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Biochimie III > Introduction- ARN > Flashcards

Introduction- ARN Flashcards

1
Q

Transcription de l’ARN

Quels sont les 3 ARN chez les eucaryotes et leur ARN polymérase associée ?

A
  • ARNr: ribosomal, transcrit par l’ARN polymérase I
  • ARNm: messager, transcrit par l’ARN polymérase II
  • ARNt: transfert, transcrit par l’ARN polymérase III.
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Q

Transcription de l’ARN

Donner la définition de promoteur.

A

Séquence d’ADN reconnue par l’ARN polymérase, située en amont de la séquence d’un gène. C’est une région où la transcription du gène est initiée.

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3
Q

Transcription de l’ARN

Pourquoi la région codante chez les eucaryotes est différente par rapport à celle des procaryotes ?

A

Elle possède des introns (partie qui est éliminée) et des exons.

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4
Q

Transcription de l’ARN

Qu’est ce que l’épissage ?

A

L’épissage consiste à retirer toutes les séquences d’introns afin que l’ARN puisse être transcrit en ARN messager.

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5
Q

Facteur de transcription

Quels sont les différents facteurs de tanscription pour l’initiation de la transcription des ARNm ( par l’ARN pol II) ?

A

Les facteurs de transcription: TF II D, TF II B, TF II F, TF II E, TF II H.

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6
Q

Facteur de transcription

Quels sont les rôles du facteur de transcription TF II D ?

A

Il reconnait la TATA box, d’autres séquences d’ADN proches du +1 de la transcription, et il régule les liaisons à l’ADN.

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7
Q

Facteur de transcription

Quels sont les rôles du facteur de transcription TF II H ?

A

Il déroule l’ADN au point de départ de la transcription, phosphoryle la Ser5 de l’ARN polymérase, et libère l’ARN polymérase du promoteur.

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8
Q

Facteur de transcription

Certains TF sont situés plus en amont du promoteur, dit “activator protein”, quel est leur rôle général ? comment s’organisent -t-ils ?

A

Ils décident de quel gène doit être transcrit selon le type cellulaire.
Ils ont deux domaines: un qui reconnait une séquence spécifique et un domaine activateur qui donne l’ordre aux TF de se positionner en amont du promoteur pour recruter l’ARN polymérase.

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9
Q

Facteur de transcription

Que permet un activateur ? (TF)

A

-Permet le recrutement d’autres facteurs
-Permet le recrutement direct des TF II
-Permet le début de la transcription.

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10
Q

Facteur de transcription

Quelles sont les caractéristiques de l’activateur ?

A

-Riche en résidus acides, proline, glutamine
-Interchangeable
-Tolérant aux mutations
(Ce sont des caractéristiques des protéines intrinsèquement désrdonnées).

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11
Q

Facteur de transcription

Quels sont les différents types de régulation des facteurs de transcription ?

A

-Interaction d’un TF avec un inducteur: hormone, substrat,…
-Activation du gène codant pour le TF.
-Phosphorylation, dimérisation des liaisons à l’ADN
-Dissociation d’un inhibiteur

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12
Q

Synthèse et maturation des ARNm

Qu’est ce que le CTD ?

A

C-terminal domain

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13
Q

Synthèse et maturation des ARNm

Quels sont les rôles du CTD ?

A
  1. Phosphorylation (permet la transcription: départ de l’ARN pol II)
  2. Recrutement des enzymes qui ajoutent la coiffe
  3. Epissage
  4. Ajout d’une queue poly A (poly adénilation)
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14
Q

Synthèse et maturation des ARNm

Quels sont les rôles de la coiffe ?

A
  • Résistance aux éxonucléases (qui agissent de 5’ vers 3’)
  • Importante pour l’épissage ( si il n’y en a pas ça ne marche pas)
  • Importante pour la poly adénilation (si pas de coiffe pas de queue poly A)
  • Importante pour l’export
  • Nécessaire à la traduction.
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15
Q

Synthèse et maturation des ARNm

Où retrouve-t-on les coiffes ?

A

On les retrouve sur les ARNm, les U-ARN (spliceosomes), micro-ARN.
Ce sont tous des ARN transcrit par l’ARN pol II.

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16
Q

Synthèse et maturation des ARNm

Qu’est-ce qu’un spliceosome ?

A

C’est un complexe formé de snRNP ( contenant des snRNA : U1,U2,U3,U4,U5,U6) et des protéines.
Il permet de couper les introns.

17
Q

Synthèse et maturation des ARNm

A quoi servent les groupements méthyl, qu’on retrouve sur les coiffes de type 1 et 2 ?

A

Les groupements méthyl permettent d’augmenter le nombre de traduction de l’ARNm: il sera plus traduit avec des groupements méthyl que s’il n’en a pas.

18
Q

Synthèse et maturation des ARNm

Donner les étapes de la formation de la coiffe.

