforiliraju se serinski i treoninski AK ostatci, uvodi se negativan naboj

63
Q

kromatin remodelirajući kompleksi

A

koriste energiju ATP-a kako ni “povukli” DNA po nukleosomu i oslobodili neki dio regije DNA

64
Q

otvoreni promotori

A

promotori koji nisu u strukturi kromatina, ekspresija je konstitutivna

65
Q

zatvoreni promotori

A

promotori koji se nalaze u strukturi kromatina, ekspresija je regulirana modifikacijom i remodeliranjem kromatina, te vezanjem različitih TF, regulatornih molekula

66
Q

za šta kodira Pho5?

A

za kiselu fosfatazu koja hidrolizira fosfomonoestere

67
Q

metoda za identifikaciju regulatornih elemenata

A
68
Q

analiza aktivatora transkripcije-zašto se provodi i koraci

A

-provodi se kako bi odredili koji su dijelovi aktivatora bitni za njegovu funkciju, određuje se funkcija pojedine domene (aktivacijska i DNA binding domena)
-prvo se konstruira konstrukt koji sadrži UAS, TATA box, reporter gen
-potrebno je uvesti delecije u genu koji kodira za protein tako da dobijemo protein koji je skraćen na N-terminalnom kraju
-tako skraćeni geni se uvode u plazmid s kojim se transformiraju stanice
-praatimo je li došlo do ekspresije reporter gena, ako nije onda smo uklonili važan dio aktivatora
-možemo i pratiti je li došlo do vezanja na UAS

69
Q

na koji način se može dokazati da se vezajuća domena nalazi na N terminalnom kraju, a aktivacijska na C terminalnom kraju kod aktivatora?

A

tako da skrati određeni broj AK sa C terminalnog kraja i primjeti se smanjena aktivnost, što upućuje na to da je tamo aktivacijska, a na N terminalnom vezajuća domena

70
Q

metode za određivanje kompleksa DNA i proteina

A
  1. elektroforetska mobilnost, metoda pomaka u gelu (EMSA)
  2. DNAse footprint, DNaza 1 otisak prsta
71
Q

metoda pomaka u gelu

A

-koristi se za detekciju translripcijskih faktora koji su vezani na određene regije DNA
-provodi se elektroforeza DNA i ako je na DNA vezan protein ta DNA će imati veću masu i sporije će putovati u gelu
-također možemo izolirati regiju kada ima transrkripcije i kada nema i onda vidjeti veže li se na tu regiju neki transkripcijski faktor

72
Q

DNAse footprint

A

footprint zato što vezani protein ima svoj footprint i prekriva određeni dio DNA koji onda DNaza ne može cijepati
-regija DNA na kojoj se veže protein se označi radioaktivno,
-DNaza I cijepa nasumično i onda na elektroforezi dobijemo bandove
-ako se vezao protein na tu regiju ne dobijemo band jer nije došlo do cijepanja

73
Q

metoda za određivanje uloge proteina (aktivator ili represor)

A

in vivo transfecion assay

74
Q

utvrđivanje interakcija između dva proteina

A

-sustav dva hibrida
pomoću interakcije između dva proteina može se zaključiti o funkciji ili lokalizaciji proteina
-ko-imunoprecipitacija

75
Q

što radi multiproteinski kompleks egzosom?

A

-prepoznaje neisprvavni mRNA i razgrađuje ju pomoću egzonukleaznih podjedinica
-egzosom postoji i u jezgri i u citoplazmi
-ima 3’ egzoribonukleaznu aktivnost

76
Q

sinteza tRNA

A

pomoću RNA pol III
sudjeluje i egzosom koji skraćuje pretRNA da bi dobile formu tRNA koja se transportira iz jezgre u citoplazmu

77
Q

sinteza rRNA

A

pomoću RNA pol I
u jezgrici i transportira se kroz jezru u citoplazmu

78
Q

metoda za određivanje protein-DNA interakcija

A

ChIP=kromatin imunoprecipitacija
Ovom metodom možemo utvrditi o kojoj je točno DNA riječ i o kojem je proteinu riječ

79
Q

ChIP metoda

A

-dodaje se formaldehid koji crosslinkerom povezuje DNA i protein, ali se formiraju čvršće interakcije, tj. Schiff-ove baze
-slijedi sonafikacija da DNA pokidamo na manje fragmente, važno je imati fragmente različite duljine
-na neke kraaće fragmente je vezan protein i sada želimo vidjeti na koje je vezan
-dodamo antitijelo za protein od interesa, ako je na protein vezana DNA povući će se i ona (imat ćemo antirijelo na koje je vezan protein sa DNA)
-nakon toga odvajamo DNA od proteina (temp, proteinaze)
-za provjeru prisutnosti regije koje nas zanima u DNA provedemo PCR, sekvencioniranje, hobridizaciju
-isto se provodi za provjeru vezanja proteina na RNA

