Les génomes viraux Flashcards
Comment peut-on caractériser la composition en bases des virus ?
Elle n’est pas conventionelle !Il y a présence de bases modifiées chez certains bactériovirus.
Chez les bactériovirus infectant Bacillus, on distingue 3 groupes selon les bases modifiées. Lesquels?
Groupe 1 : L’‘uracyle remplace la Thymidine.
Groupe 2 : L’hydroxymethyluracyle remplace la thymidine.
Groupe 3 : les bases normales.
Par quoi sont incorporées les bases non conventionnelles et comment s’appelle ce procédé ?
Par la polymérase virale. Le procédé s’appelle la glucosylation post-réplication.
Quel est le rôle de la glucosylation post-réplication ?
Permet de protéger vs les nucléases de l’hôte.
Permet de protéger des nucléases propres au virus.
Permet d’être bien reconnues pour la transcription.
Quel est la fonction du génome virale ?
Pour unique fonction de produire de nouvelles particules virales.
Quelles protéines permettent de diriger la synthèse d’autres protéines ?
Les protéines structurales ainsi que les protéines nécessaires à l’amplification du génome.
Quel type de génome est directement codant ?
Les génomes à ARN messagers, ou virus à ARN+.
Comment se déroule la réplication de l’ARN+ ?
Complexe de réplic reconnait 3’ de l’ARNg.
Réplicase recopie ARNg en ARNc (ARN antigénomique)
ARNc sert de matrice pour nouveaux ARNg.
Nouveaux ARNg -> protéine A.
Que fait la protéine A ?
Elle empêche la phagocytose ?
Qu’est-ce que ORF ?
Open Reading Frame. C’est la partie d’un génome qui peut potentiellement donner une protéine en étant transcrite.
Quelles sont les caracs d’un virus à ARN+ eucaryote ?
Infectent les plantes herbacées, mécaniquement. Génome de 6435 nts, coiffe + polyA.
5 ORFs.
Ou est-ce que le génome est coiffé ? Poly A ?
Coiffé en 5’, polyA en 3’.
Dans les virus à ARN+ eucaryote, il y a 5 ORF. Lesquels ?
5 ORF : ORF1 pour la réplicase, 2-4 pour 3 gènes, et le ORF5 :CP.
quelle est la première protéine exprimée chez les virus eucaryotes ARN+ et a quoi sert elle ?
La polymérase. sert à produire l’ARNc en s’associant à desfacteurs cellulaires.
Une fois produit par la polymérase, l’ARNc sert a quoi ?
A faire des nouveaux ARN viraux, ainsi que de synthétiser des ARN subgénomiques (plus courts que génomiques).
Le virus TMV a une particularité concernant la structure du génome. Quoi ?
N’a pas de séquence polyA en 3’ mais une structure ressemblant aux ARNt : amino-acylable.
Le virus Poliovirus a une particularité concernant la structure du génome. Quoi ?
N’a pas de coiffe 5’ mais une protéine VPg fixée dessus : la traduction est donc coiffe indépendante : structure IRES guide les ribosomes.
Qu’est-ce qu’une structure IRES ?
Ce sont des séquences qui permettent de recruter directement les ribosomes pour commencer la traduction de manière interne.
Pour exprimer l’ensemble de leurs ORFs, les virus peuvent : …
Produire des ARN subgénomiques
Posséder des génomes segmentés
Utiliser des stratégies -> picornavirus.
L’ARN génomique des virus ARN+ sont ils infecteurs ou pas ?
Oui, infectieux !
De quoi est constitué l’ARN génomique des virus à ARN non codant ?
Un ou plusieurs ARN simple brin à polarité négative.
D’un ou plusieurs ARN à double brin.
Est-ce que l’ARN- a une coiffe ? queue ?IRES ? VPg ?
Rien de tout ça, puisque ARN non codant.
Que manque-il aux virus à ARN- pour produire des protéines et comment l’obtient il ?
Il manque de l’ARN messager, qui est transcrit depuis le génome du virus. Le virus fournit alors sa propre enzyme.
Qu’est-ce que RdRp ?
Rna Dependant RNA Polymerase.
dans les virus à polarité négatives, de quoi sont recouverts le génome et l’antigénome ?
de nucléocapside, qui permettent de se protéger contre les mécanismes de défense innée de l’hôte.
C’est quoi l’antigénome ?
C’est le brin complémentaire d’ARN à partir duquel le génome viral est crée.
