Intra Flashcards
1
Q
Est-ce qu’une personne malade a plus de virus qu’une personne saine ?
A
Non, suite à une comparaison de virus entre patients sains et malades, il a été découvert qu’une personne saine avait autant de virus qu’une personne malade
2
Q
Est-ce que porter des virus est signe de maladie ?
A
Non, car on a tous des virus
3
Q
Pourquoi c’est impossible pour le moment de voir tous les virus ?
A
Car on n’a pas encore de techniques comme pour les bactéries
Les techniques d’isolation sont trop grossières pour un virus
La majorité des séquences qu’on a sont inconnues
On ne sait pas comment faire pour maintenir le virus en laboratoire
4
Q
Quel est l’impact avec un virus que tous les être humains aient un génome différent ?
A
Les humains vont réagir différemment à un même virus. C’est pourquoi certains peuvent mourir de la grippe. On peut être susceptible ou pas
5
Q
Qu’Est-ce que le virome inclut ?
A
virus des eucaryotes
endorétrovirus
virus des bactéries
aussi : virus de virus
6
Q
Est-ce que tous les virus sont pathogènes ?
A
Non, beaucoup de virus sont pathogènes, mais d’autres vivent aussi en symbiose avec leur hôte. Beaucoup nous infectent mais ne causent pas de symptômes apparents aussi
7
Q
Qu’Est-ce qu’un endorétrovirus ?
A
C’est un virus à ARN. une fois dans sa cellule hôte, il va produire un ADN db qui va s’intégrer à l’intérieur du génome de la cellule
8
Q
Qu’arrive-t-il si un endorétrovirus infecte une cellule germinale ?
A
Il va y avoir transmission du virus à la descendance, car il s’est intégré au génome de la cellule
9
Q
Parmi les virus des eucaryotes, en quelles catégories peut-on les classer ?
A
pathogènes
neutre ou symbiote
associés au cancer
émergents
10
Q
Les virus infectent quoi ?
A
TOut ce qui est vivant sur terre, même les virus eux-mêmes
11
Q
QUelles sont les conséquences de l’évolution rapide des virus ?
A
Leurs mutations très fréquentes leur permettent de franchir les barrières de l’hôte et de créer des maladies émergentes.
12
Q
Vrai ou faux : le nombre de gènes que possède un virus est proportionnel à sa pathogénicité.
A
Faux. L’un des virus les plus mortels sur Terre est l’hépatite B et il possède uniquement 4 gènes
13
Q
À quoi ressemblent les virus ?
A
Ils ont des tailles, formes, grosseurs et matériel génétique différents. Ils sont tous uniques
14
Q
Comment s’est faite la découverte des virus ?
A
Elle s’est fait grâce à un filtre utilisé pour l’eau à boire : le filtre de Chamberland-Pasteur.
Un scientifique a analysé le filtre pour essayer de déceler les bactéries qui donnaient des taches brunes sur les feuilles de tabac. Suite à l’analyse du filtre, il n’a rien découvert.
Un deuxième scientifique est parvenu à transmettre la maladie de plante en plante grâce au filtrat. Il croyait que la maladie était une toxine, car ça pouvait être assez petit pour passer à-travers le filtre.
Un troisième scientifique a découvert que c’était des virus suite à une analyse du filtrat et à plusieurs passages pour être certain d’éliminer les toxines
15
Q
Qu’Est-ce qu’un virus ?
A
C’est l’agent infectieux à tous les stades du cycle viral, extracellulaire ou intracellulaire
16
Q
Est-ce qu’un virus est infectieux ?
A
Non, le terme virus inclus le stade infectieux et non infectieux, selon le stade
17
Q
qu’Est-ce qu’un virion ?
A
c’est la particule virale infectieuse complète
18
Q
Est-ce qu’un virion est infectieux ?
A
oui !
19
Q
De quoi est constitué un virion ?
A
Génome (ADN ou ARN) + Capside
20
Q
Qu’Est-ce qu’un capside ?
A
C’est composé de protéines et ça entoure le génome du virion pour le protéger
21
Q
Qu’est-ce qu’un virus nu ?
A
C’est un virus avec un une nucléocapside, soit un génome et une capside.
22
Q
Qu’est-ce qui caractérise un virus enveloppé ?
