Lecture 1 - 3 Flashcards
איזה בסיסים חנקניים יכולי להיות בנוקלאוטידים?
פורינים: 2 טבעות חנקן
GA
פירימידינים: טבעת אחת
TUC
שם של תהליך מעבר מדנ’‘א לרנ’‘א
שיעתוק Transcription
שם של תהליך מעבר מרנ’‘א לחלבון
תרגום Translation
מעבר מדנ’‘א לדנ’‘א
Replication שכפול
ממה מסונתזת מולקולת דנ’‘א החדשה?
מנוקלאוטידים חופשיים הנמצאים בתא
Griffith experiment
Important points and conclusion
- נלקחו חיידיקים עם קפסולה והוזרקו לעכברים. עכברים מתו
- עכברים נדבקו באותו חיידקים אבל ללא קפסולה - עכברים לא מתו
- קפסולה היא גורמת לעכברים למות
- אחרי הרתיחה של חיידקים עם קפסולה - עכברים חיים
- אבל קפסולה אחרי הרתיחה + חיידקים ללא קפסולה - עכברים מתו
מסקנה: קיים גורם כלשהו שעבר בין הזנים
Avery-MacLeod-McCarty experiment
Important points+conclusion
- חיידקים פורקו לחלקיקים של התא
- כל אחד מהחלקים הוכנס לחיידק לא וירולנטי
- חיידקים עם חלקיקים הוכנסו לעכברים
- עכברים מתו
מסקנה: דנ’‘א הוא זה שמעביר את החומר הגנטי
Hershey and Chase
Important points+conclusion
הם רצו לבדוק את הניסוי של מאק לאוד 1. השתמשו בבקטריופאג מסוג T2 2. בדקו מה החומר שפאג' מכניס לחיידק 3. סימנו את הדנ''א עם חומר רדיואקטיבי 4. סימנו חלבונים עם גופרית רדיואקטיבית 5. ערבבו פאגים + חיידקים והמתינו 20 דק 6. לאחר הסרכוז הם ראו שרוב החומר המסומן עם פוספט רדיואקטיבי נמצא, וקצת חומר שמסומן עם גופרית. מסקנה: החומר התורשתי הוא מה שמסומן בפוספט - דנ''א הוא חומר התורשתי
ממה בנוי הנוקלאוטיד?
- בסיס חנקני
- טבעת סוכר
- קבוצת פוספט
מה מאפיין את טבעת סוכר בנוקלאוטיד?
- אלדוז
2. 5 פחמנים
הבדל בין ריבוז לדא-אוקסיריבוז
ריבוז - אל פחמן 2 בטבעת סוכר מחובר OH
דא-אוקסיריבוז - אל פחמן 2 בטבעת סוכר מחובר רק
H
מה מאפיין את טבעת בסיס חנקני?
- מבנה שטוח בגלל הקשרים כפולים
- מסיסות נמוכה במים ב-PH 7
3.
Does DNA is soluble in water or no? If yes. why?
מתמוסס
בזכות קשרי מימן שנמצאים על גבי טבעת הסוכר וקבוצת פוספט
מה טוב בזה שלטבעת חנקתית יש בליעת אור UV
ב-260nm?
מעניק להם יתרון במעקב אחרי חומצות גרעין רנ’‘א או דנ’‘א
סוכר +בסיס חנקתי עם קבוצת פוספט זה
nucleoTIDE
סוכר + בסיס חנקתי
nucleoSIDE
ברוב המקרים נוקלאוטיד שנמצא בתוך פולימר, כמו מולקולה של חומצת גרעין, מכיל כמה קבוצות פוספט
?
ואם הוא מחוץ לפולימר?
קבוצה אחת בתוך הפולימר, ויכולות להיות כמה קבוצות עם הוא לבד
כאשר נוקלאוטידים מתחברים ביניהם כדי לבנות את הגדיל של חומצת גרעין, מה הוא סוג הקשר ביניהם?
Phosphodiester linkage
קשר פוספודיאסטרי
בין איזה פחמנים קיים קשר פוספו-די-אסטרי?
