Krebso ciklas Flashcards
suminė piruvato oksidacinio dekarboksilinimo lygtis (piruvato ir acetil KoA struktūrinės formulės)
Piruvatas + KoA-SH + (NAD–>NADH)+ veikiami piruvato dehidrogenazės komplekso virsta į acetil-KoA + CO2
piruvato dehidrogenazės komplekas (fermentai ir kofermentai)
fermentai:
1 piruvato dekarboksilazė
2 dihidrolipoiltransacelitazė
3 dihidrolipoildehidrogenazė
kofermentai:
1 tiamino difosfatas (TDP, B1)
2 lipo rūgštis
3 KoA (pantoteno r. B5)
4 FAD (riboflavinas B2)
5 NAD+ (niacinas B3)
Kur ląstelėje vyksta piruvato oksidacinis dekarboksilinimas?
Mitochondrijų matrikse
Kokiomis sąlygomis (aero/anaero) vyksta piruvato oksidacinis dekarboksilinimas? Kodėl?
aerobinėmis sąlygomis, tam, kad piruvatas būtų oksiduojamas
Kaip dar vadinamas Krebso ciklas?
trikarboksirūgščių ciklas, citrinų rūgšties ciklas (?)
Koks junginys oksiduojamas Krebso cikle?
acetil KoA
Krebso ciklo lokalizacija
mitochondrijų matriksas
Krebso ciklo 1 reakcija, fermentai, kofermentai
kondensacijos reakcija
Oksaloacetatas + Acetil KoA –>citratas
fermentas: citrato sintazė
Krebso ciklo 2 reakcija, fermentai, kofermentai
Citratas –>izocitratas
fermentas: akonitazė
krebso ciklo 3 rekacija, fermentai, kofermentai
Izocitratas –> 2-oksoglutaratas
fermentas: izocitrao dehidrogenazė (aktyvuojamas Ca ir ADP)
kofermentas: NAD+ –>NADH
krebso ciklo 4 reakcija, fermentai, kofermentai
2-oksoglutaratas –>sukcinil-KoA
fermentas: oksoglutarato dehidrogenazė (slopinamas sukcinil-KoA, NADH)
kofermentai: NAD+->NADH
krebso ciklo 5 reakcija, fermentai, kofermentai
sukcinil-KoA –> sukcinatas
fermentas: sukcinil-KoA sintetazė
kofermentas: GDP + Pi –> GTP
Krebso ciklo 6 reakcija, fermentai, kofermentai
sukcinatas –>fumaratas
fermentas: sukcinato dehidrogenazė
kofermentas: FAD–>FADH2
Krebso ciklo 7 reakcija, fermentai, kofermentai
Fumaratas –> Malatas
Fermentas: fumarazė
fermentas labai stereospecifiškas, hidratuoja fumaratą, bet ne jo cis izomerą maleatą
Krebso ciklo 8 rekacija, fermentas, kofermentas
L-Malatas –> oksaloacetatas
fermentas: malato dehidrogenazė
kofermentas: NAD–>NADH
Kokiomis sąlygomis vyksta Krebso ciklo reakcijos (aero/anaero) ir kodėl?
Aerobinėmis, nes deguonis būtinas oksidacijos-redukcijos reakcijoms, kad būtų redukuojamas NAD ir vyktų ATP sintezė
Krebso ciklo reikšmė kaip energiją teikiantis procesas (kiek kokių redukuotų kofermentų ir ATP)
Sintetinami NADH ir FADH2
3NADH (9ATP), 1FADH2 (2ATP), 1GTP (1ATP)
Krebso ciklo reikšmė kaip kitų junginių biosintezės procesas
Tarpiniai junginiai audojami gliukozės pakeičiamų aminorūgščių, riebalų rūgščių sintezėje
Krebso ciklo reikšmė kaip apjungiantis ir reguliuojantis junginių metabolizmą procesas
Krebso ciklas apjungia aminorūgščių, riebalų rūgščių ir angliavandenių katabolizmą
Mitochondrijų kvėpavimo grandinės funkcija
ATP sintezė oksidacinio fosforilinimo būdu iš redukuotų kofermentų
Mitochondrijų kvėpavimo grandinės substratai, jų kilmė (kokie fermentai dalyvauja sudaryme)
Redukuoti kofermentai: NADH + H, FADH2 iš krebso ciklo ir piruvato oksidacinio dekarboksilinimo
Kvėpavimo grandinės lokalizacija ląstelėje
Vidinė mitochondrijų membrana
Kvėpavimo grandinę sudarantys kompleksai, judrieji nešikliai (kiekvieno komplekso fermentai, kofermentai)
I – NADH dehidrogenazė
kofermentas – NADH->NAD
II – sukcinato dehidrogenazė
kofermentas – FADH2
III – citochromai bc1
kofermentas –NADH
IV – citochromo oksidazė
kofermentas – NADH
redukuoja deguonį, susidaro H2O
judrūs elektronų nešikliai: kofermentas Q ir citochromas C
Elektronų pernašoje dalyvaujančių kompleksų eiliškumas (nuo redukuotų fermentų iki H2O)
I komplekse oksiduojant NADH, protonai išnešami į tarpmembraninę erdvę, elektronai ir protonao panaudojami redukuoti kofermentą Q.
II komplekse FAD prostetinė grupė perneša protonus nuo FADH2-> 3Fe-S centrai –> CoQ
III kompleksas turi kelis citochromus, kurie perneša elektronus nuo KoQ į citochromą C. Čia protonai irgi pernešami į tarpmembraninį tarpą.
IV
