Intra 1 Flashcards
Qu’est-ce que la définition de la cellule
La cellule est le plus petit commun dénominateur de la matière vivante (Heillbrunn)
Que son les propriétés de la cellules
Maintiennent une barrière sélective
Héritent et transmettent du matériel génétique
Possèdent une machinerie métabolique
Montrent diverses formes de motilité
Que son les 3 domaines du monde des vivants
Procaryotes: Archea, Eubacterie
eucaryotes
Qu’est ce que la description d’une cellules procaryotes
Absence de noyau
* Peu d’organelles
– Inclusions cytoplasmiques
– Thylakoïdes
* Très riches et variées biochimiquement
Qu’est ce que la description d’une cellules eucaryotes
Possèdent un noyau
Riches en organelles
– Noyau
– Mitochondries
– Réticulum endoplasmique
– Complexe golgien
– Lysosomes
– Peroxysomes
– Chloroplastes
Qu’elle type de cellule est plus petit
les cellules procaryotes
Que son les caractéristiques de l’ADN des archées
bicaténaire, circulaire ou linéaire, dans le cytoplasme, associé à des protéines semblables aux histones, présence d’intron, 1 seul chromosome, petit génome et peu contenir des plasmides
Que son les caractéristiques de l’ADN des bactéries
Bicaténaire, circulaire, dans le cytoplasme, associé à des protéines peu semblables aux histones, absence d’intron, 1 seul chromosome, petit génome et peu contenir des plasmides
Que son les caractéristiques de l’ADN des eucaryotes
Bicaténaire, linéaire,Très long, avec régions codantes et d’autres non codantes, confiné dans le noyau, associé aux histones, présence d’intron, plusieurs chromosomes et génome important
étape de la transcription de l’ADN d’une cellule eucaryote
transcription, maturation de l’ARN et traduction
étape de la transcription de l’ADN d’une cellule procaryote
transcription et traduction
Que son les caractéristiques de la synthèse de l’ARNm et des protéines des archées
ARN et protéines synthétisées dans le cytoplasme, la transcription de l’ADN en ARNm et la traduction de l’ARNm en protéines s’effectuent simultanément, ARN polymérase similaire aux eucaryotes, Ribosomes 70S
Que son les caractéristiques de la synthèse de l’ARNm et des protéines des bactéries
ARN et protéines synthétisées dans le cytoplasme, la transcription de l’ADN en ARNm et la traduction de l’ARNm en protéines s’effectuent simultanément, ARN polymérase moins complexe que les eucaryotes, Ribosomes 70S
Que sont les caractéristiques de la synthèse de l’ARNm et des protéines des eucaryotes
Transcription de l’ADN en ARN se fait d’abord dans le noyau, La traduction de l’ARNm en protéine s’effectue dans le cytoplasme, Remodelage de l’ARN précurseur (ARNhn, ARN hétérogène) en ARNm mature et Ribosomes 80S (1S = 10^-13s)
Comparaison du cytosquelette pour les cellules procaryotes et eucaryotes
procaryotes : peu développé
eucaryotes: très développé
Comparaison du métabolisme pour les cellules procaryotes et eucaryotes
procaryotes : extrêmement diversifié
eucaryotes: peu diversifié
Comparaison de la division cellulaire pour les cellules procaryotes et eucaryotes
procaryotes : fission binaire
eucaryotes: mitose, méiose
Qu’est-ce que la définition du virus
Fragment de matériel génétique ADN ou ARN entouré d’un manteau protéique (capside) et dans certains cas d’une enveloppe membranaire additionnelle, les virus sont des organismes non- vivants
Qu’est-ce que la structure du virus
10 nm à 300 nm de diamètre
* Acides nucléiques mono ou bicaténaire
* Quelques gènes à une centaine
Que son les stratégie virale du virus
- Parasites intracellulaires obligatoires (pas de croissance ni de division)
- Attaque virulente (cycle lytique)
- Attaque tempérée (cycle lysogène)
Que son les caractéristiques du vivant retrouvées chez le virus
- Hautement organisée (macromolécules)
- Reproduction
- Mais ne possède pas de machinerie
- Donc, pas de photosynthèse, ni respiration, ni fermentation.
Qu’est ce que la définition de la différentiation chez les organismes pluricellulaires
Acquisition de caractères spécifiques en vue d’une fonction spécifique.
