IId. Replicación del ADN Flashcards
Introdujo el termino dogma central de la biología molecular en 1958
Francis Crick
Su descubrimiento rompio el dogma central de la biología molecular
DNA polimerasa RNA dependiente (Retrotranscripción)
Formación de DNA a partir de RNA cromosómico. Catalizada por Transcriptasas inversas. En retrovirus
Transcripción inversa
Sintesis de una molécula de RNA como duplicado de RNA cromosómico. Catalizada por RNA replicasas. En mosaico del tabaco
Replicación del RNA
La replicación, transcripción, transcripción inversa, replicación del RNA y traducción son parte deL…
Dogma central de la genética molecular
Los nuevos dúplex sintetizados de novo tienen la misma secuencia que el dúplex de novo. V o F
verdadero
Las cadenas originales se mantienen unidas después de servir como molde, al igual que las sintetizadas de novo
Replicación conservativa
La molécula de DNA original se fragmenta en pequeños pedazos sintetizandose así las cadenas de novo, de tal forma que los dúplez hijos tendrían cadena de DNA antiguo y nuevo
Replicación dispersiva
Los dúplex hijos están formados por una cadena del progenitor y una cadena de nueva sintesis
Replicación semiconservativa
Experimento que uso isótopos pesados (N15) e isotopos ligeros (N14) en donde se descubrio que el modelo de replicación de dispersión y conservativa no son ciertas
de Meselson- Stahl
Unidad de DNA en la que se produce un acto individual de replicación. Se dispar una vez por ciclo celular
Replicón
Principal patología asociada a fallla durante replicación
Cáncer
Tasa de replicación de células eucariotas
2,000 bp/min
Se incorpora en la horquilla de replicación y marca la base
BrdU-FITC
% de replicones activos en un momento dado
no más del 15%
En la etapa de elongación existe como complejo asociado a la estructura de la horquilla de replicación. No independiente. Fx sintesis de DNA entre otras
Replisoma
En la etapa de iniciación actuan dos enzimas que sirven como cebador (primer) y para separar las cadenas respectivamente
Primasa y helicasa
El primosoma, en la etapada de iniciación esta en…
E. coli
Detienen la replicación inmediatamente al subir la temperatura (Elongación)
Mutantes de detención rápida
Completan la tanda de replicación en curso pero no pueden comenzar otra (iniciación)
Mutantes de detención lenta
Cortan o degradan los ácidos nucleicos hidrolizando el enlance éster de fosfato de nucleótidos contiguos
Nucleasas
Tipo de nucleasa que actua sobre enlaces internos de la molécula de DNA
Endonucleasa
Tipo de nucleasa que actua sobre los extremos del DNA
Exonucleasa
DNA pol que participa en la reparación del DNA en E. coli
DNA pol I y pol II
Tipo de DNA pol que participa activamente en la replicación
DNA replicasas
Subunidad del DNA pol III replicasa que sirve para quitar nucleotidos erroneo
ε. Exonucleasa 3´-5´
Subunidad catalitica de la DNA pol III replicasa
α. dna polimerasa
Subunidad en célula eucariota que replica el Adn mitocondrial
y. Replicación DNA mitocondrial
Tendencia a permanecer en una sola plantilla o molde, evitando el deslizamiento de replicación, sobretodo en regiones homopoliméricas
Procesividad de la enzima
Subunidad en eucariotas que sirve para la replicación nuclear
δ. Replicasa nuclear
Virus que hibrida un RNA preformado con la cadena molde
Retrovirus
Cadena que crece de 3´a 5. Se sintetiza en fragmetnos de 100-2000 bases (Procariotas) y 100-200 en eucariotas
Cadena retrasada
En la replicación hay unas células que sus extremos 5´de los cromosomas eucariontes sufren acortamiento
Células somáticas
Enzima que incorpora un cebador de RNA de unas 11-12 bases (dnaG)
Primasa
Donde se lleva a cabo la actividad primasa en la iniciación y elongación
Primosoma y replisoma (comienzo de cada fragmento de Okazaki)
Unica polimerasa con actividad 5´-3´exonucleasa. Traslación de melladuras, remueve los cebadores de RNA
DNA pol I
Polimerasa en eucariota con actividad endonucleasa que hace ruptura en dúplex RNA-DNA
RNAsa H1
Polimerasa sin actividad exonucleasa en eucariota que elimina el RNA
FEN1/ MF1
El AMP del complejo Enzima-AMP se une al 5´fosfato de la melladura y forma un enlace fosfodiester
Pasos de la ADN ligasa
Que tipo de ADN ligasa usa ATP y NAD respectivamente
ADN ligasa tipo I y tipo II
Proteína de unión a cadena sencilla de DNA, impiden que se vuelva a hacer el dúplex de DNA. mutante de detención rápida
SSB
Enzima que separa las cadenas de DNA empleando la hidrolisis del ATP. dnaB (5´-3´). DNA dúplex y cadena sencilla
Helicasa
Molde de la cadena retrasada
5’-3’
Componente de la replicasa que mantiene a la polimerasa sobre el DNA
β. Tenaza
Formado por un dímero β, un complejo y y el DNA
Complejo de preiniciación
Cargador que coloca las subunidades β sobre el DNA ( rompe ATP)
Componente y de replicasa
Subunidades de enzima central o núcleo (core)
α. Centro catalítico DNA polimerasa
e. exonucleasa 3’-5’
t. ensamble α y e
Los dos núcleos de la replicasa son independientes ya que cada uno tiene un dímero β asociado. V o F
v
Componente de replicasa que une los dos nucleos de la replicasa y mantiene la estructura dimérica
Subunidades t (tau)
Conecta al primosoma (helicasa-primasa) con la polimerasa. Se incrementa 10X la velocidad de síntesis y la procesividad
Tau
El fragmento de Okazaki se extiende hasta justo antes del comienzo del siguiente cebador de RNA. V o F
V
Polimerasa se une a nueva tenaza β unida en el siguiente punto de inicio. V o F
v
Protuyen alrededor de la doble hélice en el extremo que bloquea la horquilla de replicación
Helices α de Tus
Tipo de actividad de Tus
anti-helicasa
Es un punto de actuación en cis, capaz de afectar solamente a aquella molécula de DNA en la que reside
Origen de replicación
Proteína que desplaza a DnaA y activa a DnaG primasa
DnaB
Proteína que estabiliza la cadena sencilla impidiendo el duplex
SSB
Proteínas que son el motor de inicio
DnaB/DnaC
Forma parte del empaquetamiento de proteínas
HU
Si un origen de replicación no esta metilado son activos. V o F
V
Metila la adenina en N6
Dam
Asociación del DNA con la membrana. Cuando esta hemimetilado el DNA permanece unido a la membrana y no se permite su replicación por interracción con algún otro componenete de la membrana
Secuestro físico del origen
seqA es otra proteína que retrasa la remetilación del oriC y dnaA. Regulador negativo que interacciona con DnaA. No tiene por sí sola especificidad por la secuencia oriC
Inhibición de la unión de DnaA
Se unen al material cromosómico antes de la replicación y se liberan posteriormente a la replicación
MCM 2, 3, 5
Cadena que se toma como molde para sintesis de una nueva partiendo del asa D que abarca 500 -600 bases
Cadena H
La síntesis de la cadena H inicia en sentido contrario cuando se expone el origen de la cadena L. V o F
V
