Kapittel 3 - Proteiner Flashcards

1
Q

Nevn minst tre av proteiners funksjoner.

A

Byggesteiner for cellen, utførelse av mange av cellens funksjoner, danne kanaler og pumper som kontrollerer passasjon av små molekyler inn og ut av cellen, antistoffer, hormoner, giftstoffer, budbringere mellom celler, signalsendere fra plasmamembranen til nukleus, får organeller til å bevege seg gjennom cytoplasma

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
2
Q

Hva kalles de mest strukturelt komplekse og funksjonelt sofistikerte molekylene som finnes?

A

Proteiner

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
3
Q

Hva er et protein?

A

En lang, uforgrenet kjede av aminosyrer koblet til hverandre via en kovalent peptidbinding

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
4
Q

Hva er et annet navn for proteiner?

A

Polypeptider

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
5
Q

Hva kalles de 20 ulike kjedene som ikke bidrar til dannelse av en peptidbinding, men som gir hver aminosyre sine unike egenskaper?

A

Aminosyrenes sidekjeder

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
6
Q

Hvordan avgjøres hva slags form et protein får?

A

Hvilken svak binding som er involvert

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
7
Q

Hvilke tre svake bindinger er involvert i proteindannelse?

A

Ionebindinger, hydrogenbindinger og van der Waals-tiltrekning

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
8
Q

Hva kalles fenomenet hvor hydrofobiske molekyler tvinges samme i et vannholdig miljø for å minimere forstyrrelse av det hydrogenbundne nettverket av vannmolekyler?

A

Den hydrofobiske samlekraften

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
9
Q

Hva er en konformasjon?

A

En endelig utgave av en polypeptidkjede

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
10
Q

Hva er funksjonen til en konformasjon?

A

Å minimere polypeptidkjedens frie energi

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
11
Q

Hvilken funksjon har et anstandsmolekyl?

A

Bidra til at proteinet får sin form

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
12
Q

Hvor mange aminosyrer består de fleste proteiner av?

A

50-2000

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
13
Q

Hva er et proteindomene?

A

En strukturell enhet I store proteiner som former seg uavhengig av hverandre

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
14
Q

Hvilke to vanlige formmønstre finnes i proteindomener?

A

a-heliks og B-ark

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
15
Q

Hva slags formmønster har hår, hud og negler?

A

a-heliks

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
16
Q

Hvor mange nivåer av struktur finnes i et protein?

A

4

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
17
Q

Hva er proteinets primærstruktur?

A

Sekvensen av aminosyrer

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
18
Q

Hva kalles deler av polypeptidkjeden som danner a-helikser og B-ark?

A

Sekundærstrukturen

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
19
Q

Hva består et proteins tertiærstruktur av?

A

Hele den tredimensjonale organiseringen av en polypeptidkjede

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
20
Q

Hvor mange aminosyrer utgjør et proteindomene?

A

40-350

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
21
Q

Hvor mange polypeptidkjeder med fire aminosyrer hver er teoretisk mulig å danne?

A

160.000

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
22
Q

Hvorfor er ikke alle 160.000 mulige polypeptidkjeder med fire aminosyrer hver mulig å danne i praksis?

A

Fordi kun noen av disse vil gi en stabil, tredimensjonal konformasjon (+ naturlig utvelgelse)

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
23
Q

Hvor mange proteinkodende gener inneholder et menneske?

A

21.000

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
24
Q

Hvor mange måter for et protein å forme seg på er kjent?

A

2000

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
25
Q

Hva kalles tilstanden hvor domener har slått seg sammen i nye kombinasjoner?

A

Domeneshuffling

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
26
Q

Hva er proteinmoduler?

A

Sett av proteindomener som har vært spesielt mobile i løpet av evolusjonen og som lett kan integreres i andre proteiner

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
27
Q

Hvor stor andel av proteiner består av to eller flere proteindomener?

A

2/3

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
28
Q

Hvor mange proteiner i det menneskelige genomet mangler vi informasjon om?

A

Over 10.000

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
29
Q

Hva kalles en del av et proteins overflate som kan samhandle med et annet molekyl gjennom sett av ikke-kovalente bindinger?

A

Bindested

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
30
Q

Hva er globulære proteiner?

A

Proteiner hvor polypeptidkjeden former seg som en ball med ujevn overflate

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
31
Q

Gi to eksempler på globulære proteiner.

A

Aktin og enzymer

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
32
Q

Hva er fibrøse proteiner?

A

Proteiner med en enkel, forlenget og tredimensjonal struktur som det finnes mange av utenfor cellen hvor de utgjør en viktig del av ekstracellulærvæsken

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
33
Q

Gi to eksempler på fibrøse proteiner.

A

Kollagen og elastin

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
34
Q

Hva kalles den viktige delen av cytoskjelettet som danner cellens interne strukturelle rammeverk?

A

Intermediære filamenter

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
35
Q

Hva er stillasproteiner?

A

Proteiner som konsentrerer sett av interagerende proteiner for å øke reaksjonshastigheten og avgrense reaksjoner til et bestemt sted i cellen

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
36
Q

Hva er disulfidbindinger?

