Le transport vésiculaire et transport/entrée des protéines Flashcards
Véscules tapissées COPII, vésicules tapissées COPI, vésicules tapissées de clathrine, tri/transport des protéines dans RTG, entrée des protéines dans mitochondrie
Quelles sont les 3 sortes de vésicules et leurs fonctions principales?
- Vésicules tapissées COPII : transport de matériaux par voie centrifuge de RE vers CIREG (compartiment médian entre RE et Golgi) vers Golgi
- Vésicules tapissées COPI : transport de matériaux par voie centripède du Golgi au CIREG au RE ou des citernes trans golgiennes aux citernes cis golgiennes
- vésicules tapissées de clathrine : transport des LDL (contiennent cholestérol) dans la cellule
Quelles sont les fonctions de COPII?
Transport de protéines et d’enzymes du RE qui possèdent des signaux d’exportation sur leur queue cytosolique
Enzymes qui activent des stades ultérieurs de la voie biosynthétique (aka dans CIREG ou Golgi)
Donner les étapes d’assemblage de COPII
- -Protéine Sar1 liée au GDP reccruté par la protéine membranaire GEF.
(GDP = coenzyme de transfert et donneur de phosphate)
- GEF catalyse échange GDP en GTP
2.
- Sar1-GTP provoque courbure de la membrane (hélice)
3.
- Sar1-GTP recrute Sec23 et Sec24 (polypeptides) qui forme hétérodimère Sec23-Sec24.
- Accentue la courbure de la membrane
- Récepteurs de cargaison s,accumulent das COPII en formation par queues cytisoliques avec Sec24
- Recrutement de Sec13 et Sec 31 pour former structure du revêtement
- Bourgeon séparé de la membrane du RE
- Revêtement protéique dégradé (par hydrolyse du GTP qui libère sous-unité Sar1-GDP) dans cytosol pour fusion
Quelles est la structure de COPII?
- Cage externe formée de Sec13-Sec31
- La couche interne du manteau COPII se compose de complexe Sar1-Sec23-Sec24
- 4 des bras converge pour former le sommet de chaque maille
Quelles sont les fonctions de COPI?
- Déplacement centripète des protéines
(ex. enzymes localisées dans golgi trans vers cis)
(ex. enzymes revenant du Golgi au CIREG au RE - Retour des protéines non-autorisés dans vésicules de transport ou celles qui ont étés internalisés par accident
(Étapes de récupération : - Les protéines portent une séquence signal KDEL et sont reconnues par des récepteurs de KDEL logés dans la paroi membranaire des compartiments du cis golgi. Formation d’une vésicule contenant récepteurs-KDEL par une vésicule de recyclage COPI et transport au RE)
Protéines :
Étapes du tri et transport des protéines dans RTG (réseau trans Golgien)
- Résidus mannose de l’enzyme lysosomale sont phosphorylés dans les citernes du Golgi
- -Incorporation vésicule de clathrine dans RTG
(clathrine se lie adapteur GGA, GGA se lient à RMP (récepteur mannose-6-phosphate) et enzymes lysosomales de la lumière s’unissent)
- union RMP et enzymes lysosomales se concentrent dans vésicule de clathrine, ARF1-GTP à l’extérieur de la membrane du RTG - Les RMP interargissent avec les enzymes lysosomales et les les adapteurs sur la face cytosolique de la vésicule
4.
Les RMP se séparent des enzymes
- Les récepteurs retournent au complexe de Golgi
6.
Les enzymes lysosomales sont apportés aux endosomes et ensuite à un lysosome
(les enzymes sont à l’extérieur à cette étape)
7.
Les RMP qui sont sur la membrane plasmique capturent les enzymes lysosomales qui sont sécrétées dans l’espace extracellulaire et renvoient les enzymes par un chemin qui les dirige vers un lysosomes
Protéines:
Guidage des vésicules vers un compartiment particulier
Partie 1. Mouvement de la vésicule vers le compartiment cible spécifique
(microtubules)
Les mouvement sont guidés par les microtubules associées à leur protéine motrice
La paroi du microtubule est composée de protéine globulaire disposées en rangées longitudinales. On parle de protofilaments alignés parallèlement au grand axe du tubule
Déplacement de la vésicule par microtubules à l’aide de protéines motrices comme Kinésine
Protéines:
Guidage des vésicules vers un compartiment particulier
Partie 2. Accrochage des vésicules au compartiment cible
(protéines d’ancrage et protéines Rab)
1.
- Contact entre 2 membrane par protéines d’accrochage :
a) protéines fibres (forme ponts ente 2 membranes)
b) complexe multi-protéique
2.
