I colloquy Flashcards

1
Q

koks procesas laikomas klasikinės biotechnologijos pradžia?

A

fermentacija

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
2
Q

koks įvykis žymi šiuolaikinės biotechnologijos pradžią?

A

rekombinantinio žmogaus insulino pagaminimas

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
3
Q

kas įeina į baltają biotechnologiją?

A

pramonė

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
4
Q

kas įeina į geltonąją biotechnologiją?

A

maistas

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
5
Q

kas įeina į žaliąją biotechnologiją?

A

žemės ūkis

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
6
Q

kas įeina į mėlynąją biotechnologiją?

A

akvakultūra

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
7
Q

kas įeina į raudonąją biotechnologiją? (2)

A

vaistinės medžiagos, žmogaus sveikata

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
8
Q

raudonosios biotechnologijos objektai (5)

A
  1. bakterijos;
  2. mielės;
  3. augalų ląst.;
  4. gyvūnų ląst.;
  5. virusai
How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
9
Q

3GM augalų grupės

A
  1. galintys augti ypatingomis sąlygomis;
  2. pagerintos maistinės vertės;
  3. biofabrikai
How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
10
Q

kokie maisto produktai daugiausiai gaminami geltonosios biotechnologijos srityje? (4)

A
  1. vynas;
  2. sūris;
  3. alus;
  4. vabzdžiai
How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
11
Q

kas įeina į violetinę biotechnologiją? (3)

A
  1. teisė;
  2. etika;
  3. filosofija
How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
12
Q

kas įeina į tamsiąją biotechnologiją? (2)

A
  1. bioterorizmas;

2. biologinis ginklas

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
13
Q

kas įeina į auksinę biotechnologiją? (3)

A
  1. bioinformatika;
  2. informatika;
  3. čipai
How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
14
Q

kas įeina į rudąją biotechnologiją? (2)

A
  1. desertai;

2. alkoholis

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
15
Q

kas įeina į pilkąją biotechnologiją?

A

aplinkosauga

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
16
Q

5 pramoninio biotechnologinio proceso etapai

A
  1. žaliava;
  2. pirminis apdorojimas;
  3. fermentacija + transformacija;
  4. antrinis apdorojimas;
  5. švarus produktas
How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
17
Q

kas įeina į pirminį apdorojimą?

A

biokatalizatoriaus ir jo optimalios biosistemos parinkimas

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
18
Q

kas įeina į antrinį apdorojimą? (2)

A
  1. prod. atskyrimas;

2. prod. gryninimas

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
19
Q

kokia sistema yra geriausia biokatalizatoriui?

A

mikroorganizmai, augalai ir ląstelės, kurios sparčiai auga

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
20
Q

5 biotechnologijų produktų grupės

A
  1. fermentai;
  2. monokloniniai antikūniai;
  3. rekombinantiniai baltymai;
  4. organizmai;
  5. ląstelės
How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
21
Q

kas yra monokloniniai antikūniai?

A

homogeniškų antikūnių populiacija, kuri turi tą patį antigeninį specifiškumą ir yra kilusi iš vieno antikūnius gaminančių ląstelių klono

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
22
Q

kas yra rekombinantiniai baltymai?

A

baltymai, dirbtinai sintetinami tokiose ląstelėse, kurioms šie baltymai yra svetimi

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
23
Q

pagal ką fermentai yra atskiriami vieni nuo kitų?

A

pagal katalizuojamą reakciją

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
24
Q

transferazių funkcija

A

funkcinių gr. pernaša nuo vienos molek. prie kitos

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
25
Q

hidrolazių funkcija

A

skaido chem. ryšius dalyvaujant vandeniui

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
26
Q

liazių funkcija

A

nedalyvaujant vandeniui skaido ryšius tarp substrato atomų

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
27
Q

izomerazių funkcija

A

tos pačios molek. vidumolekulinis persitvarkymas

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
28
Q

ligazių funkcija

A

naudodamos ATP hidrolizės metu išsiskiriančia energiją, katalizuoja C-O, C-S, C-C kovalentinių ryšių susidarymą

