Instuderingsfrågor Flashcards

1
Q

Beskriv kortfattat HPV vad gäller struktur och genom organisation.

A

HPV är ett naket icosahedral kapsid med en diameter på ca 55nm.
Genomet är cirkulärt dsDNA och är ca 8 kbp. DNA:t är packat i mini kromosomer med cellulära nucleosomala histoner.
Genomet är en episome och integreras inte normalt i cellens genom.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
2
Q

Beskriv kortfattat HPVs livscykel.

A

Viruset infekterar basala lagret av epitelet, mucosa eller kutant. Virusets tar sig in via sår eller mindre lesioner. Livscykeln är kopplad till cellernas differentiering. Viruset har specifika differentierings gener som uttrycks vid olika tillfällen i livscykeln. Det finns regulatoriska gener i alla lager av vävnaden, även strukturella gener dock endast i övre lagret.

E6, E7: uttrycks i basala celler och uttrycket sträcker sig en bit in i vävnaden.
E1, E2, E4, E5: uttrycks i nästan hela vävnaden utom i basala celler och i översta lagren.
L1, L2: uttrycks i övre lagren

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
3
Q

Beskriv vad HPV proteiner har för funktion.

A
E7: Inducering av S-fas
E6: Förhindrar apoptos
E2: DNA bindande transkription och replikations faktorer
E1: Replikationsfaktor
E5: modulation av immunsvar och transformation
E4: stärker late life cycle
L1: Major structural protein
L2: minor structural protein
How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
4
Q

Beskriv HPV proteinet E5:s funktioner.

A
  • Integrerar med många olika cellulära protein
  • Immune evasion i basala cellerna (binder MHC-1 och degraderar dem)
  • Bibehåller en aktiv cellcykel i infekterade celler
  • Förhindrar apoptos och differentiering
  • Påverkar flera signaltransduktions vägar via interaktion med EGFR
How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
5
Q

Vilka händelser krävs för att HPV ska kunna utveckla cancer.

A
  • Cellulär transformation av E7/E6
  • Viral genom integration, förlust av E2 -> ökat uttryck av E7/E6
  • Förlust av L1/L2, virus känns inte igen av immunförsvaret.
How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
6
Q

Beskriv olika sätt HPV undviker Immunförsvaret

A
  • Uttryck av immunogena proteiner sker endast i övre epitellagret där det finns färre immunceller.
  • Involverar inte blodet
  • Lyserar eller dödar inte celler
  • E5 blockerar MHC-1
  • E6/E7 blockerar IFN-response
How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
7
Q

Nämn kort tre nackdelar med dagens HPV vaccin

A
  • Kan inte skydda personer med pågående infektion
  • Skyddar inte mot alla HPV typer
  • Dyr för många kvinnor i utvecklingsländer.
How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
8
Q

Vilka terapier (behandlingar) kan man använda mot HPV infektion.

A
  • Mekaniskt ta bort skadad vävnad
  • Kemisk behandling (topikalt på vårtor och CINs
  • Stimulering av medfödda immunförsvaret
How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
9
Q

Beskriv med vilka mekanismer virus kan lämna cellen.

A
  • Exocytos (höljebärande)
  • Budding (slow infection, cell might survive)
  • Lysering/Burst (höljebärande och nakna)
  • Apoptos
  • Cell - Cell fusion
How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
10
Q

Beskriv kortfattat Adenovirus med avseende på struktur och genomorganisation.

A

Adeno är ett naket ikosahedralt virus med antenner som sticker ut ur alla 12 symmetriska hörn. Den har en diameter mellan 70-90 nm. Kapsiden består av 11 olika protein.
Genomet är linjärt dsDNA och innehåller ca 30-36 kbp.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
11
Q

Beskriv kortfattat Herpesvirus med avseende på struktur och genomorganisation

A

Dessa är stora höljeförsedda virus (125 nm), Linjärt dsDNA. Herpesvirus har något som kallas tegument protein. Genomet är mellan 120-130 kbp långt.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
12
Q

Beskriv progressionen av Burkitts Lymfom

A

Anledningen till att burkitts lymfom finns i tropikerna (afrika och Nya Guinea) är för att väldigt många är drabbade av malaria vilket immunsupresserar personen. Har man malaria samtidigt som man får en EBV infektion så är det väldigt svårt för kroppen att hämma lymfoproliferation. För att utveckla lymfom krävs även ett re arrangemang av EBVs kromosomer. I det flesta fall har en “heavy chain promotor enhancer” translokerats till c-myc genen som är en proto-onkgen och kommer bli aktiv hela tiden vilket förklarar cancern.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
13
Q

Punkta upp händelserna som inträffar vid EBV reaktivering.

A

Lytiska gener reaktiveras (IE och E)

Korsbindning av BCR -> minnescell differentierar till plasmacell -> migerar till muköstepitel. Smittspridning via saliv.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
14
Q

Beskriv kortfattat kliniska bilden av kaposis sarcom.

A
  • mild infektion hos väsentligen friska
  • Reaktivering hos immunsupprimerade medför risk för lymfoproliferation eller endotelsarkom.
  • Karposis sarcom är vanligaste cancernformen i samband med AIDS

Får man infektion som väsenligt frisk behöver det inte hända så mycket, annars kan man få proliferation av endotel. Det gör att man kan få kaposis sarcom. Viruset har förmågan att stimulera angiogenes, man får då en tillväxt av endotelceller och kärlväggarna växer till och det ser då ut som blodblåsor, både externt och internt.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
15
Q

Beskriv Polyomavirus kortfattat med avseende på struktur och genomorganisation

A

Naket virus med en icosahedralstruktur. Kapsiden har en diameter på 45 nm och bildas av 72 kapsomerer. Genomet är cirkulärt dsDNA, ca 5,3 kbp. Packat i minikromosomer med nucleosomer bestående av viralt DNA och cellulära histoner.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
16
Q

Vilket cellulärt protein är viktigt för transkriptionsinitiering hos polyomavirus?