Qu’est ce que la cryptobiose
C’est un état complètement arrêté du métabolisme
Pour les Spores et kystes c’est une formes de résistantes aux mauvaises conditions
Pour certains invertébrés c’est l’Anhydrobiose
– Ex. Tardigrades
» Organismes capables de survivre à la dessiccation sans produire de structures résistantes
Que son les états de l’eau
– Eau libre
* Libres de ses mouvements
* Disponible comme solvant
– Eau liée
* N’a plus sa liberté
* Peu ou pas disponible comme solvant
Qu’est ce que la définition de l’ADN
– Polymère formé de 2 chaines de désoxyribonucléotides
* Désoxyribonucléotides
– Base azotée + désoxyribose + groupement phosphate
* Bases azotées
– Dérivés de la purine ou pyrimidine
– 4 bases azotées
* Adénine (A) et guanine (G) = purines
* Cytosine (C) et thymine (T) = pyrimidines
Que son les fonctions des nucléotides
- Transport d’énergie
- Coenzyme
- Messager chimique
Qu’est ce que la définition de l’ARN
– Chaîne unique de ribonucléotides
* Particularités
– Le ribose est le sucre de l’ARN
– L’uracile (U) remplace la thymine (T)
– Possibilité de former des structures en épingle
Qu’elle est la classification de l’ARN
– ARN messager (ARNm)
* Molécule transcrit à partir d’un gène codant pour une protéine
– ARN de transfert (ARNt)
* Molécule servant d’adaptateur pour la traduction
– ARN ribosomal (ARNr)
* Molécule faisant partie de la structure d’un ribosome
– ARN nucléaire hétérogène (ARNhn, ARN prémessager)
* Transcrit primaire qui deviendra un ARNm après remodelage
Qu’est ce que la définition d’une protéine
– Un polymère constitué d’un grand nombre d’acides aminés unis par des liaison peptidiques et replié dans un configuration 3D.
Qu’est ce qu’un acide aminé
– Unité de base des protéines
– Présente un groupement aminé (NH2) ou iminé (NH) et un groupement carboxyle (COOH)
– Il existe 21 a.a. protéiques
Qu’est ce qu’une liaison peptidique
– Formée par les groupement COOH d’un a.a. et le groupement NH2 (ou NH) d’un autre a.a.
Qu’est ce qu’une chaînes latérales
– Le carbone α, qui lie le groupement COOH et NH2, porte également un atome d’hydrogène et un groupement variable (R) nommé chaîne latérale
– Chaque a.a. possède une chaîne latérale qui lui est spécifique
– Types : Polaires chargées, polaires non chargées, non polaire
Que son les étapes du cycle catalytique d’une enzyme
Le substrat entre dans le site actif, la forme de l’enzyme change pour s’ajuster au substrat, le substrat est transformé en produits, les produits sont libérés et le site actif est de nouveau prêt à accueillir le substrat
Que son les caractéristiques des lipides
– Famille très hétérogène
– Définis par leurs propriétés physiques
* Solubles dans les solvants des lipides
* Aspect et consistance (corps gras, visqueux)
Qu’elle est la classification des lipides
– Les triacylglycérols
– Les phosphoglycérolipides (phospholipides)
– Les glycolipides
– Le cholestérol
Que sont les triacyglycérols
- Esters de 3 acides gras avec le glycérol
Que sont les phosphoglycérolipides (phospholipides)
- Esters de 2 acides gras avec le glycérol + un groupement phosphate portant un ammonium quaternaire (selon les phospholipides)
- Molécules amphipathiques
- Constituants des membranes biologiques
Que sont les glycolipides
- Structure qui ressemble à celles des phospholipides : 2 chaînes d’acides gras + une tête hydrophile constituée d’un ou plusieurs sucres
- Molécule amphipathique
- Constituants des membranes biologiques
Qu’est ce que le cholestérol
- Comprend une structure plane (stéroïde) avec une queue d’hydrocarbure non polaire et une région hydrophile constituée par un groupement OH.
- Constituant des membranes biologiques
Qu’est ce que la définition des glucides
– Polyalcools qui portent soit une fonction aldéhyde ou cétone
Qu’elle est la terminologie des glucides
– Monosaccharides
* Type de glucides le plus simple
– Oligosaccharides
* Chaîne plus ou moins longue de monosaccharides liés les uns aux autres
– Polysaccharides
* Longue chaîne et complexe constitués de centaines de monosaccharides
* Source d’énergie ou de réserve (ex.: glycogène, amidon)
– Glycosaminoglycanes
* Longues chaînes polysaccharidiques non ramifiées
* Composées d’unités disaccharidiques répétées d’un des glucides est aminé
* Constituants de la matrice extracellulaire
Qu’est ce qu’un artéfact
Structure artificielle apparaissant lors de la préparation de l’échantillon pour son observation au microscope.