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
29
Q

fermentų klasifikavimo kodo pirmojo skaičiaus reikšmė

A

viena iš 6 klasių

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
30
Q

fermentų klasifikavimo kodo antrojo skaičiaus reikšmė

A

poklasis

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
31
Q

fermentų klasifikavimo kodo trečiojo skaičiaus reikšmė

A

popoklasis

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
32
Q

fermentų klasifikavimo kodo ketvirtojo skaičiaus reikšmė

A

fermento eilės nr. popoklasyje

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
33
Q

monokloninių antikūnų panaudojimo sritys (4)

A
  1. diagnostika;
  2. histologija;
  3. klinik. chem.;
  4. mikrobiologija
How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
34
Q

kas skalbimo milteliuose pakeitė aplinką teršiančius fosfatus? (2)

A

lipazės, proteazės

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
35
Q

kaip vaistų gamybai pasitarnauja fermentai?

A

sutrumpina vit. C, B2 gamybos laiką

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
36
Q

kas yra genų rekombinacija?

A

gen. medž. pasikeitimas tarp dviejų DNR molek.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
37
Q

kas yra DNR replikacija?

A

DNR sintezė, vykstanti prieš ląst. dalijimąsi

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
38
Q

genų inžinerijoje taikomi metodai (6)

A
  1. geno išskyrimas;
  2. geno perkėlimas į vektorių;
  3. vektorių kūrimas;
  4. vektorių įterpimas į ląst. ir genomą;
  5. perkelto geno veiklumo užtikrinimas;
  6. ląst., kuriose perkeltas genas veiklus, atranka
How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
39
Q

kas yra DNR vektoriai?

A

mažos DNR molekulės, pritaikytos svetimos DNR fragmentų įsiuvimui ir padauginimui

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
40
Q

kas yra plazmidės?

A

mažos DNR, galinčios egzistuoti viduje ląstelių atskirai nuo ląstelės DNR

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
41
Q

3 prokariotinių ląst. grupės

A
  1. termofilai;
  2. mezofilai;
  3. psichofilai
How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
42
Q

kam naudojami termofilai?

A

genų produktų, stabilių aukštose temp., gavimui

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
43
Q

psichofilų panaudojimo pvz.

A

toksinių teršalų šaltuose vandenyse biodegeneracijai

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
44
Q

kokį ploidiškumą ir kiek chromosomų paprastai turi prokariotai?

A

haploidai; 1 chrom.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
45
Q

kokia dažniausiai yra mikroorganizmų chromosoma?

A

žiedinė

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
46
Q

kokia yra E. coli Gramo dažymo būdu?

A

neigiama

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
47
Q

kokiose sąlygose auginama E. coli, kad būtų gauta didesnė išeiga?

A

aerobinėse

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
48
Q

kas yra nukleoidas?

A

kompaktiškai supakuota DNR ląstelėje

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
49
Q

F plazmidės funkcija

A

genų info perdavimas į kitas ląst.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
50
Q

2 R plazmidės funkcijos

A
  1. atsparumas antibiotikams;

2. toksinų, adhezinų gamyba

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
51
Q

4 reikalavimai plazmidėms

A
  1. mažas dydis;
  2. kirpimo vietos;
  3. replikacijos pradžios seka ORI;
  4. atrankos genetiniai markeriai
How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
52
Q

kokios DNR sekos yra būtinos plazmidės replikacijai?

A

ori

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
53
Q

kas jungiasi prie ori?

A

DNR polimerazės

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
54
Q

kur turi būti klonavimo sritis?

A

plazmidės regione, kuris nėra būtinas replikacijai ar kitai svarbiai plazmidės išsilaikymo ląst. funkcijai

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
55
Q

kodėl reikia atrankos geno?

A

nes bakterinės plazmidės transformacija nėra efektyvi

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
56
Q

ką reiškia bla?

A

atsparumą ampilicinui

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
57
Q

ką reiškia tc?

A

atsparumą tetraciklinui

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
58
Q

kiek plazmidžių maždaug būna genome?

A

20

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
59
Q

kas yra transformatų selekcija?