A
Il va avoir une enveloppe de nature lipidique qui enveloppe la nucléocapside
23
Q
Que peut coder le génome contenu dans un virus?
A
Des protéines de structure qui constituent la capside et l’enveloppe
Des enzymes nécessaire à la réplication (pas tous)
Des protéines de régulation qui se fixent sur les promoteurs viraux pour les activer ou réprimer
24
Q
Pourquoi ce ne sont pas tous les virus qui possèdent un génome codant pour des enzymes de réplication ?
A
Parce que certains virus utilisent la machinerie de réplication de leur hôte
25
Que signifie le « + » pour un virus à ARN sb + ?
Ça signifie que l'ARN est de polarité positive. Le génome du virus ressemble à un ARNm et va directement être pris en charge par les ribosomes de l'hôte.
26
Que signifie le « - » pour un virus à ARN sb - ?
L'ARN est de polarité négative. Il doit être transformé en ARN à polarité positive avant d'être traduit
27
Pourquoi la capside ne peut pas être composé d'une seule grande protéine ? De quoi est-elle composée ?
Parce que le génome du virus est trop petit , la protéine «consommerait» toute l'information génétique.
La capside est composée d'un assemblage de sous-unités protéiques.
Il peut y avoir un seul type de sous-unité (petits virus) jusqu'à une dizaine (pour les plus gros virus)
28
Quelles sont les fonctions de la capside ?
Elle protège le génome viral
| Elle aide à la fixation du virus sur sa cellule cible
29
Dans quel cas la capside aide à la fixation du virus sur sa cellule cible ?
Quand le virus est nu, donc ne possède pas d'enveloppe
30
Comment le virus assemble-t-il sa capside ?
C'est un auto-assemblage selon un arrangement symétrique.
Chez certains virus, l'assemblage nécessite des protéines échafauds
Chez d'autres virus, il y a une phase terminale de maturation par des protéases
31
À quoi sert la phase terminale de maturation par des protéases chez certains virus et donner un exemple
C'est une étape essentielle pour rendre le virus infectieux
| Elle est utilisée chez le VIH
32
Donner un exemple de virus qui utilise des protéines échafaud pour l'assemblage de la capside
Virus de l'herpes simplex
33
Quelles sont les unités retrouvées dans la capside et quelles sont-elles ?
Protomère : sous-unité protéique de structure
Capsomère : unité formée par l'assemblage de sous-unités de structure, identiques ou différentes
Capside : Revêtement protéique obtenu par l'assemblage des capsomères
34
Quelles sont les types de capsides que l'on peut retrouver ?
Hélicoidale
Icosaédrique
Complexe (bactériophages)
35
Comment déterminer si les protéines qui forment la capside sont identique ou non ?
On fait un migration sur gel d'acrylamide des virus, comme ca, toutes les bandes vont correspondre à un type de sous-unité protéique
36
Combien de protomère(s) possède le virus du tabac ?
Un seul, c'est la même sous-unité protéique qui forme la capside hélicoidale du virus du tabac
37
Jusqu'à combien de sous-unités protéiques peut-on trouver dans une capside de forme hélicoidale?
L'assemble de la capside est toujours formé d'un seul type de protomère
38
COmment vont s'assembler les sous-unités d'une capside hélicoidale en premier lieu ?
Elles vont s'assembler automatiquement en forme de beignet constitués d'une double couche d'unités de structure. (2 beignet un au-dessus de l'autre)
39
COmment fait le génome d'un virus à capside hélicoidale pour s'insérer ?
Les doubles beignets formés par les protomères possèdent des formes particulières qui forment des sites de reconnaissances particuliers pour les acides nucléiques des virus. Le génome va ainsi pouvoir s'incruster dans le disque formé de manière spécifique.
Suite à la fixation du génome, ça va enclencher l'initiation de l'auto-assemblage de la capside.
40
Quels sont les 5 paramètres pour définir un virus à capside hélicoidale ?
Le nombre de sous-unité protéique par tour
Le pas de l'hélice
L'angle thêta (angle formé entre l'axe central de la capside et le centre de 2 sous-unités)
La distance entre 2 sous-unités
La longueur de la structure du virus
41
Comment est constituée une capside icosaédrique ?
C'est une forme géométrique obtenue par l'assemblage de 20 triangles équilatéraux
42
Quelles sont les caractéristiques géométriques d'une capside icosaédrique?
