Krebso ciklas

Question 1

suminė piruvato oksidacinio dekarboksilinimo lygtis (piruvato ir acetil KoA struktūrinės formulės)

Answer 1

Piruvatas + KoA-SH + (NAD–>NADH)+ veikiami piruvato dehidrogenazės komplekso virsta į acetil-KoA + CO2

Question 2

piruvato dehidrogenazės komplekas (fermentai ir kofermentai)

Answer 2

fermentai:
1 piruvato dekarboksilazė
2 dihidrolipoiltransacelitazė
3 dihidrolipoildehidrogenazė

kofermentai:
1 tiamino difosfatas (TDP, B1)
2 lipo rūgštis
3 KoA (pantoteno r. B5)
4 FAD (riboflavinas B2)
5 NAD+ (niacinas B3)

Question 3

Kur ląstelėje vyksta piruvato oksidacinis dekarboksilinimas?

Answer 3

Mitochondrijų matrikse

Question 4

Kokiomis sąlygomis (aero/anaero) vyksta piruvato oksidacinis dekarboksilinimas? Kodėl?

Answer 4

aerobinėmis sąlygomis, tam, kad piruvatas būtų oksiduojamas

Question 5

Kaip dar vadinamas Krebso ciklas?

Answer 5

trikarboksirūgščių ciklas, citrinų rūgšties ciklas (?)

Question 6

Koks junginys oksiduojamas Krebso cikle?

Answer 6

acetil KoA

Question 7

Krebso ciklo lokalizacija

Answer 7

mitochondrijų matriksas

Question 8

Krebso ciklo 1 reakcija, fermentai, kofermentai

Answer 8

kondensacijos reakcija
Oksaloacetatas + Acetil KoA –>citratas

fermentas: citrato sintazė

Question 9

Krebso ciklo 2 reakcija, fermentai, kofermentai

Answer 9

Citratas –>izocitratas

fermentas: akonitazė

Question 10

krebso ciklo 3 rekacija, fermentai, kofermentai

Answer 10

Izocitratas –> 2-oksoglutaratas

fermentas: izocitrao dehidrogenazė (aktyvuojamas Ca ir ADP)

kofermentas: NAD+ –>NADH

Question 11

krebso ciklo 4 reakcija, fermentai, kofermentai

Answer 11

2-oksoglutaratas –>sukcinil-KoA

fermentas: oksoglutarato dehidrogenazė (slopinamas sukcinil-KoA, NADH)

kofermentai: NAD+->NADH

Question 12

krebso ciklo 5 reakcija, fermentai, kofermentai

Answer 12

sukcinil-KoA –> sukcinatas

fermentas: sukcinil-KoA sintetazė

kofermentas: GDP + Pi –> GTP

Question 13

Krebso ciklo 6 reakcija, fermentai, kofermentai

Answer 13

sukcinatas –>fumaratas

fermentas: sukcinato dehidrogenazė

kofermentas: FAD–>FADH2

Question 14

Krebso ciklo 7 reakcija, fermentai, kofermentai

Answer 14

Fumaratas –> Malatas

Fermentas: fumarazė

fermentas labai stereospecifiškas, hidratuoja fumaratą, bet ne jo cis izomerą maleatą

Question 15

Krebso ciklo 8 rekacija, fermentas, kofermentas

Answer 15

L-Malatas –> oksaloacetatas

fermentas: malato dehidrogenazė

kofermentas: NAD–>NADH

Question 16

Kokiomis sąlygomis vyksta Krebso ciklo reakcijos (aero/anaero) ir kodėl?

Answer 16

Aerobinėmis, nes deguonis būtinas oksidacijos-redukcijos reakcijoms, kad būtų redukuojamas NAD ir vyktų ATP sintezė

Question 17

Krebso ciklo reikšmė kaip energiją teikiantis procesas (kiek kokių redukuotų kofermentų ir ATP)

Answer 17

Sintetinami NADH ir FADH2

3NADH (9ATP), 1FADH2 (2ATP), 1GTP (1ATP)

Question 18

Krebso ciklo reikšmė kaip kitų junginių biosintezės procesas

Answer 18

Tarpiniai junginiai audojami gliukozės pakeičiamų aminorūgščių, riebalų rūgščių sintezėje

Question 19

Krebso ciklo reikšmė kaip apjungiantis ir reguliuojantis junginių metabolizmą procesas

Answer 19

Krebso ciklas apjungia aminorūgščių, riebalų rūgščių ir angliavandenių katabolizmą

Question 20

Mitochondrijų kvėpavimo grandinės funkcija

Answer 20

ATP sintezė oksidacinio fosforilinimo būdu iš redukuotų kofermentų

Question 21

Mitochondrijų kvėpavimo grandinės substratai, jų kilmė (kokie fermentai dalyvauja sudaryme)

Answer 21

Redukuoti kofermentai: NADH + H, FADH2 iš krebso ciklo ir piruvato oksidacinio dekarboksilinimo

Question 22

Kvėpavimo grandinės lokalizacija ląstelėje

Answer 22

Vidinė mitochondrijų membrana

Question 23

Kvėpavimo grandinę sudarantys kompleksai, judrieji nešikliai (kiekvieno komplekso fermentai, kofermentai)

Answer 23

I – NADH dehidrogenazė
kofermentas – NADH->NAD

II – sukcinato dehidrogenazė
kofermentas – FADH2

III – citochromai bc1
kofermentas –NADH

IV – citochromo oksidazė
kofermentas – NADH
redukuoja deguonį, susidaro H2O

judrūs elektronų nešikliai: kofermentas Q ir citochromas C

Question 24

Elektronų pernašoje dalyvaujančių kompleksų eiliškumas (nuo redukuotų fermentų iki H2O)

Answer 24

I komplekse oksiduojant NADH, protonai išnešami į tarpmembraninę erdvę, elektronai ir protonao panaudojami redukuoti kofermentą Q.

II komplekse FAD prostetinė grupė perneša protonus nuo FADH2-> 3Fe-S centrai –> CoQ

III kompleksas turi kelis citochromus, kurie perneša elektronus nuo KoQ į citochromą C. Čia protonai irgi pernešami į tarpmembraninį tarpą.

IV

Question 25

Elektronų pernašos principas

Question 26

Kompleksai, veikiantys kaip protonų siurbliai

Answer 26

1, 3, 4 kompleksai

Question 27

Kaip sukuriamas elektrocheminis protonų gradientas?

Answer 27

Pernešant H (gaunami oksidavus kofermentus) į tarpmembraninę erdvę, kur jie kaupiasi, kadangi membrana yra nepralaidi

Question 28

Elektrocheminį protonų gradientą sudarančios dalys

Question 29

Kokia elektrocheminio gradiento funkcija?

Question 30

Kokiomis sąlygomis (aero/anaer) kvėpavimo grandinė aktyvi? Kodėl?

Question 31

Kvėpavimo grandinės slopiklių veikimo principas, veikimo pasekmės, pavyzdžiai

Question 32

Kokie procesai vyksta kvėpavimo grandinėje kai oksiduojami substratai? Kokie kompleksai, kokie substratai oksid., lokalizacija?

Question 33

Kokia forma išlaisvinama energija?

Question 34

Kaip išlaisvinta energija naudojama ADP fosforilinimui? (katalizuojantis fermentas, lokalizacija, pgr strukt. dalys ir veikimo mechanoizmas)

Question 35

Nuo kokių veiksnių priklauso oksidacinio fosforilinimo greitis?