Maladies infectieuses Flashcards
Maladies infectieuses
Agents pathogènes en cause (4)
Virus
Bactéries
Parasites
Champignons
Maladies infectieuses; Modes de transmission (2)
Direct: Contact peau à peau, contact muqueuse, contact avec du sang
Indirect: Aérosols, gouttelettes, surfaces ou aliments contaminés
Maladies infectieuses
On peut définir différentes catégories de maladies infectieuses (5)
Infections transmissibles sexuellement et par le sang (ITSS)
Infections respiratoires et saisonnières
Infections nosocomiales/infections résistantes (dans hôpitale)
Infections par des pathogènes entériques (intestinales)
Infections vectorielles et zoonoses (ex: moustique, puce)
L’étude des maladies infectieuses est coordonnée au Québec par l’INSPQ/LSPQ. Ils divisent ce champ d’expertise en 4 domaines:
- Immunisation
- ITSS et biovigilance
- Infections nosocomiales et risques infectieux en milieu de soins
- Surveillance, prévention et contrôle des maladies infectieuses
TAAN veux dire?
techniques d’amplification des acides nucléiques (TAAN)
Avantages des méthodes TAAN en infectiologie
- Mé….
- Appl…
- Méthode de choix en identification de microorganismes
- Applications diverses
Désavantages des méthodes TAAN en infectiologie
- Qu…
- Qu’est-ce qu’on…
- Asp…
- Questionnements et indications cliniques
- Qu’est-ce qu’on cherche à identifier?
- Aspects de laboratoire
Les infections respiratoires sont c________, ont des caractères souvent s_____________et sont responsables d’infections n__________ et c_____________.
Les infections respiratoires sont courantes, ont des caractères souvent saisonniers et sont responsables d’infections nosocomiales et communautaires.
Infections respiratoires, populations à risque (5)
3 premier évident
4e logique
5e fourre tout
- Nouveaux-nés
- Personnes agées
- Femmes enceintes
- Patients immuno(déprimé/supprimé)
- Patients ayant certains facteurs de risque
Infections respiratoires, SAG: Syndrome d’allure grippale
Quels en sont les 4 signes classiques?
- Fièvre
- Toux
- Fatigue extrême
- Douleurs articulaires/musculaires
Respiratory syncytial virus (RSV) affecte plus quel population?
Les enfants
Les infections respiratoires atteignent leur pic vers saisons?
Automne et hiver
Causant des infections respiratoires:
Donne moi trois virus
Donne moi trois bactérie
- RSV Respiratory scyncytial virus
- Influenza A/B
- Adénovirus
- Staphylococcus aureus
- Bordetella pertussis
- Chlamydia pneumoniae
% de population canadienne infecté au moin 1 fois par SRAS-CoV-2?
60%
SRAS-CoV-2, transmission?
Principalement une transmission personne-à-personne par gouttelette-contact
SRAS-CoV-2, Infectiosité
La probabilité de transmission est plus grande lorsque la charge virale est le plus élevé (Ct < ?)
La probabilité de transmission devient basse à un Ct de combien?
Cycle treshold de < 24
Ct ≥ 30
SRAS-CoV-2, Infectiosité
Infectiosité débute environ ___ jours avant le début des Sx
Le pic d’infectiosité est à ____ jours avant et ____ jours suivant
l’apparition des Sx.
L’infectiosité est quasi-nulle __-___ jours après le début des Sx
La médiane de clairance virale est de ___ jours
2.3 jours
0.7 jours et 2 jours
7-10 jours
30 jours
SRAS-CoV-2, SŜ à la présentation initiale:
1. Symptômes…
2. Symptômes…
3. Symptômes…
4. Symptômes…
- Symptômes respiratoires
- Symptômes généraux
- Symptômes GI
- Symptômes neurologiques
SRAS-CoV-2, SŜ à la présentation initiale (génétique):
1. Symptômes respiratoires (3)
2. Symptômes généraux (4)
3. Symptômes GI (2)
4. Symptômes neurologiques (1)
Toux
Essouflement ou difficulté à respirer (Dyspnée)
Nez qui coule (Rhinorrhée)
Fièvre
Maux de tête
Douleur musculaire (Myalgie)
Mal de gorge
Diarrhée
Nausée / vomissements
Perte d’odorat (Anosmie)
SRAS-CoV-2, Évolution clinique fréquente suivant les SŜ à la présentation initiale?