A

klonų, į kuriuos transformacijos metu pateko plazmidė, atranka

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
60
Q

kur dauginasi Ff bakteriofagai?

A

E. coli F+ kamienuose

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
61
Q

kodėl Ff bakteriofagai dauginasi E. coli F+ kamienuose?

A

nes adsorbcijai prie infekuojamos bakterijos jie naudoja F faktoriaus formuojamus pilius

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
62
Q

lėčiau ar greičiau auga bakterijos, infekuotos M13 bakteriofagu?

A

lėčiau

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
63
Q

kas yra fagemidės?

A

vektoriai, savyje kombinuojantys plazmidžių ir bakteriofagų savybes

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
64
Q

bakteriofago lemda 2 vystymosi alternatyvos

A
  1. lizuojantis vystymosi kelias;

2. lizogeninis vystymosi kelias

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
65
Q

kas yra kosmidės?

A

plazmidės, leidžiančios klonuoti ir dauginti didelius DNR fragmentus

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
66
Q

kas yra Ylp plazmidės?

A

vektoriai, kurie turi mielių ar kitokį geną transformantų atrankai, bet neturi sekos, užtikrinančios plazmidės replikaciją mielėse

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
67
Q

ką galima padaryti su Ylp plazmidėmis?

A

integruoti DNR sekas į mielių genomo homologines dalis

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
68
Q

kodėl Ylp plazmidės tinka integravimui į DNR sekas mielių genomo homologinėse dalyse?

A

nes mielėse S. cerevisiae homologinė rekombinacija vyksta labai efektyviai ir tiksliai

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
69
Q

ką turi YRp plazmidės?

A

mielių genomo fragmentą (ARS seką)

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
70
Q

ką užtikrina ARS seka?

A

plazmidės autonomišką replikaciją

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
71
Q

YRp plazmidžių pliusas

A

labai efektyviai transformuoja mieles

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
72
Q

YRp plazmidžių minusas

A

transformantai būna labai nestabilūs

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
73
Q

YRp plazmidžių transformantų nestabilumo priežastis

A

netolygus plazmidės pasiskirstymas tarp motininės ir dukterinės ląstelių mielių pumpuravimo metu

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
74
Q

kodėl YRp plazmidė lieka motininėje ląstelėje ir tik maža dalis patenka į atsipumpuruojančią dukterinę ląst.?

A

nes šios plazmidės neturi pasiskirstymo tarp pumpuruojančių ląstelių mechanizmo

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
75
Q

kas yra YCp plazmidės?

A

centromeros seką turinčios plazmidės

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
76
Q

kiek nukleotidų seka sudaro S. cerevisiae centromera?

A

100-200

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
77
Q

S. cerevisiae centromeros sekos įjungimo į YRp plazmides rezultatai (2)

A
  1. padidina stabilumą iki 99 proc.;

2. kopijų sk. sumažėja iki 1-2 plazmidžių ląstelei

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
78
Q

kas yra YEp?

A

episominės plazmidės

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
79
Q

kaip sukurtos YEp?

A

naudojant mielių 2mikrom plazmidę

80
Q

kur randama 2mikrom plazmidė?

A

daugumoje mielių kamienų

81
Q

ką užtikrina YEp plazmidė? (2)

A

autonomišką replikaciją;

pakankamą stabilumą

82
Q

kokiai klasei priklauso 2mikrom plazmidė?

A

savanaudiškų DNR klasei

83
Q

kokį dydį turi pasiekti linijinės plazmidės, kad pasiektų stabilumą?

A

100 kb

84
Q

kokius vektorius naudojant sukurti visi mielių vektoriai?

A

E. coli

85
Q

agrobacterium tumefaciens funkcijos (2)

A
  1. infekuoja augalą per pežeistas vietas;

2. aktyvina augalų ląstelių nereguliuojamą dalijimąsi

86
Q

kas yra bakulovirusai?

A

vabzdžių virusai

87
Q

ką infekuoja bakulovirusai?

