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Quimioinformática > Introducción al Diseño de Fármacos Asistido por Computadora > Flashcards

Introducción al Diseño de Fármacos Asistido por Computadora Flashcards

1
Q

Etapas del desarrollo de un fármaco

A

Descubrimiento del fármaco
Desarrollo preclínico
Desarrollo clínico
Aprobación por las autoridades sanitarias
Fase IV

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Q

Descubrimiento del fármaco

A

Selección de la diana
Busqueda de la molécula de partida
Optimización de la molécula de partida
Evaluación de características farmacológicas

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3
Q

Desarrollo preclínico

A

Farmacocinética (prueba con animales)
Toxicología a cortoplazo
Formulación
Síntesis a gran escala

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4
Q

Desarollo clínico

A

Contiene Fase 1, 2 y 3

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5
Q

Fase 1

A

Farmacocinética (ADME), tolerabilidad, efectos secundarias en voluntarios sanos.

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6
Q

Fase 2

A

Ensayos a pequeña escala en pacientes para valorar eficacia y dosis. Estudios toxicológicos a largo plazo

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7
Q

Fase 3

A

Ensayos clínicos controlados a gran escala

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8
Q

Fase IV

A

Vigilancia tras la comercialización

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9
Q

Diana

A

El proceso de enzima-sustrato.

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10
Q

Hits

A

Molécula que muestra actividad biológica en un ensayo dado

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11
Q

Métodos para la busqueda de la molécula de partida

A

Métodos tradicionales y ensayos biológicos
u otras estrategias con ensayos de alto rendimiento

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12
Q

Métodos tradicionales

A

Síntesis orgánica
Productos naturales

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13
Q

Otras estrategias

A

Química combinatoria
Métodos computacionales

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14
Q

Química combinatoria

A

Sintesis de una gran cantidad de compuesto estructuralmente relacionados mediante la combinación sistemática de estructuras más pequeñas

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15
Q

High throghput screening (HTS) Cribado de alto rendimiento

A

Es el proceso de probar compuestos químicos y otras sustancias para observar su interacción con materiales biológicos. El equipo de laboratorio puede analizar muchas muestras diferentes a la vez, con el objetivo de encontrar una reacción para estudiar más a fondo.

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16
Q

Diseño de fármacos asistidos por computadora

A

Aplicación de procesos realizados por las computadores para relacionar la actividad biológica de un compuestos con su estructura química

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17
Q

Como se divide el CADD

A

-CADD basado en estructura
-CADD basado en ligando

18
Q

Entre las opciones que hay ¿Cómo se elige la más adecuada?

A

Considerando que el enfoque debe ser basado en la resolución de un problema y no en la aplicación de una técnica

19
Q

Polifarmacología

A

Un fármaco puede modular múltiples blancos terapéuticos haciendo que su efecto terapéutico sea mayor que al modular uno solo de los blancos

20
Q

¿Cuál etapa es la apropiada para acortar el desarrollo de un fármaco?

A

El desarrollo clínico

21
Q

El reproposicionamiento de fármacos fue una de las estrategias utilizadas contra el COVID ¿A que se refiere esto?

A

Se hizo uso de la polifarmacología para poder encontrar nuevos compuestos que puedan ir contra el COVID

22
Q

¿Por qué se suele utilizar DIFAC?

A

-Disminuir el número de experimentos
-Disminuir los costos asociados
-Priorizar la realización de experimentos

23
Q

¿Qué otras disciplinas son parte de DIFAC?

A

Modelado molecular, quimioinformática, bioinformática, química teórica

24
Q

Nombra alguna de las herramientas útiles para el descubrimiento de fármacos

A

DiFAC
Farmacología
Química combinatoria
HTS

25
Q

¿En qué se basan los métodos basados en la estructura del receptor?

A

Conocer donde se puede unir una molécula pequeña

26
Q

Menciona los tres métodos usados en el método basado en la estructura del receptor

A

Acoplamiento molecular
Modelado de farmacóforo
Diseño de novo

27
Q

Acoplamiento molecular

A

Modelar el proceso de reconocimiento molecular entre una molécula pequeña y una macromolécula biológica para poder predecir su modo de unión y afinidad

28
Q

¿Qué se debe considerar en el acoplamiento molecular?

A

Modelar las conformaciones de los ligandos
Modelar conformaciones del receptor
Modelar la interacción entre ellas (Función de evaluación)
Implementar un algoritmo para encontrar la mejor solución posible

29
Q

farmacóforo

A

Conjutno de rasgos estructurales en una molécula que es reconocido por un receptor y responsable de la actividad biológica de esa molécula

30
Q

Aspectos a considerar del modelado de farmacóforo

A

Un sitio de unión puede dar lugar a múltiples farmacóforos
Modelar conformaciones de los ligandos (moléculas pequeñas)
Evaluar el ajuste del ligando al farmacóforo

31
Q

Diseño de novo

A

Diseño de moléculas de cero, para esto es necesario concoer el sitio de unión

32
Q

¿Cuáles son los métodos utilizados para el diseño de novo?

A

Cambiar el grupo R, crecimiento, unión, evolución, con una plantilla o síntesis

33
Q

Aspectos a considerar en el diseño de novo

A

La factibilidad sintética de los compuestos no está garantizada
La diversidad de los compuestos está limitada por los fragmentos iniciales y las reglas de combinación usadas
Propiedades fisicoquímicas desconocidas

34
Q

Métodos basados en la estructura del ligando

A

Se necesita conocer la estructura de al menos un ligando con actividad.

35
Q

Menciona los métodos basados en la estructura del ligando

A

Similitud molecular, modelado de farmacóforo, diseño de novo, QSAR

36
Q

Similitud molecular

A

Moleculas similares tendrán propiedades similares. Se tiene un ligando específico y una serie de compuestos (base de datos molecular), se ordenan de mayor a menor y los que se parezcan más son los primeros en hacer las pruebas

37
Q

Aspectos a considerar de similitud molecular

A

-Depende de la representación empleada
-Depende del método de comparación
-La diversidad de las moléculas seleccionada no suele ser muy grande

38
Q

Modelado de farmacóforo en ligandos, aspectos a considerar

A

-Generar hipótesis sobre los modos de unión de los ligandos
-Suponer que distintos ligandos actúan sobre el mismo sitio de unión
-Múltiples farmacóforos posibles

39
Q

Diseño de novo en ligandos

A

Para hacerlo se necesita conocer al menos un ligando con actividad, y se realiza una retrosíntesis

40
Q

Aspectos a considerar del diseño de novo

A

-Modo de unión desconocido
-La diversidad de los compuestos esta limitada por los fragmentos iniciales y las reglas de combinación usadas
-Propiedades fisicoquímicas desconocidas

41
Q

Relaciones cuantitativas estructura-actividad (QSAR)

A

Construcción de un modelo de regresión que establezca la relación entre la estructura de las moléculas con actividad biológica conocida y la actividad experimental de las mismas

42
Q

Aspectos a considerar de QSAR

A

-Dependientes de la descripción de las moléculas
-Dominio de aplicación limitado
-NO es exacto aunque es un método cuantitativo

Quimioinformática (2 decks)

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