Qu’elle est un exemple de cause d’artéfact
Fixateurs
* Qui causent la précipitation ou coagulation de substances qui ne devraient pas avoir de structure dans la cellule
Comment peut on prouver qu’une structure n’est pas un artéfact
– Préparer les échantillons de différentes façons
– Utiliser avec différent fixateurs ou sans fixateur (congélation rapide et cryodécapage)
Que ce que la limite de résolution (d)
C’est une expression quantitative de la capacité de grossissement efficace d’un appareil optique.
La distance minimale (d) (centre à centre) de 2 points qui peuvent être distingués comme tels.
C’est quoi l’équation de la limite de résolution (d)
d = (0,61*longueur d’onde)/ouverture numérique(O.N.)
Quelle est la solution au problème du grossissement efficace en lumière visible
Amélioration de la limite de résolution en éclairant la préparation avec de courtes longueurs d’onde (ex. lumière bleue).
Quelle est la solution au problème du grossissement efficace en lumière ultraviolette
– À 200 nm on réussit à baisser de moitié la limite de résolution par rapport à la lumière visible (400 nm).
Que son les inconvénients à l’utilisation de la lumière ultraviolette
- Optique en quartz et non en verre qui est opaque aux U.V.
- Miroir à première surface (couche métallique non recouverte de verre)
- Invisible pour l’œil humain
Qu’est ce qui est utile d’utiliser le microscope électronique à transmission (MET)
L’utilisation d’un faisceau d’électrons comme source d’éclairage améliore la limite de résolution.
Au photonique la longueur d’onde moyenne est de 500 nm et la limite de résolution de 0,2 μm. Au MET à 100 000 V (avec O.N. de 0.01), on obtient un λ de 0,004 nm et une limite de résolution de 0,00025 μm… donc 1000 fois mieux.
(0,25 nm)
Le MET permet une meilleure résolution et donc un grossissement efficace plus fort.
Que son les contraintes de l’utilisation du MET
– Faire le vide
– Préparations très minces (0,5 μm)
– Cellules mortes
– Coût élevé
Que son les étapes de la préparation du matériel pour la coupe
Fixation, déshydratation, intermédiaire, inclusion, spécimen incorporé dans la paraffine, microtome
Q’est ce qu’un microtome
Le couteau est fixe, alors que le spécimen à couper est mobile.
Qu’est ce qu’un exemple d’artefact introduit lors de la préparation du spécimen
L’artéfact est causé par le rinçage du spécimen dans le toluène qui cause l’élimination du lipides
Qu’est que la différence entre un ultramicrotome et un microtome
utilisation du glutaraldéhyde, tétrode d’osmium, oxyde de propylène et de la résines de type epoxy puisque c’est plus résistants
Que sont les étapes de la préparation du cryodécapage
Congélation dans l’azote liquide et fracture grâce à une microhache
Que sont les étapes du cryodécapage
Fracture, décapage, ombrage et réplique
Que sont les différences entre une coupe et une fracture
couper(microtome): coupe mince sans relief
fracture(cryodécapage): fracture avec relief
Comment est ce qu’il améliore le contraste des préparations en photonique
- Colorants usuels
– Approche empirique - Technique que l’on juge strictement d’après le résultat
– Histocytochimie - Technique où l’on se questionne sur les raisons de la coloration (ex. Pourquoi un colorant colore-t-il une organelle différemment
d’une autre?) - Fluorochromes
– Fluorescence primaire - Substances qui fluorescent naturellement
– Fluorescence secondaire - Substance qui doivent être colorées par les fluorochromes
– Immunofluorescence - Cytoenzymologie
- Méthodes basées sur l’éclairage
– Permettent l’observation contrastée de cellules vivantes - Autoradiographie
Que ce que la fluorescence
Système additif des couleurs primaires
Qu’est ce qui arrive si on fait de la fluorescence en lumière bleu
Il n’y aura pas de couleur bleu
Que son les technique pour améliorer le contraste des prépations avec le MET
- Imprégnation métallique
- Coloration négative
- Ombrage
– Avec ou sans réplique - Cytoenzymologie
- Immunocytochimie
- Imunocytoenzymolgie
Qu’est ce que l’imprégnation métallique
Dépôt de métaux lourds sur les
membranes.
