Izpitna vprašanja Flashcards
Plazmodezme
- cevasti membranski izrastki
- povezujejo citoplazmo celic
- obdani s plazmalemo
- 40 do 50 nm
- direktni medcelični transport in komunikacija (globularni proteini)
Prehajanje vode skozi plazmalemo
- difuzija zaradi koncentracijskega gradienta
- snovni tok skozi akvaporine (regulacija s fosforilacijo proteinskega dela)
Mehanizmi odpiranja & zapiranja listnih rež
- povečanje turgorja v zapiralkah odpre reže
- za odprtje potrebna sončna svetloba > s fotosintezo nastaja malat
- posledica spreminjanja vodnega potenciala v zapiralkah
- ob ugodnih razmerah protonske črpalke v membrani zapiralk izplavijo protone iz celic > el potencial postane negativen in vdrejo katijevi ioni
- zmanjša se osmotski tlak & poveča se konc topljenca > vdre voda > poveča se prostornina in turgor zapiralk > celična stena se upogne
- ob neugodnih razmerah se veže ABA > vdor protonov in izhod kalija > zmanjša konc topljenca in poveča osmotski tlak > voda izhaja iz celice, zmanjša se prostornina > zapiralki se zapreta
Nalaganje celične stene
a) primarna:
- osrednja lamela s polisaharidi
- primarna celična stena
- nastanek mikrofibril (vežejo polisaharidi matriksa)
- povečevanje celic in rast rastline
b) sekundarna:
- nerastoče celice
- celulozne mikrofibrile obdane s polisaharidi in ligninom
- fenolne podenote lignina v medprostorih
Membranski transport raztopin
selektivna prepustnost odvisna od:
- kemijskih lastnosti
- lipidne zgradbe membrane
- membranskih proteinov
Aktivni transport -> gibanje proti koncentracijskem gradientu, porablja ATP
Pasivni transport -> spontano gibanje v smeri konc. gradienta
Sekundarni transport -> simport, antipot
Membranski transportni proteini -> kanali, prenašalci in črpalke
Biosinteza celične stene
> CSC gradi rozeto iz 6 podenot (36 podenot)
povezava podenot s beta-1,4-glukansko vezjo
osnovni gradnik UDP-glu (aktivna glukoza)
rozeta v smeri mikrotubolov, ki narekujejo smer
matriks dopolnita ER in GA
Transport vode v celice
> hkratno izločanje vode in CO2
evaporacija ohlaja rastlino
voda omogoča kapilarnost (adhezija & kohezija)
a) snovni tok:
> gibanje mol zaradi gradienta tlaka
> transport na daljše razdalje (ksilem, tla, apoplast, floem)
> neodvisen od konc gradienta
> Poiseuille-ov zakon
b) difuzija:
> spontano gibanje mol v smeri konc gradienta
> krajše razdalje
> med apoplastom in simplastom, preko membran, …
> Fickov zakon
c) osmoza:
> prehajanje vodr skozi semipermeabilno membrano
> gradient konc in tlaka
d) vodni potencial:
> opis vodnih razmer v celici
> razpoložljivost vode v sistemu
> pozitiven (turgescentna celica)
> negattiven (tenzija)
e) toničnost:
> odgovor celice v raztopini
> izotoničnost - rahlo turgescentna celica
> hipotoničnost - voda vdira v celico
> hipertoničnost - voda izhaja
Vodne razmere v celici
> opisujemo z vodnim potencialom
osmotski potencial - konc snovi v vodi
turgorski tlak - absolutni-atmosferski tlak
gravitacijski potencial (nv)
matrični potencial - adhezija
potencial vodnih hlapov - vlažnost
Osmoregulacija
> uravnavanje vodnih razmer v celicah & tkivih s spreminjanjem koncentracije razt snovi brez sprememb turgorja in volumna celice