20 triangles (20 faces)
12 sommets
30 arrêtes
12 pentamères (Chaque sommet est entouré de 5 autres)
6 hexamères (Chaque face est entourée de 6 autres)
43
COmment les virus à capside icosaédrique peuvent avoir des tailles différentes ?
Grâce au nombre de triangulations. Plus il y en a, plus le virus va être gros.
Une triangulation correspond au nombre de fois qu'une face peut être divisée
44
Comment doit être un virus pour être classé dans la catégorie des capsides complexes ? Donner 2 exemples
Le virus possède une capside qui n'a pas de symétrie précise
Phage T4
Poxvirus (variole)
45
Pourquoi l'enveloppe des virus enveloppés est de nature lipidique ?
Car le virus vole la membrane lipidique de son hôte en traversant une membrane. C'est pourquoi l'enveloppe possède les caractéristiques lipidiques de la même nature que la cellule infectée.
46
De où proviennent les enveloppes des virus enveloppés et donner un exemple?
Membrane cytoplasmique (rougeole)
Membrane nucléaire (herpes)
Réticulum endoplasmique (fièvre jaune=flavivirus)
certains prennent aussi l'appareil de Golgi
47
que rajoutent les virus enveloppés sur leur enveloppe ?
Les virus vont rajouter leurs déterminants viraux, comme des glycoprotéines, qui vont se lier aux récepteurs cellulaires de manière spécifique pour infecter de nouvelles cellules. Suite à la fixation aux récepteurs de la membrane cellulaire, l'enveloppe peut fusionner avec la membrane par endocytose et permettre l'introduction du nucléocapside dans la cellule (ex:VIH)
48
À quoi servent les glycoprotéines de l'enveloppe des virus ?
Reconnaitre des cellules cibles pour les infecter
49
Expliquer les étapes de l'acquisition de l'enveloppe par les virus enveloppés
1- Le virus entre dans la cellule cible
2- Le virus exprime son génome et produit les protéines qui vont constituer la surface du virus
3- Les protéines de la capside vont s'assembler pour former la nucléocapside
4- La nucléocapside va migrer vers la membrane plasmique où ont été insérées les glycoprotéines
5- Bourgeonnement qui va faire sortir le virus avec la membrane de l'hôte
50
QUelles enzymes peuvent être exprimées par les virus ?
Polymérases, intégrases et autres protéines associées (surtout les virus enveloppée)
Protéases
Enzymes de modification (Ajout de la coiffe sur l'ARNm)
Poly-A polymérase
Topoisomérase
51
Qu'Est-ce que la classification de Baltimore ?
C'est la classement des virus en 7 groupes basé sur la stratégie de réplication.
1- ADN db (produit un ARNm en entrant dans l'hôte)
2- ADN sb (doivent former un ADN db)
3- ARN db (produit un ARNm)
4- ARN sb + (sert directement d'ARNm)
5- ARN sb - (doit faire un intermédiaire +)
6- ARN sb + (nécessite une transcriptase inverse qui va créer un ADN pour s'insérer dans le génome cellulaire, pour ensuite produire un ARNm viral)
7- Comme la classe 1, mais l'ADN db est partiel
52
Expliquer les étapes principales d'une infection virale avec l'hôte
1- Le virus va se disséminer dans l'hôte, ce qui va mener à l'induction de la RI innée, puis adaptatrice
2-Période d'incubation silencieuse, car pas de symptômes apparents
3- Apparition des symptômes
4- La réponse immunitaire va soit éliminer le virus, ou le virus va se cacher
53
Qu'Est-ce qu'un réservoir ?
c'est la source des virus infectieux.
souvent l'homme
le réservoir doit permettre une réplication dynamique du virus afin qu'il soit capable d'initier un nouveau cycle
54
Quels peuvent être les modes de transmission des virus ?
Respiration, salive (rhinovirus, influenza, rougeole)
Transfusion sanguine (VIH, Hépatite B-C)
Fécal à oral (Rotavirus, hépatite A, Norovirus)
Sexuelle (VIH, virus papillome humain, herpes)
mère-enfant (VIH, hépatite B-C)
Vecteurs (virus du Nil, fièvre jaune)
Zoonose
latrogène (dans les hôpitaux)
55
Quels sont les paramètres de la sévérité d'une infection?