* Ex.: Pb, W, Os, Au, Pt
Qu’est ce que l’ombrage
L’ombrage se réalise uniquement
sur des structures tridimensionnelles
Qu’est ce que la cytoenzymologie
Immunocytochimie
* Anticorps couplée à la ferritine
– Protéine dense aux électrons
– Protéine de stockage du fer (Fe3+) dans le
foie
Immunocytoenzymologie
* Anticorps couplée à une enzyme
De quoi dépend le taux de sédimentation relatif des particules
Elle dépend de leur
taille, de leur forme et de leur densité,
Pourquoi est ce que le déplacement des particules dépend de la densité
elle dépend de la densité, puisque une particule migre dans le tube à centrifugation tant que sa densité est plus élevée que celle du milieu
Pourquoi est ce que le déplacement des particules dépend surtout de la taille
Leur taille peut varier de plusieurs ordres de grandeur. De plus la valeur de leur taille
étant portée au carré son impact sur le taux de sédimentation sera d’autant plus important.
Qu’est ce que la centrifugation zonale
Centrifugation basée sur l’équation de Stokes,
mais où l’homogénat est déposé en surface d’un
léger gradient de saccharose.
Que sont les fonctions de la membranes plasmique
- Délimite physiquement la cellule
- Détermine ce qui entre et ce qui
sort
Que fait la phase liquide de la membrane plasmique
Phase lipidique
– Fluide visqueux et non pas une
barrière rigide.
– Sépare 2 phases aqueuses
Qu’elle problème à la membrane plasmique au microscope
Sa taille est en dessous de la limite de
résolution du microscope
photonique
– Ce que nous observons est dû à un
gradient d’indices de réfraction entre
le cytosol et le milieu extracellulaire
Qu’est ce que Gorter et Grendel on trouver
L’analyse chimique:
* Hémolyse du globule rouge
* Extraction des lipides
* L’utilisation des érythrocytes a
l’avantage qu’ils ne possèdent que peu
d’organelles.
Comment est ce que Gorter et Grendel on extrait des lipides
- Extraction des lipides avec de l’acétone
(48 à 72 heures). - Évaporation de l’acétone et dissolution
du résidu dans du benzène. - Langmuir avait démontré que les lipides
s’étalaient en une monocouche lorsque
dissous dans du benzène.
Que sont les résultats de l’extraction de lipides de Gorter et Grendel
- Suffisamment de lipides pour faire une
double couche autour de la cellule. - Double artéfact : ils ont sous-estimé la
surface membranaire et effectué une
extraction partielle des lipides.
Qu’est ce que Schmitt, Bear et Clark on découvert
Détermination de la dimension des
couches superposées de protéines
et de lipides
Comment est ce que Schmitt, Bear et Clark on déterminer la dimensions des couches superposées des protéine et de lipides
Étude par diffraction des rayons-X de neurones
myélinisés, car la régularité de la structure de la
myéline le permet.
Qu’est ce que Danielli et Davson on trouvé
Le modèle paucimoléculaire
Qu’est ce que le modèle paucimoléculaire
Un premier modèle de la membrane
plasmique, basé sur les études chimiques
et de perméabilité, suivi de quelques
améliorations
Que sont les améliorations amené au modèle paucimoléculaire
1935
Bicouche de phospholipides avec des
protéines globulaires de part et d’autre
1937
Addition de protéines fibreuses pour
expliquer la grande cohésion mécanique
des membranes plasmiques.
1954
Addition de pores pour tenir compte de la
diffusion facilitée et du transport actif.
Qu’est ce que la découverte de robinson
Aspect de la membrane plasmique au
MET: 2 bandes sombres séparées par une
bande claire. Les métaux lourds se déposent sur les
parties hydrophiles des membranes.
Et Le glycocalyx: 1ère manifestation de l’asymétrie
membranaire
Que sont les experiences de Branton
Membrane vue par cryodécapage
Et Disposition des protéines dans la
membrane vue en cryodécapage
Que est la découverte de braton pour la membrane vue par criodécapage
- Nécessité d’un nouveau modèle de
membrane. - En cryodécapage la ligne de faille
passe entre les 2 couches de
phospholipides.
Que est la découverte de braton pour la disposition des protéines dans la membrane vue en criodécapage
3 types de membranes furent observées
1. Membrane artificielle composée de
phosphoglycérolipides
2. Membrane artificielle composée de
phosphoglycérolipides et de protéines
hydrophiles
3. Membrane artificielle composée de
phosphoglycérolipides et de protéines
hydrophobes
De quoi dépend le point de transition de phase de la membrane
Le point de transition de phase de la membrane dépend
de sa composition lipidique
Qu’est ce que le point de fusion
Le point de fusion est une zone de température
critique où une membrane donnée subit un
changement d’état.