sprejem vode preko TAKT
Transport vode v tleh & sprejem vode v korenine
> razpoložljivost vode v tleh odvisna od fiz-kem lastnosti tal in poljske kapacitete
pot vode: tla - sprejem - korenina - steblo - list - transpiracija - zrak
vstop v korenino preko koreninskih laskov
formacija žil na območju koreninskih laskov - vstop vode z difuzijo/snovnim tokom
razmerje med površino listov in korenin
> za vstop vode se v korenini zniža koreninski potencial
radialni transport po koreninah
- simplastni (skozi plazmodezme)
- apoplastni (po medceličnih prostorih do Casparijevih prog)
- transcelularni
endodermis s suberiziranimi stenami - voda vstopi v žilne stene
Radialni transport vode
> pot vode po principu nižanja vodnega potenciala
simplastno, apoplastno in transcelularno potovanje vode
voda potuje iz korenin do centralnega dela korenine s prevajalnimi tkivi in nato po ksilemu do nadzemnih delov
Aksialni transport
> transport vode po ksilemu v nadzemne dele
daljše razdalje
poganja tlak - tenzija zaradi izhlapevanja vode s površine sten mezofilnih celic
pasiven reguliran proces
sekundarne odebelitve CS omogočajo mehansko trdnost
kohezijske sile omogočajo, da se vodni stolpec ne prekine
Kapilarnost - dvig vode vzdolž tanke kapilare
Koreninski tlak - ioni nakopičijo v centralnem cilindru, pade osmotski potencial
Tenzija - nadzemni deli ob transpiraciji; pasivno srkanje vode
Transpiracija
> oddajanje vode s površine rastline po principu difuzije
pot vode v smeri nižanja vodnega potenciala
voda do mezofila - ustvarijo meniski vode
manjšanje meniskov pomeni upad matričnega in vodnega potenciala
ohlajanje, mineralna prehrana in sprejem CO2
Ozmostki, osmotski tlak in potencial
> ozmotski potencial - tlak za prehajanje vodnih molekul v del s topljencem
osmotski tlak - tlak vode na selektivno prep membrano zaradi konc gradienta
osmotski potencial - potencial raztopine
Vodni potencial in kemijski potencial vode
Vodni potencial
- gibanje vode po rastlini v smeri nižjega tlaka do izenačenja
- vodne razmere v celici
- mera za razpoložljivost vode v sistemu
Kemijski potencial
- konc raztopljenih snovi
- vpliv na pot vode med celicami in med okoljem in rastlino
- več je snovi bolj je negativen
Hitrost transpiracije
- povečanje transpiracije poveča vodni potencial > povečanje hitrosti črpanja
- majhna transpiracija, ko rastline dobro zalivane z dobro vlago, pojavi koreninski tlak
- sončno > ohlajanje rastline s transpiracijo in fotosintezo > odprte reže
- nizka vlažnost > večja razlika v vodnem potencialu > hitro izgubljanje vode
Vodni stoplec
> transport 100m v višino potrebni 3MPa razlike v tlakih
kapilarnost - dvig vodnega stolpca vzdolž tanke kapilare, posledica adhezije in kohezije
koreninski tlak
podtlak v nadzemnem delu
> v ospredju transpiracija, ki zmanjšuje vodni potencial - voda se prečerpava skozi celo rastlino
adhezija omogoča interakcijo mol vode s površino - se držijo sten ksilema
kohezija - molekule povezane med seboj z vodikovimi vezmi, da se ne prekine vodni stolpec
Gnojenje v času suše
> kopičenje hranil v tleh in rastlinah
rastlin ni varno uživati
negativen vpliv na količino pridelka
hipotonično okolje - izgubljanje vode
