Maintenance du génome Flashcards
Vrai ou faux: les chromosomes des cellules procaryotes ne peut être que circulaire
Faux
Qu’est ce qu’un nucléosome
Le nucléosome est un complexe d’ADN et de protéines (les histones) qui constituent, chez les eucaryotes, l’unité de base de la chromatine. Il représente le premier niveau de compaction de l’ADN
Qu’est ce qu’un nucléoide
La région nucléoïde se trouve dans le cytoplasme des cellules procaryotes . Elle contient de l’ADN, parfois plusieurs copies, ainsi que des protéines, dont des enzymes, et de l’ARN.
Vrai ou faux: l’ADN des cellules bactérienne ne se trouve que dans leurs chromosomes
Faux, les plasmides sont des petits ADN circulaires extrachromosomiques, mm si pas essentiels à la prolifération des bactéries, sont porteurs de gènes
Qu’est ce qu’un exon
séquence codante de l’adn
Qu’est ce qu’un intron
séquence non-codante de l’adn
La taille du génome est corrélée à…
la complexité de l’organismes, + la taille est grosse + l’organisme est complexe
Quel lien on peut faire entre la densité génique et la complexité de l’organisme?
Plus la densité génique de l’organisme est faible et plus il est complexe
Donne des raisons pour lesquelles les organismes + complexes ont une densité génique + faible.
ils ont plus d’introns et un plus grande proportion de séquences répétées
Donne des raisons pour lesquelles la taille du génome des organismes eucaryotes est plus grosse
c’est influencé par le nombre de séquences répétées
Que contient l’ADN intergénique?
(60% du génome humain)
- > 70 % de séquences répétées de
100-1000 pb dispersées à travers le
génome (provenant d’éléments
transposables) - 25 % de séquences uniques (ex.
régions régulatrices de la transcription
et microARNs) - 3 % d’ADN microsatellite (courtes
séquences répétées en tandem de
moins de 13 pb)
Quelle proportion représente les séquences codante dans le génome
1,5%
origine des pseudogène
Une transcriptase inverse
d’origine rétrovirale copie
l’ARNm d’un gène fonctionnel
en ADN double-brin (ADNc)
L’ADNc est ensuite intégré dans
le génome sous la forme d’un
‘pseudogène’.
Ce ‘pseudogène’ ne peut pas être exprimé, aucune séquence régulatrice et initiatrice de la transcription
Qu’est ce qu’une chromatine
Un complexe constitué de d’ADN, ARN et de proteines
Que se passe t’il durant l’interphase?
Durant l’interphase l’ADN est transcrit et dupliqué et à ce stade les
chromosomes sont diffus et non visibles
À quel moment les chromosomes sont visibles?
au cours de l’étape de
ségrégation des chromosomes (mitose et méiose) au cours de la métaphase
Qu’est ce qui représente environ 40% du génome humain
Des séquences de gènes dont la majorité (95%) contiennent: des introns, régions non-traduites, fragments de gènes, pseudogènes (gènes non-fonctionnels)
Comment déterminer la distance moyenne entre les nucléosomes
Vrai ou Faux: Les histones sont de petites protéines contenant un grand nombre de résidus d’acides aminés acides
Faux, les résidus d’acides aminés sont basiques
Quels sont les acides aminés basiques
Lysine, arginine, histidine
Quelles modification post-traductionnelles réversibles subissent les histones?
- méthylation
- acylation
- phosphorylation de résidus spécifiques
Explique comment l’acétylation de résidus lysine des histones modifie leur interaction avec l’ADN
La lysine de la queue de l’histone se lie à l’ADN chargé négativement grâce au groupement amine qu’elle contient. Cependant, lorsque l’histone est acétylé, le groupement amine perd sa charge positive et il n’est donc plus possible pour elle de se lier à l’ADN chargé négativement.
Quelle est la composition d’un domaine structural?
Trois hélices alpha conservées chez toutes les histones de cœur
Le nucléosome présente un double axe de…
symétrie dyade
Résume les principales interactions entre les histones
Combien d’istone pour former un nucléosome
8
Nombre de pb pour l’ADN de coeur du nucléosome chez les eucaryotes
147
Vrai ou faux?
Entre les mitoses, l’ADN est moins compacté.
Vrai
Comment les nucléosomes s’assemblent pour former des structures de niveau supérieur de compaction (rôle histone H1)
H1(chargé+) lie l’ADN de liaison (chargé-) au nuclésome et contribue à la formation de la fibre de 30 nm, organisé soit en solénoide soit en zigzag en resserant les nucleosomes adjacents.
Quels sont les 2 facteurs qui permettent la condensation de la fibre de 30 nm?
- Les queues N-terminales chargées + qui interagissent avec l’ADN internucléosomales et l’ADN de coeur pour stabiliser la structure
- H1 qui lie l’ADN de liaison au nucléosome et les rapproche
Où se lie H1?
H1 se lie à deux sites de l’ADN
– l’ADN internucléosomique à
une extrémité du nucléosome
(ADN de liaison)
– l’ADN du coeur du
nucléosome
(au milieu des 147 pb)
Quel est le nombre de pts de contact entre l’ADN nucléosomal et l’histone
14
Vrai ou faux?
Selon leurs charges, les queues Nt de certaines histones d’un nucléosome interagiront spécifiquement avec les queues Nt de certaines histones du nucléosome suivant.
Vrai
Qu’est-ce qui est indispensable à la formation de la fibre de 30 nm?
Queues N-terminales
Qu’est-ce qui caractérise la fibre de 30 nm?
- 6 nucléosomes par tour;
- Spirale hélicoïdale de 11 nm de diamètre = diamètre du nucléosome;
- Les surfaces des disques d’octamères se font face;
- L’ADN de liaison est à l’intérieur de la fibre de 30 nm, sans jamais traverser l’axe.
Existe 3 niveaux de compactions:
1. Nucléosomes, facteur de compactage:6
2. Fibre de 30nm, facteur de compactage: 40
3. ?
Boucle radiale, facteur de compactage :1000 à 10 000
Qu’est ce qui participe à la formation de la boucle radiale ?
Topoisomérase II et proteines SMC (font partie de matrice nucléaire)
Pourquoi dit-on que la conformation spatiale des nucléosomes est dynamique?
La conformation spatiale des nucléosomes est dynamique car les interactions entre ADN et histones résultent de liaisons faibles (liaisons hydrogènes), interaction avec sillon mineur et A-T
Qu’est-ce qui permet les changements de structure des nucléosomes?
Ces changements de structure s’opèrent grâce à l’action d’un complexe de remodelage des nucléosomes.
que permettent les changements de structure des nucléosomes?
Ces changements de structure permettent l’accès transitoire de certaines protéines de régulation à l’ADN.
= ACTIVATION/RÉPRESSION des gènes.
Quelles sont les deux actions du complexe de remodelage des nucléosomes?
- Glissement de l’ADN autour de l’octamère.
- Transfert de l’octamère d’une double hélice à une autre.
