Kontrol af prokaryot geneekspression Flashcards
Hvad gør negativ kontrol?
- Hindre transcription
- Regulation via repressor
Hvad er enzym repression?
Hvis et enzym producerer et bestemt stof, og dette stof er i overskud, så vil enzymet ikke blive dannet.
Dette er en specifik effekt for et specifikt enzym
Gælder mest for anabolske enzymer
Hvad er enzym induction?
Det modsatte af enzym regression.
Her laves enzymet kun, når substratet er til stede
Gælder mest for kataboliske enzymer
Her dannes enzymerne, kun når der er brug for dem
Hvad er forskellen på inducer og corepressor?
En inducer sætter enzymproduktionen i gang, mens en corepressor hæmmer enzymproduktionen
(De kaldes til sammen effectors)
Hvordan kan et repressor protein være allosterisk reguleret af et enzym?
Et repressor protein (rp) kan aggerer som en inducer eller en corepressor
Corepressor: Når dannes for meget stof, vil correpressor binde til rp, som binder til DNA, så RNA polymerase ikke kan binde til RNA og dermed forsætte transkriptionen
Inducer: Når induceren binder til rp, vil den fjerne sig fra DNA, og dermed vil RNA polymerase kunne kører videre
Hvad er positiv kontrol?
Her aktiveres transkriptionen
Det regulative protein er en aktivator
Hvad er repressor protein?
Et regulerende protein, som binder til specifikke sider af DNA og blokkerer transskription
Binder til operon
Hvad er et aktivator protein?
Et regulerende protein, som binder til specifikke sider af DNA og stimulerer transskription
Skal bruge en inductor for at kunne binde til DNA
Er der ingen inductor kan det ikke binde, og derfor kan polymerase heller ikke binde til DNA
Binder på activator-binding site
Hvad er en regulon?
Når mere end en operon kontrolleres af et regullatory protein, kaldes disse operoner samlet en regulon
Gælder både for negativ og positiv kontrol
Hvad er katabolsk repression?
Når bakterien har flere forskellige carbon-kilder, vil den bruge de bedste først
Fx vil nogle bakterier bruge glucose først, så de ikke behøver omdanne fx lactose til glucose først
Hvad er diauxic growth?
Når bakterien har two gode carbon-kilder, vil den bruge den bedste først til at vokse, hvorefter den har en lag periode, og derefter vil den bruge den næste kilde
Hvad gør cyclic AMP receptor protein (CRP) ?
CRP er et aktiverende protein for katabolsk repression, da genet som koder for det katabolske-repressive enzym kun kan dannes, når CRP binder til DNA i promotor området
Hvad sker der når der er meget glucose i forhold til CRP?
Glucose hæmmer dannelsen af cyclic AMP receptor protein (CRP) -> CPR binder ikke til DNA -> RNA polymerase binder ikke til promotoren
Hvad er to-komponent regulativ system?
Et signal transduction system, som består af to komponenter, hvor signalet kommer til det ene komponent og derefter videre til det andet
Hvad er sensor kinase protein?
I et to-komponent regulativ system er et kinase portein, et portein som sidder i den cytoplasmiske membran, som opfanger et signal fra omgivelserne, hvorefter det fosforylerer sig selv (på histidine rest), og derefter give fosfor-gruppen videre til respons regulatoren
Hvad er en respons regulator?
Typisk et DNA-binding protein som regulerer transkription enten positiv eller negativt
Hvad er kemotaksi?
Prokaryote celler som bevæger sig væk fra dårlige steder til bedre steder -> Flageller
De opfanger ændringer i konc. af et kemikalie
Hvad er quorum sensing?
En makanisme hvor bakterier kan opfange densiteten af sine artsfæller omkring sig
Mest i gram-negative bakterier
Hvad er en autoinducer?
Et specifik signal molekyle, som laves ved quorum sensing
Det binder til et aktivator protein eller en sensor kinase i et to-komponent regulativt system
Hvad er heat shock proteiner?
Når en celle udsættes for stress, synteserer den heat shock proteiner, som modvirker skader -> for cellen til at komme over stress
Det sker ikke kun ved varme, men også ved andre stressfaktorer
Hvad er attenuation?
En tidlig afslutning af mRNA syntese. Dette sker efter transskriptionen er startet og før den slutter.
Det sker ved at den dannede første del af mRNA (the leader) kan folde sig til to sekundære strukturer, hvor den ene kan forsætte syntesen, mens den anden starter afslutningen
Hvad gør sRNA?
sRNA (small RNA) kan ændre translationen på fire forskellige måder:
1: sRNA vil base-pare til deres target mRNA, og dermed ændre dens sekundære struktur, så at RBS blokkeres eller gøres mere tilgængelig
2: Den kan også åbne tidligere blokkerede RBS, og dermed gøre dem tilgængelig for ribosommet
3: Ændre på stabiliteten af mRNA grundet binding til sRNA -> mRNA mindre stabil -> færre proteinsynteser
- > mRNA mere stabil -> flere proteinsynteser
Kan dobbeltstrenget RNA translateres?
Nej - ribosomet kan ikke binde til dobbeltstrenget RNA
