L’organisation Et La Lecture Du Génome Flashcards
De quoi est formé le génome?
Des gènes et des chromosomes
Donnez la définition d’un gène
Région de l’ADN qui contrôle une caractéristique héréditaire particulière d’un organisme, spécifiant la synthèse d’un ARNm ou d’un ARN fonctionnel
Quel pourcentage du génome est transcript?
80%
Quel pourcentage du génome transcrit sert à produire les protéines?
2%
Quels sont les rôles des gènes?
Les gènes sont toujours à la recherche d’un équilibre. Ainsi, leur rôles sont :
1- Différenciation/spécialisation cellulaire
2- Réponse cellulaire
3- Division cellulaire
4- Mort cellulaire
Qu’est-ce que la transcription sélective des gènes?
Différents types de cellules contiennent le même génome mais l’utilise de façon différente
Comment peut-ont expliquer le fait que les différents types de cellules ont le même génome mais acquièrent des différences?
Car il ne synthétisent pas les mêmes ARNm et les mêmes protéines
Quelles sont les 3 étapes de la transcription et de la traduction?
1-Initiation
2-Élongation
3-Terminaison
Qu’est-ce que la transcription?
Processus par lequel les ARN polymérases synthétisent un brin d’ARN à partir de la lecture du code génétique retrouvé dans un gène
Qu’est-ce que le brin codant?
Le brin codant désigne celui des deux brins d’un ADN double brin qui est utilisé en complément de celui pour la transcription. Représente la séquence codante pour des protéines. Sa séquence est identique à l’ARNm sauf que T remplace U dans le brin codant.
Qu’est-ce que le brin non codant?
Brin transcrit, brin lu ou brin matrice.
Qu’est-ce qui forme la matrice lu?
Gènes (l’ADN)
Quelles-sont les deux conditions pour l’initiation de la transcription?
1- Positionner les ARN polymérases aux bons endroits
2- L’ADN doit être décondensé
Quel est le rôle de l’ARN polymérase II?
Transcrire pour la majorité des gènes qui codent pour les protéines
Quel est le rôle de l’ARN polymérase I?
Transcrire des gènes qui encodent pour les ARNr
Quel est le rôle de l’ARN polymérase III?
Il transcrivent les gènes qui codent pour les ARNt
Quel est le rôle des facteurs de transcription?
Ils sont des recruteurs d’autres protéines sur le promoteur (co-facteur)
Les facteurs de transcription possèdent 2 domaines caractéristiques. Lesquels ?
Un site de liaison direct à une séquence spécifique d’ADN et un domaine d’activation ou de répression qui permet au facteurs de transcription d’interagir avec des co-facteurs pour contrôler (do-activateurs ou co-répresseurs) l’activation de la machinerie transcriptionnelle.
Définir le promoteur et de quoi est-il composé?
Il s’agit de la région du gènes où se fixe la machinerie transcriptionelle. Il est composé de l’ARN polymérase II et des facteurs généraux de transcription
Quelles séquences précises sont reconnues par les facteurs de transcription?
Les séquences régulatrices
Quels sont les 3 groupes de facteurs de transcription?
1- Facteurs de transcription généraux
2- Facteurs de transcription constitutifs
3- Facteurs de transcription inductibles
Quel groupe de facteurs de transcription forment, avec l’ARN pol II, un complexe entourant le point de départ de la transcription et déterminent ainsi le site d’initiation de la transcription?
Les facteurs de transcription généraux
Comment est appelé le complexe formé par l’ARN pol II et les facteurs de transcription généraux?
Le complexe basal de transcription ou le complexe de pré initiation
Quel est le rôle de TFIID?
Reconnaître la boîte TATA et permet à l’ARN pol II de lier le promoteur
Quel type de facteurs de transcription lient l’ADN en amont du site de démarrage de la transcription en permettant la stabilisation de la liaison de la machinerie de transcription de base à l’ADN par leur association à des co-facteurs?
Facteurs de transcription constitutifs
L’activateur transcriptionnel SP1 se fixe ou?
Sur les motifs riches en GC
Quel activateur transcriptionnel se fixe à la séquence CAAT?
CTF
Quel type de facteur de transcription vont reconnaître une séquence spécifique sur les séquences proximales et discales, permettre le recrutement de co-facteurs HAT/HDAC et est lié au complexe médiateur?
Facteurs de transcription inductibles
Comment les facteurs de transcription inductibles sont activés?