Comment est ce que la la longueur des chaînes affecte le point de transition
- Chaînes longues = pt de transition élevée
(membrane plus épaisse) - Chaînes courtes = pt de transition bas
(membrane moins épaisse)
Comment est ce que le Degré de saturation des chaînes affecte le point de transition
- Beaucoup d’ac. gras saturés = point de
transition élevé - Beaucoup d’ac. gras non-saturés = point
de transition bas.
Que fait le cholestérol dans les membranes des eucaryotes
– Rend les membranes plus visqueuses.
– Empêche un changement d’état draconien au
point de transition de phase.
– Il réduit la précision du point de transition de
phase.
Qu’est ce que la conclusion sur le point de transition de la membrane
L’organisme ajuste la composition lipidique de
ses membranes afin que le point de transition
de phase se situe quelques degrés Celsius
sous la température de l’organisme.
– Les membranes sont donc très dynamiques.
Que sont les types d’asymétrie transversale des membranes
Asymétrie relative
* Phospholipides
* Cholestérol
Asymétrie absolue
* Glycolipides
Où peut on trouvé le radeaux lipidiques
dans le Golgi,
dans les vésicules de sécrétion et dans la
membrane plasmique
apicale ainsi que dans la membrane nucléaire
interne.
QUe sont les catégories de protéines membranaires
- Protéines intrinsèques * Protéines ancrées * Protéines enchâssées * Protéines extrinsèques
Que sont les rôles des protéines membranaires
- Adhérence cellulaire
- Pores membranaires, * Diffusion facilité,
- Transport actif, etc
Qu’est ce que l’asymétrie de composition des protéines membranaires
- Absolue * Ex.: Glycoprotéines
Qui sont les glucides membranaires
Glucose, glucosamine, galactose,
galactosamine, mannose, fucose, etc.
Que sont les structures permanantes de la membrane plasmique
- Microvillosités
- Cils et flagelles
- Intradigitations
- Interdigitations
Que sont les structures transitoires de la membrane plasmique
Endocytose: sorti dans le cytosol
Exocytose: rentre dans le milieu extracellulaire
Que sont les types de jonctions cellulaires
jonctions occlusives, jonctions d’adhérence et jonctions de communications
Que sont les jonctions occlusives
Zonula occludens
Que sont les jonction d’adhérence
Liées à l’actine
cellule – cellule
cellule – substrat
Liées au FI
cellule – cellule
cellule – substrat
Que sont les jonctions de communications
Jonction de type gap
Synapse chimique
Que sont les cas de transport membranaires
Cas des petites molécules et Cas des particules et des macromolécules
Que sont les perméabilité des cas des petites molécules
Perméabilité passive
Diffusion à travers la phase lipidique
Diffusion facilitée par des canaux protéiques
Diffusion facilitée par des perméases
Diffusion par des ionophores
Perméabilité active
Source d’énergie
Que sont les cas des particules et des marcomolécules
Phagocytose
Pinocytose
Endocytose par l’entremise de récepteurs
Que sont les protéeines impliquées dans les mécanismes d’adhérence
intégrines et Cadhérines
Qu’est ce qu’une intégrine
famille de glycoprotéines transmembranaires qui connectent le cytosquelette à la matrice
extracellulaire. Les intégrines transmettent des signaux (dans les deux sens) entre
les milieux intra et extracellulaire.
Où est ce qu’on retrouve les intégrines
On retrouve les intégrines dans les jonctions d’adhérence à la matrice extracellulaire.
Qu’est ce qu’une Cadhérines
C’est une glycoprotéines de liaison transmembranaires (une hélice alpha, 700 ac. aminés) qui forment des
liens entre 2 cellules voisines.
Par quoi est ce que la fixation des cadhérines est régulée
La fixation des cadhérines entre elles est régulée par les ions Ca++
Où est ce qu’on retrouve les cadhérines
On retrouve les cadhérines dans les zonula adherens et dans les desmosomes
Que sont les terminologie des jonctions cellulaires selon leur configuration
Zonula: forme une bande continue
encerclant toute la cellule (Épithélium).
Fascia: Plaque étendue et irrégulière
Macula: Jonction ponctuelle, petite surface.
Que sont les terminologie des jonctions cellulaires selon l’épaisseur de l’espace intercellulaire
Occludens: espace intercellulaire nul
Adherens: espace > 15 nm
Gap: espace d’environ 2 ou 3 nm.
Que sont les combinaisons qui existe
Zonula occludens
Zonula adherens
Macula adherens