Malattie Flashcards
che tipo di malattia è la fibrosi cistica
autoomica recessiva`
che tipo di malattia è la malattia di Huntington
autosomica dominante
sindromi da microdelezioni
- sindrome di Williams-Beuren
- sindrome di DiGeorge
- sindrome di Koolen- De Vries
- sindrome del Cri-du-chat
sindrome di Williams-Beuren
- causa genetica
- sintomi
- come si rileva
- sindrome da delezione sbilanciata del braccio lungo del cromosoma 7 7q11.23
- bassa statura/ disabilità intellettiva/ fisionomia specifica/ stenosi aortica sopravalvolare/ cocktail party personality
- FISH e aCGH
sindrome di DiGeorge
- causa genetica
- sintomi
- come si rileva
- delezione sul cromosoma 22
- problemi cardiaci congeniti/ facies/ infezioni ricorrenti/ ritardo nello sviluppo/ palatoschisi/ problemi dell’apprendimento
- FISH o aCGH
sindrome di Koolen- de Vries
- causa genetica e che gene
- sintomo
- microdelezione sul cromosoma 17 causata dal gene KANSL1
- disabilità intellettiva
sindrome del Cri du chat
- causa genetica e gene
- sintomi
- come si rileva
- delezione terminale del cromosoma 5 causata dal gene CTNND2
- alterazione dello sviluppo della laringe/ ipertelorismo/ microcefalia/ disabilità intellettiva
- FISH
4 patologie causate da espansione di triplette
- atassia spino cerebellare
- distrofia miotonica
- sindrome dell’X fragile
- corea di Huntington
sindrome di Rett
- tipologia di malattie e chi affetta
- gene mutato
- fenotipi
- malattia X linked che colpisce solo le femmine nei maschi è letale
- gene reader MeCP2
- inizialmente prive di fenotipi/ poi perdita del controllo delle mani/ epilessia/ problematiche muscolari/ anomalie respiratorie e oculari
gene BRCA1
- cosa causa la sua mutazione
- con quale meccanismo si trasmette
- ruolo del gene
- tumore alla mammella
- meccanismo double hit
- promuovono il double strand break repair mediante ricombinazione omologa
gene APOE
fattore predisponente all’alzheimer
TP53
- cos’è il gene
- quale sindrome causa
- è un fattore di trascrizione anti apoptotico
- causa la sindrome di li fraumeni
gene APC
- ruolo del gene
- cosa causa la sua perdita
- quale sindrome causa
- fondamentale nei processi cellulari
- la sua perdita fa aumentare la beta catenina che attiva MYC facendolo diventare oncogene
- causa la FAP
gene VHL
- ruolo del gene
- quale sindrome causa
- è un tumor suppressor gene che inibisce fattori di crescita
- sindrome di Von Hippel - Lindau
FAP poliposi adenomatosi familiari
- gene mutato
- meccanismo di trasmissione
- polipi
- pathway che attiva la malattia
- APC
- doppio hit
- tanti polipi con aumentato rischio di ottenere mutazione
- aumenta la beta catenina che induce la trascrizione di Myc portandolo da protoncogene ad oncogene
MAP
- gene mutato
- ruolo del gene
- tipo di malattia
- MUTYH
- base excision repair gene
- recessiva
sindrome di Lynch
- geni mutati
- ruolo dei geni
- meccanismo di trasmissione
- quali malattie provoca
- geni MLH1, MSH2, MSH6, PMS2, EPCAM
- geni del mismatch repair
- doppio hit
- cancro colonrettale, all’endometrio, ovario, stomaco, melanoma ecc
sindrome di Li-Fraumeni
- gene mutato
- ruolo del gene
- meccanismo di trasmissione
- 5 tipi di cancro che causa
- TP53
- fattore di trascrizione proapoptotico
- dominant negative
- carcinoma adrenocorticale/ cancro alla mammella/ tumori del snc/ osteosarcomi/ sarcomi dei tessuti molli
sindrome di Von Hippel Lindau
- gene mutato
- ruolo del gene
- meccanismo di trasmissione e letalità
- una mutazione dello stesso gene è legata anche ad un’altra malattia
