MANIPULACIÓN DE GENES. ANÁLISIS DE ÁC. NUCLEÍCOS: PCR, BLOT Y ELISA Flashcards
Pasos de extracción de DNA por técnica de fenol-cloroformo
Lisis de células y liberación de DNA
Extracción de proteínas y lípidos con solventes orgánicos
Precipitación de DNA
Lavado de DNA
Lisis de eritrocitos se realiza con
Cloruro de amonio
Lisis de membranas celulares y nucleares se realiza con
SDS (dodecilsufato sódico)
La extracción de proteínas y lipidos se realiza con
Febol:cloroformo:alcohol isoamilico 25:24:1
Fases de la extracción de proteínas y lipidos con solventes orgánicos
Fase orgánica: Fenol: lipidos, proteínas y de risa celulares.
Fase acuosa: ácidos nucléicos
Precipitación de DNA se realiza con
Sol salina saturada
Etanol 100%
Lavado de DNA se realiza con
Etanol 70%
Agua
Cuantificación de DNA se hace con
Espectrofotometría o fluorometria.
Espectrofotometría
Cualquier solución con moléculas suspendidas permite el paso de un haz de luz a través de ella en proporción inversa a la cantidad de moléculas que contiene.
Mientras más luz absorba mayor concentración.
Absorción de RNA y DNA
260 nm
Absorción de proteínas
280 nm
Absorción de fenol
270 nm
Fluorometría
Unión especifica de colorantes fluorescentes al ácido nucleico.
Absorbe la luz a una determinada longitud de onda y emite una longitud de onda superior.
La concentración es proporcional a la intensidad de emisión fluorescente.
Para una PCR se requiere:
Secuencia de DNA
Enzima DNA polimerasa
Desoxiribonucleotidos (dNTP)
Primers
Buffer/cofactores (amortiguadores)
Enzima que polimeriza una cadena de DNA tomando como molde una preexistente.
DNA polimerasa
Thermus aquaticus (Taq)
Soporte 95°C
Desoxiribonucleótidos
dATP, dCTP, cGTP, dTTP
Amortiguador de DNA polimerasa debe tener
pH adecuado (8.4)
Cofactor de la Taq polimerasa
Magnesio
Iniciadores de PCR (primers)
Lo que determina el inicio y el término de la región que se va amplificar.
Se diseñan y utilizan para reconocer secuencias blanco en el DNA molde.
Son cortos de 18 a 24 nt.
No debe de ser autocomplementario.
No debe de formar estructuras secundarias.
Los iniciadores de PCR proporcionan
Un extremo 3’
Forward 5’ a 3’
Los iniciadores de PCR tienen alto contenido en
GC
Fases de la reacción en cadena de la polimerasa
Desnaturalización
Hibridación
Extensión
En una PCR. ¿Qué sucede en la desnaturalización?
Se separan las cadenas de DNA
Temperatura necesaria para la desnaturalización en PCR
95°C (20 a 30 seg)