A

Lepidoptera, Diptera, Hymenophera ir kt. vabzdžių lervas

88
Q

kokioje stadijoje esantys vabzdžiai yra labiausiai jautrūs bakulovirusams?

A

lervų

89
Q

kas sudaro bakuloviruso genomą?

A

dvigrandė uždara DNR

90
Q

kokio ilgio DNR sudaro bakuloviruso genomą?

A

80-150 bp

91
Q

kam buvo naudoti vaccinia virusai?

A

žmonių vakcinacijai prieš raupus

92
Q

kur replikuojasi vaccinia virusai?

A

citoplazmoje (dėl to turi nepriklausomas replikacijos ir transkripcijos sistemas)

93
Q

kas sudaro vaccinia viruso genomą?

A

linijinė, dvigrandė, apie 200 kb DNR, suformuojanti linijinį dupleksą su segtuko formos kilpomis galuose

94
Q

iš ko sudarytas virionas? (2)

A
  1. sudėtingos viruso šerdies;

2. šerdį supančio lipoproteininio paviršiaus

95
Q

kas yra viruso šerdyje?

A

baltymai, reikalingi viruso transkripcijai

96
Q

kam dažniausiai naudojami vaccinia vektoriai?

A

kDNR raiškai

97
Q

kur prijungiama geno kDNR?

A

prie viruso promotoriaus

98
Q

kodėl yra būtinas viruso promotorių naudojimas?

A

nes Vaccinia viruso RNR polimerazė atpažįsta tik virusinius promotorius

99
Q

kokiu būdu į viruso genomą yra įvedama ekspresijos kasetė?

A

rekombinacijos

100
Q

koks yra tradicinis genų įterpimo taikinys?

A

TK genas

101
Q

Viruso TK funkcija

A

fosforilina (aktyvina) nukleotidų analogus

102
Q

kodėl yra atsisakoma gyvų vakcinų?

A

nes imunodeficito sąlygomis bet koks virusas tampa pavojingu

103
Q

kam naudojami Vaccinia viruso vektoriai?

A

rekombinantinių baltymų gavimui žinduolių ląst.

104
Q

kokie genai naudojami gauti stabilią žinduolių ląstelių transformaciją?

A

apsaugantys nuo citotoksinių junginių

105
Q

kur analizuojamas reporterinis baltymas tyrimuose, kur naudojami in vitro žymenys? (2)

A

ląstelių lizatuose;

augimo terpėje

106
Q

kokie metodai naudojami in vitro naudojamų žymenų testavimui? (2)

A

biocheminiai;

imunologiniai

107
Q

iš ko kilės CAT (chloramfenikolio acetiltreansferazės) genas?

A

iš bakterijų

108
Q

kodėl CAT yra patogus?

A

nes žinduolių ląstelėse nėra jam giminingų baltymų, trukdančių testavimui

109
Q

kuo paremtas CAT testavimas? (2)

A
  1. izotopiniais metodais;

2. ELISA

110
Q

kas įvyksta, kai substratas sumaišomas su ląstelių lizatu, turinčiu liuciferazės?

A

lizatas skleidžia trumpą blyksnį, kurį fiksuoja luminometras

111
Q

ką hidrolizuoja E. coli beta galaktozidazė?

A

galaktozidus

112
Q

iš kur izoliuotas genas GFP?

A

iš medūzų

113
Q

ką galima stebėti suliejus GFP su tiriamuoju genu? (3)

A

baltymo sintezę, lokalizaciją, judėjimą ląstelėje

114
Q

2 virusinių vektorių klasės

A
  1. RV, Lentivirusai, AVV - integruojasi į genomą;

2. Adv, HSV1, AVV - kaip ekstrachromosominiai elementai

115
Q

4 grupės fermentų, naudojamų DNR manipuliacijoms atlikti

A
  1. nukleazės;
  2. ligazės;
  3. polimerazės;
  4. modifikacijos fermentai
116
Q

nukleazių funkcijos (3)

A
  1. kerpa;
  2. trumpina;
  3. degraduoja nukleor. molek.
117
Q

ligazių funkcija

A

sujungia nukleorūgščių molek.