- gene VHL
- tumor suppressor gene
- doppio hit letale
- una gain of function causa eritrocitosi di tipo 2
come si chiamano i frammenti di dna mitocondriale che si trova nel dna nucleare
NUMTs
3 sindromi mitocondriali
- sindrome melas
- sindrome merrf
- sindrome di Leigh
sindrome melas
- che tipo di malattia è
- sintomi
- malattia mitocondriale
- encefalopatia con acidosi ed episodi simili a ictus/ dolore muscolare/ disabilità intellettiva/ ritardo psicomotorio/ epilessia
sindrome merrf
- che tipo di malattia è
- sintomi
- gene mutato
- malattia mitocondriale
- facies/ disabilità intellettiva/ fibre rosse sfilacciate/ epilessia
- MT-TK
sindrome di Leigh
- che tipo di malattia è
- sintomi
- malattia mitocondriale
- deficit respiratorio/ ipossia/ difficoltà respiratoria
3 terapie per le malattie mitocondriale
- terapia sintomatica
- terapia che agisce sul danno
- terapia genica attraverso mito-TALENS
editing genetico per le malattie mitocondriali
tecnica Mito-TALENS
- si taglia il DNA mutato con enzimi di restrizione
- il pezzo mutato viene rimpiazzato con un pezzo sano
- le estremità vengono saldate
si riduce l’eteroplasmia ma non si induce omoplasmia
viene applicato a cellule somatiche ma non germinali
varianti puntiformi estremamente rare
associate alle malattie mendelliane
varianti puntiformi rare
MAF<0.005
varianti puntiformi a bassa frequenza
0.005 < MAF < 0.05
varianti puntiformi comuni
MAF > 0.05
retinite pigmentosa
- tipo di malattia
- geni coinvolti
- malattia digenica
- ROM1 e PRPH2
poligenic risk score
stima della predisposizione genetica di una persona ad una malattia rara, dato dalla somma di varianti rilevanti sul fenotipo e varianti lievi sul fenotipo
prader willi syndrome
- tipo di sindrome
- gene coinvolto
- fenotipi
- da cosa è causata
- loss of imprinting
- gene SNRPN con fisiologico imprinting materno
- bassa statura/ carattere scontroso/ dis int/ obesità
- delezione paterna/ upd materna/ traslocazione paterna/ mutazioni puntiformi paterne/ mutazioni centri imprinting
angelman syndrome
- tipo di sindrome
- gene coinvolto
- fenotipi
- da cosa è causata
- loss of imprinting
- gene UBE3A con fisiologico imprinting paterno
- allegria/ alta statura/ disabilità intellettiva/ epilessia
- delezione materna/ upd paterna/ traslocazione materna/ mutazioni puntiformi materne/ mutazioni centri imprinting
su che cromosoma è prader willi e angelman
15q
silver Russell syndrome
- tipo di sindrome
- fenotipi
- genotipi
- loss of imprinting con espressione materna
- asimmetria/ bassa statura/ clinodattilia ecc
- varianti / upd materna chr 7/ pat IC1 LOM
beckwith-wiedemann syndrome
- tipo di sindrome
- fenotipi
- genotipi
- loss of imprinting con espressione paterna
- overgrowth/ iperglicemia/ iperinsulina/ suscettibilità a tumori embrionali/ onfalocele
- mat IC2 LOM/ mat IC1 GOM/ upd pat/ microduplicazione pat
geni di silver Russell e beckwith-wiedemann e su che cromosoma
paterni: IGF2 e KCNQ1OT1
materni: H19, KCNQ1, CDKN1C
su 11p
in quali cromosomi possono avvenire gli isocromosomi
acrocentrici o metacentrici
meccanismo di formazione di isocromosomi
perdita dei bracci corti
linearizzazione
duplicazione
cromosomi acrocentrici
13 14 15 21 22
sindrome dell’x fragile
- altro nome
- dove si trova
- fenotipo
- chi ne è affetto
- di Martin bell
- braccio lungo del cromosoma X
- disabilità intellettiva
- più i maschi che le femmine
cariotipo di una triploidia
69, XXX
dove è fisiologica la poliploidia nel nostro corpo?