80
Q

koliko proteina se veže na mRNA i njihova uloga

A

-6 proteina i oko njih se veže 500-800 pb
-oni su core proteini i uvijek su prisutni na mRNA
-oni sprječavaju nastajanje sekundarnih struktura RNA, kontrolira se interakcija mRNA s drugim proteinima, oni su također važni za nastavak procesiranja

81
Q

5’ kape od čega se sastoji

A

sastoji se od 7-metil gvanozina i dodaje se metilna skupina na OH skupinu C2 atoma riboze prvog nukleotida u lancu

82
Q

kojom vezom se veže 7-metil gvanizin

A

5-5 fosfodiesterskom vezom na prvi nukleotid mRNA koji se također metilira-takva metilacija je karakteristična za biljne i životinjske stanice

83
Q

poliadenilacija

A

-započinje cijepanjem endonukleazom do nastanka 3’-OH skupine i povezivanje poliadenina
-utječe na stabilizaciju mRNA, o njoj također ovisi prepoznavanje ispravne mRNA

84
Q

enzim koji katalizira poliadenilaciju

A

poliadenilat polimeraza
dio je multiproteinskog kompleksa, nije joj potreban kalup

85
Q

ribozimi

A

RNA molekule koje imaju katalitičku funkciju, kataliziraju reakciju transesterifikacije kod splicinga
-samosplicing jer RNA molekula katalicira tu reakciju

86
Q

spliceosom-šta je i podjedinice

A

ribonukleoproteinski komleksi koji se sastoje od snRNA i proteina (snRNP)
-podjedinice se označavaju sa U (od 1 do 6)
-sastoji se od 170 proteina

87
Q

klasični splicing

A

podrazumijeva izrezivanje svih introna i povezivanje svih egzona

88
Q

alternativni splicing

A

-omogućuje nastanak različitih RNA molekula i proteina, može doći do izbacivanja nekim egzona, a neki introni mogu ostati
-na taj način može doći do regulacije određenih mRNA u stanici

89
Q

mehanizmi regulacije transkripcije s alternativnim splicingom

A

alternativnim splicingom dolazi do izbacivanja egzona koji npr. kodira za aktivacijsku domenu aktivatora i sada se taj aktivator može vezati na DNA, ali neće doći do aktivacije transkripcije tako da je sad taj aktivator zapravo represor

90
Q

od čega se sastoji egzosom?

A

-sastoji se od 9 proteina koji su srž tog kompleksa, to su strukturni proteini
-sastoji se i od dvije egzonukleaze, oni cijepaju samo RNA molekule koje prepoznaju kao neipsravne, za prepoznavanje pomažu i kofaktori egzosoma

91
Q

koje su podjedinice katalitičkih proteina u egzosomu?

A

Rrp6-podjedinica koja je aktivna u jezgri
Dis3- podjedinica koja je aktivna u citoplazmi
-u sredini se nalzi otvor kroz koji ulazi RNA koja se razgrađuje

92
Q

mehanizmi kontrole mRNA molekula u citoplazmi

A

temelje se na kontroli stabilnosti mRNA ili se može kontrolirati sam proces translacije

93
Q

načini razgradnje mRNA u citoplazmi

A
  1. razgrana mRNA ovisna o deadenilaciji
  2. razgradnja mRNA neovisna o deadenilaciji
  3. mehanizam s endonukleazama
94
Q

regulacija na razini stabilnosti mRNA

A

stabilnost može biti regulirana kaoodgovor na signal izvan stanice
-primjer je protein transferin

95
Q

pozitivna kontrola translacije

A

postoje proteini koji funkcioniraju kao aktivatori translacije te regije na mRNA i privlače aktivatore i ribosom

96
Q

negativna kontrola translacije

A

vezanje represora translacije na regiju na mRNA i onda onemogućuju vezanje ribosoma ili ga slabi

97
Q

primjer mehanizma postranskripcijske kontrole na razini translcije

A

-primjer u kojem jedan protein regulira translaciju mRNA koja kodira za feritin, ali istovremeno razgrađuje mRNA koja kodira za transferin
-kontrola razine željeza u stanica

98
Q

feritin

A

-veže slobodno željezo i sprječava njegovu akumulaciju u stanici
-mRNA za feritin na 5’ kraju ima IRE elemente, sekundarna struktura na koje se veže IRE binding protein
-nema željeza-nema transalcije
-ima željeza-ima translacije

99
Q

transferin

A

mRNA transferina na svom 3’kraju ima IRE petlje i AU bogate elemente koji utječu na nestabilnost mRNA
-nema željeza-nema razgradnje mRNA
-ima željeza-ima razgradnje mRNA

100
Q

na šta utječe IRE binding protein?

