Le génome Flashcards
Taille du génome humain
3,2 milliard de paires de bases (pb)
P.S. ≈ 20 000 gènes codants pour des protéines (1.5% du génome)
Nucléosome
Segment de 147 paires de bases d’ADN enroulé autour d’un octamère d’histones.
Formes de la chromatine selon son activité transcriptionnelle
- Inactive = hétérochromatine
- Active = euchromatine
3 mécanismes principaux d’altération des histones affectant l’activité transcriptionnelle
- Méthylation : activation ou répression d’expression selon le résidu méthylé
- Acétylation : Activation
- Phosphorylation : activation ou répression d’expression selon le résidu
4 fonctions principales de régulation génétique des long ARN non-codants.
- Facilitation de liaison de facteurs de transcription
- Inactivation de facteurs de transcription par liaison directe
- Promotion de modification des histones via acétylases ou méthylases
- Stabilisation de structures secondaires ou tertiaires (ex. : architecture de chromatine)
Expliquer ADN codant vs ADN non codant
- ADN codant (1.5%) : code pour les protéines (≈ 20 000)
- ADN non codant (98.5%): ne code pas pour des protéines ; > 85% transcrit ; ≈80% dédié à la régulation de l’expression des gènes
5 grandes classes de séquences non codantes fonctionnelles
du génome
- Promoteurs et amplificateurs
sites de liaisons de facteurs de transcription - Sites de liaison de facteurs d’organisation et de maintien de la structure de la chromatine
- ARN régulateurs non codants :
-microARN (miRNAs)
-Longs ARn non codants (lncRNAs) - Éléments génétiques mobiles (transposons)
- Régions structurelles spécialisées
-Télomères
-Centromeres et ADN satellite
Vrai ou faux :
Plusieurs variations génétiques associées aux maladies sont localisées dans les régions non codantes du génome
Vrai
(maladies complexes)
Vrai ou faux :
La variation inter-individuelle, incluant la différence de susceptibilité aux maladies et à l’environnement, est codée par moins de 0,5% du génome
Vrai
(≈ 15 millions de paires de bases)
2 formes les plus fréquentes de variation génétique dans le génome humain
- Single nucleotide polymorphisms
(SNPs) : variations nucléotidiques - Copy number variations (CNVs) : variation du nombre de copies d’un segment de l’ADN
SNP
(single nucleotide polymorphism)
- Variation d’un nucléotide
- Presque toujours bi-allelique
- Localisation : exons, introns,
régions intergeniques
-1% dans les régions codantes
-Régions non-codantes : susceptibilité aux maladies (effet faible)
Déséquilibre de liaison (linkage disequilibrium)
Association non aléatoire entre allèles de différents locus dans une population.
* Par exemple : un SNP “neutre” peut être un marqueur s’il est co-hérité avec un SNP de susceptibitité à une maladie à cause de leur proximité physique.
CNVs
(copy number variations)
- Variation génétique structurelle qui consiste en de grandes étendues d’ADN contigu répétées dans le génome
- Le nombre de copies dans le génome varie selon les individus
- Dû à une duplication ou suppression
- Affecte un grand nombre de paires de bases (1000 à des millions)
Intérêt des CNVs
- Responsables de différences de séquences entre 2 individus (entre 5 à 24 millions de paires de bases)
–> Médecine légale
–> Diversité phénotypique - ≈ 50% des CNVs impliquent des séquences de gènes codants
Vrai ou faux :
Les altérations de la séquence d’ADN
ne peuvent expliquer à eux seuls la diversité des phénotypes dans les populations humaines
Vrai
(Épigénétique)
Différences phénotypiques entre jumeaux monozygotes