MANIPULACIÓN DE GENES. ANÁLISIS DE ÁC. NUCLEÍCOS: PCR, BLOT Y ELISA Flashcards

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1
Q

Pasos de extracción de DNA por técnica de fenol-cloroformo

A

Lisis de células y liberación de DNA
Extracción de proteínas y lípidos con solventes orgánicos
Precipitación de DNA
Lavado de DNA

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Q

Lisis de eritrocitos se realiza con

A

Cloruro de amonio

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3
Q

Lisis de membranas celulares y nucleares se realiza con

A

SDS (dodecilsufato sódico)

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4
Q

La extracción de proteínas y lipidos se realiza con

A

Febol:cloroformo:alcohol isoamilico 25:24:1

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Q

Fases de la extracción de proteínas y lipidos con solventes orgánicos

A

Fase orgánica: Fenol: lipidos, proteínas y de risa celulares.
Fase acuosa: ácidos nucléicos

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6
Q

Precipitación de DNA se realiza con

A

Sol salina saturada
Etanol 100%

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7
Q

Lavado de DNA se realiza con

A

Etanol 70%
Agua

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8
Q

Cuantificación de DNA se hace con

A

Espectrofotometría o fluorometria.

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9
Q

Espectrofotometría

A

Cualquier solución con moléculas suspendidas permite el paso de un haz de luz a través de ella en proporción inversa a la cantidad de moléculas que contiene.
Mientras más luz absorba mayor concentración.

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10
Q

Absorción de RNA y DNA

A

260 nm

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11
Q

Absorción de proteínas

A

280 nm

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12
Q

Absorción de fenol

A

270 nm

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13
Q

Fluorometría

A

Unión especifica de colorantes fluorescentes al ácido nucleico.
Absorbe la luz a una determinada longitud de onda y emite una longitud de onda superior.
La concentración es proporcional a la intensidad de emisión fluorescente.

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14
Q

Para una PCR se requiere:

A

Secuencia de DNA
Enzima DNA polimerasa
Desoxiribonucleotidos (dNTP)
Primers
Buffer/cofactores (amortiguadores)

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15
Q

Enzima que polimeriza una cadena de DNA tomando como molde una preexistente.

A

DNA polimerasa
Thermus aquaticus (Taq)
Soporte 95°C

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16
Q

Desoxiribonucleótidos

A

dATP, dCTP, cGTP, dTTP

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17
Q

Amortiguador de DNA polimerasa debe tener

A

pH adecuado (8.4)

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18
Q

Cofactor de la Taq polimerasa

A

Magnesio

19
Q

Iniciadores de PCR (primers)

A

Lo que determina el inicio y el término de la región que se va amplificar.
Se diseñan y utilizan para reconocer secuencias blanco en el DNA molde.
Son cortos de 18 a 24 nt.
No debe de ser autocomplementario.
No debe de formar estructuras secundarias.

20
Q

Los iniciadores de PCR proporcionan

A

Un extremo 3’
Forward 5’ a 3’

21
Q

Los iniciadores de PCR tienen alto contenido en

A

GC

22
Q

Fases de la reacción en cadena de la polimerasa

A

Desnaturalización
Hibridación
Extensión

23
Q

En una PCR. ¿Qué sucede en la desnaturalización?

A

Se separan las cadenas de DNA

24
Q

Temperatura necesaria para la desnaturalización en PCR

A

95°C (20 a 30 seg)

25
Q

En una PCR. ¿Qué sucede en la hibridación?

A

Los primers se alinean al extremo 3’ e hibridan con su secuencia complementaria.

26
Q

Temperatura necesaria para la hibridación en PCR.

A

50 a 60°C

Tm = ((4G + C) + ( 2A +T))

27
Q

En una PCR. ¿Qué sucede en la extensión?

A

La Taq polimerasa actúa sobre el complejo templado de primers. Agrega dNTP’s complementarios para crear cadenas completas de ADN.

28
Q

Temperatura necesaria para la extensión en una PCr

A

72°C

29
Q

Al final de la PCR se realiza un

A

gel de electroforesis.

30
Q

Es una técnica utilizada para separar el ADN, el ARN, o moléculas o proteínas en base a su tamaño y carga eléctrica.

A

Electroforesis

31
Q

Genera campo eléctrico alrededor de un gel, cuenta con dos polos que se conectan a una fuente de energía.

A

Cámara de electroforesis

32
Q

¿Qué es el gel de agarosa y qué hace?

A

Polisacárido extraído de algas marinas.
Separa fragmentos de ácido desoxirribonucleico que van de 100 pb a 25 kb.

33
Q

La concentración de agarosa se escoge según

A

El tamaño del ácido nucleico que se vaya a analizar.

34
Q

El tamaño de los poros de la matriz del gel de agarosa depende de

A

la concentración de agarosa utilizada

35
Q

La concentración de agarosa es inversamente proporcional al

A

Tamaño del poro obtenido

36
Q

Son una mezcla de moléculas de DNA o de proteínas que permite determinar por comparación del tamaño de las moléculas contenidos en las muestras sometidas a electroforesis.

A

Marcador de peso molecular

37
Q

¿Los pasos de la PCR se repiten?

A

Si, la amplificación de una secuencia de DNA se realiza de manera exponencial.
Se repiten las fases de 20- 30 veces (ciclos)

38
Q

Donde se realiza la reacción en cadena de la polimerasa.

A

Termociclador
(Establece un sistema homogéneo, donde la temperatura y tiempo no se modifique en cada ciclo)

39
Q

¿Cómo funciona la electroforesis?

A

Se utiliza una corriente eléctrica para mover las moléculas y que se separen a través de un gel.
Los poros en el gel actúan como un colador, permitiendo que las moléculas más pequeñas se muevan más rápido que las grandes.

40
Q

Técnica de laboratorio utilizada para detectar una secuencia específica de ADN en una muestra de sangre o tejido.

A

Southern Blot

41
Q

Técnica de laboratorio que se utiliza para detectar una secuencia de ARN específica en una muestra de sangre o de tejido.

A

Northern Blot

42
Q

Técnica de laboratorio utilizado para detectar una proteína específica en una muestra de sangre o tejido.

A

Western Blot

43
Q

¿Para qué sirve una PCR?

A

Para amplificar/identificar secuencias de DNA

44
Q

Sirve para estudiar la expresión de muchos genes al mismo tiempo. Se colocan secuencias génicas en un portaobjetos de vidrio, llamado chip.

A

Microarreglos