plazmoliza celic in celična smrt
ob suši velika transpiracija za ohlajanje - znižanje vodnega potenciala - gnojenje zmanjša osmotski potencial in oteži dostop do vode
Zgradba listne reže
> odprtine v spodnji povrhnjici
prenos plinov in vlage
obdajata celici zapiralki in celice spremljevalke
nimajo plazmodezem
imajo kloroplaste s slabo razvitim sistemom tilakoid (škrob nastaja ponoči)
Uravnavanje odpiranja listnih rež
a) razpoložljivost vode
- ob zmanjšani razpoložljivosti se zmanjša vodni potencial > zapiranje listnih rež (hidropasivno zapiranje)
- vodni stres povzroči nastajanje ABA > zapisanje rež (hidroaktivno zapiranje)
- ABA neprestano nastaja v mezofilu in se akumulira v kloroplastih; ob dehidraciji mezofila se sprosti v apoplast in se s transpiracijo prenese v zapiralke > pospešeno se sintetizira in podaljša učinek
b) koncentracija CO2
- zmanjšana konc je signal za odprtje
- povečana konc je signal za zaprtje
c) svetloba
- prevodnost rež močnejša ob močni svetlobi zaradi porabe CO2
- spodbuja odpiranje rež (modri del spekta) > aktivira protonske črpalke na plazmalemi zapiralk, dvigne turgor
- rdeča svetloba spodbudi odpiranje posredno preko fotosinteze > poveča fotosinteza v zapiralkah
d) temperatura > hlajenje s transpiracijo
e) veter > pospešuje transpiracijo, zapiranje rež
f) signal iz tal
- ob sušenju tal v koreninah nastaja ABA > reže zaprejo za zmanjšanje izgube vode
Vloga ABA pri odpiranju/zapiranju LR
- stresni hormon za zapiranje rež
- vodni stres > naraste pH > disociiranje ABA in potovanje iz kloroplastov v zapiralke
- vdor protonov in izhod kalijevih ionov ter kalcijevih ionov iz vakuole > izhod vode iz celice, naraste osmotski tlak, upade turgor > zaprtje
Vloga kalcijevih ionov pri odpiranju/zapiranju rež
- sproščajo v zapiralke iz vakuole in odpirajo kalijeve kanale
- zviša se osmotski tlak, zmanjša se turgor > zapiranje
Vloga H-ATP-az in svetlobe pri odpiranju/zapiranju rež
- protonske črpalke črpajo protone iz celice ob svetlobi
- vdor kalija > dvig turgorja in vdor vode > odpiranje
Skupine elementov glede na biokemijsko vlogo
a) organske spojine (asimilacija v reakcijah oks in red)
- N
- S
b) elementi pomembni v strukturnih in energetskih mol
- P, Si, B
- fosfati, silikatni estri
- vezani na organske molekule
c) v ionski obliki (raztopina vakuol)
- Mn, Cl, K, Ca
- kofaktorji encimov
- osmoregulacija
d) vključeni v el transport (redoks reakcije)
- Mo, Fe, Ni
- reverzibilna oksidacija in redukcija
- vezani na citokrom, klorofil, proteine
Sprejem ionov v korenino
- odsotnost svetlobe > proces dihanja, ni fotosinteze
- ustvari CO2, veže v ogljikovo kislino > odcepi vodikov ion
- tla so negativna (vežejo pozitivne ione)
- protonske črpalke izločajo protone za pozitivne ione > aktivni transport skozi kanale s simportom/antiportom
- črpanje aktiven proces, porablja se energija
- mineralna hranila različno dostopna (posredno, neposredno)
- sprejem hranil selektiven > snovni tok/difuzija do površine korenin
- do ksilema radialni transport skozi apoplast/simplast
Transport ionov po rastlini
a) radialni transport (iz koreninskih laskov v žile)
- ioni apoplastno in simplastno do endodermisa (aktivni trans)