A

Bindinger som dannes når cellene forbereder nylig syntetiserte celler for eksport

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
37
Q

Hva er et kapsid?

A

Svært tilpasningsdyktig proteinlag på utsiden av mange enkle virus

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
38
Q

Kan strukturer i celler sammenføye seg selv?

A

Ja

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
39
Q

Hva kalles spesielle enzymer og andre proteiner som fungerer som maler for strukturer som ikke kan sammenføye seg selv?

A

Sammensetningsfaktorer

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
40
Q

Gi to eksempler på strukturer som ikke kan sammenføye seg selv.

A

Cilium og myofibrill

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
41
Q

Hva er amyloide fibriller?

A

En spesiell type proteinstrukturer som kan bidra til sykdom når de ikke kontrolleres

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
42
Q

Hva kan akkumulasjon av amyloide fibriller føre til?

A

Celledød og vevsskade

43
Q

Hvilken del av kroppen er spesielt sårbar for amyloide fibriller?

A

Hjernen

44
Q

Hvordan defineres prionsykdommer?

A

En spesiell type sykdom knyttet til abnormal dannelse av stabile amyloide fibriller

45
Q

Hvilke to sykdommer i hjerne skyldes blant annet akkumulasjon av amyloide fibriller?

A

Alzheimer’s og Parkinson’s

46
Q

Hvordan spres prionsykdommer?

A

Ved at den ene organismen spiser et vev fra den andre organismen som inneholder proteinaggregatet

47
Q

Nevn tre eksempler på prionsykdommer.

A

Creutzfeldt-Jacobs sykdom, kuru, BSE hos kuer (kugalskap)

48
Q

Kan amyloide strukturer også være nyttige?

A

Ja

49
Q

Hvordan kan amyloide strukturer være nyttige?

A

Som lagre for peptid- og proteiner hormoner i kjerner som består av amyloide fibriller og hos bakterier som bruker dem til å skille ut proteiner som for å binde bakterienaboer til biofilmer

50
Q

Hvilken funksjon har biofilmer?

A

Hjelper bakterier med å overleve

51
Q

Hva er reversible amyloider?

A

Strukturer som holdes sammen av svake ikke-kovalente bindinger og brytes opp som respons på signaler

52
Q

Hva er en granulær?

A

En struktur som dannes ved at molekyler dras sammen ved hjelp av en vannholdig gele i cellen (hydrogel)

53
Q

Binder alle proteiner seg til andre molekyler?

A

Ja

54
Q

Hva betyr det at en binding har høy spesifitet?

A

At hvert molekyl vanligvis kun binder seg til ett eller noen få molekyler

55
Q

Hva er en ligand?

A

Et ion, molekyl eller makromolekyl som bindes av et protein

56
Q

Hva avhenger et proteins evne til å binde seg selektivt og med høy spesifitet til et ligand av?

A

Dannelsen av svake ikke-kovalente bindinger og fordelaktige hydrofobiske interaksjoner

57
Q

Hvilke to kategorier av reaksjoner hos de kjemiske gruppene på proteiners overflate har vi?

A

Interaksjonen til nabodeler av polypeptidkjeder og samling av nærliggende polare sidekjeder av aminosyrer

58
Q

Hva kalles metoden hvor man identifiserer steder i et proteindomene som er viktigst for domenets funksjon?

A

Evolusjonær sporing

59
Q

På hvilken måte binder proteiner seg vanligvis til hverandre?

A

Ved presis matching av en rigid overflate med en annen rigid overflate

60
Q

Hva må alle proteiner binde seg til for å utføre sine ulike funksjoner?

A

Spesifikke ligander

61
Q

Hva er antistoffer?

A

Proteiner produsert av immunsystemet som respons på fremmede molekyler

62
Q

Hva er et annet navn på immunoglobuliner?

A

Antistoffer

63
Q

Hva er et antigen?

A

Målet til et antistoff

64
Q

Hvilken fasong har et antistoff?

A

Y

65
Q

Hva dannes ved at flere loops av en polypeptidkjede går ut fra endene til et par nærliggende proteindomener?

A

Antistoffer

66
Q

Hva er ekvilibriumskonstant (K)?

A

Styrken to molekyler binder seg til hverandre med

67
Q

Hva er Vmax?

A

Reaksjonshastigheten når et enzym-molekyl er fylt med substrat

68
Q

Hva er Km?

A

Konsentrasjonen av substrat som lar reaksjonen pågå på halvparten av den maksimale hastigheten

69
Q

Hva er de to årsakene til at enzymer oppnår svært raske kjemiske reaksjoner?

A

Øker konsentrasjonen av substratmolekyler på katalysestedet og fordi de har høyere spesifitet for overgangstilstanden til substratet enn for den stabile formen

70
Q

Hva kan bruke syre- og basekatalyse samtidig?

A

Enzymer

71
Q

Hva er et lysosym?

A

Enzym som katalyserer kutting av polysakkaridkjeder i celleveggen til bakterier

72
Q

Hva er Heme-grupper?

