Lett me learn this shit pt 2 (cours complet) Flashcards

1
Q

Décrire le test d’Ames.

A

Il permet de détecter les composés mutagènes. On prend une souche qu’on met en présence du composé à tester et on augmente les concentrations. Si y’a plus de colonies avec plus de concentration, mutagène.

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2
Q

C’est quoi l’échange horizontal ?

A

échange génétique entre deux cellules sans lien d’espèce; l’information n’est transmise que à la descendance de la cellule qui a subi le transfert.

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3
Q

C’est quoi l’échange vertical ?

A

C’est quand le transfert de l’information se fait sur toute la descendance et correspond à des changements ponctuels sur l’endogénome.

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4
Q

Expliquer les différences entre les trois mécanismes de transfert horizontal d’adn.

A

Transformation : choper des bouts d’ADN de l’environnement
Transduction : phage encapside l’ADN et transmet le fragment vers une autre bactérie.
Conjugaison : contact entre deux cellules par pili : l’adn passe par ce pont sous forme de plasmide.

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5
Q

Comment a été découvert la transfo ?

A

Des souches R ont été transformées en souches S lors d’un expérience : elles ont chopé un truc des cellules S mortes pour se transformer.

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6
Q

Décrire l’exp avec le thymus de veau.

A

En gros, on a pris une souche sensible à la péniciline et on l’a mis avec des bactéries résistantes à la péni et de l’ADN de thymus de veau (compétiteur). + y’a d’adn de thymus, - y’a de souches résist a la péniciline qui se dev. Par contre, si on le dénature cet ADN de thymus, il y a autant de souches résistantes : seul l’ADN db est intégré dans les génomes !

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7
Q

est-ce que l’ADN intégré remplace ou se rajouter à l’ADN existant ?

A

Il remplace (exp avec caractères dominants)

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8
Q

Quels rôles pour cette transformation ?

A

On pense qu’elle peut jouer un role dans la réparation de l’ADN ou s’adapte mieux à l’environnement en chopant des génomes mosaiqués.

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9
Q

Quel requirement pour la conjugaison ?

A

Les deux cellules doivent avoir un contact entre elles.

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10
Q

Comment a fonctionné l’exp qui a permis de montrer l’existance de la conjugaison ?

A

Simple : mis en place d’un filtre imperméable (pas au milieu) entre les deux bactéries -> 0 recombinants maggle.

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11
Q

Qu’a montré l’expérience de Hayes ?

A

Que le transfert était à sens unique

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12
Q

Qu’appelle-t-on plasmide conjugatif ?

A

Tout plasmide transférable

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13
Q

de quels gènes dépend la formation du couple de conjugaison ?

A

Des gènes tra. Causent synthèse des pilis, qui se rétractent et rapprochent les deux cellules.

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14
Q

de quels gènes dépend le transfert d’ADN lors de la conjugaison ?

A

des gènes mob. une nucléase reconnait spécifiquement une séquence dans le plasmide et fait une coupure là. Puis synth du brin qui se retrouve dans l’autre bact.

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15
Q

Comment est généralement le plasmide F par rapport au génome ? Si c’est pas le cas on a affaire à quoi ?

A

Il est généralement isolé du génome. Parfois, il est intégré dedans et on appelle ça un plasmide Hfr.

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16
Q

Dans le cas d’un plasmide HFr, comment peut se faire encore la conjugaison ?

A

Se fait a partir de l’origine de transfert en plein milieu du plasmide.

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17
Q

Quel pb avec les plasmides HFr ?

A

ben tout le plasmide peut pas être transféré. du coup c’est juste les gènes proches du site d’insertion qui risquent d’être transférés.

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18
Q

Comment savoir si certains gènes sont plus ou moins proches du site d’insertion ?

A

IZI MAGGLE : si beaucfoup de cellules sont devenues de ce gène, alors elles sont situées proche.

19
Q

est-ce que le plasmide F s’intègre toujours au même endroit si il le fait ?

A

Non que dalle, on sait pas ou il s’intègre.

20
Q

Qu’appelle-t-on la mobilisation ‘

A

transfert de réplicons non conjugatifs à l’0aide d’un plasmide non conjugatif appelé plasmide helper.

21
Q

Combien de types de plasmides helpers ?