Ils sont activés par la présence de messagers chimiques qui se lient à des récepteurs membranaires ou nucléaires
Dans quelles sections de la région promotrice retrouve-t-on chaque classe de facteurs de transcription?
1- Les facteurs de transcription généraux (ex: TFIID) reconnaissent le promoteur minimal
2- Les facteurs de transcription constitutifs (ex: SP1) reconnaissent la séquences régulatrices proximales
3- Les facteurs de transcription inductibles reconnaissent des séquences régulatrices présentes dans les parties proximales et distales
Quel est le rôle du promoteur minimal dans l’initiation de la transcription?
Recrutement de l’ARN pol II et formation du complexe de pré-initiation grâce aux facteurs de transcriptions généraux
TFIID reconnaît quelle séquence?
La séquence TATA
Qu’est ce qui permet à TAFII250 de décondenser la chromatine afin de stabiliser la complexe de pré-initiation ?
Son domaine Histone Acetyl Tranferase (HAT)
Quelles sont les deux choses qui permettent de modifier l’aspect de l’histone de l’ADN?
1-HAT va décondenser
2-SWI/SNF va remodeler
Quels sont les 4 différents co-activateurs ayant une activité HAT?
P300, CBP, PCAF, TAFII250
Quelles sont les deux sous-unités de TFIID?
TBP et TAFII250
Quel est le nom du complexe permettant l’interaction des facteurs de transcriptions inductibles avec la machinerie transcription elle de base?
Le complexe médiateur
Quelles sont les 4 grandes familles de facteurs de transcription?
1- Doigt de zinc
2- Hélice-coude-hélice
3- Agrafe de leucines
4- Hélice-boucle-hélice
Qu’est-ce qui est à la base de la différenciation et spécialisation cellulaire (2choses)
L’activation des facteurs de transcription et les évènements épigénétique
Quel est le codon d’initiation de la traduction?
ATG
Quelle est la séquence de reconnaissance pour la coupure du transcrit primaire ?
AATAAA
Où se fait la maturation de l’ARNm dans la cellule?
Dans le noyau
Lors de la maturation de l’ARNm, un élément est ajouté. Quel est cet élément et quel est son rôle?
Addition de la coiffe 7 methyl guanosine en 5’ qui a pour rôle le recrutement aux ribosomes et circularisation (augmente la stabilité des ARNm)
Quelles sont les deux enzymes permettant la création de la queu de poly A et quels sont leur rôle?
CstF: induit une cassure dans le brin d’ARN
CPSF: Permet le recrutement de l’enzyme poly-A polymérase (PAP)
À quoi correspond l’épissage de l’ARN primaire?
Étape à laquelle les séquences d’intrinsèques sont retirées du transcrit primaire d’ARN
Quel est le nom du complexe d’épissage?
Le Splicéosome
Quelles sont les étapes de réactions d’épissage?
Étape 1- Liaison 2’-5’ phosphodiester : attaque nucléophile du phosphate par le groupement hydroxyle du dite de branchement
Étape 2 - Clivage de l’intron et formation d’un lasso, liaison 3’-5’ phosphodiester : attaque nucléophile du phosphate par le groupement hydroxyle de l’exon
Étape 3 - L’intron excisé sous la forme d’un lasso sera dégradé dans le noyau
Pourquoi y a-t-il autant de régions non codantes dans l’ADN?
LA présence de nombreux introns permet de facilement combiner les exon de différents gènes par recombinaison génétique, favorisant ainsi l’évolution de gènes codants pour de nouvelles protéines grâce à la combinaison de gènes préexistants. Aussi, cela contribue à la production d’une série correspondante de protéines différentes à partir des mêmes gènes.
Quelle est l’étape limitante de la traduction?
L’initiation
Quelles sont les deux sous-unités qui forment le ribosome? Quelle est l’unité du ribosome?
La grosse unité 60S et la petite unité 40S forment l’unité 80S
De quoi est constitué la grosse sous unité ribosomique?
D’ARNr 28S, 5S et de 49 protéines
De quoi est composé la petite sous unité ribosomique?
ARNr 18S et de 33 protéines
Quel sont les 3 sites de liaisons pour l’ARNt dans le ribosomes?
Site A : arrivé de l’ARNt
Site P : chaînes peptidique en croissance
Site E : Sortie de l’ARNt (exit)
À quoi servent les deux sillons dans le ribosomes?
1 sillon permet le passage de l’ARNm et l’autre sillon permet la croissance de la chaîne peptidique en synthèse
Quels sont les 3 codons STOP?
UAA, UAG, UGA