118
Q

polimerazių funkcija

A

kopijuoja molekules

119
Q

modifikacijos fermentų funkcija

A

prideda/pašalina spec. chem. grupes

120
Q

kokį ryšį suardo nukleazės, ardydamos DNR molekules?

A

fosfodiesterinį

121
Q

kam naudojama DNRazėI?

A

pašalinti DNR priemaišoms iš RNR preparatų

122
Q

kam naudojama DNRazėA?

A

pašalinti RNR priemaišoms iš DNR preparatų

123
Q

egzonukleazės III savybės (2)

A
  1. degraduoja vieną grandinę 3’-5’;

2. neskaido DNR, jei 3’ OH galas atsikišęs

124
Q

pageidautinas substratas egzonukleazei III

A

buki DNR galai arba buki 3’ galai

125
Q

Bal31 egzonukleazės panaudojimas (3)

A
  1. DNR trumpinimui;
  2. trūkių identifikavimui;
  3. delecijų ruošimui
126
Q

S1 endonukleazės funkcija

A

degraduoti viengrandžius fragmentus (RNR, DNR)

127
Q

kam naudojama S1 endonukleazė?

A

išsikišusių DNR fragmentų pašalinimui

128
Q

ką daro Dnazė I?

A

nespecifiškai skaldo viengrandę ir dvigrandę DNR

129
Q

kas gaunama DNR paveikus Dnaze I?

A

mononukleotidų ir labai trumpų oligonukleotidų mišinys

130
Q

kam naudojama Dnazė I?

A

DNR pašalinimui iš įv. preparatų

131
Q

restrikcijos endonukleazių funkcija

A

skaldyti DNR specifinėse atpažinimo vietose

132
Q

3 restriktazėms duodamų pavadinimų dalys

A
  1. pirma raidė - gentis, kitos dvi - rūšis;
  2. kamieno tipas;
  3. kelintas fermentas, atrastas tame organizme
133
Q

ką bakterijoms atstoja restrikcijos-modifikacijos sistema?

A

imuninę sistemą, apsaugančią nuo svetimos DNR

134
Q

iš kiek ir kokių subvienetų sudaryta I tipo R-M sistema?

A

5: 2 R, 2 M ir S.

135
Q

M subvienetų funkcija

A

metilinimas

136
Q

iš ko sudaryta II tipo R-M sistema?

A

restrikcijos endonukleazės ir metiltransferazės

137
Q

iš ko sudaryta III tipo R-M sistema?

A

2 R ir 2 M subvienetų

138
Q

iš ko sudaryta IV tipo R-M sistema?

A

RE fermento

139
Q

IV tipo R-M sistemos funkcija

A

skaldo tik modifikuotą DNR (metilintą, pusiau metilintą, gliukzyl-hidroksimetilintą)

140
Q

kiek ir kokie genai sudaro III tipo R-M sistemas?

A

2 genai (mod ir res)

141
Q

kaip III tipo R-M sistemų fermentas skelia DNR?

A

per specifinį atstumą nuo vieno iš 2 taikinių

142
Q

per kokį atstumą III tipo R-M sistemų fermentas skelia DNR?

A

20-30 nt

143
Q

kam III tipo sistemos svarbios patogeninėse bakterijose?

A

virulentiškumui

144
Q

kam naudingos IV tipo R-M sistemos?

A

apsisaugant nuo bakteriofagų, turinčių labai modifikuotą DNR

145
Q

kokiu atstumu skeliama DNR IV tipo R-M sistemomis?

A

30 bp nuo taikinio

146
Q

kas yra izošizomerai?

A

restrikcijos endonukleazės, atpažįstančios ir vienodai skaldančios tokią pat DNR seką, bet išskirtos iš skirtingų organizmų.

147
Q

kas yra neošizomerai?

A

fermentai, atpažįstantys tą pačią seką, bet kerpančios skirtingai.

148
Q

kas yra aktyvumo vienetas?

A

fermento kiekis, per 1 val. suskaldantis 1 mikrogramą DNR

149
Q

kas yra nikazės?