A

TFllD

17
Q

Beskriv enligt vilka processer sena transkriptionen hos polyomavirus

A
  1. Stora T-antigenet supresserar transkription av tidiga gener
  2. Aktivering eller inducering av nya transkriptionsfaktorer (en kobinerad effekt av små, medel och stora T-antigen)
  3. De-suppression av sena transkript mha av cellulärt protein
  4. Ökad effektivitet gällande processning och export av sena mRNA
  5. “read through RNA” hybridiserar med tidiga transkript och leder till dess degradering.
18
Q

Beskriv kortfattat Picorna virus med avseende på struktur och genomorganisation

A

Litet ssRNA virus (positiv polaritet). Genomet är ca 7-8,5 kbp. Alla gener translateras till en polypeptid som senare klyvs av cellulära och virala proteiner.

19
Q

Beskriv vad som händer när influensavirus genomet tagit sig in i kärnan.

A

Väl inne kärnan behöver viruset börja replikera sitt (-)ssRNA. Viruset använder cellulärt RNA som primer. PB2 binder 5’Cap –> PB1 agerar nucleas –> klyver cellulärt RNA –> sedan agerar PB1 polymeras -> syntetiserar komplemntär sträng och Poly-A svans.
Transkription som också äger rum i kärnan genererar 8 virala mRNA -> mRNA ut ur kärnan -> translation -> NP, PA, PB1, PB2. Dessa proteiner transporteras tillbaka till kärnan. NPs närvaro i kärnan -> inducerar fullängds transcription –> progeny nucleokapsid. M1 och NS2 (som också syntetiseras i cytoplasman) står för exporten ut ur kärnan. (membranproteinerna HA, NA och M2 vildas i ER/golgi).

20
Q

Vad är skillnaden mellan HTLV-1 och HIV-1?

A

Precis som HIV-1 infekterar HTLV-1 främst CD4+ T-celler, även CD8+ T-celler, dendritiska celler och B-celler. Dock är det endast 1-5% som utvecklar ATL från HTLV infektion tillskillnad från HIV där majoriteten utvecklar svår sjukdom. HTLV innehåller onkogena proteinet TAX som kan inducera T-cells transformation vilket HIV-1 inte har möjlighet att göra. HTLV använder GLUTs för att mediera entry in i cellen. HTLV stimulerar även T-cellsproliferation med HIV “dödar” T-celler.

21
Q

Beskriv olika mekanismer som virus utvecklat för att inte cellen ska uttrycka MHC1 på cellmembranet?

A

Adenovirus - håller kvar MHC1 i ER, hålls fast av 19K som sitter i ER membranet
HSV1, 2 - Har ett protein som blockerar TAP transporten av virala peptiden. reducerar uttrycket av MCH1 på cellytan
HIV - accelererar endocytosen av MHC-1 så att dem exponeras jättefort sedan tas tillbaka. Selektivt HLA-A och B.
EBV - proteiner degraderas inte av proteasomen.

22
Q

Hur kan virus blockera interferon signalering?

A
  1. Blockera interferon induktion
  2. Förhindra IFN att binda receptor
  3. Blockera JAK/STAT
  4. Förhindra transkribering av ISG gener
23
Q

Hur kan virus passera BBB

A

Spridning med blodet

  • Transport i makrofager
  • infektion av endotelceller
  • Transcystosis mellan endotelceller

Spridning med neuron

  • Kranialnerver
  • Perifera nerver
24
Q

Vad innebär immunopatogenes?

A

Det är när det aktiverade immunförsvaret orsakar skada och sjukdom och inte viruset i sig.

25
Q

Vilka genetiska modifikationer har adenovirus vektor genomgått?

A

Eliminering av virusets kapacitet att replikera
Öka dess kapacitet att kondensera exogent genom
Modifiera vektorns specificitet till specifika cell-receptorer.

26
Q

Beskriv strategin för gen-terapi försök (trials) riktade för behandling av SCID-XI (Bubble
boys) och Parkinsons.

A

Retrovirus vektorer används frekvent i behandling av blodsjukdomar. SCID-XI orsakas av
mutationer i γc cytokin-receptorn vilken krävs för differentiering av T-lymfocyter.
Hematopoetiska stamceller tas ut från kroppen och infekteras med virus som innehåller den

friska genen. Sedan förs dem tillbaka till kroppen där de kan differentiera och prolifirera med
en ny intakt gen. Barn som drabbats av SCID-XI dör ofta unga pga. att de saknar T-cells
medierat immunförsvar. De barn som behandlas med denna retrovirusvektor har påvisat full
tillfrisknad av deras immunsystem.
Denna metod tror man kunna utveckla och även använda vid sjukdomar som har låga
dopaminnivåer i hjärnan, Parkinsons. Vid Parkinson dör dopaminerga neuron som står för
sekretionen av dopamin. Genom att uttrycka de enzym som krävs för dopaminsyntes tror
man sig kunna återställa produktionen av dopamin. En lentivirus vektor som uttrycker de tre
enzym involverade i dopaminsyntes injicerades i hjärnorna på djurmodeller för Parkinsons.
Neuronen transducerades av vektorn och man såg en ökning av dopamin produktion. Denna
vektor är i fas ll/lll i en klinisk prövning på mänskliga patienter med Parkinsons.