Pneumonie atypique avec infiltrats bilatéraux au CT scan
Spectres de sévérités des infections
1. As…, x-y%
2. At…, x%
3. At…, y%
4. At…, z%
Mortalité global estimée à ?%
- Asymptomatiques: Estimé à 30-40% des infections
- Atteinte légère: Estimé à 81%
- Atteinte sévère: Estimé à 14%
- Atteinte critique: Estimé à 5%
Mortalité global estimée à 2.3%
Pneumonie atypique avec infiltrats bilatéraux au CT scan, 4 signes
O…
O… et c…
É…. ….
É…. ….
Console mes pleures Agacant Interminable
Opacification
Opacification et consolidation
Épaississement pleural adjacent
Épaississement interlobulaire
SRAS-CoV-2 – Aspects laboratoire le test initial de détection est centré autour de quel gène?
Gène E
SRAS-CoV-2 – Aspects laboratoire
Processus optimale en 5 étapes:
Phonétique HIER mnémonique IEAIR
- Inactivation
- Extraction
- Amplification
- Interprétation
- Rapport
SRAS-CoV-2 – Problèmes d’approvisionnement systématique à tous les niveaux
Phase analytique: Quels problèmes? (3)
Phase pré-analytique: Quels problème? (1)
- Baisse des réactifs d’extraction
- Rupture de stock de réactifs d’extraction
- Qualité des sondes et amorces
- Rupture de stock de milieu de transport UTM/VTM (Universal/Virus Transport Media)
SRAS-CoV-2 – Problèmes d’approvisionnement systématique à tous les niveaux
Phase analytique -Baisse des réactifs d’extraction
C’est quoi la solution?
Avantages (2) vs désavantages (3)
Stratégie de pooling (pool patients ensemble avant extraction)
Avantages:
1. Capacité analytique ↑
2. Réactifs d’extraction ↓
Désavantages:
1. Temps technique ↑
2. Quel population ciblé/poolé ensemble?
3. Utilité du pooling dépend de l’incidence
SRAS-CoV-2 – Problèmes d’approvisionnement systématique à tous les niveaux
Phase analytique - Rupture de stock de réactifs d’extraction
C’est quoi la solution?
Avantages (2) vs désavantages (2)
Développement d’une stratégie sans extraction (lyse thermique)
Avantages:
1. Plus besoin de réactifs
2. Inactivation et extraction même étape
Désavantages:
1. Pas de pool possible
2. Nécessite l’ajout d’un contrôle interne
SRAS-CoV-2 – Problèmes d’approvisionnement systématique à tous les niveaux
Phase analytique - Qualité des sondes et amorces
C’est quoi le problème?
C’est quoi la solution?
P: Sondes et amorces contaminés par séquences de SRAS-CoV-2
S: Séquençage des sondes/amorces au LSPQ avant distribution aux laboratoires
SRAS-CoV-2 – Problèmes d’approvisionnement systématique à tous les niveaux
Phase pré-analytique - Rupture de stock de milieu de transport
C’est quoi la solution?
Réception au laboratoire de n’importe quel milieu de transport mais, tous ces milieux ont dû être validés exhaustivement pour chaque méthode.
Progression de l’emplacement du prélèvement sur l’humain?
1. → 2. → 3.
- Nasopharyngé → 2. Oro-nasal → 3. Salive et gargarisme (G-SPIT)
Comment gérer un patient se présentant avec SAG à l’urgence?
L’obtention de résultats rapides et différentiel pour distinguer différents types d’infections respiratoires devient un pré-requis important pour les équipes de soins.
Multiplex respiratoires, Test de Éric développé pour détection de quel genre de virus? (4)
COVID
Influenza A
Influenza B
RSV
Interférences dans un multiplex melting qPCR (4)
1 évidente
2 moin évidente, 2 mot clé
dernière pense LCMS
- Channeling
- Sensibilité relative des sondes
- Optimisation des mastermix
- Intégration systématique de contrôles internes
Influenza A/B
Glycoprotéine de surface?
Changement antigénique?
Humain ou zoonotiques?
A = hémaglutinine, fréquents, réservoirs zoonotiques
B = neuraminidase, peu fréquents, exclusivement humain
Virus respiratoire syncitial (RSV); Épidémiologie (2)
E______
S______
Enfats
Saisonnière
Virus respiratoire syncitial & Influenza A/B; transmission?
Les deux contact et par aérosol
Influenza = nosocomiale aussi
Virus respiratoire syncitial & Influenza A/B; SŜ?
Influenza = SAG
RSV = Toux, fièvre, détresse respiratoire (enfant) ou écoulement nasal (adulte)
Influenza A/B; Complications (4)
Virus respiratoire syncitial; Complications (1)
Influenza
Complications respiratoires
Complications musculaires
Complications cardiaques
Complications nerveuses
RSV = Complications respiratoires
Virus respiratoire syncitial & Influenza A/B; Tx
Influenza = Tamiflu
RSV = Ribaflavin