État immunologique de l'hôte
Quantité d'inoculum
État physique (stress, malnutrition, autres maladies)
Niveau économique (disponibilité du traitement)
56
Lors du cycle réplicatif du virus, Quels sont les impacts que peuvent avoir des mutations ou changements génétiques du virus ?
Diminution de la virulence, réduction des symptômes chez l'hôte
Avirulence, disparition de la maladie
Augmentation de la virulence
57
Que peuvent être les portes d'entrée des virus chez l'humain ?
```
respiratoire (grippe)
digestive (poliomyélite)
oculaire (adénovirus)
cutanée (verrues)
piqure d'insecte (fièvre jaune)
morsure (rage)
après inoculation (hépatite B)
génital et bucco-pharyngienne (Herpes simplex 2, VIH, Hépatite B)
```
58
Lors de la réplication du virus au site d'infection, dans quels cas l'étape peut être longue ?
Le nombre de virus entrant est limité (ex: vecteur)
| La réponse immunitaire ralentit la réplication
59
Combien de temps prend la réplication du virus dans son hôte ?
De quelques heures à quelques années
| Dans certains cas, l'infection avorte
60
Comment font les virus pour se propager dans l'organsime infecté ?
De proche en proche par contact intercellulaire
Par les voies lymphatiques
Par la circulation sanguine (souvent transitoire)
Le long des trajets nerveaux
61
Comment est caractérisée une infection virale localisée vs généralisée?
la porte d'entrée du virus correspond à son lieu d'infection
| le virus entre dans l'organisme et va voyager par le sang/lymphe pour atteindre d'autres cibles
62
COmment se produit la multiplication d'un virus ?
Il doit obligatoirement entrer dans une cellule qui les accepte, à l'aide de récepteurs de surface qui se lient aux structures virales
63
Qu'Est-ce que le tropisme cellulaire d'un virus ?
| Donner un exemple
C'est la préférence d'un type cellulaire par rapport à un autre
Pour certains virus il faut juste un récepteur alors que pour d'autres il faut aussi un co-récepteur
VIH : préférence pour les cellules T et macrophages (CD4 et CCR5) grâce à sa protéine GP120
64
Que fait le virus à la cellule lors de son cycle de réplication
Il induit des changement subtils ou profonds qui peuvent induire des disfonctionnements cellulaires et créer la maladie
Il utilise sa machinerie de réplication pour produire de nouveaux virions
65
Est-ce que le virus est responsable de l'apparition de la maladie?
De manière indirecte oui, mais c'est surtout le système immunitaire qui lutte contre le virus qui cause les symptômes.
l'infection dépendant autant de l'hôte que du virus
66
Expliquer les étapes de la réplication du virus de l'entrée dans la cellule jusqu'à la sortie des nouveaux virus
1- interaction avec les récepteurs cellulaires spécifiques à la surface de l'hôte et pénétration du gnome viral dans la cellule
2- Expression des gènes viraux par la cellule hôte
3- Les protéines virales modifient la cellule hôte et permettent au génome viral de se répliquer en utilisant les enzymes de l'hôte et les enzymes virales
4- Assemblage des protéines de la capside virale et inclusion du gnome viral
5- Relargage des virus (souvent par lyse cellulaire) et reprise du cycle sur une nouvelle cellule
67
QUels sont les 3 possibilités d'infection d'un virus ?
infection productivve
infection abortive
latence (induction de changements/transformation de la morphologie, biochimie ou paramètres de croissance de la cellule)
68
Quelles sont les caractéristiques du virus qui permettent la force de l'infection ?
génotype viral (+ virulent ou - virulent)
quantité d'inoculum viral
compétence immunologique de l'hôte
69
Qu'Est-ce que l'infection lytique?
c'est lorsque les cellules infectées sont détruites en libérant les nouveaux virus
70
Qu'est-ce que l'infection tempérée ?
c'est quand les cellules résistent à l'infection, mais gardent soit des particules virales dans leur cytoplasme, soit des informations virales intégrées dans leur génome
71
qu'Est-ce que l'infection transformante ?