- iz simplasta vstopijo v ksilem (pasivno)
- vstop v žilne elemente z difuzijo
b) aksialni transport (po ksilemu in v liste)
- transport po ksilemu s pomočjo transpiracije s snovnim tokom vode
- iz ksilema ioni vstopajo v celice listov (aktivno)
Pomen fosforja
- sestavni del biomolekul: aminokisline, nukleinske kisline, nukleotidi, koencimi, fosfolipifi
- reakcije z ATP
- absorbira kot fosfat PO4(2-)
- simptomi pomanjkanja:
> pritlikava rast
> temnozeleni listi z nekrozami
> odmiranje starih listov
> zakasnel razvoj
Pomen magnezija
- encimi v transferju fosfatov
- aktivacija encimov dihanja,
- fotosinteza
- sinteza DNA in RNA
- uravnavanje celičnega pH
- sestavni del klorofila
- absornira kot kation Mg2+
> kloroze starih listov
nekroze
sušenje konic
Pomen kalija
- kofaktor encimov dihanja in fotosinteze7
- osmoregulacija > vzdrževanje turgorja in elektronegativnosti
- absorbira kot kation K+
> marginalna kloroza
sušenje konic in uvihavanje starih listov
šibko steblo
Pomen kalcija
- osrednja lamela celične stene > tvorba novih celičnih sten
- delitveno vreteno
- kofaktor encimov pri hidrolizi ATP in fosfolipidov
- absorbira kot kation Ca2+
> nekroze meristematskih tkiv
hiter propad rastline
Pomen železa
- sestavni del hem proteinov, citokromov
- prenos elektrona v dihalni verigi, svetlobnih reakcijah fotosinteze in redukciji dušika
- absorbira kot helati
- sestavni del klorofila
> močna kloroza mladih listov
Pomen dušika
- potreben v velikih količinah
- gradnik biomolekul, aminokislin, nuk kislin, proteinov, amidov, nukleotidov in koencimov
- absorbira kot nitratni ion NO3- z aktivnim transportom in kot amonijev ion NH4+ s pasivnim transportom (v simbiozi tudi kot N2)
> zavrta in pritlikava rast
kloroze starih delov
tvorba antocianov
Dodajanje Fe vezano na kelatorje
kelatorji > organske snovi, ki tvorijo z Fe komplekse in ga sprostijo v raztopino
- vežejo Fe in ga prenesejo do reduktaze
- Fe tako postane lažje dostopen rastlini
Kloroze ob pomanjkanju Fe, Mn in N
N:
- pritlikava rast
- kloroze na starih listih, nato nekroze
- tvorba antocianov
- N dobro mobilen zato pojav najprej na starih listih
Fe:
- intervenozne kloroze v mladih listih
- tvorba klorofilproteinskih kompleksov > porumeneli listi
Mn:
- nekroze v mladih in starih listih
Asimilacija nitrata (redukcija)
- N sprejme skozi korenine, ki ga v zemlji iz organskega materiala bakterije pretvorijo v nitrat > alkalizacija tal s protoni
- asimilacija nitrata v korenini in poganjkih
- NO3- iz korenin gre v vakuolo, kjer se asimilira in gre v liste
- nitrat se reducira v nitrit, ta pa v amonij > uporabi se redukcijski potencial svetlobnih reakcij > amonij se veže v AK
- v citoplazmo se nitrat transportira z nitratnimi transporterji
- v citoplazmi se z nitrat reduktazo nitrat pretvori v nitrit NO2-, ki potuje v tilakoide kloroplastov > tu se pretvori s nitrit reduktazo v amonijev ion NH4+ (ATP in NADP+) > nato v glutamin
- asimilacija samo ob fotosintezi
nitrat reduktaza - molibden in železo (potreben NADPH in NADH)
Asimilacija nitrita (redukcija)
- Po redukciji v nitrit vstopi v kloroplast > nitrit reduktaza ga pretvori v amonijev ion s pomočjo feredoksina (pridobi elektrone v transportni verigi)