A

fermentai, atpažįstantys specifinę seką ir skeliantys tik vieną DNR grandinę

150
Q

kam naudojamos nikazės? (2)

A
  1. viengrandės DNR paruošimui;

2. linijinių DNR galų “uždarymui”, suformuojant uždarais galais dvigrandes DNR

151
Q

kokia ligazė daugiausiai naudojama genų klonavimo praktikoje DNR fragmentų sujungimui?

A

T4 bakteriofago DNR ligazė

152
Q

kas naudojama norint padidinti DNR galų susidūrimo tikimybę?

A

PEG (polietilenglikolio) tirpalas

153
Q

ką daro ribonukleazė H?

A

skaldo RNR, esančią hibride su DNR (šalina RNR pradmenis iš Okazaki fragmentų 5’ galų)

154
Q

kam naudojama Klenow fragmentas? (4)

A
  1. DNR galų bukinimui;
  2. 3’ galo žymėjimui;
  3. antros grandinės sintezei;
  4. kDNR žymėjimui atsitiktinių pradmenų metodu
155
Q

kuo T7 polimerazė išsiskiria nuo kitų?

A

gebėjimu sintetinti in vitro didelius DNR fragmentus (dideliu procesyvumu)

156
Q

kaip veikia Taq polimerazė?

A

įgaliną DNR sintezės aktą kartoti daug kartų nepridedant papildomai fermento

157
Q

kam naudojama atvirkštinė transkriptazė? (5)

A
  1. kDNR sintezei;
  2. RNR virusų diagn. (AT-PCR);
  3. RNR galų kartiravimui pradmenų pratempimo reakcijoje;
  4. DNR 3’ galų žymėjimui, sekvenavimui;
  5. norimų DNR fragmentų sintezei naudojant RNR matricą (AT-PCR)
158
Q

kam naudojamos RNR polimerazės?

A

RNR sintezei in vitro

159
Q

šarminių fosfatazių funkcija

A

nuo DNR galų pašalina fosfatą

160
Q

pop. fosfatazės (3)

A
  1. bakterijų;
  2. veršio žarnų;
  3. krevečių
161
Q

krevečių šarminės fosfatazės savybės (2)

A
  1. jautri temp.;

2. lengvai inaktyvuojama aukštoje temp.

162
Q

ką skaldo agarazė? (2)

A
  1. agarą;

2. agarozę

163
Q

kam naudojama agarazė?

A

DNR ir RNR išgryninimui iš agarozės gelio

164
Q

kas yra kompetentiškumas?

A

ląstelių sugebėjimas transformuotis, paimti svetimą DNR

165
Q

kokie 2 parametrai naudojami vertinant transformaciją?

A
  1. transformacijos dažnis;

2. efektyvumas

166
Q

rekombinantinės DNR įvedimo į ląstelę 4 žingsniai

A
  1. norimo geno izoliavimas, naudojant restrikcinius fermentus;
  2. geno įterpimas į vektorių (ligazės pagalba);
  3. vektoriaus įterpimas į šeimininką (transformacija);
  4. ląst. šeimininkių padauginimas
167
Q

kas yra konjugacija?

A

gen. medž. pernešimas esant kontaktui tarp dviejų ląst.

168
Q

kokie 2 faktoriai reikalingi konjugacijai?

A
  1. DNR vieta, kur prasideda DNR pernešimas (oriT);

2. baltymai pernešimui (su tra genais plazmidėje)

169
Q

kiek ir kokius genus koduoja F+ faktorius?

A

26 tra genus

170
Q

ką reikia daryti, kad visos bakterijos turėtų F+ plazmides?

A

sumaišyti kultūrą su F+ faktoriaus plazmidėmis ir kultūrą be plazmidės

171
Q

kas yra genų terapija?