C'est lorsque les cellules résistent à l'infection, mais leur fonctionnement physiologique est modifié (ex: cancer)
72
Quelles sont les défenses non-spécifiques de l'hôte pour prévenir les infections ?
barrière cutanéo-muqueuse (obstacle mécanique à l'entrée des virus dans les tissus, des molécules présentes dans le sang et à la surface des muqueuses ont des analogies structurales avec les récepteurs cellulaires se lient aux virus et empêchent leur fixation aux cellules, donc pas de réplication)
interférons (glycoprotéines sécrétées par les cellules infectées qui bloquent la réplication virale. Les IFN type I induisent la synthèse de protéines antivirales dans la cellule pour bloquer la traduction des ARNm)
Phagocytose et macrophages (Les virus ne peuvent pas se répliquer dans les macrophages qui détruisent les particules virales, à l'aide de l'IL-2, IFNgamma ou TNF)
73
Quelles sont les défenses spécifiques de l'hôte pour se protéger des virus?
```
anticorps (Détectent les antigènes à la surface des virus, s'y fixent et empêchent leur attachement aux cellules et activent le système du complément par l'activité ADCC)
Lymphocytes T (l'antigène viral exprimé à la surface des cellules et une cible pour les cell T cytotoxiques et les NK et les cell T stimulent les monocytes et macrophages pour augmenter la défense)
```
74
QUelles sont les voies de sortie du virus pour la dissémination ?
les mêmes que les portes d'entrée
75
Qu'Est-ce que la pathogénèse ?
Étude des infections sur un hôte (virus + mode de transmission + RI de l'hôte)
76
Qu'est-ce que la pathogénicité?
c'est la somme des fonctions virales qui contribuent à la propagation du virus dans la cellule infectée, l'organisme ou la population
Le facteur majeur de la pathogénicité est le génotype
77
qu'Est-ce que la virulence ?
c'est la sévérité des symptômes d'une maladie dans un organisme ou une population (combinaison entre expression des gènes viraux de pathogénicité, réponses physiologiques de l'individu face au virus et réponse de la population en présence du virus)
78
qu'Est-ce qu'une épidémie ?
Se définit par un nombre de nouveaux cas anormalement élevés sur une période de temps et sur un territoire limité
79
qu'Est-ce qu'un endémie ?
se définit par un nombre de cas anormalement élevés sur un territoire limité , mais sans limite de temps
80
Qu'Est-ce qu'une pandémie ?
Se définit par un nombre de cas anormalement élevés sur une période de temps limitée, mais non-limitée dans l'espace
81
Quelles sont les méthodes pour observer un virus ?
Microscopie électronique (reconstruction des images par ordinateur)
82
Quelles sont les méthodes pour compter les particules virales?
Microscope électronique (pas de différence entre particules infectieuses ou inactives, le compte dépend de l'habileté de l'expérimentateur)
Hémagglutination (indirect) (ne renseigne pas sur l'activité de la particule virale)
83
Quelles sont les méthodes pour analyser la réplication et mesurer l'activité biologique des virus?
```
Culture cellulaire (car les virus ne se répliquent que dans des cellules, Culture primaire, cellules en système semi-continu ou lignées continues (immortalisées))
Résultats de l'infection virale sur les cellules (destin du virus : infection productive ou non-productive, destin de la cellule :changement dans l'apparence physique ou chimique)
Mesure de l'activité biologique des virus par essai en plaque ou par essai quantal (dilutions)
```
84
Dans quels cas une infection virale peut être non-productive ?
La cellule qui a été infectée par le virus est non-permissive (ne possède pas la machinerie nécessaire à la réplication)
Virus avec des gènes défectifs
85
Quelles sont les méthodes pour analyser les protéines structurales des virus ?
Isolement des virus par gradient de densité
Isolement des virus par centrifugation différentielle
électrophorèse en condition dénaturante des protéines
86
Quelles sont les méthodes d'analyse du génome viral ?
Séquençage pour analyser la séquence
Analyse de la taille du génome par électrophorèse sur gel d'agarose ou microscopie électronique
Détection de la présence du génome viral par southern blot ou PCR ou rt-PCR
87
Quelles sont les méthodes pour analyser les produits viraux dans la cellule infectée ?
Marquage des protéines virales nouvellement synthétisées après différents temps d'infection
Détection des protéines virales pas immunofluorescence
isolement des protéines virales par chromatographie d'affinité
Analyse de l'immunité médiée par les cellules T
Mesure des anticorps antiviraux
Mesure de la production d'IFN