A

utječe na dvije mRNA istovremeno
ima željeza-on je inaktivan, sinteza feritina, razgradnja mRNA
nema željeza-on je aktivan, nema sinteze feritina, mRNA se ne razgrađuje, sintetizira se transferin

101
Q

RNA interferencija
šta je
koje RNA

A

-proces u stanici koji dovodi do utišavanja ekspresije gena, odnosno potiče degradaciju ciljane mRNA molekule
-kod eukariota se koristi za utišavanje mnogih gena
-postoje i miRNA, siRNA (mala interferirajuća molekula), shRNA (struktura ukosnice

102
Q

kad protein postaje aktivan?

A

tek nakon njegovog transporta na mjesto djelovanja odnosno tek nakon ispravne lokalizacije

103
Q

gdje se nalaze receptori u ER koji prepoznaju proteine koji nemaju funkciju u ER?

A

na unutrašnjoj membrani ER

104
Q

sekretorna vezikule

A

u njima se uglavnom nalaze proteini koji se izbacuju van stanice

105
Q

dva načina sekrecije

A

regulirana (prohormoni) i konstitutivna (albumin)

106
Q

regulatorna sekrecija

A

odvija se kada su posebni uvjeti kao što je stres koji aktiviraju sekretorni vezikulu u kojoj se zatim transportiraju sekrecijski proteini

107
Q

tko je zaslužan za usmjeravanje proteina?

A

signalne sekvence, određuju u kojoj organeli će se naći neki protein
-pomoću metoda GI nekim intracelularnim proteinima je dodana signalna sekvenca i oni su uspješno transportirani van stanice

108
Q

vrste vezikula i razlika

A

transportne i sekretorne
u sekretnoj vezikuli se protein zadržava malo duže dok kod transportne se zadržava kratko

109
Q

šta je SRP

A

-citosolni kompleks koji se sastoji od RNA i 6 proteina
-protein p54 prepoznaje signalnu sekvencu, protein p54 ima hidrofobne i bazične AK kako bi se povezao sa signalnom sekvencom i tada dolazi do zaustavljanja translacije
-hidofobne i ionske interakcije

110
Q

glikozilacija proteina

A

vezanje ugljikohidrata na proteinski lanac
događa se u lumenu ER, a kod nekih proteina i u golgijevom aparatu
služi za usmjeravanje proteina na daljnje korake u sekretnom putu

111
Q

vrtse glikozilacije proteina

A

O-glikozilacija i N-glikozilacija

112
Q

koji nosač je bitan za glikozilaciju proteina

A

dolikol fosfat i to je transmembranski protein u ER

113
Q

koji je protein zaslužan za uspostavljanje pravilnih disulfidnih veza kod proteina?

A

disulfid izomeraza (PDI)

114
Q

gdje se nalazi signalna sekvenca kod slobodnih proteina

A

može biti na N ili na C terminalnom kraju proteina

115
Q

NPC

A

-nuclear pore complex
-multiproteinski kompleks građen od oko 30 proteina nukleoporina
-kompleks ima prstenastu strukturu s filamentima koji strše iz njega

116
Q

nukleoporini

A

-proteini koji izgrađuju NCP
-mogu biti membranski, strukturni i FG nukleoporini

117
Q

šta je potrebno za transport proteina u jezgru?

A

signalna sekvenca (NLS) i citoplazmatski ekstrakt (RAN i receptor za transport)

118
Q

mitohondrij dijelovi

A

matriks mitohondrija, unutarnja membrana, međumembranski prostor, vanjska membrana

119
Q

signalna sekvenca na proteinima koja ih usmjerava u mitohondrije

A

-matrix targeting sequance
-nalazi se na N terminalnom kraju
-protein također mora imati jednu ili više sekvenci koja usmjerava njegovu lokalizaciju nako što uđe u mitohondrij

120
Q

matrix targetin sequence

A

-ima i primarnu i sekundarnu strukturu (alfa heliks)
-karakteristike te sekundarne strukture su da se s jedne strane nalaze bazične AK, a s druge hidrofobne AK

121
Q

promotorska regija kod eukariota

A

nalazi se uzvodno prije početka transkripcije , ali ona uključuje i mjesta gdje se vežu aktivatori i transkripcijski faktori, a ta mjesta se ne moraj uvijek biti uzvodno

122
Q

trp represor je kakav protein

A

dimer, dvije podjedinice su simetrične i kada se one saviju dolazi do vezanja na operator

Molekularna biologija (1 decks)

Brainscape helps you reach your goals faster, through stronger study habits.
© 2024 Bold Learning Solutions. Terms and Conditions