Asimilacija nitrata (vgradnja)
- dva encima: glutamin sintetaza in glutamat sintetaza
- amonijev ion se v AK vgradi hitro, ker je reaktiven
- glutamat > AK z eno amino skupino, nastane z glutamin sintetazo iz glutamina
- glutamin je donor z dvema amino skupinama
- če premalo svetlobe se nitrat skladišči v vakuoli
> glutamin veže z 2-oksaloglutaratom (odda amino skupino)
nastanek 2 glutamatov
glutamat se pretvori v glutamin in nastane še več glutamatov
Transaminacija > sinteza AK in amidov
- aminoskupine se podajajo iz glutamata za nastanek različnih AK
- citoplazma, kloroplast, mitohondrij, glioksisomi, peroksisomi
- donorja amino sk sta glutamin in glutamat
Asimilacija žvepla (sprejem, aktivacija)
- asimilacija v listih (kloroplasti)
- sprejem kot sulfat SO4(2-) v koreninah s simportom (sulfatni simporter)
- skozi reže sprejem SO2
- sulfat veže z ATP s pomočjo ATPsulfurilaze > nastane APS
- APS reduktaza in glutation reducirata v sulfit
Asimilacija žvepla (redukcija sulfata)
- APS se reducira do sulfita SO3 (v plastidih) s sulfit reduktazo in feredoksinom > sulfid
- iz listov transport v obliki glutationa na mesta sinteze beljakovin
- regulatorna vloga
- dihalna veriga > disulfidni mostički
- mesta redukcije citosol, plastidi, mitohondrij
Asimilacija žvepla (neredukcijska vgradnja v organske mol)
- sulfid s serinom in acetil koencimom A veže v cistein
- APS veže z ATP > nastane PAPS in ADP
- holin, peptidi, polisaharidi, flavonoli
Asimilacija fosforja v org mol
- oksidiran se veže na
> hidroksilno skupino sladkorjev
> fosfatno molekulo»_space; pirofosfatna vez
> diestersko vez (struktura molekul)
Biokemija biološke vezave zračnega N2
- simbioza s prokarioti
- ločitev stabilne trojne vezi
- cianobakterija Anabaena
- heterociste > samo FS1
- s feredoksinom in nitrogenazo redukcija dušika v amonij (molibden in kobalt)
- nitrogenaza > katalizira redukcijo zračnega dušika (brez O2)
- nastane amonijev ion
Razvoj nodula v koreninah metuljnic (infekcija z Rhizobiumin)
- koreninski laski izločajo flavonoide > privlačijo bakterije
- bakt izločajo snovi za stimulacijo rasti in zvijanje koreninskih laskov
- bakt z lektini prilepijo na koreninski lasek
- bakt invadirajo v celice preko koreninskih niti > z rastjo penetrirajo v koreninske kortikalne celice
- bakt sprostijo iz niti v citoplazmo nodulnih kortikalnih celic (obdane z membrano rastlinskega izvora)
- bakt v ovoju diferenciira v bakteriod
- primordiji diferenciirajo v nodule (poteka fiksacija)
- noduli odvisno od preskrbe s fotosintetskimi produkti gost rastlin
- fiksiran dušik se presene v citosol v obliki amonijaka, ki se asimilira v rastlinske poganjke
- koncentracija prostega kisika v celicah nizka > nitrogenaza občutljiva na kisik > prisoten v vezani obliki na leghemoglobinu (potreben za dihanje, aktivni transport, asimilacijo amonijaka in visoke nivoje ATP)
Pretvorba amonijevega iona v organsko vezan N in translokacije
- organski N pretvarja v nitratni ion > sprejem preko simporta skozi korenine
- redukcija nitrata v nitrit v citoplazmi s nitrat reduktazo
- transport nitrita v kloroplasta > pretvorba v amonij z nitrit reduktazo