nei megacariociti e negli epatociti
da cosa è causata l’aneuploidia
- anaphase lag
- non disgiunzione
5 determinanti della variabilità del nostro genoma
- assortimento indipendente
- crossing over
- snvs de novo
- cnvs causate da low copy repeats
- instabilità dei repeats
definizione di pseudodominante
mutazione recessiva che troviamo in generazioni consecutive per la consanguineità
3 sindromi da espressività variabile
- sindrome di Marfan
- sonic hedgehog
- sindrome di DiGeorge
fenilchetonuria
- gene e su che cromosoma
- per cosa codifica
- fenotipo
- test
- gene PAH sul cromosoma 12
- fenilalanina idrossilasi
- accumulo di fenilalanina nei tessuti (cervello, sangue, urine) con disabilità intellettiva e problemi motori
- test di Guthrie
retinoblastoma
- gene
- modalità di trasmissione
- ereditario o sporadico (caratteristiche)
- gene RB1
- recessivo
- ereditario: una variante è ereditata e l’altra è acquisita, è più precoce e bilaterale
sporadico: mutazioni de novo, più tardiva e unilaterale
leucemia acuta linfoblastica
- gene e su che cromosoma
- modello di trasmissione
- second hit
- gene PAX5 sul cromosoma 9
- modello a doppio hit
- il second hit può essere una delezione del cromosoma 9 o isocromosoma 9 (e dare fenotipo più grave) o una variante missenso (con fenotipo meno grave)
sindrome TAR
- meccanismo di trasmissione
- primo hit e secondo hit
- fenotipi
- situazioni:
1. solo la delezione
2. solo variante ipomorfica
3. due delezioni
4. delezione e variante ipomorfica
- a doppio hit dove entrambi sono germinali in trans
- il primo è una delezione interstiziale sul braccio lungo del cromosoma 1, mentre il secondo è una variante ipomorfica sul gene RBM8A
- trombocitopenia, assenza del radio, focomelia
1. nulla
2. nulla
3. letale
4. TAR
sindrome TACS
- gene e su che cromosoma
- fenotipi
- meccanismo di trasmissione
- da cosa è dato l’aplotipo di rischio
- situazioni:
1. entrambi wild type
2. un wild type e un allele di rischio
3. un allele wild type e una delezione
4. allele di rischio su entrambi
5. delezione e allele di rischio
6. delezione su entrambi
- gene TBX6 sul cromosoma 16
- emivertebra, scoliosi congenita, vertebra a farfalla, fusione dei corpi vertebrali
- a doppio hit
- l’aplotipo di rischio è dato dall’unione di 3 varianti in cis tra di loro
1. no TACS
2. rischio vicino allo zero
3. rischio basso
4. rischio basso
5. TACS
6. letale
retinite pigmentosa
- tipo di malattia
- due geni
- malattia a eredità digenica
- geni ROM1 e PRPH2
malattie da effetti posizione
- loss of function
- gain of function
- errori codificanti
- aniridia/ sindrome di leri weill
- sex reversal
- sindrome F/ sindrome di liebenberg
sindrome di Claes-Jensen
- gene mutato
- che tipo di gene è e qual è la funzione
- fenotipi
- gene KDM5C
- eraser, demential la lisina 4 dell’istone H3
- disabilità intellettiva/ dismorfismi facciali/ micro o macrocefalia
sindrome di Rubinstein-Taybi
- geni mutati
- per cosa codificano
- fenotipi
- CREBBP e EP300
- enzimi Writer
- disabilità intellettiva/ sopracciglia folte e naso lungo e prominente/ anomalie scheletriche e comportamentali
sindromi Kabuki di tipo 1 e 2
- geni mutati e che tipo di modifica
- per cosa codificano
- fenotipi
- gene KMT2D mutazione de novo lof/ gene KDM6A
- writer e eraser
- disabilità intellettiva, bassa statura, dimorfismi facciali e anomalie cardiache e renali