A

gydymas, ligos eigos sulėtinimas arba apsaugojimas nuo susirgimo funkcionalių genų įvedimu į organizmą

172
Q

somatinių ląst. genų terapijos pagrindiniai taikiniai (3)

A
  1. cistinė fibrozė;
  2. raumenų distrofija;
  3. vėžys
173
Q

genų įvedimo metodai (2)

A
  1. virusinės kilmės vektoriai;

2. nevirusinės kilmės DNR įvedimo sistemos

174
Q

5 vektorių klasės virusų pragrindu

A
  1. adenovirusų (AdV);
  2. adeno-asocijuotų virusų (AAV);
  3. onko-retrovirusų (RV);
  4. lentivirusų;
  5. herpes simplex-ą (HSV)
175
Q

kam naudojami vektoriai, kurie negali integruotis?

A

laikinai geno raiškai besidalijančiose ląst. arba ilgalaikei raiškai nesidalijančiose

176
Q

ką reikia naudoti norint gauti pastovią geno raišką proliferuojančiose ląst.?

A

integruojančius vektorius

177
Q

kokie vektoriai naudojami klinikiniuose tyrimuose?

A

onko-RV (retrovirusai)

178
Q

pagr. onko-RV vektorių trūkumas

A

galimybė infekuoti tik besidalijančias ląst.

179
Q

kaip buvo įveiktas onko-RV pagr. trūkumas?

A

prie RV matrikso baltymo NLS prijungtas į branduolį nukreipiantis signalas

180
Q

kam naudojami letivirusų vektoriai?

A

ramybės būsenoje esančių ląst. (kraujodaros kamieninių, nervinių, smegenų) infekcijai

181
Q

3 svarbiausios vektorių savybės

A
  1. vektorių tropizmas;
  2. transgeno ekspresijos laikas;
  3. vektoriaus imunogeniškumas
182
Q

didžiausias ir sudėtingiausias iš genų terapijoje naudojamų virusų

A

Herpes simplex

183
Q

HSV vektorių pagr. privalumai (2)

A
  1. didelė talpa;

2. galimybė infekuoti nervines ląsteles

184
Q

kur integruojasi AAV (adeno-asocijuoti virusai)?

A

į 19 chrom. specifinį lokusą

185
Q

vektorių, nukreiptų į vėžio gydymą, savybės (5)

A
  1. turi anti-angiogeninius faktorius;
  2. stabdo kraujagyslių vystymąsi auglyje;
  3. turintys supresuojančius genus (p53);
  4. turintys imuno-stimuliacinius genus;
  5. lizuoja ląsteles
186
Q

kokiu pagrindu konstruojami priešvėžiniai vektoriai? (2)

A
  1. AdV;

2. HSV-1

187
Q

2 nevirusinių genų įvedimo metodų tipai

A
  1. chem.;

2. fiziniai

188
Q

chem. nevirusinių vektorių rūšys (2)

A
  1. lipopleksai;

2. polipleksai

189
Q

kas yra lipopleksai?

A

katijoninių liposomų/micelių-DNR kompleksai

190
Q

kas yra polipleksai?

A

katijoninių polimerų-DNR kompleksai

191
Q

kaip chem. nevirusiniai vektoriai patenka į ląst.?

A

endocitozės būdu

192
Q

pagr. chem. nevirusinių vektorių problemos (3)

A
  1. nestabilūs ir agreguojantys fiziologinėm sąlygom;
  2. heterogeniški;
  3. mažas efektyvumas
193
Q

fizinių nevirusinių vektorių rūšys (4)

A
  1. genų šautuvas;
  2. mikroinjekcijos;
  3. nuogos DNR injekcijos;
  4. elektroporacija
194
Q

pagr. genų šautuvo trūkumas

A

sužalojama daug ląstelių

195
Q

kokie įrankiai naudojami DNR mikroinjekcijai suleisti? (2)

A
  1. mikromanipuliatorius;

2. mikropipetė

196
Q

pagr. 4 elektrogenoterapijos privalumai

A
  1. paprasta ir saugu;
  2. plazmidės paruošimas pigesnis ir paprastesnis nei kitų vektorių;
  3. lokalu, tiksliose vietose;
  4. nėra apribojimų dėl dydžio
197
Q

pagr. 2 elektrogenoterapijos trūkumai

A
  1. efektyvumas palyginti mažas;

2. geno ekspresija neilgalaikė