- vgradnja amonijevega iona z glutamin sintetazo in ATP > glutamin (citosol/kloroplast)
- glutamat sintetaza in 2oksoregulat ga pretvora v glutamat v kloroplastu
Vloga nitrogenaze v vezavi zračnega N
- fiksacija in pretvorba zračnega N v cianobakterijah
- redukcija v amonij s feredoksinom, potrebna molibden in kobalt
- potreben ATP, NADPH
- odsotnost O2 (izolacija nodula)
- nastanek amonija za vezavo v aminokisline, glutamin in glutamat
Različni tipi mikorize in pomen
- simbiotska povezava rastlin in gliv
- mutualističen odnos (oba korist)
> rastlina daje glivi ogljikove hidrate, nazaj dobi mineralna hranila - izboljšanje mineralne prehrane/ povečajne razpoložljivosti mineralnih hranil
- odpornost na abiotski stres, patogene in herbivore
a) ektotrofna mikoriza - gliva zunaj celic
- ektomikoriza > na koncu koreninskih laskov tvori glivni plašč, ki razteza v okolico (Hartigova mreža)
b) endotrofna mikoriza > hife gliv vraščajo v celice
- arbuskularna mikoriza > hife oblikujejo grimičaste strukture v koreninah
- erikoidna mikoriza > hife oblikujejo zvitke v koreninah
- orhidejska mikoriza > skupki hif znotraj korenin in embrija
c) ektendotrofna mikoriza - prehod med ektotrofno in endotrofno
- arbutoidna
- monotropoidna
- ekendomikoriza
Pozitivni učinki mikorize na rastlino
- povečana mineralna prehrana
- povečan volumen tal za izkoriščanje hranil
- povečana razpoložljivost hranil za glive
- povečana preskrba z vodo
- povečana odpornost na sušo
- povečana odportnost na abiotski in biotski stres
Zgradba kloroplasta
- dvomembranska sturktura/plastid
- lastna DNA (sinteza encimov)
- notranja membrana nagubana
- medmembranski prostor z uvihavanjem dvoslojnega fosfolipida
- v notranjosti stroma > redukcija CO2
- v stromo zajeda tilakoidna membrana (nahajajo pigmenti) in tvori tilakoide
- tilakoide tvorijo granume
Klorofili in vloga v rastlini
- asimilacijski pigment za vršenje procesa fotosinteze (absorbcija, prenos in pretvorba energije)
- tilakoidne membrane kloroplastov
- porfirini > štirje pirolovi obroči s centralnim Mg ionom
- del beljakovinskih kompleksov v notranjih membranah kloroplastov (fotosistemi)
- glavni je klorofil a > edini ob eksitaciji odda elektron in opravi fotokemično delo»_space; pretvorba energije svetlobe v kemijsko
- vezan dušik
Karotenoidi
- pomožna fotosintetska barvila > prenos energije do glavnega barvila
- tetraterpeni iz izoprena
- kloroplasti (tilakoidna membrana) in kromoplasti (stroma)
- karoteni (oranžnordeči)
- ksantofili (rumeno do rdeči)
- privabljanje opraševalcev in raznašalcev semen (kromoplasti)
- zbiranje svetlobe, odvajanje odvečne svetlobe iz fotosistema in odstranjevanje škodljivih molekul
Zakaj je list zelen?
- kloroplasti s tilakoidami v notranji membrani, ki vsebujejo barvila
- klorofila a in b absorbirata svetlobo v modrovijoličnem in rdečem spektru > odbijata zeleni del
Raziskovalci pred WW2
Van Niel
- primerjal biokemijo org, ki oddajajo kisik in bakterij, ki ga ne
- med fotosintezo se cepi voda > vir kisika
- CO2 se reducira v ogljikov hidrat
Hillova reakcija
- dokaz o izvoru kisika z izoliranimi kloroplasti
- izločanje kisika ob prisotnosti reducirajoče snovi
Emerson in Arnold
- osvetljevanje alge z bliski svetlobe