A
  1. L’ARn triphosphatase supprime un phosphate sur le 1er nucléotide.
  2. La Guanylyltransférase ajoute un GMP (Gp-GTase) sur la base 1.
  3. N7-méthyltransférase: méthylation de la guanosine
  4. Si il s’agit d’une coiffe de type 1: Méthylation sur la base 1 la 2’O-méthyltransféranse. S’il s’agit d’une coiffe de type 2 méthylation sur la base 1 et 2 .
19
Q

Synthèse et maturation des ARNm

Donner les lieux des étapes de la synthèse et maturation des ARNm.

A

Dans le noyau:
- épissage des ARNm
- Polyadénylation des ARNm
- Export des U ARNsn

Dans le cytoplasme:
-Initiation de la traduction.

20
Q

TD- Acides nucléiques

Combien de paires de base par tour d’hélice présente la double hélice dextrogyre de l’ADN ?

A

10 paires de base.

21
Q

TD- Acides nucléiques.

A quoi correspond la température de fusion d’un ADN ?

A

A la température à laquelle 50% des deux brins sont dissociés.

22
Q

TD-Acides nucléiques.

Dans un acide nucléique, par quoi sont reliés les nucléotides ?

A

Par des liaisons phosphodiester.

23
Q

TD-Acides nucléiques

Grâce à quoi les eucaryotes prolongent la demi-vie des ARNm ?

A

Grâce à l’ajout d’une coiffe en 5’ et d’une chaine polyA en 3’.

24
Q

TD-AN

Quelle est la configuration de la double hélice d’ADN ?

A

Configuration antiparallèle.

25
Q

Dans la double hélice d’ADN, la chaine poly phosphate- deoxyribose est située où ?

A

A l’extérieur de la molécule.

26
Q

A quelle extrémité la queue poly- A est ajoutée ?

A

A l’extrémité 3’ de l’ARNm après transcription

27
Q

Quelles sont les étapes de la polyadénilation ?

A
  • Clivage de l’ARNm à un site spécifique (site de polyadénylation)
  • Ajout de la queue poly-A par une enzyme appelée poly(A) polymérase
28
Q

Quels sont les rôles de la queue polyA ?

A
  • protège l’ARNm de la dégradation
  • facilite son exportation du noyau vers le cytoplasme
  • rôle dans l’initiation de la traduction
  • régulation de la durée de vie de l’ARNm dans le cytoplasme
29
Q

Quels sont les deux scénarios de régulation de l’ARNm ?

A
  • stabilité de l’ARNm : La dégradation des ARNm peut être régulée en fonction des signaux cellulaires, influençant ainsi l’expression des protéines
  • Micro-ARN et autres régulateurs : Ces petits ARN peuvent se lier à des ARNm spécifiques, réprimant leur traduction ou accélérant leur dégradation.
30
Q

Quels sont les modifications qui peuvent avoir lieu lors de la maturation des U-snRNA ?

A
  • Méthylation dans le cytoplasme : Après la formation des snRNPs, deux groupements méthyl sont ajoutés sur la guanine à l’extrémité 5’, formant une coiffe hyperméthylée (m7,2,2 GpppN).
  • Retour dans le noyau : Une fois méthylés, ces snRNPs matures retournent dans le noyau, où ils participent à l’épissage. Ces modifications sont nécessaires pour leur fonctionnalité dans le noyau et pour leur rôle dans l’épissage de l’ARNm.
31
Q

Quelles sont les étapes de la première réaction de l’épissage ?

A

Réaction de transestérification:
- Reconnaissance du site d’épissage 5’ : Le snRNP U1 reconnaît et se fixe au site d’épissage 5’ (au niveau de la jonction entre l’exon 1 et l’intron)
- Le snRNP U2 se fixe au point de branchement
- Le 2’-OH (hydroxyle) du résidu d’adénine au niveau du point de branchement effectue une attaque nucléophile sur le groupement phosphate du site d’épissage 5’ (entre l’exon 1 et l’intron).
- Clivage de la liaison entre l’exon 1 et l’intron
- l’extrémité 5’ de l’intron est maintenant liée à l’adénine du point de branchement via une liaison phosphodiester 2’-5’, formant une structure en lasso (ou lariat).

32
Q

Quelle sont les étapes de la seconde réaction d’épissage ?

A
  • Reconnaissance du site d’épissage 3’ : Le snRNP U5 aide à rapprocher l’extrémité 3’ de l’exon 1 (clivé) et l’extrémité 5’ de l’exon 2 (située juste après l’intron).
  • Le groupement 3’-OH de l’exon 1 (qui a été libéré lors de la première réaction) effectue une attaque nucléophile sur le groupement phosphate du site d’épissage 3’ (entre l’intron et l’exon 2).
  • clivage de la liaison entre l’intron et l’exon 2, et la liaison phosphodiester est formée entre les deux exons.

Biochimie III (4 decks)

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