פחמן 3 בנוקלאוטיד הראשון (עליון), לפחמן 5 בשני
נא לענות על השאלות לגבי רנ’‘א:
- סוג סוכר
- הרכב בסיסים
- מספר גדילים
- יציבות
- ריבוז
- AGCU
- לרוב חד גדילי
- פחות יציב
נא לענות על השאלות לגבי דנ’‘א:
- סוג סוכר
- הרכב בסיסים
- מספר גדילים
- יציבות
- דאוקסיריבוז
- AGCT
- לרוב דו-גדילי, אנטי-פרללים, משלימים
- ימיב
שתי סיבות למה רנ’‘א פחות יציב מדנ’‘א
- סיבה כימית - בגלל הפחמן מס’ 2.
2. סיבה ביוכימית - אנזימים של רנ’‘אזות ודנ’‘אזות
מה הם 4 חוקים של צ’ארגף?
- הרכב בסיסי הדנ״א לרוב שונה ממין אחד לשני
- דגימות דנ״א מרקמות שונות של אותו מין בעלות הרכב בסיסים דומה
- הרכב הבסיסים במין מסוים לא משתנה עם הגיל, התזונה, או שינויים סביבתיים
- G=C, A=T, G+A=C+T
כמה הוא מרחק בין כל 2 בסיסים?
0.34nm
סיבוב המלא של אותו הליקס כפול הוא
3.6 nm
or
36 A
מה זה קשרי ווטסון-קריק?
קשרי מימן בין ציטוזין, גואנין, אדנין וטימין
A-T
G-C
כמה קשרי ווטסון קריק ביניהם?
A-T - 2
G-C - 3
מה מחזיק את ההליקס כפול במקומו?
- base pairing (hydr. bonds)
2. Base stacking (קשרי ואן דר ואלס)
איפה ניתן למצוא את
G-quadruplex DNA (G4)?
טלומרים
פרומוטרים
מקור השכפול
למה עוד צריך נוקלאוטידים חוץ מבניית חומצות גרעין?
- נשיאת מולקולות אנרגיה
- העברת מידע
- מעורבות בקביעת צבע עור
איך זיקית משנה צבע עור שלה? (ע’‘י איזה נוקלאוטיד)
תאי עור שלו מכילים ננו-קריסטלי גואנין. שינוי ארגון המרחבי של גואנין גורם למולקולות להיות יותר צפופות - כך בליעה שונה של קרני אור וצבע משתנה
איך מכמתים את דנטורציה או רנטורציה של דנ’‘א?
באמצעות בליעת אור
UV 260 nm
מה זה אפקט היפרכרומי?
ירידת בבליעת האור
מתרחש במהלך דנטורציה
מה זה אפקט היפרכרומי?
עליה בבליעת האור
מתרחש במהלך רנטורציה
בעזרת איזה שיטה ניתן לזהות רצף של דנ’‘א מתוך תערובת של רצפים?
תספוג הדנ’‘א
eng.name is SOUTHERN BLOT
מה זה מודיפיקציה של בסיסים של מולקולת דנ’‘א?
כאשר הבסיסים מוסיפים לעצמם קבוצות כימיות נוספות
סוג המתילציה בבע’‘ח ובצמחים הוא…
לאן מצטרף מתיל ומה יתרון של זה
מולקולה מטיל-ציטוזין הופכת למולקולה מטיל-ציטידין
עוזרת בבקרת השיעתוק
סוג המתילציה בחיידקים הוא…
לאן מצטרף מתיל ומה יתרון של זה
מולקולה אדנוזין הופכת למולקולה מטיל-אדנוזין
בפרוקריוטים - עוזרת בבקרה על הכפלת דנ’‘א, מעכרת הגנה מפני הוירוסים
Nucleoid
מה זה?
איזור בתא פרוקריוטי, במקום גרעין
מה מכיל וא לא מכיל נוקלאואיד? nucleoid
כרומוזום ומידע תורשתי שלו
מוקף בריבוזומים