Interação enzimática Flashcards

1
Q

Qual é a diferença entre catálise ácido-base geral e específica?

A

A geral envolve uma espécie HA, a específica envolve a água (H3O+)

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Q

Quais são os aminoácidos que estão mais frequentemente envolvidos em catálise acido-base?

A

Glutamato, Aspartato, Lisina, Arginina, Cisteína, Histidina, Serina e Tirosina

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3
Q

Em que consiste a catálise ácido-base?

A

Catálise em que um H+ é transferido no estado de transição por um grupo localizado no local ativo da enzima que seja aceitador ou dador de protões

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4
Q

O que é catalise covalente?

A

Um grupo lateral nucleofílico forma um intermediário covalente instável com o substrato

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5
Q

Quais são as proteases de serina?

A

Tripsina, Quimiotripsina, Elastase, Trombina, Plasminogénio e Subtilisina

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6
Q

Quais das proteases de serina são enzimas digestivas?

A

Tripsina, Quimiotripsina e Elastase

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7
Q

Quais das proteases de serina estão envolvidas na coagulação do sangue?

A

Trombina, Plasminogénio e Subtilisina

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8
Q

Onde são produzidas e secretadas as proteases de serina que são enzimas digestivas?

A

Prod. no pâncreas, secretadas no aparelho digestivo

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9
Q

As proteases de serina digestivas são produzidas sobre uma forma inativa chamada de…

A

Zimogénio ou Proenzima

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10
Q

De entre as proteases relacionadas com a coagulação do sangue qual delas destroi os polímeros de fibrina?

A

Plasminogénio

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11
Q

Qual das proteases de serina relacionadas com a coagulação do sangue, é uma endopeptidase bacteriana?

A

Subtilisina

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12
Q

Quais aminoácidos compõe a triade catalítica nas proteases de serina?

A

Serina, Histidina e Aspartato

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13
Q

O local ativo das proteases de serina fica protegido do ambiente aquoso num…

A

Bolsão hidrofóbico

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14
Q

Qual a função do Asp-102 na protease de serina?

A

Orienta a His-57

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15
Q

Qual a função da His-57 nas proteases de serina?

A

Atua como um ácido e base geral

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16
Q

Qual a função da Ser-195 nas proteases de serina?

A

Forma uma ligação covalente com o péptido a ser clivado

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17
Q

A ligação convalente estabelecida entre a serina e o péptido a ser quebrado nas proteases de serina provoca que modificação no C?

A

C trigonal passa a C tetraédrico

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18
Q

Que aminoácidos estabilizam o intermediário oxianião?

A

N-Hs da Gly-193 e Ser-195

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19
Q

Qual a função da histidina na ação enzimática da quimiotripsina?

A

Desprotona a serina formando o ião alcóxido, bom nucleófilo

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20
Q

Depois da desprotonação da serina na ação enzimática da quimiotripsina, o que acontece?

A

O O- ataca o substrato no C do grupo carbonilo formando uma acil-enzima tetraédrica (intermediário)

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21
Q

Como se dá a clivagem da ligação peptídica na ação enzimática da quimiotripsina?

A

Depois do ataca de serina, a carga negativa do O do grupo carbonilo volta a formar uma ligação dupla, sendo o grupo amina o grupo de saída

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22
Q

(Quimiotripsina) Depois da saída do grupo amina que molécula é desprotonada pela Histidina, que vai resultar na regenaração da atividade da enzima?

A

Uma molécula de água

22
Q

Em relação à especificidade para o substrato qual protease de serina prefere Arg e Lys?

A

Tripsina

22
Q

Na ação enzimática da quimiotripsina, que tipos de catálise existem?

A

Catálise ácido-base geral (His) e catálise covalente (Ser)

23
Q

Como se chama o percursor nao ativo da Quimiotripsina?

A

Quimiotripsinogénio

23
Q

A elastase prefere no seu bolso de ligação que aminoácidos?

A

Alanina, Glicina e Valina

23
Q

Como é ativado o quimiotrispinogénio a quimiotripsina?

A

Por proteólise. 1º reação com a tripsina, formando o pi-quimiotripsina (forma ativa) e depois sofre autólise formando a alfa-quimiotripsina

23
Q

Em relação á especificidade para o substrato qual protease de serina prefere moléculas mais volumosas como a fenilalanina e o triptofano?

A

Quimiotripsina

23
Q

Quais são as proteases aspárticas?

A

Pepsina, Quimosina, Catepsina D e Protease do HIV-1

24
Q

O que têm em comum no local ativo as proteases aspárticas?

A

Dois resíduos de aspartato

25
Q

Que tipo de catálise faz parte das proteases aspárticas?

A

Catálise ácido-base geral

26
Q

A HIV-1 protease é um…

A

Homodímero

27
Q

Como começa a ação enzimática das proteases aspárticas?

A

Um dos Asp desprotona a água, formando o ião OH- que é um bom nucleófilo para atacar o substrato

28
Q

Qual a diferença entre os dois Asp envolvidos na ação enzimática das proteases aspárticas?

A

Um tem pka baixo (desprotonado) e outro tem pKa alto (protonado)

29
Q

Qual é a função da protease do HIV-1?

A

Cliva poliproteínas virais em proteinas virais

30
Q

Porque é que os fármacos contra o HIV inibem a protease aspártica do HIV-1?

A

Pois esta é responsável pela clivagem de uma poliproteína vírica em várias sub-proteínas víricas funcionais, permitindo a dispersão e atuação do vírus no organismo.

31
Q

Que sequência de aminoácidos caracterísitca se encontra no local ativo da protease do HIV?

A

Aspartato-Tirosina-Glicina

32
Q

Em que consiste a catálise por iões metálicos?

A

Enzimas que possuem iões metálicos fortemente ligados e que atuam tendo por base reações REDOX

33
Q

O que é catálise eletroestática?

A

A distribuição de carga no local ativo estabiliza o estado de transição

34
Q

A enolase tem por base de funcionamento que tipo de catálise?

A

Catálise por iões metálicos

35
Q

A enolase converte o … em …

A

2-Fosfoglicerato em Fosfenolpiruvato

36
Q

Qual a função dos catiões Mg2+ na catálise da enolase?

A

Estabilizam a carga negativa do intermediário enolato

37
Q

Que nutrientes são percursores das coenzimas?

A

Vitaminas

38
Q

As vitaminas são classificadas como… e …

A

Hidrossolúveis e Lipossolúveis

39
Q

Quais das vitaminas, hidrossoluveis ou lipossoluveis ão percursoras de coenzimas?

A

Hidrossoluveis

40
Q

O que são as coenzimas?

A

Moléculas de baixo peso molecular que conferem características químicas particulares as reações enzimáticas

41
Q

O que são o NAD+ e o NADP+?

A

Transportadores de eletrões para a cadeia transp. de eletrões. Participam em reações redox.

42
Q

O NAD+ e o NADP+ são coenzimas das…

A

Desidrogenases

43
Q

Qual das coenzimas, NAD+ e NADP+ está relacionada com anabolismo?

A

NADP+

44
Q

Qual é o máximo de absorção do NADH?

A

340nm

45
Q

As proteínas que se ligam ao NAD+ têm uma estrutura conhecida por…

A

The Rossman fold

46
Q

Para além do NAD e do NADP que outras coenzimas redox existem?

A

FAD e FMN

47
Q
A