A

2 : la donation et la conduction (B).

22
Q

Quand peut on dire qu’un ADN est plasmidique ?

A

Il doit être autoréplicatif, avec une origine végétative.

23
Q

Qu’est-ce que deux plasmides “incompatibles” ?

A

C’est deux plasmides qui ne peuvent pas se répliquer dans une même bactérie

24
Q

C’est quoi les éléments transposables ?

A

C’est des séquences sauteuses non réplicatives qui sautent un peu partout dans le génome. Codent pour des enyzmes de transposition. Réarrangent le génome.

25
Q

Quelles catégories d’éléments transposables dans les bactéries à Gram - ?

A

Insertion : avec transposase au milieu et séquences inversement répétées autour. Lorsque transpo : coupure décalée au niveau de la séquence cible, alors dupliquée.
Composés : 2 copies de séquence d’insertions.

26
Q

Que se passe-t-il pour insérer un transposon ?

A

Quand il apparait, la séquence cible est coupée puis ouverte : le transposon s’y insère, puis la séquence cible est dupliquée de l’autre côté.

27
Q

Quel mécanisme de transposition ont les deux première familles, IS et Tn5 ?

A

Coupécollé : séquence cible s’ouvre en décalé, ouverture, et synthèse du second brin.

28
Q

Quel mécanisme de transposition a la dernière famille, Tn3 ?

A

Copié collé (réplicatif). marche avec deux enzymes, tranposase qui insère et résolvase qui sépare les deuxcercles.

29
Q

C’est quoi le cointégrat ?

A

C’est la molécule hybride formée lors d’un mécanisme copier coller.

30
Q

Quel impact des transposons ?

A

Provoque des mutations ! Utilisé pour mutagénèse.

31
Q

A quoi peut servir une mutagénèse de transposon ?

A

On peut lui coller des gènes qui codent des protéines dessus : du coup nous permet de localiser le promoteur de la bactérie, si elle produit les protéines.

32
Q

C’est quo iles intégrons ?

A

C’est un élément génétique qui contient un ou plusieurs gènes de résistance aux antibiotiques
Peut capturer des cassettes grace a l’intégrase.

33
Q

Qu’est-ce que une cassette ?

A

C’est une séquence d’ADN contenant les gènes de résistance aux antibios.

34
Q

Qu’est-ce qu’un ilot génétique ?

A

C’est des régions chromosomiques entourées de séquences répétées

35
Q

C’est quoi des séqu. flipflop ?

A

capables de changer d’orientation dans une bactérie. fait que l’ADN se retourne, marche comme un interrupteur en arrêtant l’exp de certains gènes.

36
Q

donner une méthode d’étude des phages.

A

phage sur lyse : étale tapis bactérien puis vaporise phages dessus, apparition de trous dans le tapis de taille diff.

37
Q

Quelles sont les barrières à la conjugaison ?

A

Concentration faible de bactéries.
Spécificité.
Exclusion de surface
Morphologie du pili.

38
Q

Quelles barrières à la transformation ?

A

Compétence limitée

Nécessité de recombiner (sinon pas de transmission)

39
Q

Quelles barrières à la transduction ?

A

Inhibition d’adsorption
inhibition d’injection d’ADN
infection abortive
pb avec le SI

40
Q

Quelle diff entre recombinaison homologue et illégitime (RecA dep) ?

A

homologue nécessite des séquences homologues entre les deux ADN, tandis que l’illégitime non.

41
Q

Comment marche la recombinaison Rec-A dep ?

A

La protéine Rec fait un déroulement local de la Db, puis coupe un seul brin au niveau de la séquence “chi”. Puis RecA stabilise le sb et forme une D loop à trois brins. puis synth, forme des jonctions, et se délie (WTFFFF SRX)

42
Q

c’est quoi la recombinaison illégitime non rec-a dep ?

A

marchent avec des extrémités transposons et une transposase = transposome.

43
Q

Quels sont les deux types de réparation ?

A

Directe ou par excision / réparation.

44
Q

A quoi servent les protéines Mut ?

A

Role de réparation : reconnaissent mésappariement, se fixent dessus, puis stabilisent. Puis exonucléase coupent le bout qui bugge, et la pol III répare le trou.