sindrome di Rett
- modalità di trasmissione
- gene mutato e che tipo è
- fenotipi
- XLD
- gene MeCP2 reader
- inizialmente privi di fenotipi, al 6/18 mese perdita di controllo delle mani, epilessia, anomalie respiratorie e oculari
enzima demetilazione semiconservativa
DNMT1
enzimi demetilazione de novo
DNMT3a e DNMT3b
aniridia
- causa mendeliana
- causa effetto posizione e spiegazione
- 90% mendeliana, mutazione in PAX6
- 10% effetto posizione, delezione di ELP4
un introne il ELP4 contiene l’enhancer di PAX6 e la sua perdita equivale alla perdita di espressione di PAX6
sindrome di Leri-Weill
- causa mendeliana e che tipo di trasmissione
- causa effetto posizione
- fenotipi
- mendeliana: mutazione loss of function o delezione del gene SHOX o SHOXY/ autosomica
- effetto posizione: una delezione dell’enhancer di SHOX
- statura bassa, displasia scheletrica, polso malformato
sex reversal
- in cosa consiste
- fenotipo
- duplicazione dell’enhancer di SOX9
nei pazienti 46,XX la duplicazione dell’enhancer fa sì che SOX9 si attivi anche senza SRY - individui genotipicamente femmine sviluppano caratteri sessuali maschili
sindrome F
- prima causa
- seconda causa
- fenotipo
- delezione gene EPHA4 che contiene un insulator, quindi l’enhancer agisce anche con PAX3
- inversione risultante nell’enhancer di PAX3 che vien adottato da WNT6
- prime due dita della mano unite a formare una F
sindrome di Liebenberg
- da cosa è causata
- fenotipi
- delezione di H2AFgamma che elimina un insulator, quindi l’enhancer interagisce con PTX1
- braccia che sono anatomicamente gambe e gomiti con le stesse articolazioni delle ginocchia
meccanismi gain of function dei protoncogeni
- mutazioni missenso
- amplificazione
- riarrangiamenti cromosomici
mutazioni missenso protoncogeni
gene KRAS che attraverso un cambio nucleotidico provoca adenocarcinoma al pancreas o al colon
amplificazione negli oncogeni
- in cosa consiste
- due malattie e i loro geni
errore nella replicazione del dna e un protoncogene viene duplicato n volte
- neuroblastoma gene MYCN
- cancro alla mammella gene HER2
riarrangiamenti cromosomici degli oncogeni
- cromosoma philadelphia
- inversione di EML4 e ALK
- traslocazione bilanciata 8-14
cromosoma philadelphia
- cosa causa
- da cosa è formato
- geni
- leucemia mieloide cronica
- cromosoma 9-22: p+parte del q del 9 e q del 22
p del 22 e q del 9 - gene ABL1 sul 9 e BCR sul 22
inversione di EML4 e ALK
- cosa causa
adenocarcinoma al polmone
traslazione bilanciata 8-14
- cosa causa
- in cosa consiste
- linfoma di Burkitt
- scambio dei bracci lunghi di 8 e 14
in quali cromosomi avviene più frequentemente l’imprinting?
6, 7, 11, 14, 15, 19, 20
caratteristiche del metiloma
- geni diversi e fenotipo uguale
- stessi geni e fenotipi opposti
- geni diversi e fenotipo uguale: metilazione simile
- stessi geni e fenotipi opposti: metilazione simmetrica
sotos syndrome
- gene causativo
- che tipo di gene è
- NSD1
- writer
i tre tipi di diabete
- autoimmune/ nei giovani/ poligenica
- multifattoriale/ negli adulti/ legata a obesità
MODY. autosomica dominante/ tutte le età
tecnica 4c
studia un promotore verso tutte le regioni del genoma
tecnica Hi-C
studia tutto il genoma verso tutto il genoma
meccanismi loss of function degli Onco soppressori
- mutazioni puntiformi
- delezione del gene
- non disgiunzione con duplicazione
- ricombinazione mitotica