A

Ringformede molekyler i hvert hemoglobin-molekyl som hver har ett jernatom, gir blodet sin røde farge

73
Q

Hva kalles et stort protein som dannes når ulike enzymer er involvert i en reaksjonssekvens?

A

Multienzymkompleks

74
Q

Hva er den vanligste typen regulering av hvor raskt en kjemisk reaksjon skjer?

A

Når et enzym binder et molekyl som ikke er et substrat til et spesielt reguleringssted utenfor det aktive stedet

75
Q

Hva kalles prosessen hvor et produkt produsert sent i en reaksjonsbane hemmer et enzym som er aktivt tidligere i banen?

A

Feedback-inhibisjon

76
Q

Hva skjer ved negativ regulering?

A

Et enzym hindres fra å handle

77
Q

Hva kalles prosessen når et regulerende molekyl stimulerer et enzyms aktivitet?

A

Positiv regulering

78
Q

Hva er allosteri?

A

Regulering av et enzym ved å binde et regulerende molekyl på et annet sted enn enzymets aktive sted

79
Q

Er de fleste proteinmolekyler allosteriske?

A

Ja

80
Q

Hva er en kobling (linkage)?

A

Grunnleggende kjemisk prinsipp hvor ligander binder seg til et protein, gjensidig forhold mellom dem og påvirker begges affinitet

81
Q

Hva kalles proteiner som i prinsippet kan la et molekyl i en celle påvirke skjebnen til et annet molekyl i cellen?

A

Allosteriske proteiner

82
Q

Nevn et eksempel på negativ regulering.

A

Feedback-inhibisjon

83
Q

Hvordan kan fosforylering påvirke et protein til endring?

A
  1. Konformasjonell endring i proteinet 2. En fosfatgruppe kan bli en del av en struktur som andre proteiner gjenkjenner 3. En fosfatgruppe kan skjule et bindested og forstyrre interaksjoner mellom proteiner
84
Q

Hva skjer i proteinfosforylering?

A

Enzym-katalysert overføring av den siste fosfatgruppen i et ATP-molekyl til hydroksylgruppen på en sidekjede av serin, threonin eller tyrosin i proteinet

85
Q

Hvilken funksjon har en proteinkinase?

A

Katalyse av reaksjonen hvor fosforylering av et protein foregår

86
Q

Hvilken funksjon har en proteinfosfatase?

A

Katalyse av den motsatte reaksjonen av fosforylering (defosforylering)

87
Q

Hvor mange proteinkinaser inneholder en celle?

A

Hundrevis

88
Q

Hva er GTP-bindende molekyler?

A

En stor familie av proteiner som alle inneholder variasjoner av det samme GTP-bindende globulære domenet

89
Q

Hvilken funksjon har GTP-bindende molekyler?

A

De kan bidra til å kontrollere proteiners aktivitet ved at fosfat ikke festes direkte til proteinet, men er del av GTP som bindes tett til dem

90
Q

Hvilket protein spiller en viktig rolle i cellesignalisering?

A

Ras-proteinet

91
Q

Hvordan aktiveres Ras-proteinet?

A

Ved at det utveksler GDP mot et GTP-molekyl som respons på ekstracellulære signaler

92
Q

Hva er GTPase-aktiverende protein (GAP)?

A

Et protein som inaktiverer Ras-proteinet ved å binde seg til det og får det til å hydrolysere sitt bundne GTP-molekyl til GDP

93
Q

Hva heter det første proteinet som ble oppdaget at kunne danne kovalente bindinger med andre proteiner og dermed påvirke aktiviteten til det andre proteinet?

A

Ubiquitin

94
Q

Hvilke funksjoner har motorproteiner?

A

Bevege andre molekyler og bidra til konformasjonsendringer

95
Q

Nevn to eksempler på motorproteiner.

A

Myosin, kinesin

96
Q

Hvilke fire funksjoner har proteiner som gjennomgår allosteriske formendringer?

A
  1. Mikroprosessorer 2. Sammensetningsfaktorer 3. Generatorer av mekanisk kraft og bevegelse 4. Pumper for spesifikke ioner eller små molekyler over en membran
97
Q

Hva er ABC-transportører?

A

En viktig klasse av membranbundne pumpeproteiner

98
Q

Hvilke to funksjoner har ABC-transportører?

A

Eksportere hydrofobiske molekyler fra cytoplasma og fjerne toksiske molekyler fra overflaten av indre organer

99
Q

Hva kalles forskning som fokuserer på analyse av store sett av proteiner?

A

Proteomikk

100
Q

Hva er et proteininteraksjonskart?

A

En kartbasert fremstilling av proteiners forbindelser med hverandre

101
Q

Hva er fordelen med proteininteraksjonskart?

A

De kan identifisere den sannsynlige funksjonen til tidligere ukarakteriserte proteiner

102
Q

Hva er ulempen med proteininteraksjonskart?

A

De må tolkes med varsomhet fordi det samme proteinet kan brukes som del av ulike proteinkomplekser med ulike funksjoner

103
Q

Hvor mange ulike proteiner finnes i en menneskecelle?

A

10.000

104
Q

Hvor mange partnere samhandler hvert protein i en menneskecelle med?

A

5-10