Protéines Rab sur la vésicule recrutent les protéines d’ancrage
(protéine Rab sont des protéines G qui passent actif/GTP et inactif/GDP
Protéines:
Guidage des vésicules vers un compartiment particulier
Partie 3. Arrimage des vésicules au compartiment cible
(Protéine SNARES)
Les V-SNARE de la membrane des vésicules interagissent avec les T-SNARE de la membrane cible et permet contact intime entre les deux membranes.
Protéine membranaire intrinsèque
SNARE motifs capable de former un complexe avec un autre SNARE motif
2 catégories:
- V-Snare : S’incorporent aux membranes des vésicules de transport pendant le bourgeonnement
- T-SNARE : Localisées dans les membranes des compartiments cibles.
Protéines:
Guidage des vésicules vers un compartiment particulier
Partie 4. Fusion entre la vésicule et les membranes cibles
- Arrimage de la vésicule sur la membrane
- Stade de transition pendant la fusion des membranes
- Les helices membranaire qui se trouvaient dans les deux membranes séparées sont maintenant dans la même bicouche et un pore de fusion s’est ouvert entre la vésicule et la membrane cible
- Les vésicule déchargent leur contenue après avoir reçu un signal d’activation sous la forme d’une augmentation de la concentration en Ca+
Protéines :
Entrée des protéines dans mitochondries
pré-séquence signal, chaperonnes, complexe TOM pour passer à travers MME, complexe TIM pour passer à travers MMI vers la matrice (TIM23) ou aller dans MMI (TIM22) des mitochondries
4 sous-compartiments : MME (membrane mitochondriale externe), MMI (membrane mitochondriale interne), espace intermembranaire et matrice
Des séquences signal vont guider la protéine vers la mitochondrie (séquence spécifique)
- Protéines doivent posséder pré-séquence localisée sur l’extrémité N de la molécule
- Chaperonnes vont déplier le protéine (ne passe pas dans complexe TOM si pliées)Complexe TOM : récepteur + translocon incomplet (canal tapissé de protéines qui facilite le passage), localisé sur MMEComplexe TIM : même rôle, mais pas de récepteur pour la pré-séquence, localisé sur MMI
- TIM22 : complexe d’import pour protéines intrinsèques de MMI
- TIM23 : complexe d’import pour protéines de la matrice
(pour l’entrée dans la matrice certaines chaperonnes et enzymes* vont faciliter le passage et rendre à la molécule sa conformité native)
*La peptidase (enzyme) va venir cliver la pré-séquence des protéines qui entrent dans la matrice par TIM23
Protéines :
Entrée des protéines dans mitochondries
Des séquences signal vont guider la protéine vers la mitochondrie, pré-séquence signal sur la protéine, chaperonnes, complexe TOM ( récepteur + translocon incomplet AKA canal tapissé de protéines qui facilite le passage) pour passer à travers MME, complexe TIM (translocon incomplet) pour passage des enzymes et chaperonnes à travers MMI vers la matrice (TIM23) ou aller dans MMI (TIM22) des mitochondries
4 sous-compartiments : MME (membrane mitochondriale externe), MMI (membrane mitochondriale interne), espace intermembranaire et matrice
- TIM22 : complexe d'import pour protéines intrinsèques de MMI - TIM23 : complexe d'import pour protéines de la matrice (pour l'entrée dans la matrice certaines chaperonnes et enzymes* vont faciliter le passage et rendre à la molécule sa conformité native)
*La peptidase (enzyme) va venir cliver la pré-séquence des protéines qui entrent dans la matrice par TIM23
Protéines :
Entrée des protéines dans le noyau
Protéine avec signal (SLN) s’unit au récepteur (Importine a et b) et forme un complexe + association filament cytoplasmique, le complexe passe par un PORE NUCLÉAIRE (CPN), arrivée dans nucléoplaste et dissociation du complexe suite à interaction avec Ran-GTP, sous-unité importine b est ramenée au cytoplasme avec Ran-GTP (les 2 sont associés), hydrolisation de Ran-GTP en Ran-GDP, Ran-GDP revient au noyau et redevient du Ran-GTP et importine a ramenée au cytoplasme
**Conservation de la séquence signal parce que possibilité de sortir du noyau
Protéines :
Entrée des protéines dans peroxysome
2 sections : membrane et espace extracellulaire
Protéines destinées au PTS ou mPTS
action récepteur PTS = formation d’un translocon complet (canal tapissé de protéines qui facilite passage) permettant passage des protéines sous forme native (pliées)
